<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL805917.3	1	TGTCACAGTTCTGACAGCCCTTAGCATGGAGATAGCCAGCAGCCAATTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74226	TGTCACAGTTCTGACAGCCCTTAGCATGGAGATAGCCAGCAGCCAATTAG	74275

AL805917.3	51	ATATGGGAATCGGAAGCCTAGCAGAGAGGATAGCTGGAGAGTACATTTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74276	ATATGGGAATCGGAAGCCTAGCAGAGAGGATAGCTGGAGAGTACATTTCA	74325

AL805917.3	101	AAGTCACTGCCATATAAACAGGAATTAAAACCCTGATAGTGGGTGGGATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74326	AAGTCACTGCCATATAAACAGGAATTAAAACCCTGATAGTGGGTGGGATC	74375

AL805917.3	151	GCCTGGGAGAGTACGGAGGAAGAGGAGGATGGATTCAGAATGGAGTCCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74376	GCCTGGGAGAGTACGGAGGAAGAGGAGGATGGATTCAGAATGGAGTCCCA	74425

AL805917.3	201	GTGCTTGGGTAGTGCATGGAGGACAGGACCCCTGAACAGGCCGGCAAAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74426	GTGCTTGGGTAGTGCATGGAGGACAGGACCCCTGAACAGGCCGGCAAAGT	74475

AL805917.3	251	GTGGGTAGAGAGGTCAAGGAGAGAGAGGAGAAGTTACTGTAGAAATCGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74476	GTGGGTAGAGAGGTCAAGGAGAGAGAGGAGAAGTTACTGTAGAAATCGAT	74525

AL805917.3	301	AACTTCAACAAATGAGAGAGAGGTCAGCTGTAAGGTAAGAACCAAGAAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74526	AACTTCAACAAATGAGAGAGAGGTCAGCTGTAAGGTAAGAACCAAGAAGG	74575

AL805917.3	351	GCCCACTGGATTTGGCGTGGAGCAAAGGGATGGAGTGAGTGGAGTAAAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74576	GCCCACTGGATTTGGCGTGGAGCAAAGGGATGGAGTGAGTGGAGTAAAAG	74625

AL805917.3	401	CGAAGATGGAAGGTGGATTTCAGTGGTGCCAGAGGGGAATGGTAGTAAGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74626	CGAAGATGGAAGGTGGATTTCAGTGGTGCCAGAGGGGAATGGTAGTAAGG	74675

AL805917.3	451	AGAGCGTAGTGGACATGGAGATGTGCTGCTCAGATCTCCCCCAAGGAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74676	AGAGCGTAGTGGACATGGAGATGTGCTGCTCAGATCTCCCCCAAGGAAGG	74725

AL805917.3	501	ACTTGTTGCCCAGCTATGGGAGAGCAGTCAGCAGACAGCCTCCAGCCATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74726	ACTTGTTGCCCAGCTATGGGAGAGCAGTCAGCAGACAGCCTCCAGCCATC	74775

AL805917.3	551	AGCTCCTTCAGGGTCCCCTGGCTGCAAAGAGCTGCCTGGTCCCTCTTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74776	AGCTCCTTCAGGGTCCCCTGGCTGCAAAGAGCTGCCTGGTCCCTCTTCCT	74825

AL805917.3	601	GGTCACACCCTTTCTCCTGGCAGCTCCATGTGGTGACTAAGCAGGGCTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74826	GGTCACACCCTTTCTCCTGGCAGCTCCATGTGGTGACTAAGCAGGGCTGG	74875

AL805917.3	651	ATATAAATGCCTGGCTCTTTCAGTTCAACTTGCTTTGCTTTGATAGACAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74876	ATATAAATGCCTGGCTCTTTCAGTTCAACTTGCTTTGCTTTGATAGACAA	74925

AL805917.3	701	TACTGCCCCAAGCTCTCTGCAGAGTTATGAGAGGTGTGGTTGGGCCTGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74926	TACTGCCCCAAGCTCTCTGCAGAGTTATGAGAGGTGTGGTTGGGCCTGCA	74975

AL805917.3	751	GCTCAGTTTAACTTCTCCCTCTGCCCACTCCTGCTTCCTTGCCCTTATTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	74976	GCTCAGTTTAACTTCTCCCTCTGCCCACTCCTGCTTCCTTGCCCTTATTC	75025

AL805917.3	801	ACAGGTGTTAATACCTAATTAACATCTTGCATCCCAACTTTATCTCAGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75026	ACAGGTGTTAATACCTAATTAACATCTTGCATCCCAACTTTATCTCAGTA	75075

AL805917.3	851	TCTGTTTCCAGAGAACATGGTCTCCAACAGAATCATGGGAACAAGTCTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75076	TCTGTTTCCAGAGAACATGGTCTCCAACAGAATCATGGGAACAAGTCTTC	75125

AL805917.3	901	TGAAGAGTTTGAGAGCAGGAGTCGAGGGACGGGAAGGAGGTGTTAAAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75126	TGAAGAGTTTGAGAGCAGGAGTCGAGGGACGGGAAGGAGGTGTTAAAAAA	75175

AL805917.3	951	TTAGTAGGGAATGGTGACACGCCTATAGTCCTAGCTATTGGGAGGCTAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75176	TTAGTAGGGAATGGTGACACGCCTATAGTCCTAGCTATTGGGAGGCTAAG	75225

AL805917.3	1001	GTGAAAGGATCACTTGAGCTTAGGGGTGACTATACTCAGCTCTTCTCGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75226	GTGAAAGGATCACTTGAGCTTAGGGGTGACTATACTCAGCTCTTCTCGGG	75275

AL805917.3	1051	GCTCACGAAACACTTTACAAAACATCTTTCTGTATCTCATTTGAGGGTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75276	GCTCACGAAACACTTTACAAAACATCTTTCTGTATCTCATTTGAGGGTTT	75325

AL805917.3	1101	TTGCCTACAGTCATTGCCAAGGCCACTTATCTGTAGTTTTCTTTTCTTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75326	TTGCCTACAGTCATTGCCAAGGCCACTTATCTGTAGTTTTCTTTTCTTTT	75375

AL805917.3	1151	TTATTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75376	TTATTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGG	75425

AL805917.3	1201	CCTGATCTTGGCTCACTGCAAGCCTTGACTTCCTGGGCTCAAGTGATCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75426	CCTGATCTTGGCTCACTGCAAGCCTTGACTTCCTGGGCTCAAGTGATCCT	75475

AL805917.3	1251	CCTGCCTCAGTCCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCACAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75476	CCTGCCTCAGTCCCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCACAC	75525

AL805917.3	1301	CTGGCTAATTTTTTTTTTTTTCTTGAGATGGAGTTTTTGCTCTTGTTGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75526	CTGGCTAATTTTTTTTTTTTTCTTGAGATGGAGTTTTTGCTCTTGTTGCC	75575

AL805917.3	1351	CAGGCTGGAGTGTGATGGCACGATCTCGGCTCACTGCAGACTCCACCATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75576	CAGGCTGGAGTGTGATGGCACGATCTCGGCTCACTGCAGACTCCACCATC	75625

AL805917.3	1401	CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75626	CAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA	75675

AL805917.3	1451	GGCATGCGCCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75676	GGCATGCGCCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG	75725

AL805917.3	1501	TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75726	TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATAT	75775

AL805917.3	1551	GCCTGCCGCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75776	GCCTGCCGCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTG	75825

AL805917.3	1601	CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGATGGGGTTTTGCCCAGGCTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75826	CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGATGGGGTTTTGCCCAGGCTCA	75875

AL805917.3	1651	TCTCAAACTCCTGAACTCAAGTAATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75876	TCTCAAACTCCTGAACTCAAGTAATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTG	75925

AL805917.3	1701	CTAGGATTACAGGCGTGAGCCCCCACACCTGGCCTGATCTGTGCTTTTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75926	CTAGGATTACAGGCGTGAGCCCCCACACCTGGCCTGATCTGTGCTTTTCA	75975

AL805917.3	1751	ACATTCATCTTTTTTTCCATCTTTGGGAATCAGAGCCACACAATCTCCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	75976	ACATTCATCTTTTTTTCCATCTTTGGGAATCAGAGCCACACAATCTCCAA	76025

AL805917.3	1801	CTTCTAATACCTTTCTGCCTCTTTGTGATTTCTCAGAGATCGTTGATAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	76026	CTTCTAATACCTTTCTGCCTCTTTGTGATTTCTCAGAGATCGTTGATAGT	76075

AL805917.3	1851	GACTTGGAGATACTCTCAGTTAATTTTTATTTTGGTACTTAGGAATGTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	76076	GACTTGGAGATACTCTCAGTTAATTTTTATTTTGGTACTTAGGAATGTAA	76125

AL805917.3	1901	TCCATTCAGACCAGGAGGTTTGAACACATTTGGAGCAGCTACTCTTGCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	76126	TCCATTCAGACCAGGAGGTTTGAACACATTTGGAGCAGCTACTCTTGCTG	76175

AL805917.3	1951	TTATTATTATTTTTTTCAGGTGTTATGGTGATTCCCACTTAGCAGTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773551.4	76176	TTATTATTATTTTTTTCAGGTGTTATGGTGATTCCCACTTAGCAGTGGCC	76225

Overview

Query
AL805917.3 - 65373 bps
Hit
AL773551.4 - 76225 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link