<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845458.9	1	TTTTTGTATTTGCTTGCAGAGACAGGGTTTCGCCAGGCTGGTCTCAAATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111389	TTTTTGTATTTGCTTGCAGAGACAGGGTTTCGCCAGGCTGGTCTCAAATT	111438

AL845458.9	51	CCTGACCTCAAGTGATCCACCCACTTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111439	CCTGACCTCAAGTGATCCACCCACTTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTA	111488

AL845458.9	101	CAGGCGTGAGACACCGTGCCCAGCAAAAATATTTTTATTTTAAAATTTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111489	CAGGCGTGAGACACCGTGCCCAGCAAAAATATTTTTATTTTAAAATTTAT	111538

AL845458.9	151	TAAATTTATTAAAATTTTATTTTAAAATTTCACCATTTACAAAAAGTGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111539	TAAATTTATTAAAATTTTATTTTAAAATTTCACCATTTACAAAAAGTGAA	111588

AL845458.9	201	ATGATCAGATCTTTAGCAAATCCATCAATGAATTTTGACAAGTACATGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111589	ATGATCAGATCTTTAGCAAATCCATCAATGAATTTTGACAAGTACATGTC	111638

AL845458.9	251	ACCCACACCCCTGTCAAGATATAGAAAGTTCTCTTTGCCCTCTTTGATTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111639	ACCCACACCCCTGTCAAGATATAGAAAGTTCTCTTTGCCCTCTTTGATTC	111688

AL845458.9	301	TGCCCTACCCCTGAGTAGCCATGGATCTGATGACTATCACTATAGAGCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111689	TGCCCTACCCCTGAGTAGCCATGGATCTGATGACTATCACTATAGAGCAG	111738

AL845458.9	351	TTTTTCCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTACTCTGCCACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111739	TTTTTCCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTACTCTGCCACC	111788

AL845458.9	401	CAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111789	CAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCC	111838

AL845458.9	451	TGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAGTACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111839	TGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAGTACA	111888

AL845458.9	501	GGTGTGAGCCACCATGACTGGCTAATTTTGTACTTCCAGTAGAGATGGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111889	GGTGTGAGCCACCATGACTGGCTAATTTTGTACTTCCAGTAGAGATGGGG	111938

AL845458.9	551	TTTCGCTATGTTCACCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111939	TTTCGCTATGTTCACCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCC	111988

AL845458.9	601	ACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	111989	ACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTG	112038

AL845458.9	651	CTGGGCTGCCTGTTTTAAAACTTCCTATAAATGCATGCATAGGTATGGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112039	CTGGGCTGCCTGTTTTAAAACTTCCTATAAATGCATGCATAGGTATGGCC	112088

AL845458.9	701	TCTTTTGTGTCTGGCTTTTTGTATTTGGCATAATATCTATGTAATCCATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112089	TCTTTTGTGTCTGGCTTTTTGTATTTGGCATAATATCTATGTAATCCATC	112138

AL845458.9	751	CATGTTGTTGCACCTATAAGTAGTTCATTCTTTCTTTAAAAAAAAATTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112139	CATGTTGTTGCACCTATAAGTAGTTCATTCTTTCTTTAAAAAAAAATTTT	112188

AL845458.9	801	TTTTTTAAATTTTGAGAGAGTCTCACTGTCTTAGGCTGCAGTGCAGTGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112189	TTTTTTAAATTTTGAGAGAGTCTCACTGTCTTAGGCTGCAGTGCAGTGGT	112238

AL845458.9	851	GAGATCTCAGGTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTACAAGCATTTCTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112239	GAGATCTCAGGTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTACAAGCATTTCTTC	112288

AL845458.9	901	TGCCTCAGCCCCCTGAGTAGCTGGAACTACAGGTGTGTGCACCACCACGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112289	TGCCTCAGCCCCCTGAGTAGCTGGAACTACAGGTGTGTGCACCACCACGC	112338

AL845458.9	951	CTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGATTTCCCAGCTACTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112339	CTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGATTTCCCAGCTACTCCA	112388

AL845458.9	1001	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGCAGAGGTTGCAGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112389	GAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGCAGAGGTTGCAGTA	112438

AL845458.9	1051	AGCCGAGATCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGCGGCAAGAGTGAAACTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112439	AGCCGAGATCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGCGGCAAGAGTGAAACTC	112488

AL845458.9	1101	TGTCTCAAAAAAAAGCCAGGTGTTGTGGCTCACACCTGTGGTCCCAGCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112489	TGTCTCAAAAAAAAGCCAGGTGTTGTGGCTCACACCTGTGGTCCCAGCTG	112538

AL845458.9	1151	GTGGGGAGCCCAAGAGTTCAAGCCTTCAGTGAGTGGTAGTCATACTAGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112539	GTGGGGAGCCCAAGAGTTCAAGCCTTCAGTGAGTGGTAGTCATACTAGTA	112588

AL845458.9	1201	TACCCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCTTGTCTCAGAAAGAAAAAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112589	TACCCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAAACCTTGTCTCAGAAAGAAAAAAAA	112638

AL845458.9	1251	AAACAAGATGAAGGAAAGCATATGTAGTTTGCTAAAATTTATGTGGAAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112639	AAACAAGATGAAGGAAAGCATATGTAGTTTGCTAAAATTTATGTGGAAAG	112688

AL845458.9	1301	AGGGAAATTATATGTATATACACACACACTTATATTTGCTTGCATATGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112689	AGGGAAATTATATGTATATACACACACACTTATATTTGCTTGCATATGCA	112738

AL845458.9	1351	TAAAACGTCTAAGTTTGTTTGTTTTTTTTGGGACAGAATCTGACTGTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112739	TAAAACGTCTAAGTTTGTTTGTTTTTTTTGGGACAGAATCTGACTGTCAC	112788

AL845458.9	1401	CCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112789	CCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTC	112838

AL845458.9	1451	CCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGATTACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112839	CCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGATTACA	112888

AL845458.9	1501	GCCTTCTGCCACCATGCCCACTAATGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112889	GCCTTCTGCCACCATGCCCACTAATGTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG	112938

AL845458.9	1551	GTTTTGCCATGTTTTCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTTACCTCAGGTGATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112939	GTTTTGCCATGTTTTCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTTACCTCAGGTGATC	112988

AL845458.9	1601	CGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGGGCCACCAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	112989	CGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGGGCCACCAA	113038

AL845458.9	1651	GCCCGAACAAATGTCTTAAGTTTGTTTTCTTTCTTTCTTTAATTAATTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113039	GCCCGAACAAATGTCTTAAGTTTGTTTTCTTTCTTTCTTTAATTAATTAA	113088

AL845458.9	1701	TTTATTTATTTATTTTTCGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113089	TTTATTTATTTATTTTTCGAGACGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCCAGGCTG	113138

AL845458.9	1751	GAGTGCAATGGCAAGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113139	GAGTGCAATGGCAAGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTC	113188

AL845458.9	1801	AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGATGCCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113189	AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGATGCCC	113238

AL845458.9	1851	ACCACCACACCCGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113239	ACCACCACACCCGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGGTTTCA	113288

AL845458.9	1901	TCATGTTGGCCAGGCTGGCCTCGAACTCTTGACCTTGTAATCCACCTGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113289	TCATGTTGGCCAGGCTGGCCTCGAACTCTTGACCTTGTAATCCACCTGCT	113338

AL845458.9	1951	TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATCACAGGCTTGAGCCACTGCACCCGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773544.5	113339	TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATCACAGGCTTGAGCCACTGCACCCGGCC	113388

Overview

Query
AL845458.9 - 14168 bps
Hit
AL773544.5 - 113388 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link