<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL844203.3	1	GTGATGAAGAATGATGATAATCATTTTGACTACTTACAAATTAAAAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86075	GTGATGAAGAATGATGATAATCATTTTGACTACTTACAAATTAAAAAAAA	86124

AL844203.3	51	TCTCTTTGGCATCCACAAACACAGAAATGTACAAACACTTTCCCATAATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86125	TCTCTTTGGCATCCACAAACACAGAAATGTACAAACACTTTCCCATAATC	86174

AL844203.3	101	AACCTCAAAGACATGTAAACAGTTGATGGACAAAATAGTAACAATGTGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86175	AACCTCAAAGACATGTAAACAGTTGATGGACAAAATAGTAACAATGTGTT	86224

AL844203.3	151	AATACCCTTCAGCCCAAGGCCACCTGGAGCACATCTGTGGGTGAAGAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86225	AATACCCTTCAGCCCAAGGCCACCTGGAGCACATCTGTGGGTGAAGAAGT	86274

AL844203.3	201	TGGGTTTATTACTCACTGCAGTGGGAGGGAGAATGCACACCTTGGATAAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86275	TGGGTTTATTACTCACTGCAGTGGGAGGGAGAATGCACACCTTGGATAAC	86324

AL844203.3	251	TACCGAGTATCTTGGTAAGTGCCTTTTAGATAGAGCCTATTATAATATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86325	TACCGAGTATCTTGGTAAGTGCCTTTTAGATAGAGCCTATTATAATATTT	86374

AL844203.3	301	GGGCTTCAGCTGGTATTTCAAGTTTCCCTGGGATTTAATTAATTAGTAGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86375	GGGCTTCAGCTGGTATTTCAAGTTTCCCTGGGATTTAATTAATTAGTAGT	86424

AL844203.3	351	TATGACTGAATGATGACACAGAGAGGTCTATGCCACTGAAAAAAGAGTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86425	TATGACTGAATGATGACACAGAGAGGTCTATGCCACTGAAAAAAGAGTTT	86474

AL844203.3	401	ATTACCCACTGACATAGGAAGCACAGCACAACAGGCAGCACCAAGGCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86475	ATTACCCACTGACATAGGAAGCACAGCACAACAGGCAGCACCAAGGCTGG	86524

AL844203.3	451	TCAAGTGGCAACGGGAGGGGAAAGCATGGGCGAGAGCCTCTAATGTGGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86525	TCAAGTGGCAACGGGAGGGGAAAGCATGGGCGAGAGCCTCTAATGTGGTT	86574

AL844203.3	501	TTTAGGGGAATGAATGAGCAAGGCAGGGTAAGCAGTGTAGACATGTTCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86575	TTTAGGGGAATGAATGAGCAAGGCAGGGTAAGCAGTGTAGACATGTTCAG	86624

AL844203.3	551	TATTGATGAGTCTGAATAATCTTGGTGACTCTGAGGCATAGGGATTGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86625	TATTGATGAGTCTGAATAATCTTGGTGACTCTGAGGCATAGGGATTGTCT	86674

AL844203.3	601	CTAGTTGTCTGATACCTGTCTCTCAGATTATTAAGACAGGAGAATATTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86675	CTAGTTGTCTGATACCTGTCTCTCAGATTATTAAGACAGGAGAATATTGA	86724

AL844203.3	651	CTGGGAGTATCGGGGCCATGTGACAGCCAGAAAAAAAGAACTCATTCTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86725	CTGGGAGTATCGGGGCCATGTGACAGCCAGAAAAAAAGAACTCATTCTGA	86774

AL844203.3	701	GTTTGGGCTCTGGTTTGGTTAGTTTGCATAAGAAAGGCGCATTTGCGGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86775	GTTTGGGCTCTGGTTTGGTTAGTTTGCATAAGAAAGGCGCATTTGCGGTC	86824

AL844203.3	751	AATCCCTTTAGTATCTGTAGGAATAGACTAGTCTTGGGAGGGGAGTCCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86825	AATCCCTTTAGTATCTGTAGGAATAGACTAGTCTTGGGAGGGGAGTCCTC	86874

AL844203.3	801	ACAATCAGTGAGGACTCAGATGCCAGAGCATGAGAATAAGGAAAAAAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86875	ACAATCAGTGAGGACTCAGATGCCAGAGCATGAGAATAAGGAAAAAAAGA	86924

AL844203.3	851	AAATACAGATAACACAGTTGAGAAATTCTATTTTATTTTATTGCTCTAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86925	AAATACAGATAACACAGTTGAGAAATTCTATTTTATTTTATTGCTCTAGA	86974

AL844203.3	901	TTGAGTACTGTCAGTAAGCAGAGGCAATTCTACAATTCGGTATTTCAATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	86975	TTGAGTACTGTCAGTAAGCAGAGGCAATTCTACAATTCGGTATTTCAATA	87024

AL844203.3	951	AATCTTACCTTTAGGGAGGGTGGACTAGAGTGCAGATAAAGCTCAATCCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87025	AATCTTACCTTTAGGGAGGGTGGACTAGAGTGCAGATAAAGCTCAATCCG	87074

AL844203.3	1001	TAGAGAAGCATCAGCCACTCATACTAGCCGGGAGAGGGTTTAGACAAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87075	TAGAGAAGCATCAGCCACTCATACTAGCCGGGAGAGGGTTTAGACAAAAT	87124

AL844203.3	1051	TATGAAGTACTTTTGTTTCGCCTCACTTTCTCATGGGCTGAGAGTGATCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87125	TATGAAGTACTTTTGTTTCGCCTCACTTTCTCATGGGCTGAGAGTGATCC	87174

AL844203.3	1101	AGTGTGGTGTTGGTATTTTGTGATATAATTTATGTCCCAGAGGGACTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87175	AGTGTGGTGTTGGTATTTTGTGATATAATTTATGTCCCAGAGGGACTAAT	87224

AL844203.3	1151	ATGGCCCAGTAGTGAAGACCAGACCAGCTCCTGGCAACATTGATGCCCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87225	ATGGCCCAGTAGTGAAGACCAGACCAGCTCCTGGCAACATTGATGCCCAG	87274

AL844203.3	1201	CTGTGCCAGACAAGTTCCCAGATATTAGGGGCTGCTTTTTCTTGATTAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87275	CTGTGCCAGACAAGTTCCCAGATATTAGGGGCTGCTTTTTCTTGATTAAA	87324

AL844203.3	1251	TTCAATATTTAAAAATATCAGCATTACGTTTGAGAAATGATTAAGAAATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87325	TTCAATATTTAAAAATATCAGCATTACGTTTGAGAAATGATTAAGAAATG	87374

AL844203.3	1301	TCATATAGTTATATTAGTAATAAATATGTGCAAAAAATAAGAATGTAGAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87375	TCATATAGTTATATTAGTAATAAATATGTGCAAAAAATAAGAATGTAGAC	87424

AL844203.3	1351	TACAAAATGGGAACCAGAATTAAAATCCATCAGCTTGGCAAAGACAGAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87425	TACAAAATGGGAACCAGAATTAAAATCCATCAGCTTGGCAAAGACAGAAG	87474

AL844203.3	1401	TAAATGATGGTAGTATTGATCAGAGTACAGGGAAAATGTACTGTTACGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87475	TAAATGATGGTAGTATTGATCAGAGTACAGGGAAAATGTACTGTTACGAA	87524

AL844203.3	1451	GACTGATGGCATTGAAAAGTGGTACAAAACTTCTAAAGGGCACTTTTGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87525	GACTGATGGCATTGAAAAGTGGTACAAAACTTCTAAAGGGCACTTTTGCA	87574

AL844203.3	1501	AAATGTCTCAATAATTTAAATGTTCTGACGTTTTTGAGACAGAGTCTTGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87575	AAATGTCTCAATAATTTAAATGTTCTGACGTTTTTGAGACAGAGTCTTGC	87624

AL844203.3	1551	TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGACTTATTGAAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87625	TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGACTTATTGAAGCC	87674

AL844203.3	1601	TCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGCGTAGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87675	TCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGCGTAGCT	87724

AL844203.3	1651	GGGACTACAGGTGCGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87725	GGGACTACAGGTGCGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGT	87774

AL844203.3	1701	AGAAATGGGGTTTCACCATGATGGCCAGGCTCATCTCAAATCCTTGACCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87775	AGAAATGGGGTTTCACCATGATGGCCAGGCTCATCTCAAATCCTTGACCT	87824

AL844203.3	1751	CAAGTGATCCACCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87825	CAAGTGATCCACCCGCCTTGGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTG	87874

AL844203.3	1801	AGGGATTGCGCCGGGCCTAAGTGTTCTGACATTTTGACATGAAAATTTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87875	AGGGATTGCGCCGGGCCTAAGTGTTCTGACATTTTGACATGAAAATTTCT	87924

AL844203.3	1851	CTTTTAGGAATTTATCCCAAGGAAATAATTACATATCTTTCTAAAAACGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87925	CTTTTAGGAATTTATCCCAAGGAAATAATTACATATCTTTCTAAAAACGC	87974

AL844203.3	1901	ATATATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	87975	ATATATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG	88024

AL844203.3	1951	AGGCCGAGGCAGGTGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL773535.8	88025	AGGCCGAGGCAGGTGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCC	88074

Overview

Query
AL844203.3 - 49925 bps
Hit
AL773535.8 - 88074 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link