<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662884.11	1	GAATTCATGAATGCAGGCTCCAACGGCAGGTGAGGCTGGACAAGGGATAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	4880	GAATTCATGAATGCAGGCTCCAACGGCAGGTGAGGCTGGACAAGGGATAG	4929

AL662884.11	51	GTGTCCCGTGGCCCCAGCCCACACTACCTGTGGTGGTGATGAAGGCGTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	4930	GTGTCCCGTGGCCCCAGCCCACACTACCTGTGGTGGTGATGAAGGCGTAG	4979

AL662884.11	101	GACTTGGAGGTCTGCCCCGCCCGCACCCCGTGGACCTCCACGTGGTAGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	4980	GACTTGGAGGTCTGCCCCGCCCGCACCCCGTGGACCTCCACGTGGTAGGT	5029

AL662884.11	151	GGTGCCGGGCCTGAGGTCGGGCAGGCTGACGGTGCGCGTGGTGCCCGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5030	GGTGCCGGGCCTGAGGTCGGGCAGGCTGACGGTGCGCGTGGTGCCCGGCA	5079

AL662884.11	201	CAGTCAGCTCACCGCCGGGGCCCTCTGCAGGCGGCTGAGGCCGCCAGCGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5080	CAGTCAGCTCACCGCCGGGGCCCTCTGCAGGCGGCTGAGGCCGCCAGCGC	5129

AL662884.11	251	AGCACCACGCGCTCGAACTGGCCGCGGAGCCCGTCGAGAGACACGAGAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5130	AGCACCACGCGCTCGAACTGGCCGCGGAGCCCGTCGAGAGACACGAGAAG	5179

AL662884.11	301	CGCGCCATCGGCGGAACTGCCCAGCACCTCTGGCTTGGGGTGGCGGGACG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5180	CGCGCCATCGGCGGAACTGCCCAGCACCTCTGGCTTGGGGTGGCGGGACG	5229

AL662884.11	351	CAGCCACCCGGTCGACGCCTTCAGGCGAGAGGCCGTAGATTCCCTGGTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5230	CAGCCACCCGGTCGACGCCTTCAGGCGAGAGGCCGTAGATTCCCTGGTTG	5279

AL662884.11	401	GAGTCCCGTTTCCTGGTGCCGGGATCAGGGCTGGCGGTGGGGCGGGGGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5280	GAGTCCCGTTTCCTGGTGCCGGGATCAGGGCTGGCGGTGGGGCGGGGGTG	5329

AL662884.11	451	GCGGGGCGGGGGTGCGGGGGAGCCGGCTGGGGCGGCGGCCAACAGACGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5330	GCGGGGCGGGGGTGCGGGGGAGCCGGCTGGGGCGGCGGCCAACAGACGCC	5379

AL662884.11	501	GCTGCAAGTATTCATGGATGTGGCGCGCCACCGACGTGTAAGTCTGGTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5380	GCTGCAAGTATTCATGGATGTGGCGCGCCACCGACGTGTAAGTCTGGTTG	5429

AL662884.11	551	GCCCGCAGTGGGTAGCCGTGAGCCCGCAGGTGGCGCTCCAGGTCCTGCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5430	GCCCGCAGTGGGTAGCCGTGAGCCCGCAGGTGGCGCTCCAGGTCCTGCAC	5479

AL662884.11	601	CGTGCCGCGGAAACGGCTCAGCTCGGCCGTCAGGTTGCCCCAAGGCCGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5480	CGTGCCGCGGAAACGGCTCAGCTCGGCCGTCAGGTTGCCCCAAGGCCGCC	5529

AL662884.11	651	GTGGGGGCTGGGACAGGCTTGGCCTGGGCGGGGACTCCTCCTCCCTTTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5530	GTGGGGGCTGGGACAGGCTTGGCCTGGGCGGGGACTCCTCCTCCCTTTCC	5579

AL662884.11	701	TCTGCTGGCCTCGAGGGCCAAGGGGGCCGTGGGGGCCGCGGGGCTGGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5580	TCTGCTGGCCTCGAGGGCCAAGGGGGCCGTGGGGGCCGCGGGGCTGGGGC	5629

AL662884.11	751	TGGCCGGGGCCGGGACTTGGGGGGCGGGGCTGGGGGGCGCACCTCCGGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5630	TGGCCGGGGCCGGGACTTGGGGGGCGGGGCTGGGGGGCGCACCTCCGGGT	5679

AL662884.11	801	AACTGTAGTGGCCTGGTGCTGCCAGGGGCAAAAAAGGGGAGAACAGGTCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5680	AACTGTAGTGGCCTGGTGCTGCCAGGGGCAAAAAAGGGGAGAACAGGTCA	5729

AL662884.11	851	GTGGCAGCTCCCTCCCGGCACTCCTTCCCGCGGCAGCCCCTCCCTCGATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5730	GTGGCAGCTCCCTCCCGGCACTCCTTCCCGCGGCAGCCCCTCCCTCGATC	5779

AL662884.11	901	CCTCCCACCAGAGCCAGAGGCCTCTTCCCTGTGCCCCAGCCCCACCTGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5780	CCTCCCACCAGAGCCAGAGGCCTCTTCCCTGTGCCCCAGCCCCACCTGGA	5829

AL662884.11	951	AAGAGAACGGAGGGAAATCGGTCAGTGTCCCGCAGCCCCCCCATTCCCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5830	AAGAGAACGGAGGGAAATCGGTCAGTGTCCCGCAGCCCCCCCATTCCCCT	5879

AL662884.11	1001	CCAAGCCCACCACTGTTGGTGCCCTAGAAAGAAGAGAGAAGCCCGTGGGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5880	CCAAGCCCACCACTGTTGGTGCCCTAGAAAGAAGAGAGAAGCCCGTGGGT	5929

AL662884.11	1051	GGGGCCCTGTAGCTGAAGGAGAGAAAGGGGAGTCGGGGAAGAGAACATGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5930	GGGGCCCTGTAGCTGAAGGAGAGAAAGGGGAGTCGGGGAAGAGAACATGA	5979

AL662884.11	1101	GCTACAGCGAGGTGGGTGTCCCCCTGTCACAGGAAAAGAAAAATATCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	5980	GCTACAGCGAGGTGGGTGTCCCCCTGTCACAGGAAAAGAAAAATATCCAG	6029

AL662884.11	1151	GTATCTGTTAAGAAACCTCGAGGTTTAGTGGAAAATCACTGCTGTGAGAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6030	GTATCTGTTAAGAAACCTCGAGGTTTAGTGGAAAATCACTGCTGTGAGAC	6079

AL662884.11	1201	CCACCTCCCAGCAATCCCAATCCAAAAGTCAACAGGACTGATGATCTCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6080	CCACCTCCCAGCAATCCCAATCCAAAAGTCAACAGGACTGATGATCTCTA	6129

AL662884.11	1251	ATCTGCCTAATTCCAGTCCCACAAGATCTATCAGCACAAGGCCTGTCCCG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6130	ATCTGCCTAATTCCAGTCCCACAAGATCTATCAGCACAAGGCCTGTCCCG	6179

AL662884.11	1301	GTACCTAAATTTAAAAAAGAACCTCCCTTAACTGACTGGATCAGGCAGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6180	GTACCTAAATTTAAAAAAGAACCTCCCTTAACTGACTGGATCAGGCAGCA	6229

AL662884.11	1351	TCTCCTATTCACTTCTCTCCCTGGGGCCATTCCTTTCATAGGCTAACCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6230	TCTCCTATTCACTTCTCTCCCTGGGGCCATTCCTTTCATAGGCTAACCTG	6279

AL662884.11	1401	TAATAACCTTCCTACAGGACTCCAGGCATCTGAGGGCTCTGTCTCCCCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6280	TAATAACCTTCCTACAGGACTCCAGGCATCTGAGGGCTCTGTCTCCCCAG	6329

AL662884.11	1451	TGGCCTCAGGACAGAGCAAGGCCCCCAGCAGGTGCCTCGAGACTGCCACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6330	TGGCCTCAGGACAGAGCAAGGCCCCCAGCAGGTGCCTCGAGACTGCCACA	6379

AL662884.11	1501	CACCTGCCAGAAGCATTCAGAGGAGTCTGTGAGCCCTGAGCCTGGGCTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6380	CACCTGCCAGAAGCATTCAGAGGAGTCTGTGAGCCCTGAGCCTGGGCTCC	6429

AL662884.11	1551	TGAGGAGGAGGATCCAAGGCTGGGAAACCAGGGCCCTTCCCTAACCTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6430	TGAGGAGGAGGATCCAAGGCTGGGAAACCAGGGCCCTTCCCTAACCTCTG	6479

AL662884.11	1601	GCCAGCCATACCTGTGTTGGCCCTGACAGAAGCTGGGTAGCTGACTGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6480	GCCAGCCATACCTGTGTTGGCCCTGACAGAAGCTGGGTAGCTGACTGCCC	6529

AL662884.11	1651	GGCCCCGCTCCGCTGTGACAGTCACCACATATTCTACGCCTGGCATCAGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6530	GGCCCCGCTCCGCTGTGACAGTCACCACATATTCTACGCCTGGCATCAGG	6579

AL662884.11	1701	TCAGTCAGCAGCGTCCCGTCTGCTTCAGGGGGCACTTCCAGCCTCACCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6580	TCAGTCAGCAGCGTCCCGTCTGCTTCAGGGGGCACTTCCAGCCTCACCCT	6629

AL662884.11	1751	CTGGTTGCCGGCACTGACGTAGGACACCACAAATCGGTCCACCTCAGCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6630	CTGGTTGCCGGCACTGACGTAGGACACCACAAATCGGTCCACCTCAGCCT	6679

AL662884.11	1801	GGGGACGCAGCCAGCCAAGCTCCAGTGTTGTCGGTGTCACAGCCACCACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6680	GGGGACGCAGCCAGCCAAGCTCCAGTGTTGTCGGTGTCACAGCCACCACT	6729

AL662884.11	1851	CGGAGGTCCTGGGGCCCATCGATCACTAGCCAGGTTAAAGAGGAGGACTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6730	CGGAGGTCCTGGGGCCCATCGATCACTAGCCAGGTTAAAGAGGAGGACTC	6779

AL662884.11	1901	AGGTGGGTGTCTGGTTCTTCAATCATCATCTTTCCTTCCAAGAGCCTAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6780	AGGTGGGTGTCTGGTTCTTCAATCATCATCTTTCCTTCCAAGAGCCTAGC	6829

AL662884.11	1951	CCCCATCCAGCCCCTTCCTTCTGCCCTCCCGGAGGGCAGATTCCCTCTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772248.5	6830	CCCCATCCAGCCCCTTCCTTCTGCCCTCCCGGAGGGCAGATTCCCTCTCT	6879

Overview

Query
AL662884.11 - 137935 bps
Hit
AL772248.5 - 6879 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link