<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2584 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX004792.8	1	AAGCTTATTTGTTTGGTCATCTAACACATTTAAAGTTTTTAAGTTTAGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	189948	AAGCTTATTTGTTTGGTCATCTAACACATTTAAAGTTTTTAAGTTTAGTA	189997

BX004792.8	51	GTTTGCTATTTATATAATTATATTTTATTATTTTAAATCTTTTCTCACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	189998	GTTTGCTATTTATATAATTATATTTTATTATTTTAAATCTTTTCTCACTC	190047

BX004792.8	101	ACATCTATTTTCTCCCTCACAGGTTTACAGCTCAACCTCTAAAGTCCCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190048	ACATCTATTTTCTCCCTCACAGGTTTACAGCTCAACCTCTAAAGTCCCAT	190097

BX004792.8	151	ATCTGGCAGAGGAGACTGTGGATCATACAGTTACTACAGTATGCCTTTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190098	ATCTGGCAGAGGAGACTGTGGATCATACAGTTACTACAGTATGCCTTTAG	190147

BX004792.8	201	ATGCCTATACACACATTAAAATGATGTACAGTAAACATTACTAGTAATTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190148	ATGCCTATACACACATTAAAATGATGTACAGTAAACATTACTAGTAATTT	190197

BX004792.8	251	TAACTACAAATTATTTAGTAAATAATCAATTGTCATTTCATGTCATTTAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190198	TAACTACAAATTATTTAGTAAATAATCAATTGTCATTTCATGTCATTTAG	190247

BX004792.8	301	AACATCACCAGTGGAAAAAAAAGGTGTGAATGCATCCTCAAAGCCCCTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190248	AACATCACCAGTGGAAAAAAAAGGTGTGAATGCATCCTCAAAGCCCCTAA	190297

BX004792.8	351	GTGAGGGAGTACATGGTAAGCTATTTTATTTTATTTTTTTAAACATTTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190298	GTGAGGGAGTACATGGTAAGCTATTTTATTTTATTTTTTTAAACATTTTG	190347

BX004792.8	401	TATTTTCCTCTTAAACCAATTCCTCCTTTCACCTTTGATCTTTTGGTAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190348	TATTTTCCTCTTAAACCAATTCCTCCTTTCACCTTTGATCTTTTGGTAAA	190397

BX004792.8	451	TGTTTTATTCTCTTACCTGACTTTTTTAGGATGCTGGGCATGATGAAGCG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190398	TGTTTTATTCTCTTACCTGACTTTTTTAGGATGCTGGGCATGATGAAGCG	190447

BX004792.8	501	CAAACCTTGATGTGCAACACCACCTTATGAATCTACAGTAGTTACATTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190448	CAAACCTTGATGTGCAACACCACCTTATGAATCTACAGTAGTTACATTAA	190497

BX004792.8	551	CATTTAGCGGACTCTTTTGTCTAAAGTGACTTACAATTGAGGACACATTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190498	CATTTAGCGGACTCTTTTGTCTAAAGTGACTTACAATTGAGGACACATTC	190547

BX004792.8	601	AGCAAATCAACAAGAAGAGGCAATACATCCAAGATGTGCTAATTACACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190548	AGCAAATCAACAAGAAGAGGCAATACATCCAAGATGTGCTAATTACACAA	190597

BX004792.8	651	AAAATTGTAAGAATTAAGAATGCTTCTACATGTGGTTTGTCAAGCCCACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190598	AAAATTGTAAGAATTAAGAATGCTTCTACATGTGGTTTGTCAAGCCCACA	190647

BX004792.8	701	CACCTGTGTGAAGCAGACTTCATGCACAATGTTTTGTTTTTTGTTTTTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190648	CACCTGTGTGAAGCAGACTTCATGCACAATGTTTTGTTTTTTGTTTTTTA	190697

BX004792.8	751	GATATAGGGACTGGTTGTAAGAAAGTGTCTGGTGCAAATGTACATAAATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190698	GATATAGGGACTGGTTGTAAGAAAGTGTCTGGTGCAAATGTACATAAATG	190747

BX004792.8	801	GTGCAAGTGTCAGAGAGATGAATGTGTGTAGCTATTGCATGTTCTGTGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190748	GTGCAAGTGTCAGAGAGATGAATGTGTGTAGCTATTGCATGTTCTGTGAT	190797

BX004792.8	851	GGTTGGTCTAATTTATGGTGTAGTGCTGATCATGTTACTTTGCTTTAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190798	GGTTGGTCTAATTTATGGTGTAGTGCTGATCATGTTACTTTGCTTTAAAA	190847

BX004792.8	901	TGTTAATCTTTCTTTGAACAACATGAAGTGTTATCTGCTTTTTCAGTGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190848	TGTTAATCTTTCTTTGAACAACATGAAGTGTTATCTGCTTTTTCAGTGTA	190897

BX004792.8	951	AAGAAGGTACAGTATAGTTTACAAAGACGACTTAATTTTTCTAAGTATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190898	AAGAAGGTACAGTATAGTTTACAAAGACGACTTAATTTTTCTAAGTATAT	190947

BX004792.8	1001	TTTTGATAAATCATTTGAAGGCAGAATATTATTTTTGAATGTTTTTGTAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190948	TTTTGATAAATCATTTGAAGGCAGAATATTATTTTTGAATGTTTTTGTAA	190997

BX004792.8	1051	TATATGAAAAGTATTATTTTGAAAAGTGTATTTTATGATGTTTTTGTAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	190998	TATATGAAAAGTATTATTTTGAAAAGTGTATTTTATGATGTTTTTGTAAG	191047

BX004792.8	1101	CATATTTTTAAAATAATTTATTGTTTTCAATTTATTTCATAATTGTATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191048	CATATTTTTAAAATAATTTATTGTTTTCAATTTATTTCATAATTGTATTA	191097

BX004792.8	1151	CTATTATTTTAATAGTATTAATATTTTAACGTATTGTAATAAGTGAAGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191098	CTATTATTTTAATAGTATTAATATTTTAACGTATTGTAATAAGTGAAGAT	191147

BX004792.8	1201	ACAGATAAAGACAGTATTTGGATTTTGATAATCATTTTATTGCTGGAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191148	ACAGATAAAGACAGTATTTGGATTTTGATAATCATTTTATTGCTGGAAAA	191197

BX004792.8	1251	TGTGTAAAACTGTAAAAATGCTATTGAATAAACTCAATGAAACGGAAACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191198	TGTGTAAAACTGTAAAAATGCTATTGAATAAACTCAATGAAACGGAAACT	191247

BX004792.8	1301	GTTTTTTTTATTTGGTTAAACATAACAATATCAATTTTAGAATAATTGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191248	GTTTTTTTTATTTGGTTAAACATAACAATATCAATTTTAGAATAATTGAA	191297

BX004792.8	1351	CTTAAATAACTACATTGATTAAAGCTAAATTATAAATGTTATGTTGATTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191298	CTTAAATAACTACATTGATTAAAGCTAAATTATAAATGTTATGTTGATTG	191347

BX004792.8	1401	AACTAAACAACATTACATTACCTTTATGTAACTAACTTAAGTTCACTAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191348	AACTAAACAACATTACATTACCTTTATGTAACTAACTTAAGTTCACTAAA	191397

BX004792.8	1451	ATTAATATTCTTTCTTAAAGGTAACTTAACTCTGTTACGTGGAACCAGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191398	ATTAATATTCTTTCTTAAAGGTAACTTAACTCTGTTACGTGGAACCAGTG	191447

BX004792.8	1501	GACAAAAAAAAGTTAATTAACGCCAACATATCATTTTTTTGAGTGTAATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191448	GACAAAAAAAAGTTAATTAACGCCAACATATCATTTTTTTGAGTGTAATC	191497

BX004792.8	1551	GGTATTGTCTGAAAGCACTCGGTTCCTTCCTGATGGCTGCTAAAAATGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191498	GGTATTGTCTGAAAGCACTCGGTTCCTTCCTGATGGCTGCTAAAAATGCA	191547

BX004792.8	1601	TTAGCATTTCAGACAGCTGCAGTTCAAGCAATAACCGAGCTTCTGCATCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191548	TTAGCATTTCAGACAGCTGCAGTTCAAGCAATAACCGAGCTTCTGCATCG	191597

BX004792.8	1651	GAATGGGCCCCTAGACTGCAGCTATCAAAACAGCATTGCACACCGCTCAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191598	GAATGGGCCCCTAGACTGCAGCTATCAAAACAGCATTGCACACCGCTCAC	191647

BX004792.8	1701	TGCACCAATAAACACTGTTTTAGTATATGCAATGGGGCATGAGACAGGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191648	TGCACCAATAAACACTGTTTTAGTATATGCAATGGGGCATGAGACAGGAA	191697

BX004792.8	1751	TGTGTGTTGTATGACAGAAAGAAAAAAGTGCGAAGCAAGTACAGATAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191698	TGTGTGTTGTATGACAGAAAGAAAAAAGTGCGAAGCAAGTACAGATAAGA	191747

BX004792.8	1801	GAGATGAGGGCTTGCATGTGTTTTTACGCGACACAGTAAGGGAATGTGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191748	GAGATGAGGGCTTGCATGTGTTTTTACGCGACACAGTAAGGGAATGTGTA	191797

BX004792.8	1851	AAGGGAATACAGGACAAGATGATGTGTGAAAGTAAGAATATAAAAAAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191798	AAGGGAATACAGGACAAGATGATGTGTGAAAGTAAGAATATAAAAAAGGA	191847

BX004792.8	1901	TCTTGTAGAAAAAGCAATAGTGTTAAATCTGAATTCAATCCCTCTCAAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191848	TCTTGTAGAAAAAGCAATAGTGTTAAATCTGAATTCAATCCCTCTCAAAG	191897

BX004792.8	1951	TTCACTACAGTGATTTTGTCTCCATTTTGCCAATATCCCCAAACACACAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191898	TTCACTACAGTGATTTTGTCTCCATTTTGCCAATATCCCCAAACACACAC	191947

BX004792.8	2001	ACACACACACGCACACGCACACACACAGACACAGACATAGACAACTCACA	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191948	ACACACACACGCACACGCACACACACAGACACAGACATAGACAACTCACA	191997

BX004792.8	2051	TACCTCACACTCTTTTTTCTACAATGAGATCAAAACCCAATTACCCAGAA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	191998	TACCTCACACTCTTTTTTCTACAATGAGATCAAAACCCAATTACCCAGAA	192047

BX004792.8	2101	AAACTTGAGAGAAAATTGGGGATTTCTCCAGAGGATTCCAATGGAAGCTG	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192048	AAACTTGAGAGAAAATTGGGGATTTCTCCAGAGGATTCCAATGGAAGCTG	192097

BX004792.8	2151	AGGAGTTAATGGGGGATTTAATGCAGTTTTCCCTGTTCTTTTTCTGCTTG	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192098	AGGAGTTAATGGGGGATTTAATGCAGTTTTCCCTGTTCTTTTTCTGCTTG	192147

BX004792.8	2201	GCTCTCACGTGAAGAGTGATGAGCAGTTATGAAAAGATCAGTCTGACAGA	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192148	GCTCTCACGTGAAGAGTGATGAGCAGTTATGAAAAGATCAGTCTGACAGA	192197

BX004792.8	2251	ACCCATATGAAGTGCTGAATGAAAGAAGGACCGGGAAAAAGAACTCTAAT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192198	ACCCATATGAAGTGCTGAATGAAAGAAGGACCGGGAAAAAGAACTCTAAT	192247

BX004792.8	2301	TACAAAATATATTGGAAAGGAAGAGAGTTTCGTTAAAATAAAGCAGGAAA	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192248	TACAAAATATATTGGAAAGGAAGAGAGTTTCGTTAAAATAAAGCAGGAAA	192297

BX004792.8	2351	CGTCTTGCTTTTCCTGTCTTCTATTGCTTTGTCACTGTTGCTCTAATTTG	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192298	CGTCTTGCTTTTCCTGTCTTCTATTGCTTTGTCACTGTTGCTCTAATTTG	192347

BX004792.8	2401	ACTGTTGTTCTATCCTGTGAAGCCCTGTAGGGTCAAATTCAGTCTTTGCC	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192348	ACTGTTGTTCTATCCTGTGAAGCCCTGTAGGGTCAAATTCAGTCTTTGCC	192397

BX004792.8	2451	TTTGCCTTTTTGGCCTCATTTAACAGATTGGCCTTCACAGCAGTCTTATC	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192398	TTTGCCTTTTTGGCCTCATTTAACAGATTGGCCTTCACAGCAGTCTTATC	192447

BX004792.8	2501	TCTCAATTTCTCTTAAATTGTTTTCTGTTTTATCTTGTCAGTCTGTCAGA	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192448	TCTCAATTTCTCTTAAATTGTTTTCTGTTTTATCTTGTCAGTCTGTCAGA	192497

BX004792.8	2551	GTAAGTCTTTTGGTTCTTTTTGCCTCTGGAATTC	2584
			||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772193.5	192498	GTAAGTCTTTTGGTTCTTTTTGCCTCTGGAATTC	192531

Overview

Query
BX004792.8 - 206371 bps
Hit
AL772193.5 - 192531 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2584 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100247625841258411899481925311
279.312138164056785115758161241
385.56971829176291943-115762159411
484.57992105702857237115852160521
583.12105242194484194725115878161081
686.021352837847878760-117631179091
785.8819936064146773-146435467881
882.471463496648766835-146435467821
984.51114233152102152334146435466601
1086.08132247145779146025-146436466721
1187.47212351155471155821-146438467881
1278.86100310122968123277-150645509611
1381.43112275109957110231150651509301
1489.721562521323513486154038542901
1586.61041981477614973154286544791
1693.882282921498315274154548548411
1784.82132255102756103010-175360756161
1882131313155526155838-11152841155831
1996.9102161115751173511292181293781
2095.91100167115701173611315541317241
2193.6799160115751173411345281346851
2297.64110167115701173611347191348871
2390.42251370159033159402-11697841701481
Short-link