<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671511.4	1	GAATTCTAGTTGGTAGCCATGATGAGCATTGCTAGATCCATTATTTTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16229	GAATTCTAGTTGGTAGCCATGATGAGCATTGCTAGATCCATTATTTTCTT	16278

AL671511.4	51	AGGGATTATAAAATGCAGATATTCTAAGTCTATTATTCTGTCTAAACTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16279	AGGGATTATAAAATGCAGATATTCTAAGTCTATTATTCTGTCTAAACTGA	16328

AL671511.4	101	TTTCATTTATACAGATTATGTCCCATCTACTATTTTGACATGACTTATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16329	TTTCATTTATACAGATTATGTCCCATCTACTATTTTGACATGACTTATTT	16378

AL671511.4	151	AGGAAAGGCAGATTGATGCCATTCTTTCCCCTTTATTTAGCAGCTTTCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16379	AGGAAAGGCAGATTGATGCCATTCTTTCCCCTTTATTTAGCAGCTTTCAG	16428

AL671511.4	201	AATAATGAGTTTGTTCTCTAGCATCTGCCAAAGGTAACCAATGACCCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16429	AATAATGAGTTTGTTCTCTAGCATCTGCCAAAGGTAACCAATGACCCTTT	16478

AL671511.4	251	ATTTAGTATCACTATGAGTCAGTTGATTTGAATGTGTTTTAATCCGTTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16479	ATTTAGTATCACTATGAGTCAGTTGATTTGAATGTGTTTTAATCCGTTGC	16528

AL671511.4	301	TATCACTATTTTTACTGAGGCTCCATTTATGCCATATTTGGGCAGTGCGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16529	TATCACTATTTTTACTGAGGCTCCATTTATGCCATATTTGGGCAGTGCGA	16578

AL671511.4	351	GCCTCAAGTTGATAAAATACTAATATCTTTGATGCCTTTCTTGTTTTCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16579	GCCTCAAGTTGATAAAATACTAATATCTTTGATGCCTTTCTTGTTTTCTG	16628

AL671511.4	401	GTGATAAGATGTTCAGGCTCATCTTGTACATAAGCTGCTATATGTTTCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16629	GTGATAAGATGTTCAGGCTCATCTTGTACATAAGCTGCTATATGTTTCTT	16678

AL671511.4	451	TTTAGAGGAAATGGTACTAGGAGACCTCAGTTTGGGTGCTGAGGAAGGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16679	TTTAGAGGAAATGGTACTAGGAGACCTCAGTTTGGGTGCTGAGGAAGGTT	16728

AL671511.4	501	TGTATTTATTCATTTTTTATTTTCTAAGATAGGAGGAATAACATATTTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16729	TGTATTTATTCATTTTTTATTTTCTAAGATAGGAGGAATAACATATTTGC	16778

AL671511.4	551	TTGCTGATGGGAGTGAGCCACTGCAGAGGGAAAGGCGGTGTGCAGGAGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16779	TTGCTGATGGGAGTGAGCCACTGCAGAGGGAAAGGCGGTGTGCAGGAGAT	16828

AL671511.4	601	GGGGTATTGCTGGAGGAATGGCCCTGAGTAGGTGAGAGGCAGTGGGGTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16829	GGGGTATTGCTGGAGGAATGGCCCTGAGTAGGTGAGAGGCAGTGGGGTCT	16878

AL671511.4	651	AGTGCCCAAGTGGAGGAGTTGGTTGTTAGTTGAAAGTGAGGAAGATGAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16879	AGTGCCCAAGTGGAGGAGTTGGTTGTTAGTTGAAAGTGAGGAAGATGAGC	16928

AL671511.4	701	TGAGCACATTGGCTCATGCCAGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCTGAGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16929	TGAGCACATTGGCTCATGCCAGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCTGAGGA	16978

AL671511.4	751	GGGTGGATCACCTGAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	16979	GGGTGGATCACCTGAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTG	17028

AL671511.4	801	AAATCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17029	AAATCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCAT	17078

AL671511.4	851	GCCTGTAATCCTAGCTAATTGGGAGGCCGAAGCAGGAGAATCACTTGAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17079	GCCTGTAATCCTAGCTAATTGGGAGGCCGAAGCAGGAGAATCACTTGAAC	17128

AL671511.4	901	CCAGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17129	CCAGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGC	17178

AL671511.4	951	CTGGGCCATACAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17179	CTGGGCCATACAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	17228

AL671511.4	1001	AAGTGAGGAGGATGGAGGCTGTGTAATGAAATACAAGAAAGTGTGAAATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17229	AAGTGAGGAGGATGGAGGCTGTGTAATGAAATACAAGAAAGTGTGAAATA	17278

AL671511.4	1051	GTTGCCTTGAAATTCTGTGAGTGAGTGGCCAGGAAAATGCCGTATACTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17279	GTTGCCTTGAAATTCTGTGAGTGAGTGGCCAGGAAAATGCCGTATACTTC	17328

AL671511.4	1101	TTTTTCTTTTCTTTACTCTAATTCCATCACAGGTTATCTGCTGGGTGTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17329	TTTTTCTTTTCTTTACTCTAATTCCATCACAGGTTATCTGCTGGGTGTTT	17378

AL671511.4	1151	CTAATGGCCAACTTGAAGTTTGTAAATGTTTGATGAGCATGGTTGAGTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17379	CTAATGGCCAACTTGAAGTTTGTAAATGTTTGATGAGCATGGTTGAGTAT	17428

AL671511.4	1201	TTTTATCCAACCACTTCAGCTGCTTGGATGCAGGCATGGAGTCGGTGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17429	TTTTATCCAACCACTTCAGCTGCTTGGATGCAGGCATGGAGTCGGTGGGA	17478

AL671511.4	1251	AGTTGGAGGTAGCCAGAGCTAGGCTTTTGACAGGCAGGCATGATGGAGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17479	AGTTGGAGGTAGCCAGAGCTAGGCTTTTGACAGGCAGGCATGATGGAGGG	17528

AL671511.4	1301	AATGAGGGAAATAGGAGTTGAGATGCAAGATAGCTCTTACAACAATGCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17529	AATGAGGGAAATAGGAGTTGAGATGCAAGATAGCTCTTACAACAATGCTT	17578

AL671511.4	1351	CATGAAACCTAAGCGGGATAAGGTTGGGAGGGCACAGGATCTCATAATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17579	CATGAAACCTAAGCGGGATAAGGTTGGGAGGGCACAGGATCTCATAATGT	17628

AL671511.4	1401	CAGGGTCAAAGGGGTTGGAGGTCTGGAGAAGTGAAAATATTGTTTGATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17629	CAGGGTCAAAGGGGTTGGAGGTCTGGAGAAGTGAAAATATTGTTTGATCT	17678

AL671511.4	1451	TTGGAGGTGGACACTAGAGGGAGTGATCTGCAAGGACAGGAAGGGGGATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17679	TTGGAGGTGGACACTAGAGGGAGTGATCTGCAAGGACAGGAAGGGGGATA	17728

AL671511.4	1501	CTTAAAACTGAGATTATGGAGAGGTTTCAGGTACAGGTACAGGTAATGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17729	CTTAAAACTGAGATTATGGAGAGGTTTCAGGTACAGGTACAGGTAATGAC	17778

AL671511.4	1551	AAGGTCTAGGTATGACTGTGGAGTGAGTGGCTGTGGTAGGGGGAGGACAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17779	AAGGTCTAGGTATGACTGTGGAGTGAGTGGCTGTGGTAGGGGGAGGACAA	17828

AL671511.4	1601	GATCACTGGAGGTGAGAAGGTCAAAAGGTCAAGGTGAGAGGCCAGGGTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17829	GATCACTGGAGGTGAGAAGGTCAAAAGGTCAAGGTGAGAGGCCAGGGTGT	17878

AL671511.4	1651	TGGGTGGAGTGTCTTGGTTGATAGAGAAGCCACAAAGAATGGTAGCAGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17879	TGGGTGGAGTGTCTTGGTTGATAGAGAAGCCACAAAGAATGGTAGCAGGA	17928

AL671511.4	1701	GTGGGATGAAGAGAAAGACAGTGACCCAGGGACTGAAAATTTTAGTGAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17929	GTGGGATGAAGAGAAAGACAGTGACCCAGGGACTGAAAATTTTAGTGAAT	17978

AL671511.4	1751	TGTGAAGAGTGAGGAGTGACTGGAAGGCTGTTAAATGCTGGCAACAGGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	17979	TGTGAAGAGTGAGGAGTGACTGGAAGGCTGTTAAATGCTGGCAACAGGAG	18028

AL671511.4	1801	CAGCTGAGGGTGACGTTGGAGGCCACATGTACTGCAAAGCAGCTAAGGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	18029	CAGCTGAGGGTGACGTTGGAGGCCACATGTACTGCAAAGCAGCTAAGGCC	18078

AL671511.4	1851	CTGCATTACTCTTGACCACCAGAGAAAAGTTCATGTATTCATTCATTTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	18079	CTGCATTACTCTTGACCACCAGAGAAAAGTTCATGTATTCATTCATTTAT	18128

AL671511.4	1901	TCAAGCAGTAAGTTAACCAAGCTTGACTATCTACCCTGTGCTTAGCAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	18129	TCAAGCAGTAAGTTAACCAAGCTTGACTATCTACCCTGTGCTTAGCAAAA	18178

AL671511.4	1951	CCCTCCCTGCCCTCACAGAATGTATATGTATTCATTACAAAATTGTCCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772153.2	18179	CCCTCCCTGCCCTCACAGAATGTATATGTATTCATTACAAAATTGTCCTT	18228

Overview

Query
AL671511.4 - 87294 bps
Hit
AL772153.2 - 18228 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link