<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1982 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

AL732455.6	1	GAATTCTTGGATTATTTAAGGTAAGGGCTAAGAAAAGCTCAAGGCGATTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81704	GAATTCTTGGATTATTTAAGGTAAGGGCTAAGAAAAGCTCAAGGCGATTC	81753

AL732455.6	51	TGCCTAACCAGATCAGCCCATAACATGGGGTCTGCCCCATGTTATGTATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81754	TGCCTAACCAGATCAGCCCATAACATGGGGTCTGCCCCATGTTATGTATA	81803

AL732455.6	101	TTACAAAGTCAGGAATGCATCTTTTTCATCTTGGATTTATCTTTGATAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81804	TTACAAAGTCAGGAATGCATCTTTTTCATCTTGGATTTATCTTTGATAAT	81853

AL732455.6	151	TTGATGTTTTGTATTGATCGTTTATGAATTGACTGATTGAATTGGCATAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81854	TTGATGTTTTGTATTGATCGTTTATGAATTGACTGATTGAATTGGCATAA	81903

AL732455.6	201	TACATTTACCTGACTAATAAATTGTTATGTTTTGAATGATTCAAACAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81904	TACATTTACCTGACTAATAAATTGTTATGTTTTGAATGATTCAAACAGAG	81953

AL732455.6	251	TTCGTGTTATTATCTTTAGTAGATTGTGGTAATTTCATAGCACCACAAGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	81954	TTCGTGTTATTATCTTTAGTAGATTGTGGTAATTTCATAGCACCACAAGC	82003

AL732455.6	301	CCCTGTTCAGGTTAGTAGCGGACTAGAACACGGTAGACGGAGCATTGCGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82004	CCCTGTTCAGGTTAGTAGCGGACTAGAACACGGTAGACGGAGCATTGCGG	82053

AL732455.6	351	CACGTTACACGATGTCTCTAGAGCTCCGACTAACAAATTGGCATTTATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82054	CACGTTACACGATGTCTCTAGAGCTCCGACTAACAAATTGGCATTTATTC	82103

AL732455.6	401	ATGTATACTTAGGCTGTAAAAGGATATCTAAGGGGATAGTCCTTCACCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82104	ATGTATACTTAGGCTGTAAAAGGATATCTAAGGGGATAGTCCTTCACCCG	82153

AL732455.6	451	ATAAACTTTTAATACTATTTAGATAGTATAGTGATTATTCAAAGTTACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82154	ATAAACTTTTAATACTATTTAGATAGTATAGTGATTATTCAAAGTTACTA	82203

AL732455.6	501	CTAGTTTAAGTACGACTGGTCTGCTTAATTCTATAGTAATGATCGTTATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82204	CTAGTTTAAGTACGACTGGTCTGCTTAATTCTATAGTAATGATCGTTATA	82253

AL732455.6	551	TGACTAAATAGCTCTGTCTGATTTAGGAGGTAGCAGACCTATGGGGACCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82254	TGACTAAATAGCTCTGTCTGATTTAGGAGGTAGCAGACCTATGGGGACCG	82303

AL732455.6	601	CATAAAAAATATCCTAATCTGAGTAAGTAGGGTTCTGCCTTTTTAGGATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82304	CATAAAAAATATCCTAATCTGAGTAAGTAGGGTTCTGCCTTTTTAGGATA	82353

AL732455.6	651	GCGGTCAATCGCCCCTGTTTAGTGACCAAGACTGACATGCTTGTGCTTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82354	GCGGTCAATCGCCCCTGTTTAGTGACCAAGACTGACATGCTTGTGCTTAA	82403

AL732455.6	701	GAAATTGTATACTCGGCCGGTACAAGATTCAGGATGTTATAGAGATCCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82404	GAAATTGTATACTCGGCCGGTACAAGATTCAGGATGTTATAGAGATCCCA	82453

AL732455.6	751	ATGAACGAGAATAACATAAAATGATGAACCGAAGAGAATATTCAATCATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82454	ATGAACGAGAATAACATAAAATGATGAACCGAAGAGAATATTCAATCATA	82503

AL732455.6	801	ATCTAAATTAATGTGAACGGAAACAAAATAACCTTCTCAATGTTTTATAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82504	ATCTAAATTAATGTGAACGGAAACAAAATAACCTTCTCAATGTTTTATAA	82553

AL732455.6	851	TTGGAGTCAGATAAAACGAGGATAAACATATTAATATTCTAAACCATCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82554	TTGGAGTCAGATAAAACGAGGATAAACATATTAATATTCTAAACCATCTC	82603

AL732455.6	901	ATACTAAAATTGGAGTCAGATATGAGTTAAGTTTAATATAAATCAACATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82604	ATACTAAAATTGGAGTCAGATATGAGTTAAGTTTAATATAAATCAACATT	82653

AL732455.6	951	GTGCACTGGAAAGACCGAACATGCAGTGAACCTTCATCCACCATTGGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82654	GTGCACTGGAAAGACCGAACATGCAGTGAACCTTCATCCACCATTGGATA	82703

AL732455.6	1001	CCGTCATTGGACCAACTGGCTGGACCCTACAATAATAATAATAATAATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82704	CCGTCATTGGACCAACTGGCTGGACCCTACAATAATAATAATAATAATAA	82753

AL732455.6	1051	TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAGTGGTGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82754	TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATAGTGGTGGA	82803

AL732455.6	1101	ACTGGACTGACAGTTTTAATTTTAATTAATAACTTCAATGTTTTAGCTGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82804	ACTGGACTGACAGTTTTAATTTTAATTAATAACTTCAATGTTTTAGCTGC	82853

AL732455.6	1151	TTTGACACAATCTACATTGTAAAAGTGCTATAGAAATAAAGATAAATTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82854	TTTGACACAATCTACATTGTAAAAGTGCTATAGAAATAAAGATAAATTTA	82903

AL732455.6	1201	ATTGAATGTTACATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82904	ATTGAATGTTACATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	82953

AL732455.6	1251	AT------------------ATATATATATATATATTTAGGTGGTTCAAT	1282
			||                  ||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82954	ATATATATATATATATATACATATATATATATATATTTAGGTGGTTCAAT	83003

AL732455.6	1283	CTGCTGTGGCACCCTCTGAAATAAGTCGAAGTAAAGTGAATAAATTAATG	1332
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83004	CTGCTGTGGCACCCTCTGAAATAAGTCGAAGTAAAGTGAATAAATTAATG	83053

AL732455.6	1333	AATAAACTAATGAATTTGTTTATGTATTTACTATAACTACACTGTAAAAA	1382
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83054	AATAAACTAATGAATTTGTTTATGTATTTACTATAACTACACTGTAAAAA	83103

AL732455.6	1383	AATCCGTAATTTTACGCTTTATTTCCAGCAGTTAGGGTGCCGAAAAAAAA	1432
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83104	AATCCGTAATTTTACGCTTTATTTCCAGCAGTTAGGGTGCCGAAAAAAAA	83153

AL732455.6	1433	CCCCGTAAAATAACGGCCATTAAATTACATACATTTACTGTAAAATAACA	1482
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83154	CCCCGTAAAATAACGGCCATTAAATTACATACATTTACTGTAAAATAACA	83203

AL732455.6	1483	GAGATTGAATTTGAGAAATTTACCAGAAATTTAAATTTAAGAAAATTTCT	1532
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83204	GAGATTGAATTTGAGAAATTTACCAGAAATTTAAATTTAAGAAAATTTCT	83253

AL732455.6	1533	ATTTTAATATCCCCTATTTTACAGTAAATTTCTGTAATTTAATCCCAGCT	1582
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83254	ATTTTAATATCCCCTATTTTACAGTAAATTTCTGTAATTTAATCCCAGCT	83303

AL732455.6	1583	GCTGGATATAAACCATAAAATGACAGATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTA	1632
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83304	GCTGGATATAAACCATAAAATGACAGATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTA	83353

AL732455.6	1633	CAGTGTACAGTAACTGGATGTGTACAGTAGTTCCAGCATGCTTTGCCTTG	1682
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83354	CAGTGTACAGTAACTGGATGTGTACAGTAGTTCCAGCATGCTTTGCCTTG	83403

AL732455.6	1683	AATTACAAAAAGAGGGCAAATGTTGAAAATACGTTTAATCTCAAGTGTTA	1732
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83404	AATTACAAAAAGAGGGCAAATGTTGAAAATACGTTTAATCTCAAGTGTTA	83453

AL732455.6	1733	GTTTTAGTATTAGTACTTTTAAGTAAGTGTTACTCACATACTTTAAAGAT	1782
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83454	GTTTTAGTATTAGTACTTTTAAGTAAGTGTTACTCACATACTTTAAAGAT	83503

AL732455.6	1783	TTAGAAGTTTTAATTAAGACTTTGTGTTTTGAGGATAGCACTCATGGTAT	1832
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83504	TTAGAAGTTTTAATTAAGACTTTGTGTTTTGAGGATAGCACTCATGGTAT	83553

AL732455.6	1833	GCTATTAACTTTATGAACAACATCATTGTTCGTTGCTTCACTCGATGAAT	1882
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83554	GCTATTAACTTTATGAACAACATCATTGTTCGTTGCTTCACTCGATGAAT	83603

AL732455.6	1883	GCCAGTTCTGAGATCAATCTTTTTTAACTTGCCCAGTCTATGTTACAAAC	1932
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83604	GCCAGTTCTGAGATCAATCTTTTTTAACTTGCCCAGTCTATGTTACAAAC	83653

AL732455.6	1933	AAAAACAGTACATGTTATTAAAGTAGTTGTTCAGTATGAATTAAAATGTC	1982
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	83654	AAAAACAGTACATGTTATTAAAGTAGTTGTTCAGTATGAATTAAAATGTC	83703

Compact alignment

skip 1250 bps 100% identity alignment

AL732455.6	1251	AT------------------ATATATATATATATATTTAGGTGGTTCAAT	1282
			||                  ||||||||||||||||||||||||||||||
AL732635.7	82954	ATATATATATATATATATACATATATATATATATATTTAGGTGGTTCAAT	83003

skip 700 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL732455.6 - 192578 bps
Hit
AL732635.7 - 83703 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1982 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link