<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
C AL591399.3 97774 GATCATTTAATTGTATGATAATCGTTATTGTTACTGCTCAGAAAAAAATT 97725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14031 GATCATTTAATTGTATGATAATCGTTATTGTTACTGCTCAGAAAAAAATT 14080 C AL591399.3 97724 GATTGGACAGTTTAATGCAAAAAATATAGAAAGTCTGTTTTTGACATGCA 97675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14081 GATTGGACAGTTTAATGCAAAAAATATAGAAAGTCTGTTTTTGACATGCA 14130 C AL591399.3 97674 ATATGGTAATTATAACATTGTTATTATATTTGTATCAATAATATCTTCAT 97625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14131 ATATGGTAATTATAACATTGTTATTATATTTGTATCAATAATATCTTCAT 14180 C AL591399.3 97624 TGAATGTAATTACTTTTATTCTAAACTTTCATTCTAAATGGTATATGAAA 97575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14181 TGAATGTAATTACTTTTATTCTAAACTTTCATTCTAAATGGTATATGAAA 14230 C AL591399.3 97574 TAGCTGGAATGCGGTAGTTTTTGGCACATGCTCAAAGGGTGTGTGAATGT 97525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14231 TAGCTGGAATGCGGTAGTTTTTGGCACATGCTCAAAGGGTGTGTGAATGT 14280 C AL591399.3 97524 CAATAAGATTACTTTTGGCAAAGGAACCAGACTGATTGTGCGAACAAGTA 97475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14281 CAATAAGATTACTTTTGGCAAAGGAACCAGACTGATTGTGCGAACAAGTA 14330 C AL591399.3 97474 AGTAAAGCATTTCTAACAAAGGCAACATTAATACATGTTATTTATTTTAG 97425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14331 AGTAAAGCATTTCTAACAAAGGCAACATTAATACATGTTATTTATTTTAG 14380 C AL591399.3 97424 AAGTTTGATTTCCTAAAACGATTAACTGAGTGATATGAAAAAACACAGAT 97375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14381 AAGTTTGATTTCCTAAAACGATTAACTGAGTGATATGAAAAAACACAGAT 14430 C AL591399.3 97374 TTTGCACTTATTTAAAATTTAACTGAATCAATCAGTTCAATCAATCTAAA 97325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14431 TTTGCACTTATTTAAAATTTAACTGAATCAATCAGTTCAATCAATCTAAA 14480 C AL591399.3 97324 GTAGTTGCTTTTTATAAATACTTGCATTATTCCTTAGTCACCCACTAAAT 97275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14481 GTAGTTGCTTTTTATAAATACTTGCATTATTCCTTAGTCACCCACTAAAT 14530 C AL591399.3 97274 TCACTTATCTACATTTCTCAAAACTAATCAAAGTCAAATAGAAAACAAAG 97225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14531 TCACTTATCTACATTTCTCAAAACTAATCAAAGTCAAATAGAAAACAAAG 14580 C AL591399.3 97224 TTTTCCAAGTAATGACCTGCAAGTTACTGGCCAATGATAAAGTAACAAGA 97175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14581 TTTTCCAAGTAATGACCTGCAAGTTACTGGCCAATGATAAAGTAACAAGA 14630 C AL591399.3 97174 GGTTAATGTAGTGTACTGTACTGCTGTGTGAATAATAACTACAAGATCAT 97125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14631 GGTTAATGTAGTGTACTGTACTGCTGTGTGAATAATAACTACAAGATCAT 14680 C AL591399.3 97124 ATTTGGAAGTGGCACCAGTCTCTTTGTTTCCTCAAGTAAGAAATTTCCTG 97075 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14681 ATTTGGAAGTGGCACCAGTCTCTTTGTTTCCTCAAGTAAGAAATTTCCTG 14730 C AL591399.3 97074 ATTTTCATGAGAAGATAAACGCATAACTTTAAAATAATAAAAGTGTTGAT 97025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14731 ATTTTCATGAGAAGATAAACGCATAACTTTAAAATAATAAAAGTGTTGAT 14780 C AL591399.3 97024 ACTTGATGCATTTCTCTTTCCTAGTAAATATGACAAACAAATGCAACACT 96975 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14781 ACTTGATGCATTTCTCTTTCCTAGTAAATATGACAAACAAATGCAACACT 14830 C AL591399.3 96974 TAATCTCCCTTGCACACACACAAACACAAAATCAAATGTATATTTGCATA 96925 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14831 TAATCTCCCTTGCACACACACAAACACAAAATCAAATGTATATTTGCATA 14880 C AL591399.3 96924 AAAAAATATTATTTGAAAATACATACATTCAAAATTTCATAACTTTTATT 96875 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14881 AAAAAATATTATTTGAAAATACATACATTCAAAATTTCATAACTTTTATT 14930 C AL591399.3 96874 GCTAAAAAAAGCTCAGCGAGAGTTGTGTTAAGTATTATACACCTATAATA 96825 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14931 GCTAAAAAAAGCTCAGCGAGAGTTGTGTTAAGTATTATACACCTATAATA 14980 C AL591399.3 96824 GGGTTTAAAGTGTAACATGTAATGTTTGCAAGGTACAGTTGTTAGCAGAA 96775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 14981 GGGTTTAAAGTGTAACATGTAATGTTTGCAAGGTACAGTTGTTAGCAGAA 15030 C AL591399.3 96774 TGATGCTAGTTTCTGGTATGTGACCAATCGCTGTGTGAATGATGCGTATA 96725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15031 TGATGCTAGTTTCTGGTATGTGACCAATCGCTGTGTGAATGATGCGTATA 15080 C AL591399.3 96724 AGATTTACTTTGGTAAAGGGACCAAAGTCATAATACAGTCAAGTAAGTTC 96675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15081 AGATTTACTTTGGTAAAGGGACCAAAGTCATAATACAGTCAAGTAAGTTC 15130 C AL591399.3 96674 CGATTTTTACATATTTTACAGTTGCTTCATTTAGTTTTTTGCGTTTTGGA 96625 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15131 CGATTTTTACATATTTTACAGTTGCTTCATTTAGTTTTTTGCGTTTTGGA 15180 C AL591399.3 96624 AACATCAAAATGTTAGTGAGATTATTCGCAATGTGGTGTCTGATAATTAG 96575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15181 AACATCAAAATGTTAGTGAGATTATTCGCAATGTGGTGTCTGATAATTAG 15230 C AL591399.3 96574 CTATGCAGGTTTATGGCATTAAATTTCTCTATTACTTTTTGTCCAAAAAT 96525 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15231 CTATGCAGGTTTATGGCATTAAATTTCTCTATTACTTTTTGTCCAAAAAT 15280 C AL591399.3 96524 GCATTTTGATATATCGCAAATATCACACAAGTGTTTTGGTTAAAAATGTT 96475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15281 GCATTTTGATATATCGCAAATATCACACAAGTGTTTTGGTTAAAAATGTT 15330 C AL591399.3 96474 GCGGGTAAATGTACCATGCTGTACTAATGTGTGAATGCTGGATACAAGAA 96425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15331 GCGGGTAAATGTACCATGCTGTACTAATGTGTGAATGCTGGATACAAGAA 15380 C AL591399.3 96424 AATCATATTTGGACAAGGCACTAAACTAACAGTTGATTCACGTAAGTTTA 96375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15381 AATCATATTTGGACAAGGCACTAAACTAACAGTTGATTCACGTAAGTTTA 15430 C AL591399.3 96374 TTGTTATTTGCTAAACCATAGGACACAAGAGTGCGAACATTAAAAATATA 96325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15431 TTGTTATTTGCTAAACCATAGGACACAAGAGTGCGAACATTAAAAATATA 15480 C AL591399.3 96324 TTTAAATATTCTGATGATTTCATCACACCAGCCAAAACACTAGTAGTAAT 96275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15481 TTTAAATATTCTGATGATTTCATCACACCAGCCAAAACACTAGTAGTAAT 15530 C AL591399.3 96274 ATTAAACAACAATGACTTCAAACCTAATTTCGAAATATCTTAAAACTAGA 96225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15531 ATTAAACAACAATGACTTCAAACCTAATTTCGAAATATCTTAAAACTAGA 15580 C AL591399.3 96224 ATGTAATTTTATGTAATCAAACATAATAATGTAATTAAACATGATCAAAA 96175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15581 ATGTAATTTTATGTAATCAAACATAATAATGTAATTAAACATGATCAAAA 15630 C AL591399.3 96174 CACTTGACTATTGACTAGTAGCAATACAAAATAGCTTCAAATCACCTTTT 96125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15631 CACTTGACTATTGACTAGTAGCAATACAAAATAGCTTCAAATCACCTTTT 15680 C AL591399.3 96124 GAAATACAGTAGCTGTAACGTTAATAAAAAATTTTTTTGAAGGAATTTTT 96075 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15681 GAAATACAGTAGCTGTAACGTTAATAAAAAATTTTTTTGAAGGAATTTTT 15730 C AL591399.3 96074 TGTTTTCTCTAAACTCTTTCACTTTGAAATAAATTCATTCAAAAATGTTT 96025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15731 TGTTTTCTCTAAACTCTTTCACTTTGAAATAAATTCATTCAAAAATGTTT 15780 C AL591399.3 96024 ACACTACAATCTTGCACACTACAGTTGTCAGATGTTGCTAGTTTTTAGTA 95975 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15781 ACACTACAATCTTGCACACTACAGTTGTCAGATGTTGCTAGTTTTTAGTA 15830 C AL591399.3 95974 TGTGGCTACAGACTGTGTGAATGATGGACTTAAACTTTTCTTTGGCACTG 95925 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15831 TGTGGCTACAGACTGTGTGAATGATGGACTTAAACTTTTCTTTGGCACTG 15880 C AL591399.3 95924 GGACGAAACTTCTCGTACAAATTAGTAAGTCTTATTTTAATCTCTGCGTT 95875 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15881 GGACGAAACTTCTCGTACAAATTAGTAAGTCTTATTTTAATCTCTGCGTT 15930 C AL591399.3 95874 TATTTTTTCAAATCGAACTTCTATCATATAATCTCATATAATCCCAAAAA 95825 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15931 TATTTTTTCAAATCGAACTTCTATCATATAATCTCATATAATCCCAAAAA 15980 C AL591399.3 95824 TGTGTTTTACTAAAAATGAAACTGAAAATATACAGAAAACGTGGGAAAAT 95775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AL732505.5 15981 TGTGTTTTACTAAAAATGAAACTGAAAATATACAGAAAACGTGGGAAAAT 16030