<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL591399.3	97774	GATCATTTAATTGTATGATAATCGTTATTGTTACTGCTCAGAAAAAAATT	97725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14031	GATCATTTAATTGTATGATAATCGTTATTGTTACTGCTCAGAAAAAAATT	14080

C  AL591399.3	97724	GATTGGACAGTTTAATGCAAAAAATATAGAAAGTCTGTTTTTGACATGCA	97675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14081	GATTGGACAGTTTAATGCAAAAAATATAGAAAGTCTGTTTTTGACATGCA	14130

C  AL591399.3	97674	ATATGGTAATTATAACATTGTTATTATATTTGTATCAATAATATCTTCAT	97625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14131	ATATGGTAATTATAACATTGTTATTATATTTGTATCAATAATATCTTCAT	14180

C  AL591399.3	97624	TGAATGTAATTACTTTTATTCTAAACTTTCATTCTAAATGGTATATGAAA	97575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14181	TGAATGTAATTACTTTTATTCTAAACTTTCATTCTAAATGGTATATGAAA	14230

C  AL591399.3	97574	TAGCTGGAATGCGGTAGTTTTTGGCACATGCTCAAAGGGTGTGTGAATGT	97525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14231	TAGCTGGAATGCGGTAGTTTTTGGCACATGCTCAAAGGGTGTGTGAATGT	14280

C  AL591399.3	97524	CAATAAGATTACTTTTGGCAAAGGAACCAGACTGATTGTGCGAACAAGTA	97475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14281	CAATAAGATTACTTTTGGCAAAGGAACCAGACTGATTGTGCGAACAAGTA	14330

C  AL591399.3	97474	AGTAAAGCATTTCTAACAAAGGCAACATTAATACATGTTATTTATTTTAG	97425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14331	AGTAAAGCATTTCTAACAAAGGCAACATTAATACATGTTATTTATTTTAG	14380

C  AL591399.3	97424	AAGTTTGATTTCCTAAAACGATTAACTGAGTGATATGAAAAAACACAGAT	97375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14381	AAGTTTGATTTCCTAAAACGATTAACTGAGTGATATGAAAAAACACAGAT	14430

C  AL591399.3	97374	TTTGCACTTATTTAAAATTTAACTGAATCAATCAGTTCAATCAATCTAAA	97325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14431	TTTGCACTTATTTAAAATTTAACTGAATCAATCAGTTCAATCAATCTAAA	14480

C  AL591399.3	97324	GTAGTTGCTTTTTATAAATACTTGCATTATTCCTTAGTCACCCACTAAAT	97275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14481	GTAGTTGCTTTTTATAAATACTTGCATTATTCCTTAGTCACCCACTAAAT	14530

C  AL591399.3	97274	TCACTTATCTACATTTCTCAAAACTAATCAAAGTCAAATAGAAAACAAAG	97225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14531	TCACTTATCTACATTTCTCAAAACTAATCAAAGTCAAATAGAAAACAAAG	14580

C  AL591399.3	97224	TTTTCCAAGTAATGACCTGCAAGTTACTGGCCAATGATAAAGTAACAAGA	97175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14581	TTTTCCAAGTAATGACCTGCAAGTTACTGGCCAATGATAAAGTAACAAGA	14630

C  AL591399.3	97174	GGTTAATGTAGTGTACTGTACTGCTGTGTGAATAATAACTACAAGATCAT	97125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14631	GGTTAATGTAGTGTACTGTACTGCTGTGTGAATAATAACTACAAGATCAT	14680

C  AL591399.3	97124	ATTTGGAAGTGGCACCAGTCTCTTTGTTTCCTCAAGTAAGAAATTTCCTG	97075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14681	ATTTGGAAGTGGCACCAGTCTCTTTGTTTCCTCAAGTAAGAAATTTCCTG	14730

C  AL591399.3	97074	ATTTTCATGAGAAGATAAACGCATAACTTTAAAATAATAAAAGTGTTGAT	97025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14731	ATTTTCATGAGAAGATAAACGCATAACTTTAAAATAATAAAAGTGTTGAT	14780

C  AL591399.3	97024	ACTTGATGCATTTCTCTTTCCTAGTAAATATGACAAACAAATGCAACACT	96975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14781	ACTTGATGCATTTCTCTTTCCTAGTAAATATGACAAACAAATGCAACACT	14830

C  AL591399.3	96974	TAATCTCCCTTGCACACACACAAACACAAAATCAAATGTATATTTGCATA	96925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14831	TAATCTCCCTTGCACACACACAAACACAAAATCAAATGTATATTTGCATA	14880

C  AL591399.3	96924	AAAAAATATTATTTGAAAATACATACATTCAAAATTTCATAACTTTTATT	96875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14881	AAAAAATATTATTTGAAAATACATACATTCAAAATTTCATAACTTTTATT	14930

C  AL591399.3	96874	GCTAAAAAAAGCTCAGCGAGAGTTGTGTTAAGTATTATACACCTATAATA	96825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14931	GCTAAAAAAAGCTCAGCGAGAGTTGTGTTAAGTATTATACACCTATAATA	14980

C  AL591399.3	96824	GGGTTTAAAGTGTAACATGTAATGTTTGCAAGGTACAGTTGTTAGCAGAA	96775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	14981	GGGTTTAAAGTGTAACATGTAATGTTTGCAAGGTACAGTTGTTAGCAGAA	15030

C  AL591399.3	96774	TGATGCTAGTTTCTGGTATGTGACCAATCGCTGTGTGAATGATGCGTATA	96725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15031	TGATGCTAGTTTCTGGTATGTGACCAATCGCTGTGTGAATGATGCGTATA	15080

C  AL591399.3	96724	AGATTTACTTTGGTAAAGGGACCAAAGTCATAATACAGTCAAGTAAGTTC	96675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15081	AGATTTACTTTGGTAAAGGGACCAAAGTCATAATACAGTCAAGTAAGTTC	15130

C  AL591399.3	96674	CGATTTTTACATATTTTACAGTTGCTTCATTTAGTTTTTTGCGTTTTGGA	96625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15131	CGATTTTTACATATTTTACAGTTGCTTCATTTAGTTTTTTGCGTTTTGGA	15180

C  AL591399.3	96624	AACATCAAAATGTTAGTGAGATTATTCGCAATGTGGTGTCTGATAATTAG	96575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15181	AACATCAAAATGTTAGTGAGATTATTCGCAATGTGGTGTCTGATAATTAG	15230

C  AL591399.3	96574	CTATGCAGGTTTATGGCATTAAATTTCTCTATTACTTTTTGTCCAAAAAT	96525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15231	CTATGCAGGTTTATGGCATTAAATTTCTCTATTACTTTTTGTCCAAAAAT	15280

C  AL591399.3	96524	GCATTTTGATATATCGCAAATATCACACAAGTGTTTTGGTTAAAAATGTT	96475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15281	GCATTTTGATATATCGCAAATATCACACAAGTGTTTTGGTTAAAAATGTT	15330

C  AL591399.3	96474	GCGGGTAAATGTACCATGCTGTACTAATGTGTGAATGCTGGATACAAGAA	96425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15331	GCGGGTAAATGTACCATGCTGTACTAATGTGTGAATGCTGGATACAAGAA	15380

C  AL591399.3	96424	AATCATATTTGGACAAGGCACTAAACTAACAGTTGATTCACGTAAGTTTA	96375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15381	AATCATATTTGGACAAGGCACTAAACTAACAGTTGATTCACGTAAGTTTA	15430

C  AL591399.3	96374	TTGTTATTTGCTAAACCATAGGACACAAGAGTGCGAACATTAAAAATATA	96325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15431	TTGTTATTTGCTAAACCATAGGACACAAGAGTGCGAACATTAAAAATATA	15480

C  AL591399.3	96324	TTTAAATATTCTGATGATTTCATCACACCAGCCAAAACACTAGTAGTAAT	96275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15481	TTTAAATATTCTGATGATTTCATCACACCAGCCAAAACACTAGTAGTAAT	15530

C  AL591399.3	96274	ATTAAACAACAATGACTTCAAACCTAATTTCGAAATATCTTAAAACTAGA	96225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15531	ATTAAACAACAATGACTTCAAACCTAATTTCGAAATATCTTAAAACTAGA	15580

C  AL591399.3	96224	ATGTAATTTTATGTAATCAAACATAATAATGTAATTAAACATGATCAAAA	96175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15581	ATGTAATTTTATGTAATCAAACATAATAATGTAATTAAACATGATCAAAA	15630

C  AL591399.3	96174	CACTTGACTATTGACTAGTAGCAATACAAAATAGCTTCAAATCACCTTTT	96125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15631	CACTTGACTATTGACTAGTAGCAATACAAAATAGCTTCAAATCACCTTTT	15680

C  AL591399.3	96124	GAAATACAGTAGCTGTAACGTTAATAAAAAATTTTTTTGAAGGAATTTTT	96075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15681	GAAATACAGTAGCTGTAACGTTAATAAAAAATTTTTTTGAAGGAATTTTT	15730

C  AL591399.3	96074	TGTTTTCTCTAAACTCTTTCACTTTGAAATAAATTCATTCAAAAATGTTT	96025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15731	TGTTTTCTCTAAACTCTTTCACTTTGAAATAAATTCATTCAAAAATGTTT	15780

C  AL591399.3	96024	ACACTACAATCTTGCACACTACAGTTGTCAGATGTTGCTAGTTTTTAGTA	95975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15781	ACACTACAATCTTGCACACTACAGTTGTCAGATGTTGCTAGTTTTTAGTA	15830

C  AL591399.3	95974	TGTGGCTACAGACTGTGTGAATGATGGACTTAAACTTTTCTTTGGCACTG	95925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15831	TGTGGCTACAGACTGTGTGAATGATGGACTTAAACTTTTCTTTGGCACTG	15880

C  AL591399.3	95924	GGACGAAACTTCTCGTACAAATTAGTAAGTCTTATTTTAATCTCTGCGTT	95875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15881	GGACGAAACTTCTCGTACAAATTAGTAAGTCTTATTTTAATCTCTGCGTT	15930

C  AL591399.3	95874	TATTTTTTCAAATCGAACTTCTATCATATAATCTCATATAATCCCAAAAA	95825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15931	TATTTTTTCAAATCGAACTTCTATCATATAATCTCATATAATCCCAAAAA	15980

C  AL591399.3	95824	TGTGTTTTACTAAAAATGAAACTGAAAATATACAGAAAACGTGGGAAAAT	95775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL732505.5	15981	TGTGTTTTACTAAAAATGAAACTGAAAATATACAGAAAACGTGGGAAAAT	16030

Overview

Query
AL591399.3 - 97774 bps
Hit
AL732505.5 - 16030 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100187120009577597774-114031160301
Short-link