<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672104.4	1	GAATTCAATCTGTGAGGTGGGAAGCCCACTGGCAGAAAAAAATGCATTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	1995	GAATTCAATCTGTGAGGTGGGAAGCCCACTGGCAGAAAAAAATGCATTCT	2044

AL672104.4	51	CTCACTTTGCTAAGAGCCTCTGTTTCCCCTTTTCTTCCTTTTCACCCAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2045	CTCACTTTGCTAAGAGCCTCTGTTTCCCCTTTTCTTCCTTTTCACCCAAT	2094

AL672104.4	101	ACTCAACCTTCAAGTTGTCCTACTCACCCTTCAAGTTGTCTGTGAACGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2095	ACTCAACCTTCAAGTTGTCCTACTCACCCTTCAAGTTGTCTGTGAACGTA	2144

AL672104.4	151	ATTTCTCGTGGCTGTGTGGCAAGGACGCTGTCATTAGCTGAACTAAGGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2145	ATTTCTCGTGGCTGTGTGGCAAGGACGCTGTCATTAGCTGAACTAAGGAA	2194

AL672104.4	201	AAGTCCTGTAACACTATGTTTCCCAGGCTGGCCTCAAACTCCTTGGCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2195	AAGTCCTGTAACACTATGTTTCCCAGGCTGGCCTCAAACTCCTTGGCTCA	2244

AL672104.4	251	AGTGATCTTCCTACCTCAGTCACCTGAATTGCTGGGAGTATAGGCACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2245	AGTGATCTTCCTACCTCAGTCACCTGAATTGCTGGGAGTATAGGCACACA	2294

AL672104.4	301	CCTCCACAGTCAGCTGTACAGTTATTTTTACTTAGCATTAGTGATTTTAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2295	CCTCCACAGTCAGCTGTACAGTTATTTTTACTTAGCATTAGTGATTTTAA	2344

AL672104.4	351	AATGACAAATAATTTTAAATGGAAACTTTAAAAGCAAGTGTTTATATGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2345	AATGACAAATAATTTTAAATGGAAACTTTAAAAGCAAGTGTTTATATGAA	2394

AL672104.4	401	ATTATTCATATGTATTTACCAAAGGTCATCATGTATATGTAAAGCATTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2395	ATTATTCATATGTATTTACCAAAGGTCATCATGTATATGTAAAGCATTTT	2444

AL672104.4	451	ACCTAGAAATTTTAAGTTGTGATTTTGCCAGAACATTAAAAACAGAAATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2445	ACCTAGAAATTTTAAGTTGTGATTTTGCCAGAACATTAAAAACAGAAATA	2494

AL672104.4	501	ATAACACAAGAATAATTCAAATGTTTTAATAACTGACAACTTTAGGGAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2495	ATAACACAAGAATAATTCAAATGTTTTAATAACTGACAACTTTAGGGAAA	2544

AL672104.4	551	AATGAATCCAGATATGTGTGATGTTTGGGGATTTTGAAAAATACCTCAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2545	AATGAATCCAGATATGTGTGATGTTTGGGGATTTTGAAAAATACCTCAAA	2594

AL672104.4	601	CAAAAGAAATATTTTATAAATTATTTACAATGATACAAGTTGAGTAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2595	CAAAAGAAATATTTTATAAATTATTTACAATGATACAAGTTGAGTAAAAA	2644

AL672104.4	651	TTATTCTTGCTATAGTATTTCTCTAAAAGTATCCCATTGACTAAAGAAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2645	TTATTCTTGCTATAGTATTTCTCTAAAAGTATCCCATTGACTAAAGAAGA	2694

AL672104.4	701	TTGGCAAGGACAATCTTGCACCTGAGAGATGGTGGAGCTTGAAAGGCTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2695	TTGGCAAGGACAATCTTGCACCTGAGAGATGGTGGAGCTTGAAAGGCTTA	2744

AL672104.4	751	CAATGGGCACTAAAGAGAGAAGATGGGGGCAGGGGAATGCTTCCACTCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2745	CAATGGGCACTAAAGAGAGAAGATGGGGGCAGGGGAATGCTTCCACTCTC	2794

AL672104.4	801	ATTTGTCCTCCTCTCCGCGCCTATGCACTTGAGATAGTCATGCATTCATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2795	ATTTGTCCTCCTCTCCGCGCCTATGCACTTGAGATAGTCATGCATTCATT	2844

AL672104.4	851	ATTATCTTTGAGTCGTGGGAATATTGGTGTCCATGGGATTTATGCACCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2845	ATTATCTTTGAGTCGTGGGAATATTGGTGTCCATGGGATTTATGCACCAT	2894

AL672104.4	901	AAGAAATGTAAAAGGAAGACCTTCACACGGTAGCCATATGATATCACATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2895	AAGAAATGTAAAAGGAAGACCTTCACACGGTAGCCATATGATATCACATA	2944

AL672104.4	951	GAAACCTGGATCTATACAAAGAAATAAACGCTGGAAATGAAACATTTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2945	GAAACCTGGATCTATACAAAGAAATAAACGCTGGAAATGAAACATTTTTT	2994

AL672104.4	1001	CACATTTAAAAAATGGTCTAAAATGAGGCTTCTCAACCTCAGAACTGTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	2995	CACATTTAAAAAATGGTCTAAAATGAGGCTTCTCAACCTCAGAACTGTTG	3044

AL672104.4	1051	GCATTTTGTTTCAGGTGATTATTTTCTTGTAGGAGGCTGCCATGTGCATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3045	GCATTTTGTTTCAGGTGATTATTTTCTTGTAGGAGGCTGCCATGTGCATT	3094

AL672104.4	1101	GCAGGATGTGTAACAGCACCCCTGGCCTCTACCCAATACCTGCCAGTAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3095	GCAGGATGTGTAACAGCACCCCTGGCCTCTACCCAATACCTGCCAGTAGC	3144

AL672104.4	1151	ACCCTCCCCAGTAATGACAACAAAAGTATCTCCAGACATTGTCAAACATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3145	ACCCTCCCCAGTAATGACAACAAAAGTATCTCCAGACATTGTCAAACATC	3194

AL672104.4	1201	ACTTGCAGGAATTTTCTATTGGCCTCATTTTAGAATGTCTGTCTTACAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3195	ACTTGCAGGAATTTTCTATTGGCCTCATTTTAGAATGTCTGTCTTACAAA	3244

AL672104.4	1251	ATCATACGAAGATACTAAATCGTTGTTGGAAGTCATTAAGTTTTGGAATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3245	ATCATACGAAGATACTAAATCGTTGTTGGAAGTCATTAAGTTTTGGAATA	3294

AL672104.4	1301	GTTTGTTACATAGAAAAATCTGACAGATACAACAGTCTTCAAAGAAATTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3295	GTTTGTTACATAGAAAAATCTGACAGATACAACAGTCTTCAAAGAAATTC	3344

AL672104.4	1351	TGTTTCCTAGAAATCTCTTAGTGTTTCTGTGGCTCACAGGCTCCTATATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3345	TGTTTCCTAGAAATCTCTTAGTGTTTCTGTGGCTCACAGGCTCCTATATG	3394

AL672104.4	1401	CCTGGAGTGCCACAGGGAGAAGCTTAAATGAATGAAGAAAAAGTAATAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3395	CCTGGAGTGCCACAGGGAGAAGCTTAAATGAATGAAGAAAAAGTAATAGT	3444

AL672104.4	1451	CTGTCCCAGCCCAATGTGTGATGTTACTATCATTATCATTATTAATATTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3445	CTGTCCCAGCCCAATGTGTGATGTTACTATCATTATCATTATTAATATTT	3494

AL672104.4	1501	GTCTTTATATAGCAGCTCCCACTTGGGAATAGTTGCTAGGTGCCAGAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3495	GTCTTTATATAGCAGCTCCCACTTGGGAATAGTTGCTAGGTGCCAGAAAC	3544

AL672104.4	1551	TGGCCTGTATTTAACTGCATAATTTGTACTTATCTATCGTTTCATCATAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3545	TGGCCTGTATTTAACTGCATAATTTGTACTTATCTATCGTTTCATCATAT	3594

AL672104.4	1601	TAATTATCTTCTAATAGTTTTCATCCCACATTATAGAAAATAACCCTAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3595	TAATTATCTTCTAATAGTTTTCATCCCACATTATAGAAAATAACCCTAAG	3644

AL672104.4	1651	GCTCAGGTATTCTGAGTGGCTTGCCCAGGGTGATGGAGCTGATAAAATCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3645	GCTCAGGTATTCTGAGTGGCTTGCCCAGGGTGATGGAGCTGATAAAATCA	3694

AL672104.4	1701	AAAGCAGCATGGAATACGTTTATTTTATTACAAAATCTATAATATTTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3695	AAAGCAGCATGGAATACGTTTATTTTATTACAAAATCTATAATATTTTTA	3744

AL672104.4	1751	TTTTGCTATTCTAGACTCTGTTATTGTTGTGAAGCACCTTTAACTACTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3745	TTTTGCTATTCTAGACTCTGTTATTGTTGTGAAGCACCTTTAACTACTGC	3794

AL672104.4	1801	AAGATAGAAGTCTTGGCCTTCAGAGTAAAATTTCATCAATGCATAAAATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3795	AAGATAGAAGTCTTGGCCTTCAGAGTAAAATTTCATCAATGCATAAAATT	3844

AL672104.4	1851	AGACCTAAAGTTAGGGTCTTAGAGAATGTTATAACTGCTCCTTAGAACTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3845	AGACCTAAAGTTAGGGTCTTAGAGAATGTTATAACTGCTCCTTAGAACTA	3894

AL672104.4	1901	ACATAATTTCTGCCTAATTTCTTAGAGGGCCCTTAATAATATCAATTGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3895	ACATAATTTCTGCCTAATTTCTTAGAGGGCCCTTAATAATATCAATTGTA	3944

AL672104.4	1951	ATGGCATATCCCATTGATATTTTAGTTACGAAATTAATGGCATGTCAATT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732440.2	3945	ATGGCATATCCCATTGATATTTTAGTTACGAAATTAATGGCATGTCAATT	3994

Overview

Query
AL672104.4 - 63918 bps
Hit
AL732440.2 - 3994 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link