<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662869.2	1	GAATTCTACAGAGAAATTCCATATGGCTATCCCCTTATGCTGCAGGTGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50665	GAATTCTACAGAGAAATTCCATATGGCTATCCCCTTATGCTGCAGGTGCA	50714

AL662869.2	51	GAGAGACCTCCTGTTTATTCTCACGACAATCCTTCTCAGCACCCAGGGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50715	GAGAGACCTCCTGTTTATTCTCACGACAATCCTTCTCAGCACCCAGGGGA	50764

AL662869.2	101	CAGTTTCTCTCAGGTTTTTATGTCTAGAGATCTGCAGCTCATTGGAAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50765	CAGTTTCTCTCAGGTTTTTATGTCTAGAGATCTGCAGCTCATTGGAAGGC	50814

AL662869.2	151	AGGCAGATTTTCAGAGAGGAAAAGATTTTTGAAGATAATTTATGCTGCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50815	AGGCAGATTTTCAGAGAGGAAAAGATTTTTGAAGATAATTTATGCTGCAA	50864

AL662869.2	201	TCCCAACATCAACCATCACTTCAAATATTTTTCTATTTATAATCACTGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50865	TCCCAACATCAACCATCACTTCAAATATTTTTCTATTTATAATCACTGGG	50914

AL662869.2	251	AGTATAAATCTGAAAAGCTCTTTTACCTGTGATTCTGAACTCTCAATCCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50915	AGTATAAATCTGAAAAGCTCTTTTACCTGTGATTCTGAACTCTCAATCCG	50964

AL662869.2	301	GGTGAGAGAATAGAATAGGAGACAGGTTGGGAAGCTGCTCGTATTTTTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	50965	GGTGAGAGAATAGAATAGGAGACAGGTTGGGAAGCTGCTCGTATTTTTTA	51014

AL662869.2	351	TCTGTTAATGAGTGACCTGACTGCTTGCGAGTATTAAAGTTAGATGCCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51015	TCTGTTAATGAGTGACCTGACTGCTTGCGAGTATTAAAGTTAGATGCCCA	51064

AL662869.2	401	GGATTTAGAGCTGGTTTCCTATTTTTATGATGGAGTCTTCATTGTAGTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51065	GGATTTAGAGCTGGTTTCCTATTTTTATGATGGAGTCTTCATTGTAGTTG	51114

AL662869.2	451	TAGATTATGAAAGCATTTTGTTTTCCGCACTTTTATTGCCATATCTCCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51115	TAGATTATGAAAGCATTTTGTTTTCCGCACTTTTATTGCCATATCTCCTT	51164

AL662869.2	501	CTCTATTCAACATGCCTGGCTCTCTAGATATTCGCTAAAGCAAATCTGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51165	CTCTATTCAACATGCCTGGCTCTCTAGATATTCGCTAAAGCAAATCTGAA	51214

AL662869.2	551	ATCCCTAAATATTGAAATTGCAGTGAAAGAAATATTTTCGTACAGAGAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51215	ATCCCTAAATATTGAAATTGCAGTGAAAGAAATATTTTCGTACAGAGAAG	51264

AL662869.2	601	TTGGCTAAACAACATTCTTTAAACGTTAGGAAAATGTTGTTTTATTATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51265	TTGGCTAAACAACATTCTTTAAACGTTAGGAAAATGTTGTTTTATTATTT	51314

AL662869.2	651	ATTATTTTTTAAATTTTCTTTTTACCAAATAGATTTTTGATACAATTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51315	ATTATTTTTTAAATTTTCTTTTTACCAAATAGATTTTTGATACAATTTTA	51364

AL662869.2	701	TTTTATGGGTCAGAGAACCAAAAATAATATTTTATCTATCATTTGTACTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51365	TTTTATGGGTCAGAGAACCAAAAATAATATTTTATCTATCATTTGTACTT	51414

AL662869.2	751	TTAAAAGACATGGTAAAAGTTTTGAAAAATATGCAACATACATGGCTATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51415	TTAAAAGACATGGTAAAAGTTTTGAAAAATATGCAACATACATGGCTATC	51464

AL662869.2	801	AAATAAAGCTACTTTAAATTGTTTGGAGGCAGTCCTTCATGGAGGTGTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51465	AAATAAAGCTACTTTAAATTGTTTGGAGGCAGTCCTTCATGGAGGTGTGG	51514

AL662869.2	851	TAAAGGTTAGATAATCTCTCAAAATTTCCTCTAGCTGTAAAGCCAAATAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51515	TAAAGGTTAGATAATCTCTCAAAATTTCCTCTAGCTGTAAAGCCAAATAT	51564

AL662869.2	901	CCTATGGGCTCCCTAGAGATGTTTCCTAGTTCATTATTTTTTTTAACTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51565	CCTATGGGCTCCCTAGAGATGTTTCCTAGTTCATTATTTTTTTTAACTTT	51614

AL662869.2	951	AGTCACACCAAATCCTTTTCTTCTCTCATCAGCAATTTTTCAACCTCGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51615	AGTCACACCAAATCCTTTTCTTCTCTCATCAGCAATTTTTCAACCTCGAA	51664

AL662869.2	1001	TTATTCCCCATTTATAGGAAACACTCTAATGTCTGCATCTTTCTTCTGAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51665	TTATTCCCCATTTATAGGAAACACTCTAATGTCTGCATCTTTCTTCTGAT	51714

AL662869.2	1051	TTCCTATTGGTTCTTATTCTTTTCTAAGTGCCTGCCATTTCTATGGATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51715	TTCCTATTGGTTCTTATTCTTTTCTAAGTGCCTGCCATTTCTATGGATTT	51764

AL662869.2	1101	CCCACACATTCTTGCTTCTTTTCTCCTAATATGCAAAAGTTAATCCACTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51765	CCCACACATTCTTGCTTCTTTTCTCCTAATATGCAAAAGTTAATCCACTA	51814

AL662869.2	1151	CATTTGTACAAGAAAGGAACAAACAGGAAGCTATTTCACAAAATTATGTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51815	CATTTGTACAAGAAAGGAACAAACAGGAAGCTATTTCACAAAATTATGTC	51864

AL662869.2	1201	TGCTTTTGTCAGTGCACCTATAGAAGATAATCCCAAGTACTTTGCAAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51865	TGCTTTTGTCAGTGCACCTATAGAAGATAATCCCAAGTACTTTGCAAATA	51914

AL662869.2	1251	ATGTTAGAAAAAACCTTCAAAATATATTTCTGCCTTTCAGTAAACAGTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51915	ATGTTAGAAAAAACCTTCAAAATATATTTCTGCCTTTCAGTAAACAGTAT	51964

AL662869.2	1301	AAATTTAGTCAAATATTAAACCTCATTATAATTATCTTACTTATAATCCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	51965	AAATTTAGTCAAATATTAAACCTCATTATAATTATCTTACTTATAATCCC	52014

AL662869.2	1351	TCATGTGTTTTAACAGTTACTGAAAAAATTCTATTATTTCAATTCTGCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52015	TCATGTGTTTTAACAGTTACTGAAAAAATTCTATTATTTCAATTCTGCAA	52064

AL662869.2	1401	AAGAAAGAAAAATGAATACATTTCTTTCATAGAAAATGGAAATTTTATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52065	AAGAAAGAAAAATGAATACATTTCTTTCATAGAAAATGGAAATTTTATCT	52114

AL662869.2	1451	GATGGAAAGAAGGGGCAAATAGAGAAAACACATTTTACAAATGAAAAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52115	GATGGAAAGAAGGGGCAAATAGAGAAAACACATTTTACAAATGAAAAAGG	52164

AL662869.2	1501	CTAGAAATGTGTGGCAACTTTGGAGAGAACTGGTATGAAGCCAACAGACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52165	CTAGAAATGTGTGGCAACTTTGGAGAGAACTGGTATGAAGCCAACAGACC	52214

AL662869.2	1551	TCTGGGTTGATGGAGGAGAACCTGACTGTCAGTGTCACATTGATGAAACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52215	TCTGGGTTGATGGAGGAGAACCTGACTGTCAGTGTCACATTGATGAAACT	52264

AL662869.2	1601	AGAAGAAAAGAGAAAATTCACTTGGATACAATGTTTCTTCACATCTAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52265	AGAAGAAAAGAGAAAATTCACTTGGATACAATGTTTCTTCACATCTAAAA	52314

AL662869.2	1651	AGTGAGCTTATTTCAGGCAAAATAAAAATAAGACTTAAGAAAATGCATCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52315	AGTGAGCTTATTTCAGGCAAAATAAAAATAAGACTTAAGAAAATGCATCA	52364

AL662869.2	1701	CAAGAGAAGACAGAACTTTCAGTGGTCTAAATTCTTAGATACTTTAGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52365	CAAGAGAAGACAGAACTTTCAGTGGTCTAAATTCTTAGATACTTTAGAAG	52414

AL662869.2	1751	AAGACACTATTGGGTAAAATGAAGGAAGAATTGTTGAGTCTATTGGAAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52415	AAGACACTATTGGGTAAAATGAAGGAAGAATTGTTGAGTCTATTGGAAGA	52464

AL662869.2	1801	GTTTTTCTTATTCAGAGATTCAGGGGTGTGAAAAAGGAAAAAGTCTCAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52465	GTTTTTCTTATTCAGAGATTCAGGGGTGTGAAAAAGGAAAAAGTCTCAGT	52514

AL662869.2	1851	GCAACTGGAAACTAAAGGAACAATAACATTTGTCATCAAGTAAGTAATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52515	GCAACTGGAAACTAAAGGAACAATAACATTTGTCATCAAGTAAGTAATTT	52564

AL662869.2	1901	GGGATTTACTTTGAAAAAATTTAAAGGCTTAGGTAGAAGAAACTAAGCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52565	GGGATTTACTTTGAAAAAATTTAAAGGCTTAGGTAGAAGAAACTAAGCAC	52614

AL662869.2	1951	ATTATCTGATATAGCAGTGATAAAACTTCAAATATACCTCAGGCTAATAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732432.3	52615	ATTATCTGATATAGCAGTGATAAAACTTCAAATATACCTCAGGCTAATAT	52664

Overview

Query
AL662869.2 - 133836 bps
Hit
AL732432.3 - 52664 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link