<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL714003.6	1	GATCCTGTTGGTACGTCACAAAATTAGAGTTCCATTTTGAGTGTGCAGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	88804	GATCCTGTTGGTACGTCACAAAATTAGAGTTCCATTTTGAGTGTGCAGAT	88853

AL714003.6	51	GTTTTGTTTTGCTTATGTCAAGTAAAACATTATATATTTTGTTTTGTGTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	88854	GTTTTGTTTTGCTTATGTCAAGTAAAACATTATATATTTTGTTTTGTGTC	88903

AL714003.6	101	TCTGCTTTAGATCCACCACAAGTAACACTCTTTGCACGCATTGCATCTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	88904	TCTGCTTTAGATCCACCACAAGTAACACTCTTTGCACGCATTGCATCTGG	88953

AL714003.6	151	CCTTAGTATCAAAAAGGGAGAAGAGATTAGATTGGATGCTTACATATCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	88954	CCTTAGTATCAAAAAGGGAGAAGAGATTAGATTGGATGCTTACATATCTG	89003

AL714003.6	201	GATCTCCCTACCCAACTGTGACATGGCTCAGAAATGATGAGAATGTCAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89004	GATCTCCCTACCCAACTGTGACATGGCTCAGAAATGATGAGAATGTCAGG	89053

AL714003.6	251	CAGCCACCAGCTAAAAAGAAACCAGAAATTGTGAAGAAGAAAAAGAAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89054	CAGCCACCAGCTAAAAAGAAACCAGAAATTGTGAAGAAGAAAAAGAAGAC	89103

AL714003.6	301	TGTTCAACCTGAACCTGAAGAAGAATTCCATCCACCACTTGTAGATCGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89104	TGTTCAACCTGAACCTGAAGAAGAATTCCATCCACCACTTGTAGATCGCT	89153

AL714003.6	351	TGTCATATGAACAAACCAAAAAGGGTGAGACTGCACTGATGGTGCGTGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89154	TGTCATATGAACAAACCAAAAAGGGTGAGACTGCACTGATGGTGCGTGAT	89203

AL714003.6	401	GCCATCAGAACTGACCATGGAAATTTCACTATTAGAGTTGAGAATGCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89204	GCCATCAGAACTGACCATGGAAATTTCACTATTAGAGTTGAGAATGCCCA	89253

AL714003.6	451	TGGTTTTGCAACAGCATCTTGTGATGTCAATGTTCTTGGTAAGTGACTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89254	TGGTTTTGCAACAGCATCTTGTGATGTCAATGTTCTTGGTAAGTGACTTG	89303

AL714003.6	501	TAAAACAACTATGAATTTCCCCTGAACCATGTATTCAATCAATATATTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89304	TAAAACAACTATGAATTTCCCCTGAACCATGTATTCAATCAATATATTTA	89353

AL714003.6	551	TATTTATATATCAATATTTGTAAAAACTTACAGATAAGCCCGGCCCCCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89354	TATTTATATATCAATATTTGTAAAAACTTACAGATAAGCCCGGCCCCCCT	89403

AL714003.6	601	GTCAACTTTGGATTTGATGAGATCAGGAACACCTCAGTTGTTTGCACTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89404	GTCAACTTTGGATTTGATGAGATCAGGAACACCTCAGTTGTTTGCACTTG	89453

AL714003.6	651	GGATGCACCTCTTGATGATGGAGGTAGTGAGATCATCAACTACATACTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89454	GGATGCACCTCTTGATGATGGAGGTAGTGAGATCATCAACTACATACTGG	89503

AL714003.6	701	AAAAGAAAGACAACACTAGTGATGATATTGGATGGGTAACTGTGACCTCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89504	AAAAGAAAGACAACACTAGTGATGATATTGGATGGGTAACTGTGACCTCG	89553

AL714003.6	751	ACCCACAAGGGATACAATTATCCTGTAACCAAGCTTATTGAAGGAAAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89554	ACCCACAAGGGATACAATTATCCTGTAACCAAGCTTATTGAAGGAAAAGA	89603

AL714003.6	801	GTACATCTTCAGAGTCACCGCAGAAAATAAATTTGGCTGTGGACATCCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89604	GTACATCTTCAGAGTCACCGCAGAAAATAAATTTGGCTGTGGACATCCAT	89653

AL714003.6	851	GCTACTCTGAACCACTTGTTGCGAAGAATCAATTTGGTAAAACTGTATTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89654	GCTACTCTGAACCACTTGTTGCGAAGAATCAATTTGGTAAAACTGTATTT	89703

AL714003.6	901	TAGCTCTCTATTCGTAACAGTAGCTGGCCTATGTTACAGTTTATTGATGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89704	TAGCTCTCTATTCGTAACAGTAGCTGGCCTATGTTACAGTTTATTGATGT	89753

AL714003.6	951	TTTTATGTTGTTGTTTTTTAGAACCACCTGATGCTCCCAACGTGCCAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89754	TTTTATGTTGTTGTTTTTTAGAACCACCTGATGCTCCCAACGTGCCAAGA	89803

AL714003.6	1001	ATTGGAGAGGTCACCTCTAGCACAGTTGCTCTTAGCTGGCATGAGCCAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89804	ATTGGAGAGGTCACCTCTAGCACAGTTGCTCTTAGCTGGCATGAGCCAAA	89853

AL714003.6	1051	GGACAATGGCAGCCCTATCTTGGGCTATTGGGTTGAGAGACGTGAAGTCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89854	GGACAATGGCAGCCCTATCTTGGGCTATTGGGTTGAGAGACGTGAAGTCA	89903

AL714003.6	1101	ACAGCAAATACTGGATCAGAGTGAACAGCAATCTTCTGAGTGCATTAAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89904	ACAGCAAATACTGGATCAGAGTGAACAGCAATCTTCTGAGTGCATTAAAT	89953

AL714003.6	1151	GTTAAGGTTGAGGGTCTTATGGAAGGCCTTGTCTATGTCTTCAGGGTCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	89954	GTTAAGGTTGAGGGTCTTATGGAAGGCCTTGTCTATGTCTTCAGGGTCTG	90003

AL714003.6	1201	TGCTGAAAACTTAGCTGGCCCAGGAGAATTCAGCGTACCAACTGACCCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90004	TGCTGAAAACTTAGCTGGCCCAGGAGAATTCAGCGTACCAACTGACCCTC	90053

AL714003.6	1251	AGGCAGCAATGGATCCAATATGTAAGCATGATTTTTTTTCATTGTCACAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90054	AGGCAGCAATGGATCCAATATGTAAGCATGATTTTTTTTCATTGTCACAA	90103

AL714003.6	1301	TTGATGTAATTGTTTATTTGTGATTTTATCATTTTTGTATTATCAAAACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90104	TTGATGTAATTGTTTATTTGTGATTTTATCATTTTTGTATTATCAAAACA	90153

AL714003.6	1351	TTAGCATAGCATATTCTGGGTTTATAGAAGTCTAATTAAAACTCGTGAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90154	TTAGCATAGCATATTCTGGGTTTATAGAAGTCTAATTAAAACTCGTGAAT	90203

AL714003.6	1401	CAAATTAATTATATCTGAATTATATTTATAAATGTACCTTTTTTGCAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90204	CAAATTAATTATATCTGAATTATATTTATAAATGTACCTTTTTTGCAGTG	90253

AL714003.6	1451	CCCCCTGGCCCACCCGTACCAAAAATTGTTGATGTCACAAATACAACTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90254	CCCCCTGGCCCACCCGTACCAAAAATTGTTGATGTCACAAATACAACTAT	90303

AL714003.6	1501	TGATATCAGTTGGCAACCTCCATTGTACAATGGTGGTGGAGAAATCCTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90304	TGATATCAGTTGGCAACCTCCATTGTACAATGGTGGTGGAGAAATCCTTG	90353

AL714003.6	1551	GATATCATGTCGAGCGCTGTCTGGTTGGAGAGAAGGACTGGGTTCGCTGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90354	GATATCATGTCGAGCGCTGTCTGGTTGGAGAGAAGGACTGGGTTCGCTGC	90403

AL714003.6	1601	ACTGAGTTTAGATGCAAAGACCGCAAGTATACTGTAACTGGACTAACTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90404	ACTGAGTTTAGATGCAAAGACCGCAAGTATACTGTAACTGGACTAACTGA	90453

AL714003.6	1651	GGGAGCTGATTATAACCTTCGTGTATATGCTGTAAATGAAGGTGGACATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90454	GGGAGCTGATTATAACCTTCGTGTATATGCTGTAAATGAAGGTGGACATG	90503

AL714003.6	1701	GAGCCCCAGGCATGACTGAACCTGTTCAGGCTAAAGAACCTGAAGGTTTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90504	GAGCCCCAGGCATGACTGAACCTGTTCAGGCTAAAGAACCTGAAGGTTTG	90553

AL714003.6	1751	TTGAAAAAAAGCATCTAAATATAACGTCCAATAGAGGAACTGACTATAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90554	TTGAAAAAAAGCATCTAAATATAACGTCCAATAGAGGAACTGACTATAGT	90603

AL714003.6	1801	TCTTAAATGATATTCTTTTTCAATATTTTTTTATGTTACTTGAGATAATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90604	TCTTAAATGATATTCTTTTTCAATATTTTTTTATGTTACTTGAGATAATG	90653

AL714003.6	1851	TTATACCTGTTGTAAAGGAAGTTCACAAAAATTGTATATCTGAATTAATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90654	TTATACCTGTTGTAAAGGAAGTTCACAAAAATTGTATATCTGAATTAATT	90703

AL714003.6	1901	TAACAGAGGCTCCAGGAGTTGAGTTTGATATCTCTGTAAGGAATGGAGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90704	TAACAGAGGCTCCAGGAGTTGAGTTTGATATCTCTGTAAGGAATGGAGTC	90753

AL714003.6	1951	ATCATTAGAGCTGGAGAAACATTACGTCTCCCTGCTGTTGTTACTGGACG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732421.9	90754	ATCATTAGAGCTGGAGAAACATTACGTCTCCCTGCTGTTGTTACTGGACG	90803

Overview

Query
AL714003.6 - 136185 bps
Hit
AL732421.9 - 90803 bps
Total alignments
32
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001963200012000188804908031
298.7338807348973568-1311831961
398.72387873457735341311931961
410036738151581587-1312431961
5100367381516815881312431961
610036731343201343921312431961
791.07791137116771279-1931294231
883.72167349101672102020111691120341
989.366294120263120356115521156141
1084.371804368167882113121259216801
1185.07143324125189125512121274216011
1284.121533749844898821-121298216751
1396.8844967345173546138521386161
1410042867346073545-138532386171
1510041858151581599-138532386161
1698.8944908151681605138532386211
171003673134320134392138532386041
181003673134320134392-138543386151
1995.05801019856298662143844439441
2087.7395160120366120525151051512131
2190.44931359828298416-151080512151
2210038787346273539-169279693561
2310038788151681593-169279693561
2410038787346273539169279693561
2510038788151681593169279693561
261003673134320134392169279693511
271003673134320134392-169284693561
2884.21744588175182208-174372748331
2989.611402359855198785174597748271
3099.2901259500195125-174892750161
3197.2647731774517817-175019750911
3299.272994139500495416177446778581
Short-link