<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL627326.16	1	GAATTCCTTGGAAGAGAAGGCAGACAGAGTGTAAGAGACAGAGGAGATGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27334	GAATTCCTTGGAAGAGAAGGCAGACAGAGTGTAAGAGACAGAGGAGATGG	27383

AL627326.16	51	AGGACTCCAAAAAAACCTGACCTTATAAACCAACATGGTTAATGTTATAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27384	AGGACTCCAAAAAAACCTGACCTTATAAACCAACATGGTTAATGTTATAT	27433

AL627326.16	101	TAACCCACAGAGACTGAGACACCATGCACAAGGCCTTCATGGATCTGTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27434	TAACCCACAGAGACTGAGACACCATGCACAAGGCCTTCATGGATCTGTAT	27483

AL627326.16	151	TAAGTCCTTTGTGTGTATATTATGCCTTGTAGTTTATGCTGTTTATGGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27484	TAAGTCCTTTGTGTGTATATTATGCCTTGTAGTTTATGCTGTTTATGGGA	27533

AL627326.16	201	TTCTACATGTGAAAACAAGTAGACCTCTCCTCTTTGTGACTGCTGTTAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27534	TTCTACATGTGAAAACAAGTAGACCTCTCCTCTTTGTGACTGCTGTTAGG	27583

AL627326.16	251	CTTTTTCCCTACCATGTGCTTGTTTCACTCAATTATGATGTGTTAATTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27584	CTTTTTCCCTACCATGTGCTTGTTTCACTCAATTATGATGTGTTAATTTG	27633

AL627326.16	301	TGTTATATCTTATTTTATTAATTAGATTATATTTATTATTATACCTTAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27634	TGTTATATCTTATTTTATTAATTAGATTATATTTATTATTATACCTTAGA	27683

AL627326.16	351	ACACTGTTTGTTTTTTAATCAGAAATAGAAAGAGAATGGATCCAGAACAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27684	ACACTGTTTGTTTTTTAATCAGAAATAGAAAGAGAATGGATCCAGAACAG	27733

AL627326.16	401	AGGGAAGAGAGGGTAGAACGGGGAAGAGCAGAGAGAGGTGGATAATATGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27734	AGGGAAGAGAGGGTAGAACGGGGAAGAGCAGAGAGAGGTGGATAATATGT	27783

AL627326.16	451	AATCAGGATACAATATATGAGGAAAAATCTATTTTCAATAAAAGAAAAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27784	AATCAGGATACAATATATGAGGAAAAATCTATTTTCAATAAAAGAAAAAA	27833

AL627326.16	501	CTTTAAAAGAATCTCTCTGCAGTCTTTGACTTCATCACACAAGTTGGCAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27834	CTTTAAAAGAATCTCTCTGCAGTCTTTGACTTCATCACACAAGTTGGCAA	27883

AL627326.16	551	TGAATGAAATTCTCCCTTTCCTTACTTCTTTATTCCATCTTGGAATAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27884	TGAATGAAATTCTCCCTTTCCTTACTTCTTTATTCCATCTTGGAATAAAA	27933

AL627326.16	601	GATCAAATAGAGAGAGGTAGGAATGGGACAAACTTTGCAGGAATGGATGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27934	GATCAAATAGAGAGAGGTAGGAATGGGACAAACTTTGCAGGAATGGATGA	27983

AL627326.16	651	ACACAGCCTTGCCTGGAATGTGACTTAAGCCACAGAAGAATGCTGAAATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	27984	ACACAGCCTTGCCTGGAATGTGACTTAAGCCACAGAAGAATGCTGAAATA	28033

AL627326.16	701	TATTAAGTAATTTGAATACAAGATGTTGTAATGAGACCATATGAGATATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28034	TATTAAGTAATTTGAATACAAGATGTTGTAATGAGACCATATGAGATATC	28083

AL627326.16	751	ATAGACAGAGACTAAAGAGACTAGATTAAATATACCTACAATATTGCTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28084	ATAGACAGAGACTAAAGAGACTAGATTAAATATACCTACAATATTGCTAA	28133

AL627326.16	801	GAAGACAAGAATTCAGAAATCAACAGCTGAAAATGAGTTGAGAAAAAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28134	GAAGACAAGAATTCAGAAATCAACAGCTGAAAATGAGTTGAGAAAAAGAG	28183

AL627326.16	851	AGTTCTTTTATGTTTATACCACTTTATTGATACATATTCTGCAATTTAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28184	AGTTCTTTTATGTTTATACCACTTTATTGATACATATTCTGCAATTTAAA	28233

AL627326.16	901	TTTAAAACTTTCTTAACAACTAGACATATCTGTTGTCTCTTTTTACTAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28234	TTTAAAACTTTCTTAACAACTAGACATATCTGTTGTCTCTTTTTACTAAT	28283

AL627326.16	951	AGATTTACATTAGATTTAATCATATATTCAAAGTGCAAAGACTAGAAGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28284	AGATTTACATTAGATTTAATCATATATTCAAAGTGCAAAGACTAGAAGAA	28333

AL627326.16	1001	GATTCCAAAAGATGGATCATGTAATATCTCAAAATTCAGAGTAGCAGACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28334	GATTCCAAAAGATGGATCATGTAATATCTCAAAATTCAGAGTAGCAGACA	28383

AL627326.16	1051	TCATCATAAAGAAGCAGACATTTTAGGAAATTGACTAGAAAATCAACTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28384	TCATCATAAAGAAGCAGACATTTTAGGAAATTGACTAGAAAATCAACTGT	28433

AL627326.16	1101	TTCTAGGTCAATACGCAGGCAGAAGGAAAACATATAAAGAGCAAAAAATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28434	TTCTAGGTCAATACGCAGGCAGAAGGAAAACATATAAAGAGCAAAAAATT	28483

AL627326.16	1151	GAGTTTCTTTATCAGCTGACTTCAGGGAGTCCAAATCTGACCAGGTCGGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28484	GAGTTTCTTTATCAGCTGACTTCAGGGAGTCCAAATCTGACCAGGTCGGG	28533

AL627326.16	1201	TAGTCTTCATTTTCTTTGATTGCAGGATTAACCTATTGACCAGACATGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28534	TAGTCTTCATTTTCTTTGATTGCAGGATTAACCTATTGACCAGACATGAT	28583

AL627326.16	1251	ACTTATTATTAGTGTTTGTATTCCTTTGACCTATGCCTTCTAAAGGCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28584	ACTTATTATTAGTGTTTGTATTCCTTTGACCTATGCCTTCTAAAGGCTGA	28633

AL627326.16	1301	ATTACATTTAATAAAATGTTATAAATGTGAAATTTCAGTCACAGGCATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28634	ATTACATTTAATAAAATGTTATAAATGTGAAATTTCAGTCACAGGCATGG	28683

AL627326.16	1351	ATTTCTGCTTCTGTCACAGGATACTGTCTTTATGTCATCTAGAAGCAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28684	ATTTCTGCTTCTGTCACAGGATACTGTCTTTATGTCATCTAGAAGCAAGA	28733

AL627326.16	1401	TTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28734	TTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	28783

AL627326.16	1451	ATACACATACATACATACATACACATAAACACACACACACACACACACAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28784	ATACACATACATACATACATACACATAAACACACACACACACACACACAC	28833

AL627326.16	1501	ACATATTCCCCTTAGGTTATTTGATGATAAATAAGTATATCACTTGCAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28834	ACATATTCCCCTTAGGTTATTTGATGATAAATAAGTATATCACTTGCAAT	28883

AL627326.16	1551	TACAAAGAAGGTAATCCAGTATTCTGACACTTGAGCCTACCCTTCTGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28884	TACAAAGAAGGTAATCCAGTATTCTGACACTTGAGCCTACCCTTCTGTTT	28933

AL627326.16	1601	GTCAAATGGACAATGGAAAAATGGAGGGCAGTTCTTTCATGTAAGAAGCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28934	GTCAAATGGACAATGGAAAAATGGAGGGCAGTTCTTTCATGTAAGAAGCA	28983

AL627326.16	1651	GGTCATTGATATAAGAATATCAAATGAGTTATTTTTGAGTACTCAATCGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	28984	GGTCATTGATATAAGAATATCAAATGAGTTATTTTTGAGTACTCAATCGA	29033

AL627326.16	1701	AGAAATGGGCATTAAAGATGACTTGAGGACTTGCTATGCTCTGTGCATAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29034	AGAAATGGGCATTAAAGATGACTTGAGGACTTGCTATGCTCTGTGCATAT	29083

AL627326.16	1751	CTTGTAATGGAGAGTTTTTAATAGAAGGTTAGATGCCTAACTTTTGATCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29084	CTTGTAATGGAGAGTTTTTAATAGAAGGTTAGATGCCTAACTTTTGATCT	29133

AL627326.16	1801	TGCAAAGTGAAGTGTTTCAAAATATATCATTCACTACATAAGTCACATCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29134	TGCAAAGTGAAGTGTTTCAAAATATATCATTCACTACATAAGTCACATCA	29183

AL627326.16	1851	TTCATAAAAGACAAAATTGAAGAGTAAGAAAATTACTCACCTTAGATATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29184	TTCATAAAAGACAAAATTGAAGAGTAAGAAAATTACTCACCTTAGATATT	29233

AL627326.16	1901	ATTCTTATGATGTACTCTAGAAGGTCTTTGTTTTTTGCCTCAATGGCTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29234	ATTCTTATGATGTACTCTAGAAGGTCTTTGTTTTTTGCCTCAATGGCTTC	29283

AL627326.16	1951	GGCCTTTGATAGGATCCTATAAGGGCATTCTGGCAAAGCACTGAGTTCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732408.4	29284	GGCCTTTGATAGGATCCTATAAGGGCATTCTGGCAAAGCACTGAGTTCTG	29333

Overview

Query
AL627326.16 - 184504 bps
Hit
AL732408.4 - 29333 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link