<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL592149.8	1	GAATTCCTTTGTAAAGGATCACTGATTATTGTTTGAACGTCAGTAGATTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	3828	GAATTCCTTTGTAAAGGATCACTGATTATTGTTTGAACGTCAGTAGATTT	3877

AL592149.8	51	TATACATGAATTTGGTTCTAACAAGACAGAACACGTGAGATATTTTTTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	3878	TATACATGAATTTGGTTCTAACAAGACAGAACACGTGAGATATTTTTTGT	3927

AL592149.8	101	ACTTTCTTTCTGAAGTAAACTTGTCAAGAATTAAAATCTAATCCACATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	3928	ACTTTCTTTCTGAAGTAAACTTGTCAAGAATTAAAATCTAATCCACATGC	3977

AL592149.8	151	TGAGATCAAAATGTATGTAAATATACTTCAAGTATTTTGTTATGGACAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	3978	TGAGATCAAAATGTATGTAAATATACTTCAAGTATTTTGTTATGGACAAT	4027

AL592149.8	201	ATTGCGTCGTACTCGGCCCCATGGTGTAATGGTTAGCACTCTGGACTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4028	ATTGCGTCGTACTCGGCCCCATGGTGTAATGGTTAGCACTCTGGACTTTG	4077

AL592149.8	251	AATCCAGCGATCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTTCTTTCCTTTTGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4078	AATCCAGCGATCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTTCTTTCCTTTTGCC	4127

AL592149.8	301	GTTCTACCAGTTACTGGATCATCTTGCTTACATTTCTTCCAGTGGCTGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4128	GTTCTACCAGTTACTGGATCATCTTGCTTACATTTCTTCCAGTGGCTGGA	4177

AL592149.8	351	TCCTCCTTCTCAATTCTGGTCTCTGCTAAGTAAGTATACGGGTGGTTAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4178	TCCTCCTTCTCAATTCTGGTCTCTGCTAAGTAAGTATACGGGTGGTTAGA	4227

AL592149.8	401	GAGTTAGCTGTTAGAGTGTCCATATTTTTCCGCAGCAATCTTTTCTCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4228	GAGTTAGCTGTTAGAGTGTCCATATTTTTCCGCAGCAATCTTTTCTCTGG	4277

AL592149.8	451	AATCTCTTCAAAATATATTTTCGAATGCAAAAAGAAATGTTAGCAATAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4278	AATCTCTTCAAAATATATTTTCGAATGCAAAAAGAAATGTTAGCAATAAG	4327

AL592149.8	501	CTAACATTAGTTATTAGGAGATATTCAGTGACTGTTTAAGAGTAATATGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4328	CTAACATTAGTTATTAGGAGATATTCAGTGACTGTTTAAGAGTAATATGG	4377

AL592149.8	551	TATAGTGGATTTTATGCTACACTTTAAAATGTGTTCTGTCCATGTTCTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4378	TATAGTGGATTTTATGCTACACTTTAAAATGTGTTCTGTCCATGTTCTGC	4427

AL592149.8	601	TTCTCCTTCCTCTGCATCCATCCACACCTCATCTCCTTAATCACCCGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4428	TTCTCCTTCCTCTGCATCCATCCACACCTCATCTCCTTAATCACCCGTTA	4477

AL592149.8	651	GCTCACCTTCACCTAGTTACAAGTGCTTCCCTTTTTAAAATTTCAGTTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4478	GCTCACCTTCACCTAGTTACAAGTGCTTCCCTTTTTAAAATTTCAGTTTT	4527

AL592149.8	701	TCCTTCCTTTTCTTCAAAGTTACTCAAAGTGAAATTGTTAGCATGGACTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4528	TCCTTCCTTTTCTTCAAAGTTACTCAAAGTGAAATTGTTAGCATGGACTC	4577

AL592149.8	751	TGTCTTGGAAAGGTTTGGGGTGCAGTGGTGCAGTGTGCTTATCTTAGGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4578	TGTCTTGGAAAGGTTTGGGGTGCAGTGGTGCAGTGTGCTTATCTTAGGGT	4627

AL592149.8	801	TCCTCTTGTTTGGGACATCCCCCAAGCCCCTACACTCACGTGTTGACATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4628	TCCTCTTGTTTGGGACATCCCCCAAGCCCCTACACTCACGTGTTGACATT	4677

AL592149.8	851	ATTTAGAAGATTAGCTGTCTATTGAAAGTGCAAGCGGGACTTTCAGTACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4678	ATTTAGAAGATTAGCTGTCTATTGAAAGTGCAAGCGGGACTTTCAGTACT	4727

AL592149.8	901	TACCTAGCTGAAGGCACTCAGGATATACCACATCTAGCACTTGGATTTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4728	TACCTAGCTGAAGGCACTCAGGATATACCACATCTAGCACTTGGATTTCA	4777

AL592149.8	951	AGCCTCAGATCTGTCTCTGTTTGGTGTCTTGGCTTTTCATTTTTGCCCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4778	AGCCTCAGATCTGTCTCTGTTTGGTGTCTTGGCTTTTCATTTTTGCCCAA	4827

AL592149.8	1001	ACTAGGAATATACCCAGCATGCATAGATACACACACCTTTAGACTTACAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4828	ACTAGGAATATACCCAGCATGCATAGATACACACACCTTTAGACTTACAC	4877

AL592149.8	1051	TCTCTCTTCTCAAATCCTACCTCCTTGAGTAAAGGAAGCCCTGGCAACAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4878	TCTCTCTTCTCAAATCCTACCTCCTTGAGTAAAGGAAGCCCTGGCAACAT	4927

AL592149.8	1101	CACCCACTTTTCTTATTTTTCTTATTCATTCTTATTAAAACACACACTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4928	CACCCACTTTTCTTATTTTTCTTATTCATTCTTATTAAAACACACACTCC	4977

AL592149.8	1151	CCTCCCCCAATTGCATTGGGTACAGAAGAAAAATGGAAGCATATTCTCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	4978	CCTCCCCCAATTGCATTGGGTACAGAAGAAAAATGGAAGCATATTCTCTG	5027

AL592149.8	1201	GTGTCCAGAGACAGGCTTGGATGTTAGTTAGGATCTAGCCTGAGACTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5028	GTGTCCAGAGACAGGCTTGGATGTTAGTTAGGATCTAGCCTGAGACTCAG	5077

AL592149.8	1251	AGTTTGTCCCTAGGGTTTGTCTTTTGATGCTGTGTAACCTCACAGCTTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5078	AGTTTGTCCCTAGGGTTTGTCTTTTGATGCTGTGTAACCTCACAGCTTCT	5127

AL592149.8	1301	CCACAGCACACTGACGTCTTTGATTTCAATGGAATGAGGTAGAAACTTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5128	CCACAGCACACTGACGTCTTTGATTTCAATGGAATGAGGTAGAAACTTGA	5177

AL592149.8	1351	TCAAACAACAAGACATTTCACATCTTGATTAGTATGACAATTAAAGAGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5178	TCAAACAACAAGACATTTCACATCTTGATTAGTATGACAATTAAAGAGTC	5227

AL592149.8	1401	ACTGGATATCTCCTGATAACTAATAATGATAGGTCACAGGTGTTACGGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5228	ACTGGATATCTCCTGATAACTAATAATGATAGGTCACAGGTGTTACGGCC	5277

AL592149.8	1451	TTTCTTTCCACTGTGACCTTCTACATCAAGTCTACTCTGATGTACAAACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5278	TTTCTTTCCACTGTGACCTTCTACATCAAGTCTACTCTGATGTACAAACA	5327

AL592149.8	1501	CCATTGTATTCTATCTTTTCTTTTTGTAATGAACCAATGTTCTTTCTTAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5328	CCATTGTATTCTATCTTTTCTTTTTGTAATGAACCAATGTTCTTTCTTAG	5377

AL592149.8	1551	TGTATCAGTTATGCCTTTTACTGATTAGGTATCTGAACAGTTCACCTGGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5378	TGTATCAGTTATGCCTTTTACTGATTAGGTATCTGAACAGTTCACCTGGT	5427

AL592149.8	1601	AGCATCCACCTAGAATGAAACCTCGCTCTTGTTCCTTCCTCCAAATCACG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5428	AGCATCCACCTAGAATGAAACCTCGCTCTTGTTCCTTCCTCCAAATCACG	5477

AL592149.8	1651	CAGCCCACGTGCAAGTGCCGCAAAGCCCTTTCTTACACCTTCTTGCTGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5478	CAGCCCACGTGCAAGTGCCGCAAAGCCCTTTCTTACACCTTCTTGCTGAG	5527

AL592149.8	1701	TCTTCCCAAGTTTCTTCTTATGATGTACTCTTACTTGCAGAGCAACAATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5528	TCTTCCCAAGTTTCTTCTTATGATGTACTCTTACTTGCAGAGCAACAATT	5577

AL592149.8	1751	CCAGTTCATCTGACTGCAGATGTGTTCTTGGTGATCTTTGCTTGGTTTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5578	CCAGTTCATCTGACTGCAGATGTGTTCTTGGTGATCTTTGCTTGGTTTGG	5627

AL592149.8	1801	TGTAGAAATAGACAACAATAAGGAATATATCAAGAGAAAATACCAAATGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5628	TGTAGAAATAGACAACAATAAGGAATATATCAAGAGAAAATACCAAATGA	5677

AL592149.8	1851	CCAGTTTTGTCACATTTTTCTCTATAAACTAAACAAAACAAAGTCCTCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5678	CCAGTTTTGTCACATTTTTCTCTATAAACTAAACAAAACAAAGTCCTCTC	5727

AL592149.8	1901	AGATATCCCAGCAAGTCTGTTTCTCAATGTTCATGCTCTGTTAAGAACCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5728	AGATATCCCAGCAAGTCTGTTTCTCAATGTTCATGCTCTGTTAAGAACCA	5777

AL592149.8	1951	ATAATAATTTAACATATCCCACCTGGGATCCTTGGAGTCTAGGATTATGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732361.6	5778	ATAATAATTTAACATATCCCACCTGGGATCCTTGGAGTCTAGGATTATGC	5827

Overview

Query
AL592149.8 - 184730 bps
Hit
AL732361.6 - 5827 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110019562000120001382858271
296.3974831093911021-1212122031
310072722152861347935501
Short-link