<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671987.12	1	GAATTCTCCCTCAAGCCCAGTAGAATGCTTTGGGAAGGCTATGGTGTTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47106	GAATTCTCCCTCAAGCCCAGTAGAATGCTTTGGGAAGGCTATGGTGTTGT	47155

AL671987.12	51	GTTTGGAGAGAATTGATGTGGCCAGAGCATGAGGCTGGATGAACCCACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47156	GTTTGGAGAGAATTGATGTGGCCAGAGCATGAGGCTGGATGAACCCACAT	47205

AL671987.12	101	GACTTTAATGAGTCAGGCCCCGAGCTGTCTGATTCATAACCCTGGGGGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47206	GACTTTAATGAGTCAGGCCCCGAGCTGTCTGATTCATAACCCTGGGGGAA	47255

AL671987.12	151	TGTGGGAGGAGAACTCTAAAGGAAAACTTGGGAGGGATTGGAGGATGTGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47256	TGTGGGAGGAGAACTCTAAAGGAAAACTTGGGAGGGATTGGAGGATGTGC	47305

AL671987.12	201	TATAAAGCCAATCTTCAGTCGTAATTCTGCTTGATTCATCTTATGGTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47306	TATAAAGCCAATCTTCAGTCGTAATTCTGCTTGATTCATCTTATGGTTTG	47355

AL671987.12	251	AAATACTATAAGACATGCTTTTTAAAAAACCTGAAGCTACTAGAAGTGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47356	AAATACTATAAGACATGCTTTTTAAAAAACCTGAAGCTACTAGAAGTGTT	47405

AL671987.12	301	GCTGTGGAAAGGAGCAAAGATACTTGTAAGGATTTTACTTTTGGGCTTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47406	GCTGTGGAAAGGAGCAAAGATACTTGTAAGGATTTTACTTTTGGGCTTTG	47455

AL671987.12	351	CATTTTTGTAGTGTTTTCTGACTTCCTTCGAGTAAACTAACGAAAGTTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47456	CATTTTTGTAGTGTTTTCTGACTTCCTTCGAGTAAACTAACGAAAGTTTA	47505

AL671987.12	401	AAACTCCATTGCCTTAGGAATGTTCAAAAAGAGCCAATAACGGGAAGTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47506	AAACTCCATTGCCTTAGGAATGTTCAAAAAGAGCCAATAACGGGAAGTTT	47555

AL671987.12	451	ACTCTGCGCGATTTGCTGGTCGTTCCAATGCAGCGCGTGCTGAAGTATCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47556	ACTCTGCGCGATTTGCTGGTCGTTCCAATGCAGCGCGTGCTGAAGTATCA	47605

AL671987.12	501	CCTCCTCCTTCAGGTCTGTACATTAACAGCGCAAATGCTACCATGCATTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47606	CCTCCTCCTTCAGGTCTGTACATTAACAGCGCAAATGCTACCATGCATTT	47655

AL671987.12	551	GCTCACCCCACAGAACACCGACGGGCGGCAGCCTCATGCAGAGTCTCCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47656	GCTCACCCCACAGAACACCGACGGGCGGCAGCCTCATGCAGAGTCTCCAT	47705

AL671987.12	601	ATTATAATTAGAGCTAAGTGTGAAATGGCCAGGACAGCTAGGTGTTTTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47706	ATTATAATTAGAGCTAAGTGTGAAATGGCCAGGACAGCTAGGTGTTTTAT	47755

AL671987.12	651	TTTCCTTTTAGCAAAAATAAATAAATAAAAAACAAATAAATAAAATAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47756	TTTCCTTTTAGCAAAAATAAATAAATAAAAAACAAATAAATAAAATAATT	47805

AL671987.12	701	CTGTCTTTACTAAGAAGACATTTTGTGTTCTTCATAAAGGATAGGAAAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47806	CTGTCTTTACTAAGAAGACATTTTGTGTTCTTCATAAAGGATAGGAAAAA	47855

AL671987.12	751	AAAAAAAACTAATGAATGAAACAGATACTAGTAAAAACGTGCCTTCTATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47856	AAAAAAAACTAATGAATGAAACAGATACTAGTAAAAACGTGCCTTCTATG	47905

AL671987.12	801	GCATGTTTTGGAGTTAGCGATAATCATTCGCTAGCGAGTCAATGAACCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47906	GCATGTTTTGGAGTTAGCGATAATCATTCGCTAGCGAGTCAATGAACCTG	47955

AL671987.12	851	AGTGTGCTCAGATTACCCTCATTAGACTGTCCGCCTTATCACAATAATTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	47956	AGTGTGCTCAGATTACCCTCATTAGACTGTCCGCCTTATCACAATAATTA	48005

AL671987.12	901	AGAGAATATTGTATCATGGGCTGTATTGCTTTTTCAGTGCACGAGATGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48006	AGAGAATATTGTATCATGGGCTGTATTGCTTTTTCAGTGCACGAGATGTA	48055

AL671987.12	951	CTAAGACGGCATCTATTGTGAGGGGATGCTTACTATAACACACAAAGTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48056	CTAAGACGGCATCTATTGTGAGGGGATGCTTACTATAACACACAAAGTTT	48105

AL671987.12	1001	ATGGTTTCCACGGTTAGTCCTCTAATGAGGGTGGAGAGTCTTATAAATTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48106	ATGGTTTCCACGGTTAGTCCTCTAATGAGGGTGGAGAGTCTTATAAATTT	48155

AL671987.12	1051	AATTTGATAGCTATACCAGGAGGCTCATTAGTTCTGCTCCAAAGAAATGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48156	AATTTGATAGCTATACCAGGAGGCTCATTAGTTCTGCTCCAAAGAAATGT	48205

AL671987.12	1101	CTCATTGTATTAGTCTGCGAACCCGGCTGATGCTTGTGGAATGTCATTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48206	CTCATTGTATTAGTCTGCGAACCCGGCTGATGCTTGTGGAATGTCATTTT	48255

AL671987.12	1151	AAAAAGATCTACTACCTGTACGTGAAATAGAATTTTGAGTCTTCTGTGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48256	AAAAAGATCTACTACCTGTACGTGAAATAGAATTTTGAGTCTTCTGTGCT	48305

AL671987.12	1201	TCGTACATCTTGTATATTAAATTTCTTGAACTGTAGCCATGCAATTATTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48306	TCGTACATCTTGTATATTAAATTTCTTGAACTGTAGCCATGCAATTATTC	48355

AL671987.12	1251	GTCATTTCTATTTTGGTTCTACTGAGAAATCAGAAAAATTCAAACCCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48356	GTCATTTCTATTTTGGTTCTACTGAGAAATCAGAAAAATTCAAACCCTGA	48405

AL671987.12	1301	TTATTTCTTAAAAATGCATTAAAACATTCATGAGACCTAAACTCAAAGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48406	TTATTTCTTAAAAATGCATTAAAACATTCATGAGACCTAAACTCAAAGCA	48455

AL671987.12	1351	ACTTAATCAAATTGGATTTTATGAAAAAATAATAAGGGGCAACTCAGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48456	ACTTAATCAAATTGGATTTTATGAAAAAATAATAAGGGGCAACTCAGGCA	48505

AL671987.12	1401	ATCAGCTTTCAAGGCTTTGCGGAGCTAAAAACAGGTCCAAAATAAGATAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48506	ATCAGCTTTCAAGGCTTTGCGGAGCTAAAAACAGGTCCAAAATAAGATAA	48555

AL671987.12	1451	TAATTTGTTTTGTTTCTTTGATGTCTTGAAGCACCGACTGAAGAATTTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48556	TAATTTGTTTTGTTTCTTTGATGTCTTGAAGCACCGACTGAAGAATTTAG	48605

AL671987.12	1501	AAGGTTCAGATCAAGAGTCAGACTCTTTGGGTCCTTGTAAGATTTTGTGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48606	AAGGTTCAGATCAAGAGTCAGACTCTTTGGGTCCTTGTAAGATTTTGTGC	48655

AL671987.12	1551	AGACTCAAAAACTAAGAAATACAATGATGTGTTTTTGAACTCTTTCCTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48656	AGACTCAAAAACTAAGAAATACAATGATGTGTTTTTGAACTCTTTCCTTA	48705

AL671987.12	1601	CCCTGCTTCTCCCCCTTCTGTTGTTTTGTATTTTAGAGTTCAAGACTACG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48706	CCCTGCTTCTCCCCCTTCTGTTGTTTTGTATTTTAGAGTTCAAGACTACG	48755

AL671987.12	1651	TGTAATTCTACAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTAGGAAGCTCTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48756	TGTAATTCTACAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTAGGAAGCTCTA	48805

AL671987.12	1701	TTTTTGGTACTATATGTGGATAAAAATTTTAGAGATTTTTTTTTAACTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48806	TTTTTGGTACTATATGTGGATAAAAATTTTAGAGATTTTTTTTTAACTTT	48855

AL671987.12	1751	TAACATATTTTGGAGCACTTGTCTGGTGTCTCGAGATATCAGTTTGTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48856	TAACATATTTTGGAGCACTTGTCTGGTGTCTCGAGATATCAGTTTGTAAT	48905

AL671987.12	1801	TTTTCTCCTTACTAGTGCACTTGCATGCTTTCTAATGGAAATCCCTTCCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48906	TTTTCTCCTTACTAGTGCACTTGCATGCTTTCTAATGGAAATCCCTTCCG	48955

AL671987.12	1851	ATGCTGGCTCATCTGAGGACAATGACATAAAATTTAAAATATTTCTGACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	48956	ATGCTGGCTCATCTGAGGACAATGACATAAAATTTAAAATATTTCTGACA	49005

AL671987.12	1901	AGCAGTGAGCCTGCATGGGTCTGACCTAGGCCCTCTGTGTGATGTTTCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	49006	AGCAGTGAGCCTGCATGGGTCTGACCTAGGCCCTCTGTGTGATGTTTCAG	49055

AL671987.12	1951	TAGTATAGATTGTGGGACTCCAACAGTGGCATTGGGAAGTCTCTGACTCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731716.10	49056	TAGTATAGATTGTGGGACTCCAACAGTGGCATTGGGAAGTCTCTGACTCC	49105

Overview

Query
AL671987.12 - 183333 bps
Hit
AL731716.10 - 49105 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link