<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL713890.7	1	GAATTCTTTGTAATGTTTCACTCTAAATTCTCATAAACTTTTTAAAAAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	81879	GAATTCTTTGTAATGTTTCACTCTAAATTCTCATAAACTTTTTAAAAAAC	81928

AL713890.7	51	TAAAATTTGATATGATAGAAAGTTTGTTATGGGTGTTGTTTAGGCATTTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	81929	TAAAATTTGATATGATAGAAAGTTTGTTATGGGTGTTGTTTAGGCATTTA	81978

AL713890.7	101	AGATAACCTAAAACTCTAAACAACAGACACATTTTCCAAGTGAAGGTTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	81979	AGATAACCTAAAACTCTAAACAACAGACACATTTTCCAAGTGAAGGTTTG	82028

AL713890.7	151	GTTCTATGTCAACATACTGCCAAACAAATATACATGTATACATGTATTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82029	GTTCTATGTCAACATACTGCCAAACAAATATACATGTATACATGTATTTA	82078

AL713890.7	201	CTTAAGTTAAAATAAAATGTTTACCACATTATATATTTACAAATCATTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82079	CTTAAGTTAAAATAAAATGTTTACCACATTATATATTTACAAATCATTCT	82128

AL713890.7	251	AATTATTCTCAACTGCAATTGACTTTTAAAAATAATTGTTCAACTACCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82129	AATTATTCTCAACTGCAATTGACTTTTAAAAATAATTGTTCAACTACCAG	82178

AL713890.7	301	GTCTTGCAATTGAATATATGGCTTTCACAAATGTGATAACTGATATGAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82179	GTCTTGCAATTGAATATATGGCTTTCACAAATGTGATAACTGATATGAAG	82228

AL713890.7	351	AAAATTAATATTTAACTAAGAATAACTGAGTGGCAACTCCAAATTTGGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82229	AAAATTAATATTTAACTAAGAATAACTGAGTGGCAACTCCAAATTTGGTC	82278

AL713890.7	401	ATCAGGAAAATCTTTTCTTAGGTTATATTTAAGCTGAAACAAAAATAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82279	ATCAGGAAAATCTTTTCTTAGGTTATATTTAAGCTGAAACAAAAATAACA	82328

AL713890.7	451	TAAAGGAGCTAGAAATAAGACAATGTACATGTAACAATCAGGAAAAGAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82329	TAAAGGAGCTAGAAATAAGACAATGTACATGTAACAATCAGGAAAAGAAA	82378

AL713890.7	501	TATTCCGGGCAGAAGGAACCATCCTAACGTAGACTAAACCTGAAATGTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82379	TATTCCGGGCAGAAGGAACCATCCTAACGTAGACTAAACCTGAAATGTTA	82428

AL713890.7	551	AAAAAACAGAAATGAGGTCAGTGGCAGAGATGGCTGGATTTCCACCAAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82429	AAAAAACAGAAATGAGGTCAGTGGCAGAGATGGCTGGATTTCCACCAAAA	82478

AL713890.7	601	TTTGTGCACTCCTCCTCCTGCTGCTTAGTGATATTGCTCAGAAATGGCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82479	TTTGTGCACTCCTCCTCCTGCTGCTTAGTGATATTGCTCAGAAATGGCAG	82528

AL713890.7	651	TCCAAGTAAGGACTCCACTTTCACGCTTTTTCATCTAGGTGGGGTCACAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82529	TCCAAGTAAGGACTCCACTTTCACGCTTTTTCATCTAGGTGGGGTCACAT	82578

AL713890.7	701	CACTAGTTCTCATCATGAAATGTGACTGAAAGTGAAGTGTGTTGCTGGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82579	CACTAGTTCTCATCATGAAATGTGACTGAAAGTGAAGTGTGTTGCTGGCA	82628

AL713890.7	751	CACCAAGGAATTAAGTAATAAGTGTGCCTTCTCCACCCTCTCTCTTTTGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82629	CACCAAGGAATTAAGTAATAAGTGTGCCTTCTCCACCCTCTCTCTTTTGC	82678

AL713890.7	801	CTTTCATCATTGGAAGCAGAGAGCAGAAAGTCCAGTAAAAGAGCAGAATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82679	CTTTCATCATTGGAAGCAGAGAGCAGAAAGTCCAGTAAAAGAGCAGAATC	82728

AL713890.7	851	ACAGCATGTGAAGGGCCTGGGTTCCTGAGTCACTATGTGGAGAAAAATAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82729	ACAGCATGTGAAGGGCCTGGGTTCCTGAGTCACTATGTGGAGAAAAATAT	82778

AL713890.7	901	CTAGGCTATTAGCAATCTGGCAATGGACTGTTATGTGAATAAGAAGAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82779	CTAGGCTATTAGCAATCTGGCAATGGACTGTTATGTGAATAAGAAGAGAA	82828

AL713890.7	951	TGTCTATTTAGCTAGTCCCCTGAAATTTTTATCTTTATTCCGTATAGCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82829	TGTCTATTTAGCTAGTCCCCTGAAATTTTTATCTTTATTCCGTATAGCAG	82878

AL713890.7	1001	CTGGTGTTACCCAAACTAATAAAATGAGACAGTTAAAAGGTAGACAGTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82879	CTGGTGTTACCCAAACTAATAAAATGAGACAGTTAAAAGGTAGACAGTGA	82928

AL713890.7	1051	ACTCAGTAGTAAGGGCAAAGAGCAGATCACAGAAGATTTTATTAGCCAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82929	ACTCAGTAGTAAGGGCAAAGAGCAGATCACAGAAGATTTTATTAGCCAGG	82978

AL713890.7	1101	CAGAAGATTTGATTAGCCAGGTAAGAAATCTAGGTTTAATTCTAGATGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	82979	CAGAAGATTTGATTAGCCAGGTAAGAAATCTAGGTTTAATTCTAGATGCT	83028

AL713890.7	1151	ATAAGAAAACATGTGAGGTGTTTAATCATGATACAGATGTGGTATAGATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83029	ATAAGAAAACATGTGAGGTGTTTAATCATGATACAGATGTGGTATAGATT	83078

AL713890.7	1201	AAGTTTTATAAACATTTCTAGCAGTTGTGTGGAAAATGAACTGTAGGAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83079	AAGTTTTATAAACATTTCTAGCAGTTGTGTGGAAAATGAACTGTAGGAAT	83128

AL713890.7	1251	CAAGAAGGAAGTAGGGCGATGGGGTAGGAGGCTATTTCAACAATTCAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83129	CAAGAAGGAAGTAGGGCGATGGGGTAGGAGGCTATTTCAACAATTCAGGA	83178

AL713890.7	1301	GGAATACGGCAGTATGTTAAAGTCAAGTGGCTACAAAGAAGATGAATAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83179	GGAATACGGCAGTATGTTAAAGTCAAGTGGCTACAAAGAAGATGAATAAA	83228

AL713890.7	1351	ATGGACTAGGTTGAGAAATATTTTATCATTTAATTGATAGAATTCACCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83229	ATGGACTAGGTTGAGAAATATTTTATCATTTAATTGATAGAATTCACCAA	83278

AL713890.7	1401	CTGGCTGAATGTGGAAGTTGAGAATGTGACAAATCAAGGATAATTCCTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83279	CTGGCTGAATGTGGAAGTTGAGAATGTGACAAATCAAGGATAATTCCTCC	83328

AL713890.7	1451	TTCCCCTGATGCCTTTCTGTTATTTCTTTTATTAAATAAAACCAGTGATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83329	TTCCCCTGATGCCTTTCTGTTATTTCTTTTATTAAATAAAACCAGTGATG	83378

AL713890.7	1501	TAAACTAAAAAGTGTGGAAGAAGCTAAAGGCAAGATACTCCCACACATCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83379	TAAACTAAAAAGTGTGGAAGAAGCTAAAGGCAAGATACTCCCACACATCT	83428

AL713890.7	1551	GAAGTCATAGATAGGTAGGATCTAGTATTTCATAACTGTCCAATCTGATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83429	GAAGTCATAGATAGGTAGGATCTAGTATTTCATAACTGTCCAATCTGATT	83478

AL713890.7	1601	ATTTAAACCTTAAATAGGGGCAGGACTCCAAGAGCTAAGCTGCTATTGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83479	ATTTAAACCTTAAATAGGGGCAGGACTCCAAGAGCTAAGCTGCTATTGAC	83528

AL713890.7	1651	TCCTCATTAGAAAACCTTAATAACAGAGCATCTTGGGGATCTATACCTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83529	TCCTCATTAGAAAACCTTAATAACAGAGCATCTTGGGGATCTATACCTGA	83578

AL713890.7	1701	AAATGTTCATAACAAAAGAGACTCACATGGACATGACAAATCTCAAATGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83579	AAATGTTCATAACAAAAGAGACTCACATGGACATGACAAATCTCAAATGA	83628

AL713890.7	1751	TATTGATATCTGCCCTAATTTTGCCAACCATATTTTCCTTGATGACTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83629	TATTGATATCTGCCCTAATTTTGCCAACCATATTTTCCTTGATGACTCCC	83678

AL713890.7	1801	TCCAAAATAGACAGTAGTAGCAGACACATGTTGGGGACTGTGTGTGAGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83679	TCCAAAATAGACAGTAGTAGCAGACACATGTTGGGGACTGTGTGTGAGGA	83728

AL713890.7	1851	GTGCCCTGTTACATAACTCCAGCTGCTTTTGCATTTGGGTCCTAGTGACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83729	GTGCCCTGTTACATAACTCCAGCTGCTTTTGCATTTGGGTCCTAGTGACT	83778

AL713890.7	1901	CATTCTTTCTCCATAAGAGATTACATCCCCATGAAACAGCAGCGGGCAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83779	CATTCTTTCTCCATAAGAGATTACATCCCCATGAAACAGCAGCGGGCAAC	83828

AL713890.7	1951	AGATTTCACCTAGCTTTTCAATATCTCATCACATTGGGCAGAAGTGATCG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731683.12	83829	AGATTTCACCTAGCTTTTCAATATCTCATCACATTGGGCAGAAGTGATCG	83878

Overview

Query
AL713890.7 - 35411 bps
Hit
AL731683.12 - 83878 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link