<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645745.7	1	GAATTCAGGCAAGTAAATGGGGACCGGACAAGAAAAGTACAAAATCGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74569	GAATTCAGGCAAGTAAATGGGGACCGGACAAGAAAAGTACAAAATCGCCA	74618

AL645745.7	51	TTACCTAGGACAGTGCTAACTCTGGGCTGACTACCCAGTCACTGAGTCAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74619	TTACCTAGGACAGTGCTAACTCTGGGCTGACTACCCAGTCACTGAGTCAC	74668

AL645745.7	101	CAGGCACAGCACGTGGGAGAGGCTGTATTTGCATAGTCTGGACTTATCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74669	CAGGCACAGCACGTGGGAGAGGCTGTATTTGCATAGTCTGGACTTATCTC	74718

AL645745.7	151	TCCCAAGAGAGACACCAACCAGAAAGAAAACCTGATCGGTGATCAGAGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74719	TCCCAAGAGAGACACCAACCAGAAAGAAAACCTGATCGGTGATCAGAGGG	74768

AL645745.7	201	GAAACCCTTTACTTAGAGCCCTACTTGGACTATCAAGGGCAACGGGGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74769	GAAACCCTTTACTTAGAGCCCTACTTGGACTATCAAGGGCAACGGGGACA	74818

AL645745.7	251	TTAATAAGCCCATTACTGTCACATGACCGTTAATGTCATGCACTGAAGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74819	TTAATAAGCCCATTACTGTCACATGACCGTTAATGTCATGCACTGAAGAC	74868

AL645745.7	301	ACAGTGTCACCTCTGTGGGACTTTTACCAAAACTGCACTGACCTCAACGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74869	ACAGTGTCACCTCTGTGGGACTTTTACCAAAACTGCACTGACCTCAACGT	74918

AL645745.7	351	AACCAGAACAAGCATCGGGCAATGGAGAGACATTCCGCAAAATCGCTGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74919	AACCAGAACAAGCATCGGGCAATGGAGAGACATTCCGCAAAATCGCTGAC	74968

AL645745.7	401	TAGCGGTACCAAAAAAACATTACAGCACAGATGACAGAGAGGTCCCCAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	74969	TAGCGGTACCAAAAAAACATTACAGCACAGATGACAGAGAGGTCCCCAAA	75018

AL645745.7	451	CTACCAGAGGGACTAGCCGTTAAAAAAAATTATTCTGCTCCCCTCAAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75019	CTACCAGAGGGACTAGCCGTTAAAAAAAATTATTCTGCTCCCCTCAAAAC	75068

AL645745.7	501	CAAAACGAGAGCCATGCAAAGTGGTACTCAGGGGACTGGGGCAGAATGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75069	CAAAACGAGAGCCATGCAAAGTGGTACTCAGGGGACTGGGGCAGAATGCT	75118

AL645745.7	551	CGCCACGAGTTCAGTGAGGCTAGCCTGGGCTACATATCAAGACTCTCTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75119	CGCCACGAGTTCAGTGAGGCTAGCCTGGGCTACATATCAAGACTCTCTCT	75168

AL645745.7	601	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACAATAAATAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75169	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACAATAAATAAAT	75218

AL645745.7	651	AGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75219	AGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGA	75268

AL645745.7	701	TAGATAAAAATAGAATCACCAAAATGTCCAATGCCCTGGCAGAAGCTAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75269	TAGATAAAAATAGAATCACCAAAATGTCCAATGCCCTGGCAGAAGCTAAG	75318

AL645745.7	751	CACCATGTACCTCTGGGTTGATGTAGGGGAAAAAATACAAAAAGAGATGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75319	CACCATGTACCTCTGGGTTGATGTAGGGGAAAAAATACAAAAAGAGATGG	75368

AL645745.7	801	AACTCAGTGTAAGCCACTGTATAATAATGAAACCATTCAACTTTATTTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75369	AACTCAGTGTAAGCCACTGTATAATAATGAAACCATTCAACTTTATTTAT	75418

AL645745.7	851	TCATCCACACAGCTACAGACACTTGATCTTCAAAAAATGCCATATATGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75419	TCATCCACACAGCTACAGACACTTGATCTTCAAAAAATGCCATATATGTA	75468

AL645745.7	901	TATATATATATATGAAAAGACAGCTATTGGGTTCTAATTGGAAGCCAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75469	TATATATATATATGAAAAGACAGCTATTGGGTTCTAATTGGAAGCCAAGA	75518

AL645745.7	951	AAAACTCACTTCAGAGACAGAAGTTTAAAAATTAAAGCTTTATTTTCTAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75519	AAAACTCACTTCAGAGACAGAAGTTTAAAAATTAAAGCTTTATTTTCTAG	75568

AL645745.7	1001	TCTTTCAAAGAGGCAGCCAGTTCTGCCTCTGAAACTGCACCCTCCAAAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75569	TCTTTCAAAGAGGCAGCCAGTTCTGCCTCTGAAACTGCACCCTCCAAAGG	75618

AL645745.7	1051	GAAACTGTACAATATTTTTATAGGATGGGAACACAAAGCAGGAGGTGGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75619	GAAACTGTACAATATTTTTATAGGATGGGAACACAAAGCAGGAGGTGGGG	75668

AL645745.7	1101	GTGGGGTGGAGGACCGAGTGGACTGTTGCATTGACCAATCATATTTTGAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75669	GTGGGGTGGAGGACCGAGTGGACTGTTGCATTGACCAATCATATTTTGAC	75718

AL645745.7	1151	ACAAGGAGTTAGTCAAGAACTTAATGTTGGTGGCTGGGTCTTATCCAGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75719	ACAAGGAGTTAGTCAAGAACTTAATGTTGGTGGCTGGGTCTTATCCAGGT	75768

AL645745.7	1201	CACGTGGTTTCAGGGTCCCAATTCAGCTTTTATAGTCAGGTCCTCTCCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75769	CACGTGGTTTCAGGGTCCCAATTCAGCTTTTATAGTCAGGTCCTCTCCTG	75818

AL645745.7	1251	GACTCTGGTCTGGAATTTAGAATAATGATGGAACAAAGGAGTCGACAAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75819	GACTCTGGTCTGGAATTTAGAATAATGATGGAACAAAGGAGTCGACAAAC	75868

AL645745.7	1301	TGCACATAGTCAATTAAATTAAGACAGGCAGTTGCCTATCTGTGTGCCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75869	TGCACATAGTCAATTAAATTAAGACAGGCAGTTGCCTATCTGTGTGCCTT	75918

AL645745.7	1351	AGTTCAGATAACGGGATAGACAGCTTTCTTCTTTGCACCCTTTACATATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75919	AGTTCAGATAACGGGATAGACAGCTTTCTTCTTTGCACCCTTTACATATT	75968

AL645745.7	1401	AACAGAAATGCCCGAGGAAGCAGATATAATAAGAGTTAGTTCTGGAACCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	75969	AACAGAAATGCCCGAGGAAGCAGATATAATAAGAGTTAGTTCTGGAACCT	76018

AL645745.7	1451	GGGAACGTGAACTCAGTTTGGTCCCACCAGCAAGATGGAACTTGTCCCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76019	GGGAACGTGAACTCAGTTTGGTCCCACCAGCAAGATGGAACTTGTCCCTG	76068

AL645745.7	1501	AGATAGGAGGACTCGGGGAAACTGTCTCCTAACAACAGCCTCTTCAACAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76069	AGATAGGAGGACTCGGGGAAACTGTCTCCTAACAACAGCCTCTTCAACAA	76118

AL645745.7	1551	AGTTTGCTAAAGAAAATGAACGGTCTACATGTATAAGAATGAAACTGGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76119	AGTTTGCTAAAGAAAATGAACGGTCTACATGTATAAGAATGAAACTGGAG	76168

AL645745.7	1601	CCCTCACGCTCGGCTGGATGTTTGCGGACACCAGGACTGCAAGATGGCGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76169	CCCTCACGCTCGGCTGGATGTTTGCGGACACCAGGACTGCAAGATGGCGG	76218

AL645745.7	1651	TGCTTGTGCCACTGAAGAAGAAGAAGCTCGTGGAGGTTAAAGTTGGAGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76219	TGCTTGTGCCACTGAAGAAGAAGAAGCTCGTGGAGGTTAAAGTTGGAGAG	76268

AL645745.7	1701	TGGCCGAGTTGGATATTGATGCGGGATTTCATCCCCAGTGGTACTGCAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76269	TGGCCGAGTTGGATATTGATGCGGGATTTCATCCCCAGTGGTACTGCAGG	76318

AL645745.7	1751	AGCCTTTCCAGAGAGGGCATGATCAATACTTACAAGTACACCAGCATTCG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76319	AGCCTTTCCAGAGAGGGCATGATCAATACTTACAAGTACACCAGCATTCG	76368

AL645745.7	1801	GAAAGGCAGCATCTCGGGGATTAATATGGTACTGGCAGCCTACGTGGCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76369	GAAAGGCAGCATCTCGGGGATTAATATGGTACTGGCAGCCTACGTGGCTT	76418

AL645745.7	1851	TCAACTACTGCATTTCTTACAAGGAACCGGAACAGCGAGGCAAGAACCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76419	TCAACTACTGCATTTCTTACAAGGAACCGGAACAGCGAGGCAAGAACCCA	76468

AL645745.7	1901	TGAAGAGGAGTCACTATGGAGGGCACTGGCTGCATGGCTGAGCATAACCG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76469	TGAAGAGGAGTCACTATGGAGGGCACTGGCTGCATGGCTGAGCATAACCG	76518

AL645745.7	1951	TCTGCCCCACTCCAATCTAGGAAGAATTAAACTGGCTGAACCTTCATACC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL731659.9	76519	TCTGCCCCACTCCAATCTAGGAAGAATTAAACTGGCTGAACCTTCATACC	76568

Overview

Query
AL645745.7 - 137942 bps
Hit
AL731659.9 - 76568 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link