<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL590870.14	214308	GAATTCTGTTAATTTATAGGGTTATATGCTGCCTTTTCCTTCAACTATAC	214259
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	79955	GAATTCTGTTAATTTATAGGGTTATATGCTGCCTTTTCCTTCAACTATAC	80004

C  AL590870.14	214258	ATATATGTTAGGATTAACTTCAAAAGTTATTTGGTGTGCCACTCCTAACC	214209
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80005	ATATATGTTAGGATTAACTTCAAAAGTTATTTGGTGTGCCACTCCTAACC	80054

C  AL590870.14	214208	CTAAAGACTTGCTATAGCTTCTCATATATCGTCTTGCCTTCTAATCAACC	214159
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80055	CTAAAGACTTGCTATAGCTTCTCATATATCGTCTTGCCTTCTAATCAACC	80104

C  AL590870.14	214158	ATAAGCAATAGAGTGCCCAGGCCATACATCCAAGGATGCTTCTGTCATGT	214109
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80105	ATAAGCAATAGAGTGCCCAGGCCATACATCCAAGGATGCTTCTGTCATGT	80154

C  AL590870.14	214108	TCTTCCTTTATTCCCAGTCCTGTCTGTAAGTCCTGTCAGATTCCAAATGG	214059
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80155	TCTTCCTTTATTCCCAGTCCTGTCTGTAAGTCCTGTCAGATTCCAAATGG	80204

C  AL590870.14	214058	TTTTAGAGTGGTAGGCAGGTGGTGGCAGGAAACTCTAAGACTATGTGATT	214009
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80205	TTTTAGAGTGGTAGGCAGGTGGTGGCAGGAAACTCTAAGACTATGTGATT	80254

C  AL590870.14	214008	TGACAGGGCAGTCTCATTGCTATTGTCTCTATTCGCAGGTGGGCAGGTTC	213959
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80255	TGACAGGGCAGTCTCATTGCTATTGTCTCTATTCGCAGGTGGGCAGGTTC	80304

C  AL590870.14	213958	TCTATGCCATTTATTCACCAGTGAATAGCTAGCACGGTTGATTGACTCAT	213909
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80305	TCTATGCCATTTATTCACCAGTGAATAGCTAGCACGGTTGATTGACTCAT	80354

C  AL590870.14	213908	GCTTACAATGTTAAAGTTCCTCTTCCATCCAAGCTTCTAATGAGAAGGCT	213859
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80355	GCTTACAATGTTAAAGTTCCTCTTCCATCCAAGCTTCTAATGAGAAGGCT	80404

C  AL590870.14	213858	CTGAACACTCTTACTTTGTACCCAGGGCCATGTAAACCACATGCTTACAG	213809
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80405	CTGAACACTCTTACTTTGTACCCAGGGCCATGTAAACCACATGCTTACAG	80454

C  AL590870.14	213808	AGTGCTTGGCTACCCTTTACACAGTAGACATGCAGAAGATTCATTTGTTT	213759
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80455	AGTGCTTGGCTACCCTTTACACAGTAGACATGCAGAAGATTCATTTGTTT	80504

C  AL590870.14	213758	TGTCTTGAACTATTCATTTATTGATCTCTGCTTCCTGTGTCTCCTCCCTG	213709
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80505	TGTCTTGAACTATTCATTTATTGATCTCTGCTTCCTGTGTCTCCTCCCTG	80554

C  AL590870.14	213708	GATGGAGTCTCCTTTTGTTTGTCTCTTTGGTATCTGCCAATCATCTGTTT	213659
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80555	GATGGAGTCTCCTTTTGTTTGTCTCTTTGGTATCTGCCAATCATCTGTTT	80604

C  AL590870.14	213658	GATCTTCAATTATGTTTAAAAATATTTCTTATTATTACGTATATGTATAT	213609
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80605	GATCTTCAATTATGTTTAAAAATATTTCTTATTATTACGTATATGTATAT	80654

C  AL590870.14	213608	GTGTATGTGTATGTGTATGTATGTGTATATATATATATATATATATATAT	213559
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80655	GTGTATGTGTATGTGTATGTATGTGTATATATATATATATATATATATAT	80704

C  AL590870.14	213558	ACATATATATATATGAGTGTTTGCCTGCATATATATAAGTACACATACAT	213509
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80705	ACATATATATATATGAGTGTTTGCCTGCATATATATAAGTACACATACAT	80754

C  AL590870.14	213508	TCATATATATATATATATAATATATTTTATATATATATATATATATATAT	213459
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80755	TCATATATATATATATATAATATATTTTATATATATATATATATATATAT	80804

C  AL590870.14	213458	ATATATATATATATATATATATATATATATATATTCATTCATGTGTATGT	213409
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80805	ATATATATATATATATATATATATATATATATATTCATTCATGTGTATGT	80854

C  AL590870.14	213408	GTGTGTGTACCACTTATGTGCCTGGTACTTGTGGAGCTGTATGAGAAGGT	213359
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80855	GTGTGTGTACCACTTATGTGCCTGGTACTTGTGGAGCTGTATGAGAAGGT	80904

C  AL590870.14	213358	GAGAAGGCTATTCGATTTGCTAGAACTAGAGTTACAGAAAGAAGGTTGTG	213309
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80905	GAGAAGGCTATTCGATTTGCTAGAACTAGAGTTACAGAAAGAAGGTTGTG	80954

C  AL590870.14	213308	AGTTGCTAGGGGGTGTTGGGAATTGAACCAAGAAAATCAGACTGCTCAGA	213259
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	80955	AGTTGCTAGGGGGTGTTGGGAATTGAACCAAGAAAATCAGACTGCTCAGA	81004

C  AL590870.14	213258	AGCACTGAGCCATTCCTCTCTCCCTAATCTTTAGATCTTTAGTTATCTTC	213209
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81005	AGCACTGAGCCATTCCTCTCTCCCTAATCTTTAGATCTTTAGTTATCTTC	81054

C  AL590870.14	213208	TGATCATTCTTTAAACTATCAAAGTTTTCTACTCCCAAACCCACTAGTTT	213159
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81055	TGATCATTCTTTAAACTATCAAAGTTTTCTACTCCCAAACCCACTAGTTT	81104

C  AL590870.14	213158	AGTAATAGAACAGGCAGATACCTCATAAGTGCATCCTCAGTTATGCCAGG	213109
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81105	AGTAATAGAACAGGCAGATACCTCATAAGTGCATCCTCAGTTATGCCAGG	81154

C  AL590870.14	213108	CTCCAAGATATTATTTTTATCCTTCTTCAAAGACAATGGGTACTTGAAGA	213059
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81155	CTCCAAGATATTATTTTTATCCTTCTTCAAAGACAATGGGTACTTGAAGA	81204

C  AL590870.14	213058	CATTTTGTTGGATTTTAAGAAGAATATTAACATTGTGCTTTTGAGTTCTT	213009
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81205	CATTTTGTTGGATTTTAAGAAGAATATTAACATTGTGCTTTTGAGTTCTT	81254

C  AL590870.14	213008	CAAATTAGTTGTTACTTCCTGGTTATCATTGCATGCAGTGCACTGTGATA	212959
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81255	CAAATTAGTTGTTACTTCCTGGTTATCATTGCATGCAGTGCACTGTGATA	81304

C  AL590870.14	212958	AATTCCCATTGTCCATTGCTGAAAATCATGCAGTGTATTTTATGATCCCT	212909
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81305	AATTCCCATTGTCCATTGCTGAAAATCATGCAGTGTATTTTATGATCCCT	81354

C  AL590870.14	212908	TGAAAATGAAAAATGTTTGTGTGTGGATGCAGCAGCTTGTACTTCATCAT	212859
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81355	TGAAAATGAAAAATGTTTGTGTGTGGATGCAGCAGCTTGTACTTCATCAT	81404

C  AL590870.14	212858	CCCAGACCCCTCAGCTCAGCTCTGGCTGCAGAGGTTTTTCTTAGGCAGAG	212809
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81405	CCCAGACCCCTCAGCTCAGCTCTGGCTGCAGAGGTTTTTCTTAGGCAGAG	81454

C  AL590870.14	212808	TGGTGAAGTCCACCCTCCTACTGGAGATACTGATTCAGGAAGGGGGAGGG	212759
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81455	TGGTGAAGTCCACCCTCCTACTGGAGATACTGATTCAGGAAGGGGGAGGG	81504

C  AL590870.14	212758	CTGCCCATTGTTCTGTACCTTGTTTCCACGTGAAGACTGATGGCTTCTGG	212709
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81505	CTGCCCATTGTTCTGTACCTTGTTTCCACGTGAAGACTGATGGCTTCTGG	81554

C  AL590870.14	212708	TGCTAATCCCCTGAGTCTAGCATTTCTGGGCTTATTTATATAAGCAAACC	212659
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81555	TGCTAATCCCCTGAGTCTAGCATTTCTGGGCTTATTTATATAAGCAAACC	81604

C  AL590870.14	212658	CACTGTGCAGGACTGCAACCTTATACACAGCCTGCTATTTTTATTAGCAC	212609
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81605	CACTGTGCAGGACTGCAACCTTATACACAGCCTGCTATTTTTATTAGCAC	81654

C  AL590870.14	212608	AATTACTCTTACCCTTCCATACAATCAAACGAGGGTGAAAAATTGAGACA	212559
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81655	AATTACTCTTACCCTTCCATACAATCAAACGAGGGTGAAAAATTGAGACA	81704

C  AL590870.14	212558	ATAATTAAACTTTAAAAATATATCATGGAAACAGGATTTTCACTTAAGTT	212509
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81705	ATAATTAAACTTTAAAAATATATCATGGAAACAGGATTTTCACTTAAGTT	81754

C  AL590870.14	212508	TTATTGAGGATTATGTTCTATTGATCACCTTCATTGAAATGGTTTTCAAG	212459
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81755	TTATTGAGGATTATGTTCTATTGATCACCTTCATTGAAATGGTTTTCAAG	81804

C  AL590870.14	212458	ACCAATGTGGCCTGTGTTGATTTAAACTAAATGTGCTTTTTAACAATGTT	212409
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81805	ACCAATGTGGCCTGTGTTGATTTAAACTAAATGTGCTTTTTAACAATGTT	81854

C  AL590870.14	212408	CTTCCTGCAAAGGTCTAAAATGTAGATTGACAGTTTGGCCTGAGAAAAAA	212359
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81855	CTTCCTGCAAAGGTCTAAAATGTAGATTGACAGTTTGGCCTGAGAAAAAA	81904

C  AL590870.14	212358	TATTTTAGTAAGTATAAAAATAATATTTGATAGGCTATGTTGTTTCTTTA	212309
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL731562.10	81905	TATTTTAGTAAGTATAAAAATAATATTTGATAGGCTATGTTGTTTCTTTA	81954

Overview

Query
AL590870.14 - 214308 bps
Hit
AL731562.10 - 81954 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000212309214308-179955819541
Short-link