<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732361.6	1	TTCTGTTGACTCCAGTACGACTTCTAGTGACCACATCTGACAAGGATATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119497	TTCTGTTGACTCCAGTACGACTTCTAGTGACCACATCTGACAAGGATATT	119546

AL732361.6	51	TAACCATATTTAATGACTCTAATATTTGAAATGTTAGGTTCTGCCTAATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119547	TAACCATATTTAATGACTCTAATATTTGAAATGTTAGGTTCTGCCTAATG	119596

AL732361.6	101	TATTTCTATAGGGTATTGACTCAAAGATTAAAAAAATTGAGACTAGTCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119597	TATTTCTATAGGGTATTGACTCAAAGATTAAAAAAATTGAGACTAGTCAG	119646

AL732361.6	151	GCATAGTGGCACACTTTTTATCCAGTCCTCAGGAGGCAGAGGCAGCTCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119647	GCATAGTGGCACACTTTTTATCCAGTCCTCAGGAGGCAGAGGCAGCTCCA	119696

AL732361.6	201	TTTCTGTGAGTTCCAGGCCAGATGGAGCAATGCAGTGAGACTTTGTTTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119697	TTTCTGTGAGTTCCAGGCCAGATGGAGCAATGCAGTGAGACTTTGTTTAA	119746

AL732361.6	251	ACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGAAAACCAACCAAACAACGACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119747	ACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGAAAACCAACCAAACAACGACCC	119796

AL732361.6	301	CAAGCAAACAAACAAGATCCTGCCAGGTAGCACTCATTAACCCTGGGAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119797	CAAGCAAACAAACAAGATCCTGCCAGGTAGCACTCATTAACCCTGGGAGA	119846

AL732361.6	351	ATCTGAGGCAAGGGCCTATATGTGTAGTTTAGGCCAGGTTTGAACCTTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119847	ATCTGAGGCAAGGGCCTATATGTGTAGTTTAGGCCAGGTTTGAACCTTGA	119896

AL732361.6	401	TAGCTGAGGATGACCTTGACCCTGCTGCTGTTTTACAGCCCATGTGATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119897	TAGCTGAGGATGACCTTGACCCTGCTGCTGTTTTACAGCCCATGTGATGG	119946

AL732361.6	451	ACTACAGGGTTGTCCCATCACATCAAGCTACAAGTACTTTAACGCCATTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119947	ACTACAGGGTTGTCCCATCACATCAAGCTACAAGTACTTTAACGCCATTG	119996

AL732361.6	501	TAGCTAAAGGATTGTCTATCTACCGTTTTTCTCATAAATTTAACTTTTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	119997	TAGCTAAAGGATTGTCTATCTACCGTTTTTCTCATAAATTTAACTTTTTT	120046

AL732361.6	551	GCTCTCCTTATTAACACGAGTTTATCTCCCACAGTTTCATTTCAGCAGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120047	GCTCTCCTTATTAACACGAGTTTATCTCCCACAGTTTCATTTCAGCAGAA	120096

AL732361.6	601	GACCCCGAATGACTGCTTATTGGCTTGCACGCAGCCTTTTGGGGTGGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120097	GACCCCGAATGACTGCTTATTGGCTTGCACGCAGCCTTTTGGGGTGGTTA	120146

AL732361.6	651	TAAAATATTTTGTACTATGTGTCCAGTAACAGTCTTCTACCCAAGACTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120147	TAAAATATTTTGTACTATGTGTCCAGTAACAGTCTTCTACCCAAGACTCA	120196

AL732361.6	701	AAAGCATGATTTTGGAAAAGAAAATTTTCAGTTTATGGATGCCTTCCGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120197	AAAGCATGATTTTGGAAAAGAAAATTTTCAGTTTATGGATGCCTTCCGAT	120246

AL732361.6	751	GACCAAAGTAGTCGACATCCTTCGCCCTCATGAGAGATCCTCCATCCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120247	GACCAAAGTAGTCGACATCCTTCGCCCTCATGAGAGATCCTCCATCCAGG	120296

AL732361.6	801	TAAACCGTCCTTAATATCCGACCCACATAATCTTTGGGTTTTCTTTGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120297	TAAACCGTCCTTAATATCCGACCCACATAATCTTTGGGTTTTCTTTGCCT	120346

AL732361.6	851	TGCTTGCCTGGCCTTCTCTTGCCAGGCCAGATAGGCTCTCACGATGTACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120347	TGCTTGCCTGGCCTTCTCTTGCCAGGCCAGATAGGCTCTCACGATGTACT	120396

AL732361.6	901	TCTGGCCAGTCTGGAACTGCTATGTAGACCGGGGGTGGGATGGGGTTGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120397	TCTGGCCAGTCTGGAACTGCTATGTAGACCGGGGGTGGGATGGGGTTGTG	120446

AL732361.6	951	AGGCGGGCTTTTTAGTCTGGGGTGGGTCTGGGATGACAGTGACAGAGATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120447	AGGCGGGCTTTTTAGTCTGGGGTGGGTCTGGGATGACAGTGACAGAGATC	120496

AL732361.6	1001	TGTCTGCCTTTGTAGTTTCCGTGCTGGAATAGCAGATGTAAGCCACCACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120497	TGTCTGCCTTTGTAGTTTCCGTGCTGGAATAGCAGATGTAAGCCACCACA	120546

AL732361.6	1051	CCTAGGTTGTTTCTAAAAGTTTTAATTTTTACTTTTTTTTTCTTTAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120547	CCTAGGTTGTTTCTAAAAGTTTTAATTTTTACTTTTTTTTTCTTTAAAAA	120596

AL732361.6	1101	TTTTTATTTTTAAGTTTTTTAAAAAAATGAGCACCATTTAAACTTTCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120597	TTTTTATTTTTAAGTTTTTTAAAAAAATGAGCACCATTTAAACTTTCTTT	120646

AL732361.6	1151	TGTAAGCCAGCTCTTTATTCCAATTGTTAGAAATAAGTAATTAAGAACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120647	TGTAAGCCAGCTCTTTATTCCAATTGTTAGAAATAAGTAATTAAGAACAA	120696

AL732361.6	1201	AGTTAGGTAACTCGATCAAGATTTAAGATATTTCTCATGCTCTTCAGATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120697	AGTTAGGTAACTCGATCAAGATTTAAGATATTTCTCATGCTCTTCAGATC	120746

AL732361.6	1251	TGTATACCAAATTTAGGACTTAGAGAAATTTGGTCCAGGAAACTGAAACG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120747	TGTATACCAAATTTAGGACTTAGAGAAATTTGGTCCAGGAAACTGAAACG	120796

AL732361.6	1301	TTTTCTGCTGTTTCGGTTTCTTGTTTTTTCTTTCTTTTGTTCCCTACTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120797	TTTTCTGCTGTTTCGGTTTCTTGTTTTTTCTTTCTTTTGTTCCCTACTCC	120846

AL732361.6	1351	AGAGCAGCCAATCATAGCTACCAAAAACACCTTGGAAGACACCATACTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120847	AGAGCAGCCAATCATAGCTACCAAAAACACCTTGGAAGACACCATACTTC	120896

AL732361.6	1401	TCTGTTCTGAAGAACGAATAGGATAGACGAGAGGGACCATATTGCTGGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120897	TCTGTTCTGAAGAACGAATAGGATAGACGAGAGGGACCATATTGCTGGCT	120946

AL732361.6	1451	TTCATTTCATTTCTTTCAGTGAAATAAAAACTCTATTTTTGTTTGAGATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120947	TTCATTTCATTTCTTTCAGTGAAATAAAAACTCTATTTTTGTTTGAGATA	120996

AL732361.6	1501	ATCTCTATTTTCTAATCATCTTTTAAAAATGGTTGCGTTGTCATTTTCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	120997	ATCTCTATTTTCTAATCATCTTTTAAAAATGGTTGCGTTGTCATTTTCTG	121046

AL732361.6	1551	GGTATTGGCTTTTTTCCCCTTACAAACTAACCAGATACAAGGATACCTAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121047	GGTATTGGCTTTTTTCCCCTTACAAACTAACCAGATACAAGGATACCTAT	121096

AL732361.6	1601	GTAAGAAAGAAAAACGCCAGTGTAACAAGGAGCATTGGTGGTTCAGTGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121097	GTAAGAAAGAAAAACGCCAGTGTAACAAGGAGCATTGGTGGTTCAGTGGT	121146

AL732361.6	1651	AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAGGCCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121147	AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAGGCCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATG	121196

AL732361.6	1701	CACTCTCTCACTTTTAAGTAATTCTTTTATGAAACTACCAAAATGAAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121197	CACTCTCTCACTTTTAAGTAATTCTTTTATGAAACTACCAAAATGAAACA	121246

AL732361.6	1751	AAACAAAACAAACAAAAGTTAAAACAAAACAAAAACCCAATCACAAACAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121247	AAACAAAACAAACAAAAGTTAAAACAAAACAAAAACCCAATCACAAACAA	121296

AL732361.6	1801	ACAAAAGGTGAAACCGAAAAAAAAATTGGATTCAAAACAAGGGGTTTGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121297	ACAAAAGGTGAAACCGAAAAAAAAATTGGATTCAAAACAAGGGGTTTGGC	121346

AL732361.6	1851	AAGTTCAAAGCTTCTGCAAGATTGGTATTAAAAGTTCTGACATTAAGTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121347	AAGTTCAAAGCTTCTGCAAGATTGGTATTAAAAGTTCTGACATTAAGTGT	121396

AL732361.6	1901	GCCTTTTGCCCTGTAACCCGAAACAATTCTTGCTGTGCTCCCGAGCTCCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121397	GCCTTTTGCCCTGTAACCCGAAACAATTCTTGCTGTGCTCCCGAGCTCCA	121446

AL732361.6	1951	GCTTCAGCTTGACCGATTTTCAGCAGGAAAAATTCTAAGTCGGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL714025.12	121447	GCTTCAGCTTGACCGATTTTCAGCAGGAAAAATTCTAAGTCGGTGAATTC	121496

Overview

Query
AL732361.6 - 5827 bps
Hit
AL714025.12 - 121496 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196920001200011194971214961
210071722121219211040051040761
397.65788525722656-11048821049661
Short-link