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Alignment #1 HSP: 4950 bps / non-identical: 2650 bps

Full alignment

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C  AL713987.7	4909	AAACAGATCCTTGATGTTCCTTATTTTTTATTTAATTCAAATTATTGTAA	4860

  AL732458.5	101	AACTCTGTTAACAAACGGAGCACTTCTGTGAGGTAGCTTGAACATTCAAG	150
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C  AL713987.7	4859	AACTCTGTTAACAAACGGAGCACTTCTGTGAGGTAGCTTGAACATTCAAG	4810

  AL732458.5	151	TTAGAAAAAAAACAAACTCTTGACCTCTTGCAATCCCACGTTTACATATC	200
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C  AL713987.7	4809	TTAGAAAAAAA-CAAACTCTTGACCTCTTGCAATCCCTCGTTTACATATC	4761

  AL732458.5	201	TCACAGTTTGCTATGGCAATGTTGTCATCATTAACTTTATAATACCTCCA	250
			|||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C  AL713987.7	4660	AAGTTAATTATTTATTTAATTATATAATTAAATAATAATTAATTTATTTG	4611

  AL732458.5	351	ATTAATAATTATAGAG--TTATTTATATGATTTATTAAATTTAACATCTA	398
			||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	4610	ATTAATAATTATAGAGAGTTATTTATATGATTTATTAAATTTAACATCTA	4561

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C  AL713987.7	4560	CCCCAACCCTAAACCCAACCGTCACAGTAATGTATAAATAATAATTATTG	4511

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C  AL713987.7	4510	TTATACAATGTCACAAAAATGATGCTATATTGATGTGCGTATCCGCAGCT	4461

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C  AL713987.7	4460	GTATCCAACTAGACTTTACCAAATACTTCAAGCCAGGGGGTAGGCATATG	4411

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C  AL713987.7	4410	AAGAGGGGGATTGGTAAAATGAGGTGGCGGGCCAAATTTCAGAGGATCCA	4361

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C  AL713987.7	4360	GATCCTTGTTCTGGCACAAAATAAGCCCTGGTTATTCTGTAAAACTACTT	4311

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C  AL713987.7	4310	TTTTTTTTTTTTTTTT-CAAACTACATTTGATTTGTGGCTAAACTAAGTA	4262

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C  AL713987.7	4261	AAGTACAAAAAATATTACTGTGAAATGACTAATAATAAAAAATGTCAATT	4212

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C  AL713987.7	4161	ATAAGTGTGAAGCACAGCGTAAATTAATCCTGTCAATTTTTACAGGGCCA	4112

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C  AL713987.7	4111	GTAGTATACACAACTGTTTCTGTAGAGACACACTCTGGTATTGGTTTAGT	4062

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C  AL713987.7	4061	ACTCGATATTGCTGAGCTCAGGTATTAGAATCTGTATTGGGAAGGGGAAA	4012

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C  AL713987.7	4011	AGGGTATCGGATCATCTCTAAAAAATTATGTGCTGGATTTTATTTCTATT	3962

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C  AL713987.7	3961	TTAAAACATTATTTTTATTATTAGTATTTAATTATATTCTTTTCACATAG	3912

  AL732458.5	1042	TGGGAGTGAATAATTCATTTTCATGGTGGACTGGAATATTGCAACGTTTA	1091
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3911	TGGGAGTGAATAATTCATTTTCATGGTGGACTGGAATATTGCAACGTTTA	3862

  AL732458.5	1092	TTATAATTGAATTATACATGCACATCAATGTTACTATTTTAATGTGTGTT	1141
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
C  AL713987.7	3861	TTATAATTGAATTATACATGCACATCAATGTTACTATTTTAATGTGTGTG	3812

  AL732458.5	1142	ACTT-------TTGTTAAAATAACTTCTCTTTCCCCTTGATGACACTCTT	1184
			 | |       |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3811	CCCTGAAAATCTTGTCAAAATAGCTTCTCTTTCCCCTTGATGACACTCTT	3762

  AL732458.5	1185	CAATGATTGTGTTTACTGGCATGAGGGCGGGATCAACCTGTCACTTAAAT	1234
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3761	CAATGATTGTGTTTACTGGCATGAGGGCGGGATCAACCTGTCACTTAAAT	3712

  AL732458.5	1235	GAGATCCACCAATAGCAAAACACAATTATTCAATTAAATCCTGATTGAAC	1284
			|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3711	GAGATCCACCAATAGCAAAACATAATTATTCAATTAAATCCTGATTGAAC	3662

  AL732458.5	1285	AGTTAGTTCTGTCCTACAGTTTTTCTTCTGTCATTTCACTTA----CTGT	1330
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||
C  AL713987.7	3661	AGTTAGTTCTGTCCTACAGTTTTTCTTCTGTCTTTTCACTTAGATACTGT	3612

  AL732458.5	1331	ATACATAATTATAAAAAGAGAAAAAACTGTCACATTTTCTGTTTCATGCT	1380
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3611	ATACATAATTATAAAAAGAGAAAAAACTGTCACATTTTCTGTTTCATGCT	3562

  AL732458.5	1381	GACTTTAATCCTAACACGACTTGAACATAAATAAATGTATTTAGCTATTT	1430
			|||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
C  AL713987.7	3561	GACTTTAATCATAACATGACTTGAACATAAATAGATGTATTTAGCTATTT	3512

  AL732458.5	1431	ATTTCATTTTTTTATCAACTCCCAAACCCAAGTTTCTTCCTCAATCTCTT	1480
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3511	ATTTCATTTTTT-ATCAACTCCCAAACCCAAGTTTCTTCCTCAATCTCTT	3463

  AL732458.5	1481	TTTTTAATCTAAATAATATTTTTGTACTTTATAACTATAGATATTTAAAT	1530
			|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3462	TTTTTAATTTAAAGAATATTTTTGTACTTTATAACTATAGATATTTAAAT	3413

  AL732458.5	1531	TTCTCTGTTTAAATAGTTTTGATTTTTTTT-ATAATATGAATATCATACA	1579
			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3412	TTCTCTGTTTAAATAGTTTTGATTTTTTTTTATAATATGAATATCATACA	3363

  AL732458.5	1580	AAGAAATACTACTCAGCTCTGTGTTAAATGAGTTGAACGGATTGTTTGCC	1629
			||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3362	AAGAAATACTATTCAGCTCTGTGTTAAATGAATTGAACGGATTGTTTGCC	3313

  AL732458.5	1630	CAAAAATTGTAATTATGTTATCATTTAATCACCTTTTATTTGCTTCAAAT	1679
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3312	CAAAAATTGTAATTATGTTATCATTTAATCACCTTTTATTTGCTTCAAAT	3263

  AL732458.5	1680	ATTTAAAGGTTCCTTTTTTTTGTTGAAAAAAATACTGAAACCCTTTCATA	1729
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C  AL713987.7	3262	ATTTAAAGGTTCCTTTTTTTTGTTGAAAAAAATACTGAAACCCTTTCATA	3213

  AL732458.5	1730	GTAGTTGTTTCTCCTATATTGAAGTCAATGGTTACAGGCTTTATACTTTC	1779
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C  AL713987.7	3212	GTAGTTGTTTCTCCTATATTGAAGTCAATGGTTACAGGCTTTATACTTTC	3163

  AL732458.5	1780	TTCAACATACTGTATCTTTTTTTGTGCTTAACAAAAGAAAGAAACACATA	1829
			|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3162	TTCAACATACTGTATCTTTTTT-GTGCTTAACAAAAGAAAGAAACACATA	3114

  AL732458.5	1830	AAAGTTTGGAACCAATTGAGGGTGAGTAAATGTTGAATTTCTTAAATTTT	1879
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C  AL713987.7	3113	AAAGTTTGGAACCAATTGAGGGTGAGTAAATGTTGAATTTCTTATATTTC	3064

  AL732458.5	1880	TAGATGAACTATCCCTTTCAATCAAACTATTCTAAAGGCCCCAGTATACT	1929
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C  AL713987.7	3063	TAGATGAACTATCCCTTTCAATCAAACTATTCTAAAGGCCCCAGTATACT	3014

  AL732458.5	1930	TAAAATACATTTCTTTTTTAATCTTTGTGTGAGGGCAAAAAAAAAAAAGT	1979
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C  AL713987.7	3013	TAAAATACATTTCTTTTTTAATCTTTGTGTGAGGGCCAAAAAAAAGA-GT	2965

  AL732458.5	1980	TAGATAAGGACATTTCATTTTTGAACATTTCAACATCTAAGAAAAGAAAT	2029
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C  AL713987.7	2964	TAGATAAGGACATTTCATTTTTGAACATTTCAACATCTAAGAAAAGAAAT	2915

  AL732458.5	2030	AATATGGCAATATTAGGTCTGCCAATGGGGTAGGGAAAATAATATTATTT	2079
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C  AL713987.7	2914	AATATGGCAATATTAGGTCTGCCAATGGGGTAGGGAAAATAATATTATTT	2865

  AL732458.5	2080	TTCTTTTTGACATAAGATTATTTTGCTTACCCCATTGGCAGATTATTTTG	2129
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C  AL713987.7	2864	TTCTTTTTGACATAAGATTATTTTGCTCACCCCATTGGCAGATTATTTTG	2815

  AL732458.5	2130	CTTGTTTAAAGGTAAAACTCACTTAATTTTGGCATATTATTTCATAAAAC	2179
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C  AL713987.7	2814	CTTGTTTTAAGGAAAAACTCACTTAATTTTGGCATATTATTTCTTAAAAC	2765

  AL732458.5	2180	AAGACGATATGTTTTGCTTGTCTAGAAAATTCTTCTTGATTTAAGAATAT	2229
			||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
C  AL713987.7	2764	AAGACGATATGTTTTGCTTGTCTTGAAAATTCTTCTTGATTTAAGAATCT	2715

  AL732458.5	2230	TTAAATATTTAGACTAGAACCAAGACAAAAAAAAATCTAAGGAAGAAAAG	2279
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C  AL713987.7	2714	TTAAATATTTAGACTAGAACCAAGACAAAAAAAAATCTAAGGAAGAAAAG	2665

  AL732458.5	2280	CCTTTTTGCAGTGTAGAAGGGATCAAATCTAATAGATTACATTATCAACT	2329
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C  AL713987.7	2664	CCTTTTTGCAGTGTAGAAGGGATCAAATCTAATAGATTACATTATCAACT	2615

  AL732458.5	2330	GTTTATTTTTTGCATGTAATTTGCTGTCAGTAGTGCACAACTATTTGTAA	2379
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C  AL713987.7	2614	GTTTATTTTTTGCATGTAATTTGCTGTCAGTAGTGCACAACTATTTGTAA	2565

  AL732458.5	2380	GTATTCTGGTTGTAACTGATCTGACATTTAAACTTGAGTGGTTGCCTGCA	2429
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2564	GTATTCTGGTTGTAACTGATCTGACATCTAAACTTGAGTGGTTGCCTGCA	2515

  AL732458.5	2430	GCGAAGGGCCTTATATCAAACCCGAACACAAAATCGTGAAAAAAAAAA-G	2478
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
C  AL713987.7	2514	GCGAAGGGCCTTATATCAAACCCGAACACAAAATCGTGAAAAAAAAAAAG	2465

  AL732458.5	2479	ACTGAAAGGAGTTGAAAATGTGTCAGCACACTACACAACACTCTGAGCCC	2528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2464	ACTGAAAGGAGTTGAAAATGTGTCAGCACACTACACAACACTCTGAGCCC	2415

  AL732458.5	2529	TTCACCACTAACTGTCAGATTTGCTCTTTCCTTGTTTCTCTCTCTCTCTG	2578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2414	TTCACCACTAACTGTCAGATTTGCTCTTTCCTTGTTTCTCTCTCTCTCTG	2365

  AL732458.5	2579	TCTTTCTCTTATGTTCCCAGAGAAAAGTACAGAGCCGTTGGCTGCGCACA	2628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2364	TCTTTCTCTTATGTTCCCAGAGAAAAGTACAGAGCCGTTGGCTGCGCACA	2315

  AL732458.5	2629	AAGTCCCAGCCTCCCCGCAAGCTTTTGTGCCAGCTCCTGTTGCGCCCGCG	2678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2314	AAGTCCCAGCCTCCCCGCAAGCTTTTGTGCCAGCTCCTGTTGCGCCCGCG	2265

  AL732458.5	2679	GTGGCATTAGTGCCCAGCCCTTGCAAGACAGCACCCGTGCATGCCAGCCC	2728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2264	GTGGCATTAGTGCCCAGCCCTTGCAAGACAGCACCCGTGCATGCCAGCCC	2215

  AL732458.5	2729	ACCCACCGAGCCGACAGGACTCGCAGTGGCCCTGAAGAACACCTCCAAAC	2778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2214	ACCCACCGAGCCGACAGGACTCGCAGTGGCCCTGAAGAACACCTCCAAAC	2165

  AL732458.5	2779	CAGCAGCGTTGCCAACGGCCCCGTCAGAGCCCAGCGTGGAGTCCGAGGAG	2828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2164	CAGCAGCGTTGCCAACGGCCCCGTCAGAGCCCAGCGTGGAGTCCGAGGAG	2115

  AL732458.5	2829	GAGAAAGCCAAAAAGCTCCTGTACTGTTCGTTGTGCAAAGTGGCTGTCAA	2878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2114	GAGAAAGCCAAAAAGCTCCTGTACTGTTCGTTGTGCAAAGTGGCTGTCAA	2065

  AL732458.5	2879	CTCCCTCTCTCAGCTGGAGGCCCACAACACAGGTGGGTAGAACATCTGCC	2928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2064	CTCCCTCTCTCAGCTGGAGGCCCACAACACAGGTGGGTAGAACATCTGCC	2015

  AL732458.5	2929	TCCGCGAGCAATCTCTTTCCTACGGCTTTCTCTGCGATATGCCTTCTTCT	2978
			|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2014	TCCGCGAGCAATCTCTTTCCCACAGCTTTCTCTGCGATATGCCTTCTTCT	1965

  AL732458.5	2979	TTAAATGTTTCATGAAGTGACCCTCCGAGGCTTGGGAATGTGGAAATGTA	3028
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1964	TTAAATGTTTCATGAAGTGACCCTCCGAGGCTTGGGAATGTGGAAATGTA	1915

  AL732458.5	3029	CTCACCGTTACAACATAAATCACAACTAGTGTGAGGCTCATCATTGATAA	3078
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1914	CTCACCGTTACAACATAAATCACAACTAGTGTGAGGCTCATCATTGATAA	1865

  AL732458.5	3079	TGCATGAAGAGCTGGAAAATGTAGACAGGGCCCCCACGATCATGGAAAAC	3128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1864	TGCATGAAGAGCTGGAAAATGTAGACAGGGCCCCCACGATCATGGAAAAC	1815

  AL732458.5	3129	CTGAGATATTGAGGAATTTTTTAAAAAGCCTGGGAAAGTCATGGAGACTA	3178
			|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
C  AL713987.7	1814	CTGAGATATTGAGGAATTTTTTTAAAAGCCTGGGAAAGTCATGGGGACTA	1765

  AL732458.5	3179	ATTAAATATTAAGAAGTCATGGACATTTATGTAGTCAATATAATTTTTTG	3228
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1764	ATTAAATAATAAGAAGTCATGGACATTTATGTAGTCAATATAATTTTTTG	1715

  AL732458.5	3229	TAGTTTGGCTCAGCTTTGATGTATTTCATCTACAAGAGATTGCCTCTGAA	3278
			||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1714	TAGTTAGGCTCAGCTTTGATGTATTTCATCTACAAGAGATTGCCTCTGAA	1665

  AL732458.5	3279	AACATTATCCAGACACACATGGAGGAATTTGATCTGTGGGTTGGAGTCAG	3328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1664	AACATTATCCAGACACACATGGAGGAATTTGATCTGTGGGTTGGAGTCAG	1615

  AL732458.5	3329	ACTTGGGCTGATGATATAGCTGCGAAAATATTTTAATGTTTTTCAGCCTA	3378
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
C  AL713987.7	1614	ACTTGGGCTGATGATATAGCTGCGAAAATATTGTAATGTTTTTTAGCCTA	1565

  AL732458.5	3379	TAGATGACATTTGGTATGTACTGTATCTCATTCATTCATTCATTCATTTT	3428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
C  AL713987.7	1564	TAGATGACATTTGGTATGTACTGTATCTCATTCATTCATT----CATTTT	1519

  AL732458.5	3429	CTTGTCGGCTTGTGCCTAGTTCAGACTGCGTGATTTTAGCCCCGATTTTG	3478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1518	CTTGTCGGCTTGTGCCTAGTTCAGACTGCGTGATTTTAGCCCCGATTTTG	1469

  AL732458.5	3479	GCTCACCGACAGGTTTTGAGAAATCGCCGACAAATGCCTGAAATCACAGG	3528
			|||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||
C  AL713987.7	1468	GCTCACCGACAGGTTTTGAGAAATCGTCAACAAATGCGTGAAATCACAGG	1419

  AL732458.5	3529	CAAATCGGTGCTCGTGCACGTGAGTGACAATCACACAGTATGAACTATCA	3578
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1418	CAAATCGGTGCTCGTGCGCGTGAGTGACAATCACACAGTATGAACTATCA	1369

  AL732458.5	3579	AAGAGAATCGCCGATGAGTCGCCGATGCCTGTGAGATATTTGGCATACTA	3628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1368	AAGAGAATCGCCGATGAGTCGCCGATGCCTGTGAGATATTTGGCATACTA	1319

  AL732458.5	3629	AATATCTGGAGCTGTTGGCGATTCAAATCATGCCGTGTGAATTAAGTTTT	3678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1318	AATATCTGGAGCTGTTGGCGATTCAAATCATGCCGTGTGAATTAAGTTTT	1269

  AL732458.5	3679	GAATGAAAATAACATCGGCGATCGCCTACAGCCAATGAGAGAGCAGCATT	3728
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1268	GAATGAAAATAACATCGCCGATCGCCTACAGCCAATGAGAGAGCAGCATT	1219

  AL732458.5	3729	TACTTGTGTGTGCGTGTGTGTATACCTGCTGCAGGCCAGCGGGAGGCTGG	3778
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
C  AL713987.7	1218	TACTTGTGTGTGCGTGTGTGTATACCTGCTGCAGGCCAGCTGGAGGCTGG	1169

  AL732458.5	3779	GGAAGAAGTTAAAATCGCTCTTTTTCGGTTTATTTGGACCCACGAAATGG	3828
			|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
C  AL713987.7	1168	GGAAGAAGTTAAAAGCGCTCTTTTTCGGTTTATTTGGAACCACGAAATGG	1119

  AL732458.5	3829	AGGAAAAACT-GTGGAGGTTTGACAGGACTCAGGAGCAACCGTGTCTGTT	3877
			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1118	AGGAAAAACTAGTGGAGGTTTGACAGGACTCAGGAGCAACCGTGTCTGTT	1069

  AL732458.5	3878	TGACGTTTCATACAGAAAGAAATTAGTTTATTATCAACGTTGAGGAGAAA	3927
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1068	TGACGTTTCATACAGAAAGAAATTAGTTTATTATCAACGTTGAGGAGAAA	1019

  AL732458.5	3928	TGGCTAATTCCCTTTAAACCCAGGTGAGCAAATATGTACATGTTCTACCC	3977
			|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
C  AL713987.7	1018	TGGCTAATTCCCTTAAAATCCAGGTGAGCAAATATGTACATTTTCTACCC	969

  AL732458.5	3978	CATTAAAGGCTTCTTACTCATTATGTAGTTAATAACAAAAGATATACTAC	4027
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	968	CATTAAAGGCTTCTTACTCATTATGTAGTTAATAACAAAAGATATACTAC	919

  AL732458.5	4028	GTGTTTTTGGCTGTGAGATGTAGTTTGGACGAAGTTGTCGGCGATTATTC	4077
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			||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
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Compact alignment

  AL732458.5	1	GATCCGATACTTATATAATAAATTTTAAAAAAGATTAAAGAAGAGCGAAG	50
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	4959	GATCCGATACTTATATAATAAATTTTTAAAAAGATTAAAGAAGAGCGAAG	4910

skip 100 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	151	TTAGAAAAAAAACAAACTCTTGACCTCTTGCAATCCCACGTTTACATATC	200
			||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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			|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	4710	GACTGCTGACATACTCGGGTTGTTGCTAGATCAGATAGGGCTGCGGTCGG	4661

skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	351	ATTAATAATTATAGAG--TTATTTATATGATTTATTAAATTTAACATCTA	398
			||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
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skip 250 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	649	TTTTTTTTTTTTTTTTTCAAACTACATTTGATTTGTGGCTAAACTAAGTA	698
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	799	ATAAGTGTGAAGCACAGCGTAAATTAATCCT-------TTTACAGGGCTA	841
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skip 150 bps 100% identity alignment

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			||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	1092	TTATAATTGAATTATACATGCACATCAATGTTACTATTTTAATGTGTGTT	1141
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			 | |       |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3811	CCCTGAAAATCTTGTCAAAATAGCTTCTCTTTCCCCTTGATGACACTCTT	3762

skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	1235	GAGATCCACCAATAGCAAAACACAATTATTCAATTAAATCCTGATTGAAC	1284
			|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||
C  AL713987.7	3661	AGTTAGTTCTGTCCTACAGTTTTTCTTCTGTCTTTTCACTTAGATACTGT	3612

skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	1381	GACTTTAATCCTAACACGACTTGAACATAAATAAATGTATTTAGCTATTT	1430
			|||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
C  AL713987.7	3561	GACTTTAATCATAACATGACTTGAACATAAATAGATGTATTTAGCTATTT	3512

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			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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			|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3462	TTTTTAATTTAAAGAATATTTTTGTACTTTATAACTATAGATATTTAAAT	3413

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			|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
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			||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
C  AL713987.7	3362	AAGAAATACTATTCAGCTCTGTGTTAAATGAATTGAACGGATTGTTTGCC	3313

skip 150 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	1780	TTCAACATACTGTATCTTTTTTTGTGCTTAACAAAAGAAAGAAACACATA	1829
			|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	1930	TAAAATACATTTCTTTTTTAATCTTTGTGTGAGGGCAAAAAAAAAAAAGT	1979
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||
C  AL713987.7	3013	TAAAATACATTTCTTTTTTAATCTTTGTGTGAGGGCCAAAAAAAAGA-GT	2965

skip 100 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	2080	TTCTTTTTGACATAAGATTATTTTGCTTACCCCATTGGCAGATTATTTTG	2129
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
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			||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
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			||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
C  AL713987.7	2764	AAGACGATATGTTTTGCTTGTCTTGAAAATTCTTCTTGATTTAAGAATCT	2715

skip 150 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	2380	GTATTCTGGTTGTAACTGATCTGACATTTAAACTTGAGTGGTTGCCTGCA	2429
			||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
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			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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skip 450 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	2929	TCCGCGAGCAATCTCTTTCCTACGGCTTTCTCTGCGATATGCCTTCTTCT	2978
			|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	2014	TCCGCGAGCAATCTCTTTCCCACAGCTTTCTCTGCGATATGCCTTCTTCT	1965

skip 150 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	3129	CTGAGATATTGAGGAATTTTTTAAAAAGCCTGGGAAAGTCATGGAGACTA	3178
			|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
C  AL713987.7	1814	CTGAGATATTGAGGAATTTTTTTAAAAGCCTGGGAAAGTCATGGGGACTA	1765

  AL732458.5	3179	ATTAAATATTAAGAAGTCATGGACATTTATGTAGTCAATATAATTTTTTG	3228
			|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1764	ATTAAATAATAAGAAGTCATGGACATTTATGTAGTCAATATAATTTTTTG	1715

  AL732458.5	3229	TAGTTTGGCTCAGCTTTGATGTATTTCATCTACAAGAGATTGCCTCTGAA	3278
			||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1714	TAGTTAGGCTCAGCTTTGATGTATTTCATCTACAAGAGATTGCCTCTGAA	1665

skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	3329	ACTTGGGCTGATGATATAGCTGCGAAAATATTTTAATGTTTTTCAGCCTA	3378
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
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			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	3479	GCTCACCGACAGGTTTTGAGAAATCGCCGACAAATGCCTGAAATCACAGG	3528
			|||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||
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			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
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skip 100 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	3679	GAATGAAAATAACATCGGCGATCGCCTACAGCCAATGAGAGAGCAGCATT	3728
			||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
C  AL713987.7	1268	GAATGAAAATAACATCGCCGATCGCCTACAGCCAATGAGAGAGCAGCATT	1219

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			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	3928	TGGCTAATTCCCTTTAAACCCAGGTGAGCAAATATGTACATGTTCTACCC	3977
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	4028	GTGTTTTTGGCTGTGAGATGTAGTTTGGACGAAGTTGTCGGCGATTATTC	4077
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C  AL713987.7	918	GTGTTTTTGTCTGTGAGACGTTGTTTGGACGAAGTTGTCGGCGATTCTTC	869

skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	4128	AGTGTAAACAAAGCAGCGACGAAACGCTAGCCCAGATAGTCATGCAGTAT	4177
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	4478	GTTTTTTTAGTTTAGTTCATCCAAAAATGTCAATTACCCCATGATTTACT	4527
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skip 50 bps 100% identity alignment

  AL732458.5	4727	GCTTTTGTAAGAAATTTGTCCATATTTAAAACTTTTAAACGAGTGGAGGC	4776
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