<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662827.3	1	GAATTCGCTAAGATTTTCCTGAACCACGAGCTTGTGAGATTTCTTCTAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68622	GAATTCGCTAAGATTTTCCTGAACCACGAGCTTGTGAGATTTCTTCTAGA	68671

AL662827.3	51	TTCGGTTTCTTTACCCATCCCACCATCATAACAGCAACCCTTCCTGCGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68672	TTCGGTTTCTTTACCCATCCCACCATCATAACAGCAACCCTTCCTGCGAA	68721

AL662827.3	101	ATTTATATTCCCTGAGAATTGGAGGATTATTGGGCATCTTGAGGGATAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68722	ATTTATATTCCCTGAGAATTGGAGGATTATTGGGCATCTTGAGGGATAAG	68771

AL662827.3	151	TAGAAATACCAACAGATAAAAAGTGTGAAGAAGCCTGTAGATGGAGGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68772	TAGAAATACCAACAGATAAAAAGTGTGAAGAAGCCTGTAGATGGAGGGTG	68821

AL662827.3	201	GAAGAAGTCTGAGTGGGACATTTACTCAGATGAGCCATAATTGACACTCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68822	GAAGAAGTCTGAGTGGGACATTTACTCAGATGAGCCATAATTGACACTCC	68871

AL662827.3	251	TTTCCTGTCGAAGTGTGAAGGAGTACATCCATCTTTCTTTGGCTTTTAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68872	TTTCCTGTCGAAGTGTGAAGGAGTACATCCATCTTTCTTTGGCTTTTAAG	68921

AL662827.3	301	AATCGAATCAATGAATGCAAGAATATTATTTCACTTGAGTATTTCTCTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68922	AATCGAATCAATGAATGCAAGAATATTATTTCACTTGAGTATTTCTCTCC	68971

AL662827.3	351	ACAAACCTAATGAATTCTTGGCTTTCTAGATACATAACGTTCTTTTTTTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	68972	ACAAACCTAATGAATTCTTGGCTTTCTAGATACATAACGTTCTTTTTTTT	69021

AL662827.3	401	TCCCTTAAGTCAGAATGTGTAGTTAGTTGTGGAAATAGCCTACCAGTATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69022	TCCCTTAAGTCAGAATGTGTAGTTAGTTGTGGAAATAGCCTACCAGTATG	69071

AL662827.3	451	TGTCCATGCGTGCAGGGCTAGGCCTGTCTTCTTGGCTTCTGTTGCATGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69072	TGTCCATGCGTGCAGGGCTAGGCCTGTCTTCTTGGCTTCTGTTGCATGGT	69121

AL662827.3	501	AGGTACTTAGGCGACGTTAGGGAATGGATAGTAGTAGGGATACTGTTGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69122	AGGTACTTAGGCGACGTTAGGGAATGGATAGTAGTAGGGATACTGTTGGC	69171

AL662827.3	551	TCTGTTGAGGAATTTGTAGAGGGAAATTCCTTCTGTTGGGTGCTCTGTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69172	TCTGTTGAGGAATTTGTAGAGGGAAATTCCTTCTGTTGGGTGCTCTGTGA	69221

AL662827.3	601	AACTAATAAGGCAGTGTGAAATACTGTACTTATTTCAGAGACCGGCTGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69222	AACTAATAAGGCAGTGTGAAATACTGTACTTATTTCAGAGACCGGCTGTG	69271

AL662827.3	651	AGGCTTAAGTAGAGGTGCAGCATTCATAAGTGTAATAGAGAATAACCTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69272	AGGCTTAAGTAGAGGTGCAGCATTCATAAGTGTAATAGAGAATAACCTTC	69321

AL662827.3	701	ATGGATGTATCTAACTAAAAATTAGAAATCTTATTTCATCTATATCTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69322	ATGGATGTATCTAACTAAAAATTAGAAATCTTATTTCATCTATATCTCTT	69371

AL662827.3	751	CCCACACCCATTTTGAAGTAAATCTTTTCACTTGTAAACATATAATTAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69372	CCCACACCCATTTTGAAGTAAATCTTTTCACTTGTAAACATATAATTAAA	69421

AL662827.3	801	TTTGAGGCTTAGTGCAGTGGCTCACTCGGAGGCTGAAGTGGGCGGATCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69422	TTTGAGGCTTAGTGCAGTGGCTCACTCGGAGGCTGAAGTGGGCGGATCCC	69471

AL662827.3	851	CTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCTCGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69472	CTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCTCGTC	69521

AL662827.3	901	ATTTAATTAATAAATTTGAAAGACCCTGCTCTCTTCTGAATCAACCTAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69522	ATTTAATTAATAAATTTGAAAGACCCTGCTCTCTTCTGAATCAACCTAAT	69571

AL662827.3	951	AATTTGACCCTTGGTCATGTTTATTTATTTATCCCGAGACAGAGTCTCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69572	AATTTGACCCTTGGTCATGTTTATTTATTTATCCCGAGACAGAGTCTCAC	69621

AL662827.3	1001	CCCGTCACCCAGGCCGGAGTGCAATGGTGCAATCTTATCTCACTGCAACC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69622	CCCGTCACCCAGGCCGGAGTGCAATGGTGCAATCTTATCTCACTGCAACC	69671

AL662827.3	1051	TCAGCCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCACACGCCCAGCTAATTTTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69672	TCAGCCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCACACGCCCAGCTAATTTTTG	69721

AL662827.3	1101	TATTTTTAGAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAAACTGGTCTTAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69722	TATTTTTAGAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAAACTGGTCTTAAA	69771

AL662827.3	1151	CTTCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69772	CTTCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT	69821

AL662827.3	1201	TATAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGCCACATTTATTTTTTGAGACTGTCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69822	TATAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGCCACATTTATTTTTTGAGACTGTCG	69871

AL662827.3	1251	CCCAGGCTGGAGTGGCGGAATCACTCTTCACTGCAGCCTCGACCTCCAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69872	CCCAGGCTGGAGTGGCGGAATCACTCTTCACTGCAGCCTCGACCTCCAGG	69921

AL662827.3	1301	GCTCAAGTCAATCCTCCTACCTCAACTTTCCAAGTAGTTGGGGCTACAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69922	GCTCAAGTCAATCCTCCTACCTCAACTTTCCAAGTAGTTGGGGCTACAGG	69971

AL662827.3	1351	TGTGCACCACCACATCTGGCTAATCTGGATCTTGCTGTGTTGTCCAGGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	69972	TGTGCACCACCACATCTGGCTAATCTGGATCTTGCTGTGTTGTCCAGGCT	70021

AL662827.3	1401	GGTCTTGAACTCCTGGGCTCAGTGATCCTCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70022	GGTCTTGAACTCCTGGGCTCAGTGATCCTCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGT	70071

AL662827.3	1451	GCTGGGATTACAGGCATATAGGCATGAGCCACGGTGAAGCCAACCCTTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70072	GCTGGGATTACAGGCATATAGGCATGAGCCACGGTGAAGCCAACCCTTGA	70121

AL662827.3	1501	TCTCTTTCTTGCAGATAGGAACTGCCATTTGTTTTAGTTTCCTGGAGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70122	TCTCTTTCTTGCAGATAGGAACTGCCATTTGTTTTAGTTTCCTGGAGCCT	70171

AL662827.3	1551	ACTGTAACAAGTTCATATAAACTAAGCAGAAAATTACTCTTGGCGCTGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70172	ACTGTAACAAGTTCATATAAACTAAGCAGAAAATTACTCTTGGCGCTGGA	70221

AL662827.3	1601	GGCACTTAAGAATCCTACCTTGCCTCTTCCTGTCTTCTGGTGGTTGTCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70222	GGCACTTAAGAATCCTACCTTGCCTCTTCCTGTCTTCTGGTGGTTGTCAG	70271

AL662827.3	1651	TAATCCTTAGTGTTCCTTGGCTTGTAGCTGCATTACTCCAATCTGTTGCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70272	TAATCCTTAGTGTTCCTTGGCTTGTAGCTGCATTACTCCAATCTGTTGCT	70321

AL662827.3	1701	GTCATCTCATGGTCCTCTTCGTGTCTCTCTCATGATTTGTCATTGGATCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70322	GTCATCTCATGGTCCTCTTCGTGTCTCTCTCATGATTTGTCATTGGATCT	70371

AL662827.3	1751	AGAGCCCACCCTAATCAAATATAACGTCATTTTACCTAATTATTTCCGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70372	AGAGCCCACCCTAATCAAATATAACGTCATTTTACCTAATTATTTCCGTA	70421

AL662827.3	1801	ACGACCTTATTTCCAAATAGGGCCACATTCTGATGTTCTAGTTGGACAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70422	ACGACCTTATTTCCAAATAGGGCCACATTCTGATGTTCTAGTTGGACAAA	70471

AL662827.3	1851	ATGAGGGGCAGGGCTCAGTATTCAGTTCCTCCTTCACTCTCCAAATCACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70472	ATGAGGGGCAGGGCTCAGTATTCAGTTCCTCCTTCACTCTCCAAATCACT	70521

AL662827.3	1901	TTGGTTCATGAGTTCAGATGGCATGGGTGCTAGTGCTGGTGTTGATGTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70522	TTGGTTCATGAGTTCAGATGGCATGGGTGCTAGTGCTGGTGTTGATGTGA	70571

AL662827.3	1951	TGCTACCAATGTAAGCATTAGTTTCTTTTTATAATAACTTGGGCAGTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713971.7	70572	TGCTACCAATGTAAGCATTAGTTTCTTTTTATAATAACTTGGGCAGTCAG	70621

Overview

Query
AL662827.3 - 110794 bps
Hit
AL713971.7 - 70621 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link