<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671681.4	1	GAATTCTGGGCAGGGGCAGGTGGGCATTACAGAAGAGTGATGACCAATCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33412	GAATTCTGGGCAGGGGCAGGTGGGCATTACAGAAGAGTGATGACCAATCC	33461

AL671681.4	51	CAGACAAAAGTCCTCAGGAGTCAGTGCAGGAGTCCTGGAGAAGAGAGACG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33462	CAGACAAAAGTCCTCAGGAGTCAGTGCAGGAGTCCTGGAGAAGAGAGACG	33511

AL671681.4	101	AGGCATGATCAGCACAGGGTACCCTGAGGGACACACCCTCTCCCCTAGTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33512	AGGCATGATCAGCACAGGGTACCCTGAGGGACACACCCTCTCCCCTAGTC	33561

AL671681.4	151	CTCAGTTCCCTCTGTAGCATCAAACAGAGGATGCTGAGGTCCAGGGCATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33562	CTCAGTTCCCTCTGTAGCATCAAACAGAGGATGCTGAGGTCCAGGGCATA	33611

AL671681.4	201	TCATCATCACGTTCCCCAATATCTGTGTAAAGGTAAAATCAGCTCATGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33612	TCATCATCACGTTCCCCAATATCTGTGTAAAGGTAAAATCAGCTCATGAG	33661

AL671681.4	251	GACACAGAACTTCAGCTTGATGCAGATATGTGGAGGTGGGGGAACAGCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33662	GACACAGAACTTCAGCTTGATGCAGATATGTGGAGGTGGGGGAACAGCAG	33711

AL671681.4	301	TTACCCTTCTGGGTAATATGAAGAGTTTGATTTTTTTAGTAAATTGGGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33712	TTACCCTTCTGGGTAATATGAAGAGTTTGATTTTTTTAGTAAATTGGGTG	33761

AL671681.4	351	ACACTTCATCTCCACCACTAGCAGCCTCTTTTAGTCACTGAAAATGCCTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33762	ACACTTCATCTCCACCACTAGCAGCCTCTTTTAGTCACTGAAAATGCCTA	33811

AL671681.4	401	CAGGCAGTAGCTAACAAAATGTGGCACAAAGTGGGCATCACCCTACTATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33812	CAGGCAGTAGCTAACAAAATGTGGCACAAAGTGGGCATCACCCTACTATC	33861

AL671681.4	451	TCACATTCAAGATGTGGCTCTGTCCCCACATTTCACAAAAAGATGCCACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33862	TCACATTCAAGATGTGGCTCTGTCCCCACATTTCACAAAAAGATGCCACC	33911

AL671681.4	501	AAAGTTAAGGCCTGGTTCTAGGAAACAATCTCTGGAGATTCGTAGAAACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33912	AAAGTTAAGGCCTGGTTCTAGGAAACAATCTCTGGAGATTCGTAGAAACT	33961

AL671681.4	551	GGCAAACTTTTCCCCTAAGTCTTAACCCTCATAGCAGCAAACAGGCCATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	33962	GGCAAACTTTTCCCCTAAGTCTTAACCCTCATAGCAGCAAACAGGCCATG	34011

AL671681.4	601	AACAGAGACCACTGTGCCCTGGAACACTCCGCTCATGCTCTTCTTTTTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34012	AACAGAGACCACTGTGCCCTGGAACACTCCGCTCATGCTCTTCTTTTTTT	34061

AL671681.4	651	TTTTTTGAGACAGACTCTAGCTCTATCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34062	TTTTTTGAGACAGACTCTAGCTCTATCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCG	34111

AL671681.4	701	CCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34112	CCATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCTT	34161

AL671681.4	751	GCCTCAACCTCCCAAGTAGCCGGGATTACAGATGCACACCACCACGTCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34162	GCCTCAACCTCCCAAGTAGCCGGGATTACAGATGCACACCACCACGTCCA	34211

AL671681.4	801	GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGCGGTTTCACCATGGCTCTTCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34212	GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGCGGTTTCACCATGGCTCTTCCC	34261

AL671681.4	851	TCTTATGCCTGTGCCCTCTCCCCTGACTGGATCATGGCTGAAATATTACC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34262	TCTTATGCCTGTGCCCTCTCCCCTGACTGGATCATGGCTGAAATATTACC	34311

AL671681.4	901	TGCTGGTGGAGGCCCTCGAGGTCCTACAAAAGGAAGTTATACAGAGAAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34312	TGCTGGTGGAGGCCCTCGAGGTCCTACAAAAGGAAGTTATACAGAGAAAG	34361

AL671681.4	951	GTCTTGTTAAACAAACAACCACTATCTTACCCCAAAGGAAAATGACACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34362	GTCTTGTTAAACAAACAACCACTATCTTACCCCAAAGGAAAATGACACAT	34411

AL671681.4	1001	GTAGTTTAATTGGGGTTATATCCTCTTCCCTCCCATGTTCTTTAAGTCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34412	GTAGTTTAATTGGGGTTATATCCTCTTCCCTCCCATGTTCTTTAAGTCCT	34461

AL671681.4	1051	TAAGCACCCTAAGTTAAAATCCCCCAAAACAAAGGAAATTGTCACTAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34462	TAAGCACCCTAAGTTAAAATCCCCCAAAACAAAGGAAATTGTCACTAGAA	34511

AL671681.4	1101	GACAAGGAGGCCAAGGCTCTGACCCTCATAATGGAGGAAGCTTTTAGAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34512	GACAAGGAGGCCAAGGCTCTGACCCTCATAATGGAGGAAGCTTTTAGAAA	34561

AL671681.4	1151	GGAGCCAGTGAGACGATGATGAACGGTAAGGACGCCCTGGAATAAGCTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34562	GGAGCCAGTGAGACGATGATGAACGGTAAGGACGCCCTGGAATAAGCTCT	34611

AL671681.4	1201	ATCAGTCAGCTCTGGCAGCGCTACCATTCACCCAGTAAAATCAGATTCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34612	ATCAGTCAGCTCTGGCAGCGCTACCATTCACCCAGTAAAATCAGATTCCA	34661

AL671681.4	1251	ATGCCTCCTCCAATCTTGTCCTGTCTCCTCGCACTTCCTCTCAGGGTAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34662	ATGCCTCCTCCAATCTTGTCCTGTCTCCTCGCACTTCCTCTCAGGGTAAG	34711

AL671681.4	1301	GAGGAAAGAGCTACATCTAGAGACAGAACCTCTCTGAATAGAGGGTCTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34712	GAGGAAAGAGCTACATCTAGAGACAGAACCTCTCTGAATAGAGGGTCTGG	34761

AL671681.4	1351	GTCACAGCTCATCTTCCCCATTTCCCCCTTGGGTTCCTCACCTTTCTGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34762	GTCACAGCTCATCTTCCCCATTTCCCCCTTGGGTTCCTCACCTTTCTGAC	34811

AL671681.4	1401	CCCTGTGACGGATGATAAGGCCCAGCCCGAGGAAGATCAGCCCCAGCACG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34812	CCCTGTGACGGATGATAAGGCCCAGCCCGAGGAAGATCAGCCCCAGCACG	34861

AL671681.4	1451	AAGCCTCCAATGCCACTCAGCATCTTGCTCTGGGCAGATTCAGACTGAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34862	AAGCCTCCAATGCCACTCAGCATCTTGCTCTGGGCAGATTCAGACTGAGC	34911

AL671681.4	1501	CCCTAAGGAGCAGAACTGAGTGTGAGTGTTTGTCCCCACACCCCATAATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34912	CCCTAAGGAGCAGAACTGAGTGTGAGTGTTTGTCCCCACACCCCATAATG	34961

AL671681.4	1551	TCCTTGGTACAGGAGGTGGAGATGTCAGGGGACACTAGTTCTCCAGTCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	34962	TCCTTGGTACAGGAGGTGGAGATGTCAGGGGACACTAGTTCTCCAGTCTG	35011

AL671681.4	1601	ACCACCCTAGGGAAGAGAAAGACCAGCCAGTAGGTCTTTGGACACAATAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35012	ACCACCCTAGGGAAGAGAAAGACCAGCCAGTAGGTCTTTGGACACAATAG	35061

AL671681.4	1651	GTGGGTGAGGGAGAGGAAGAAGCGCACCCCTGCCCCTCAGGACTTCATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35062	GTGGGTGAGGGAGAGGAAGAAGCGCACCCCTGCCCCTCAGGACTTCATCC	35111

AL671681.4	1701	ATAACCTTAAACCCTAAGGCCCCAGTCACCAGCCCTAAGTCAGTCTCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35112	ATAACCTTAAACCCTAAGGCCCCAGTCACCAGCCCTAAGTCAGTCTCTCA	35161

AL671681.4	1751	TAGCTGTCAGAGCTGGTTCTGGGGCTTTAGTAGTGTTGATATGGTTTGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35162	TAGCTGTCAGAGCTGGTTCTGGGGCTTTAGTAGTGTTGATATGGTTTGAT	35211

AL671681.4	1801	TCTGTGGCCCCACCCAAATTTCATGTTCAATTGTAATTAACAATGTTGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35212	TCTGTGGCCCCACCCAAATTTCATGTTCAATTGTAATTAACAATGTTGGA	35261

AL671681.4	1851	GGTAGAGCCTGGTGGGAGGTGACTGGATCATTAGACCAGATTCTTGTCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35262	GGTAGAGCCTGGTGGGAGGTGACTGGATCATTAGACCAGATTCTTGTCAC	35311

AL671681.4	1901	CATCTCCCTTAGTACTGTCATTACAATAGTGAGTTCTCATGAGATCTGGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35312	CATCTCCCTTAGTACTGTCATTACAATAGTGAGTTCTCATGAGATCTGGT	35361

AL671681.4	1951	TATGTAAAACTGCGTAGCACCAACCCCCTCTCTCTCATGCTCCTGCCCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713890.7	35362	TATGTAAAACTGCGTAGCACCAACCCCCTCTCTCTCATGCTCCTGCCCCT	35411

Overview

Query
AL671681.4 - 166803 bps
Hit
AL713890.7 - 35411 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link