<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669927.9	1	AGAATGTTTCACCATCATCTCACTGAGGAACGCAGACTGGGGTTGGGGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	118929	AGAATGTTTCACCATCATCTCACTGAGGAACGCAGACTGGGGTTGGGGGA	118978

AL669927.9	51	AGCAGTGCATGCTTGACTCGGGCACCTTAATGACTAAGCCGCTCTTGCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	118979	AGCAGTGCATGCTTGACTCGGGCACCTTAATGACTAAGCCGCTCTTGCTC	119028

AL669927.9	101	CAAGTGTCAAACCACAGATCACTTCATAAAGGAGGGCTGAGGACTGTCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119029	CAAGTGTCAAACCACAGATCACTTCATAAAGGAGGGCTGAGGACTGTCTG	119078

AL669927.9	151	GCACCCTTGTTGATGTCCGTTTTGGCTGTGAGGAAATGGTGCAGATAGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119079	GCACCCTTGTTGATGTCCGTTTTGGCTGTGAGGAAATGGTGCAGATAGCT	119128

AL669927.9	201	TCACTCAGATTTACAAGCCAGTATTCATCATAACAATCCGCAAAACTCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119129	TCACTCAGATTTACAAGCCAGTATTCATCATAACAATCCGCAAAACTCTT	119178

AL669927.9	251	AGAAGGACCGAGGTTGTGTGACAGAGTGAGTCAGGCTCTTTGTAATGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119179	AGAAGGACCGAGGTTGTGTGACAGAGTGAGTCAGGCTCTTTGTAATGGGA	119228

AL669927.9	301	TGTCTGCAGGGGAGGGTGGAGGAGAGAGGGCTGAATAACCATCCCTGAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119229	TGTCTGCAGGGGAGGGTGGAGGAGAGAGGGCTGAATAACCATCCCTGAAT	119278

AL669927.9	351	AACTGTCTCCTCTGCCTCCTCTCTAAATTGAATCATTTTATAAACAGGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119279	AACTGTCTCCTCTGCCTCCTCTCTAAATTGAATCATTTTATAAACAGGAA	119328

AL669927.9	401	ACAATTCATAGGTTTTGTAATGGTCATTATACAAACAGGAACCGGAAGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119329	ACAATTCATAGGTTTTGTAATGGTCATTATACAAACAGGAACCGGAAGTG	119378

AL669927.9	451	CATGAAACAGTGGAACGGTACCTCTATTTAAAGGTTCCTTTTCAAGGGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119379	CATGAAACAGTGGAACGGTACCTCTATTTAAAGGTTCCTTTTCAAGGGAC	119428

AL669927.9	501	AGTGATGGGGTATGTGAAGACAAATTGCACACTTATTAAGATTGCTGGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119429	AGTGATGGGGTATGTGAAGACAAATTGCACACTTATTAAGATTGCTGGAA	119478

AL669927.9	551	AACAAAAATTACTTTGGGGGACATACTACCTGATGAGCAGACTTTGTATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119479	AACAAAAATTACTTTGGGGGACATACTACCTGATGAGCAGACTTTGTATT	119528

AL669927.9	601	GAATTAGAAATAAAATTTTCTACTATATATATTATGTATTTCATATAGTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119529	GAATTAGAAATAAAATTTTCTACTATATATATTATGTATTTCATATAGTA	119578

AL669927.9	651	TCTTTTGGGGGGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTATCTCTTCCTGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119579	TCTTTTGGGGGGTGTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTATCTCTTCCTGTC	119628

AL669927.9	701	ATGGGATTCACTCTGTAGACCAGGGCTGGCCTTGAATTCAGAGATCTGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119629	ATGGGATTCACTCTGTAGACCAGGGCTGGCCTTGAATTCAGAGATCTGCC	119678

AL669927.9	751	TGCCTCTGCCTCCCAAATGCTGGGATTAAAGGTGTGCACTACCATCATCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119679	TGCCTCTGCCTCCCAAATGCTGGGATTAAAGGTGTGCACTACCATCATCA	119728

AL669927.9	801	GGAATATATAGTATCTTTAAAACAATACCTGGTATGTATGTGTCTTCTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119729	GGAATATATAGTATCTTTAAAACAATACCTGGTATGTATGTGTCTTCTTT	119778

AL669927.9	851	CTTCCTTTTTTATTTTTCTATTGTATTTTAATGAAGGTTTAAATTTTTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119779	CTTCCTTTTTTATTTTTCTATTGTATTTTAATGAAGGTTTAAATTTTTCT	119828

AL669927.9	901	TATAGCTACTTTTAATCTTAGTCTCATCTAAAGGTGACGTGTGCATGTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119829	TATAGCTACTTTTAATCTTAGTCTCATCTAAAGGTGACGTGTGCATGTTT	119878

AL669927.9	951	GTGTGTGCATAGGCTGCACATGGGTGTTGCATGGCATGAACGTATGGATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119879	GTGTGTGCATAGGCTGCACATGGGTGTTGCATGGCATGAACGTATGGATG	119928

AL669927.9	1001	TTGGGGAAAGTATTATTTACTAACTGGCTGGTGGAGACGTAAGAGGAAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119929	TTGGGGAAAGTATTATTTACTAACTGGCTGGTGGAGACGTAAGAGGAAAG	119978

AL669927.9	1051	GCTTTGGTTTTGGTTGTTCTGATCTGGGATTGTATGTTCTTGCATTTTAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	119979	GCTTTGGTTTTGGTTGTTCTGATCTGGGATTGTATGTTCTTGCATTTTAC	120028

AL669927.9	1101	ATGGTTGGTATTTTTCTGTTGTTTCCCAGCTTAACAGAAATAGATAGATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120029	ATGGTTGGTATTTTTCTGTTGTTTCCCAGCTTAACAGAAATAGATAGATA	120078

AL669927.9	1151	GATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120079	GATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA	120128

AL669927.9	1201	TTTTGTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGACTGTCCTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120129	TTTTGTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGACTGTCCTGG	120178

AL669927.9	1251	AACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120179	AACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCT	120228

AL669927.9	1301	CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGCCTGGCAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120229	CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGCCTGGCAGA	120278

AL669927.9	1351	AATAGATATTTTAAGATCCTTTATCTAAGTCACGTTTAACCTTTCCTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120279	AATAGATATTTTAAGATCCTTTATCTAAGTCACGTTTAACCTTTCCTCTT	120328

AL669927.9	1401	TATGTAAGGAGTCTTAACCTTATTTCTTATTCATTTTATATCAGTTATTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120329	TATGTAAGGAGTCTTAACCTTATTTCTTATTCATTTTATATCAGTTATTC	120378

AL669927.9	1451	AAAACCCAGAATCACAGAACTGGAATATAATTCAAGAGTGATTTGAAAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120379	AAAACCCAGAATCACAGAACTGGAATATAATTCAAGAGTGATTTGAAAGG	120428

AL669927.9	1501	CAGTCTTGCCTGTGGTTGTGTTTGCTAATATGTGAAGAAATGAGCTGCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120429	CAGTCTTGCCTGTGGTTGTGTTTGCTAATATGTGAAGAAATGAGCTGCAG	120478

AL669927.9	1551	AAGTTGCTGGAATTAAAAGCAGCTGCAGAGATACCCTCAGCTGTCAAGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120479	AAGTTGCTGGAATTAAAAGCAGCTGCAGAGATACCCTCAGCTGTCAAGGG	120528

AL669927.9	1601	GCAGGAAAGTGAGGCCCGTATTGATTTCTGAAGGGTTGATACAAACGCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120529	GCAGGAAAGTGAGGCCCGTATTGATTTCTGAAGGGTTGATACAAACGCCA	120578

AL669927.9	1651	TGATGAATTCATGGATCTGTCCGACCTCATTCAGATAATGGGATTCTTAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120579	TGATGAATTCATGGATCTGTCCGACCTCATTCAGATAATGGGATTCTTAC	120628

AL669927.9	1701	ACTGAGAGGCAGATTTCCTCCGCCCTACAGGGAGGAGAGCTAGGTGGTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120629	ACTGAGAGGCAGATTTCCTCCGCCCTACAGGGAGGAGAGCTAGGTGGTCA	120678

AL669927.9	1751	GCGTTCACCGCTGTATCCAAGGACCATACATTTACTCAGTATTGAACTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120679	GCGTTCACCGCTGTATCCAAGGACCATACATTTACTCAGTATTGAACTAA	120728

AL669927.9	1801	TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGACAATTTTGAGGGCGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120729	TGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGACAATTTTGAGGGCGT	120778

AL669927.9	1851	GTTTTTTTCCTCTTTAGAAACAGAATTGTTTAAATCTCAAATACAAGCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120779	GTTTTTTTCCTCTTTAGAAACAGAATTGTTTAAATCTCAAATACAAGCTT	120828

AL669927.9	1901	ATGGATCAAGGATCATTCCTCATTTTACAGATAAGAAAAGATTTTTCACT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120829	ATGGATCAAGGATCATTCCTCATTTTACAGATAAGAAAAGATTTTTCACT	120878

AL669927.9	1951	TGAGGCATTTCAAGCCATGGTCTCTGTCTATGAGAACAAGCAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691478.5	120879	TGAGGCATTTCAAGCCATGGTCTCTGTCTATGAGAACAAGCAGTGAATTC	120928

Overview

Query
AL669927.9 - 64898 bps
Hit
AL691478.5 - 120928 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link