<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845553.5	1	AGAGCTGATGCCTTGTGTGCTGAGAGATGTCAAACTTCAAATAACGTAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64629	AGAGCTGATGCCTTGTGTGCTGAGAGATGTCAAACTTCAAATAACGTAGA	64678

AL845553.5	51	CGGTGAGCACAGGATGTGGGAAGTATGAAGGATGACCATGGTAATGATGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64679	CGGTGAGCACAGGATGTGGGAAGTATGAAGGATGACCATGGTAATGATGG	64728

AL845553.5	101	TGATGGCCACACATAGCATTCCTGTATGACCAGGCACATCTACATGTTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64729	TGATGGCCACACATAGCATTCCTGTATGACCAGGCACATCTACATGTTGT	64778

AL845553.5	151	TTTTTGGAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64779	TTTTTGGAGAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	64828

AL845553.5	201	GAGAACATAGAAAAGGCACCAAGACCCCTCTACCTTGAACTTTAAAAAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64829	GAGAACATAGAAAAGGCACCAAGACCCCTCTACCTTGAACTTTAAAAAGC	64878

AL845553.5	251	AGAAGTTTGGATAGCAAAAGCATCCTACATGCCCACCGCTGTTTATCTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64879	AGAAGTTTGGATAGCAAAAGCATCCTACATGCCCACCGCTGTTTATCTCC	64928

AL845553.5	301	CATAGATTGGCTTTCCAGAGTCATATCGGAGTCACAGCCTGACATTTTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64929	CATAGATTGGCTTTCCAGAGTCATATCGGAGTCACAGCCTGACATTTTGA	64978

AL845553.5	351	ATCTTGCAGAATCATGTCGCCTCCAGAGGTGGCGTTTTGATGGGATTGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	64979	ATCTTGCAGAATCATGTCGCCTCCAGAGGTGGCGTTTTGATGGGATTGAC	65028

AL845553.5	401	TCACTGTCCCACCACCTCACAATCACAGCTTCTAATGCTGAGCTCCTTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65029	TCACTGTCCCACCACCTCACAATCACAGCTTCTAATGCTGAGCTCCTTCT	65078

AL845553.5	451	GTGTGCTAGCTAGCCTTTGTCTTGGAGCACCGCATGCATCATCGATTTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65079	GTGTGCTAGCTAGCCTTTGTCTTGGAGCACCGCATGCATCATCGATTTAA	65128

AL845553.5	501	CAAATGTTTGTTGAGCAGCTTCTAGGAGTTTTACATATATTATTTATTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65129	CAAATGTTTGTTGAGCAGCTTCTAGGAGTTTTACATATATTATTTATTTT	65178

AL845553.5	551	ATTTATTTATTTAAAGTGAACATAGTATTACTGTACCTGGCATCACACTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65179	ATTTATTTATTTAAAGTGAACATAGTATTACTGTACCTGGCATCACACTT	65228

AL845553.5	601	CCTAGGGCGGTGATCATGAATGAACTATGAAGCCTCAGTAATTAGGAACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65229	CCTAGGGCGGTGATCATGAATGAACTATGAAGCCTCAGTAATTAGGAACA	65278

AL845553.5	651	GACTAGGAAAGGATACAGATAAACAGATACACAGTGACTGTACACTGTGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65279	GACTAGGAAAGGATACAGATAAACAGATACACAGTGACTGTACACTGTGC	65328

AL845553.5	701	CAATCACCGCCTCAGGCTGGTCTCAGAGTACCCTGGTCTTCTTGGTTCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65329	CAATCACCGCCTCAGGCTGGTCTCAGAGTACCCTGGTCTTCTTGGTTCTG	65378

AL845553.5	751	ACGGTGGAACAGAGTGGTCAAAGACTTTTTAGAGGAGGCAGTTTAGTTTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65379	ACGGTGGAACAGAGTGGTCAAAGACTTTTTAGAGGAGGCAGTTTAGTTTG	65428

AL845553.5	801	AATATGAATTAGCCAAGCAAGGAGACATTGGAAGAAGATCCAGACAAAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65429	AATATGAATTAGCCAAGCAAGGAGACATTGGAAGAAGATCCAGACAAAGG	65478

AL845553.5	851	GAAAAGACTGAAGTGGTGTGAGGATGCGGGGAGGAAGAAGTCCGTGCTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65479	GAAAAGACTGAAGTGGTGTGAGGATGCGGGGAGGAAGAAGTCCGTGCTTG	65528

AL845553.5	901	TGTACCAGTAACATCAGCCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65529	TGTACCAGTAACATCAGCCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGT	65578

AL845553.5	951	CAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65579	CAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGC	65628

AL845553.5	1001	CAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65629	CAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGA	65678

AL845553.5	1051	AAGGTGCCCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTGCCCCCAGCCAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65679	AAGGTGCCCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTGCCCCCAGCCAGG	65728

AL845553.5	1101	TGTGATCAGTCAGAAAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65729	TGTGATCAGTCAGAAAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGG	65778

AL845553.5	1151	TCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGGTGCCCCCAGCCAGGTGTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65779	TCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGGTGCCCCCAGCCAGGTGTG	65828

AL845553.5	1201	ATCAGTCAGAAAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGGGTCACC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65829	ATCAGTCAGAAAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGGGTCACC	65878

AL845553.5	1251	CCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65879	CCAGCCAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGTCACCCCAGCCAGGTGTGATCAG	65928

AL845553.5	1301	TCAGAAAGGTGCCCCCAGCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGGTGCCCCCAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65929	TCAGAAAGGTGCCCCCAGCAGGTGTGATCAGTCAGAAAGGTGCCCCCAGC	65978

AL845553.5	1351	CAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGCCACTCCAAGTCAAGTATGATTGTCTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	65979	CAGGTGTGATCAGTCAGAGAGGCCACTCCAAGTCAAGTATGATTGTCTCA	66028

AL845553.5	1401	TTTTTTCACCTGCGCGAGTTAAGGCTTGAAGGGACAGGAGAGAGCAAAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66029	TTTTTTCACCTGCGCGAGTTAAGGCTTGAAGGGACAGGAGAGAGCAAAGG	66078

AL845553.5	1451	AGGGCCCTCGGAAGAGTGACTAGACGACATGAAATCACATCATTTTGAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66079	AGGGCCCTCGGAAGAGTGACTAGACGACATGAAATCACATCATTTTGAGA	66128

AL845553.5	1501	ATAATTTGCTGATGAGCAAAGGAACGCAGTTAGGAGCCATGGCAGACCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66129	ATAATTTGCTGATGAGCAAAGGAACGCAGTTAGGAGCCATGGCAGACCTC	66178

AL845553.5	1551	GGTTGGACCCACAGTTTCTTTTCTGACCATTTTCTCGCAGCAATCAGCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66179	GGTTGGACCCACAGTTTCTTTTCTGACCATTTTCTCGCAGCAATCAGCAA	66228

AL845553.5	1601	TTTCATATTAGCCGTGGTCACTGCTGCTTAATAAAGCATACAAGGGAAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66229	TTTCATATTAGCCGTGGTCACTGCTGCTTAATAAAGCATACAAGGGAAAC	66278

AL845553.5	1651	GCAGCGGAACCTAGGTCAGTCTGCCTCCAAAACCCTCGTTCTCTTCTTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66279	GCAGCGGAACCTAGGTCAGTCTGCCTCCAAAACCCTCGTTCTCTTCTTAT	66328

AL845553.5	1701	TTAGAAAAATTGTGTGGTTTTACTGTCAGCAAGACTGTTCAGGATGCTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66329	TTAGAAAAATTGTGTGGTTTTACTGTCAGCAAGACTGTTCAGGATGCTGG	66378

AL845553.5	1751	GGAAGTCAAGTGCTCTGGCTTAATTAGATGCCTTTCAGGAGTCAGTCACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66379	GGAAGTCAAGTGCTCTGGCTTAATTAGATGCCTTTCAGGAGTCAGTCACC	66428

AL845553.5	1801	TCCGTCAAGTTCATGGGGTAAATAACAAGTGACTTCCCAGCAGCCTCTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66429	TCCGTCAAGTTCATGGGGTAAATAACAAGTGACTTCCCAGCAGCCTCTTG	66478

AL845553.5	1851	GAGTCCAAAGTCCAGATGCCTGGTCCTGCTGCCTTTCTATAAAGTGCTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66479	GAGTCCAAAGTCCAGATGCCTGGTCCTGCTGCCTTTCTATAAAGTGCTTG	66528

AL845553.5	1901	AGGAGGGAAGCTCGCCAGCGTTGGCAGAGTAGTCAGTATGAAAGAGTGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66529	AGGAGGGAAGCTCGCCAGCGTTGGCAGAGTAGTCAGTATGAAAGAGTGTG	66578

AL845553.5	1951	CTCTGCTAGCTAAAGTTGGCAAGACTGGGCAGCTTCCTCTGAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL691436.7	66579	CTCTGCTAGCTAAAGTTGGCAAGACTGGGCAGCTTCCTCTGAGAGAATTC	66628

Overview

Query
AL845553.5 - 10444 bps
Hit
AL691436.7 - 66628 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link