<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590864.12	1	GAATTCCTGAATAAAATACAAATGGATAAGTAGACCCAAGTATAAGCAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102603	GAATTCCTGAATAAAATACAAATGGATAAGTAGACCCAAGTATAAGCAAG	102652

AL590864.12	51	CAAAGATTGATTCGTTTATTCTCTGCTCTTGACAATGAATGTGATCAGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102653	CAAAGATTGATTCGTTTATTCTCTGCTCTTGACAATGAATGTGATCAGGG	102702

AL590864.12	101	AACTGATAGGGACCCCAAAGGCCAAACTGATTGCAACAAACCTCCCTGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102703	AACTGATAGGGACCCCAAAGGCCAAACTGATTGCAACAAACCTCCCTGGT	102752

AL590864.12	151	GACATCCTCATTCAAGTCTGAAGCTATCCTGAGAAACATCTGCCCAAGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102753	GACATCCTCATTCAAGTCTGAAGCTATCCTGAGAAACATCTGCCCAAGCT	102802

AL590864.12	201	TGTGTTAGCTTTGAGATAACTGGTTTGTCACTTCTTTTATTTTTTTTAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102803	TGTGTTAGCTTTGAGATAACTGGTTTGTCACTTCTTTTATTTTTTTTAGA	102852

AL590864.12	251	GTGTTTTAAAGAGAAGAAATCTTATATTATAAAATGCTTAAATAAAAGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102853	GTGTTTTAAAGAGAAGAAATCTTATATTATAAAATGCTTAAATAAAAGTT	102902

AL590864.12	301	AATCATCTTTTTTACTAGAAGCAAAGGGAAATTCATAACATTATTAAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102903	AATCATCTTTTTTACTAGAAGCAAAGGGAAATTCATAACATTATTAAAAA	102952

AL590864.12	351	GTCAACCTGTCTATACAGAGAGAAACTTGCCAGGGACAACACTGAAACCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	102953	GTCAACCTGTCTATACAGAGAGAAACTTGCCAGGGACAACACTGAAACCA	103002

AL590864.12	401	GCAAAGTAATAAACTCTTCTGCTAGGCTTCATGGCAAAGGGCGAGACTAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103003	GCAAAGTAATAAACTCTTCTGCTAGGCTTCATGGCAAAGGGCGAGACTAC	103052

AL590864.12	451	AGACATTAGAAAGCTGAGATGTATTCTTCACCTGGTCCTGGAAATGAGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103053	AGACATTAGAAAGCTGAGATGTATTCTTCACCTGGTCCTGGAAATGAGTT	103102

AL590864.12	501	TAAATCCACCTGAAAAGAGAGTGAGGCACGAAGCAGGTGACTTGCTCATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103103	TAAATCCACCTGAAAAGAGAGTGAGGCACGAAGCAGGTGACTTGCTCATG	103152

AL590864.12	551	ATGGGAATCTTTCTCAAGAAAGTCACTCATCGCTTTCCTAAAAGATGCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103153	ATGGGAATCTTTCTCAAGAAAGTCACTCATCGCTTTCCTAAAAGATGCCA	103202

AL590864.12	601	TTACCATAACTCTCCAAGTAGCCATTGCAATTCAAAACATCCTAAATATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103203	TTACCATAACTCTCCAAGTAGCCATTGCAATTCAAAACATCCTAAATATT	103252

AL590864.12	651	TGTTCCCTGTTGTCACTTAAATGTATACAAAGGGAAACAGAATTCCATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103253	TGTTCCCTGTTGTCACTTAAATGTATACAAAGGGAAACAGAATTCCATGT	103302

AL590864.12	701	GCAATTAGCCAGGGAGAGTAACAAAGCAATGCTTGCAGTATGCTTTAGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103303	GCAATTAGCCAGGGAGAGTAACAAAGCAATGCTTGCAGTATGCTTTAGAT	103352

AL590864.12	751	TTGTATAGAATTATCTAAGCTGAAAATAAGAATAATCTAAATCAATGTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103353	TTGTATAGAATTATCTAAGCTGAAAATAAGAATAATCTAAATCAATGTAT	103402

AL590864.12	801	TTTTGTGACGGAGGAAAGGACCAAAAAAATATATGTTAAATACTGAGATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103403	TTTTGTGACGGAGGAAAGGACCAAAAAAATATATGTTAAATACTGAGATC	103452

AL590864.12	851	CAGTCATGATCCTCGGTATTGTAAAGCTTTTTCACAGAAACTTCAGAATG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103453	CAGTCATGATCCTCGGTATTGTAAAGCTTTTTCACAGAAACTTCAGAATG	103502

AL590864.12	901	ATAGCACTCAGTGCCACCTAGCAAGGGGAGAGAGAAATGACAGCACTCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103503	ATAGCACTCAGTGCCACCTAGCAAGGGGAGAGAGAAATGACAGCACTCAG	103552

AL590864.12	951	TGCCACCTAGCAAGGGGAGAAGAGAAACTTCAACTCTCAACACAGTGTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103553	TGCCACCTAGCAAGGGGAGAAGAGAAACTTCAACTCTCAACACAGTGTTG	103602

AL590864.12	1001	GAAAAATTGATAACAGAAGCTAACCTGTTGGCAAACACCTATAATCCCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103603	GAAAAATTGATAACAGAAGCTAACCTGTTGGCAAACACCTATAATCCCAG	103652

AL590864.12	1051	CACATGGGAGGCTGAAGCAGTAGGATCGTCAGGATTTTGAAGCCAGCCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103653	CACATGGGAGGCTGAAGCAGTAGGATCGTCAGGATTTTGAAGCCAGCCTG	103702

AL590864.12	1101	GGCTATGTACTAAGATTCAAGTCAACCTGAGATATAAATTGAGGACACTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103703	GGCTATGTACTAAGATTCAAGTCAACCTGAGATATAAATTGAGGACACTG	103752

AL590864.12	1151	TCAAGAAAAAAATGGAGGGGTTCAGGGAAGAGAGAGGAAGGAAGGAAGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103753	TCAAGAAAAAAATGGAGGGGTTCAGGGAAGAGAGAGGAAGGAAGGAAGGA	103802

AL590864.12	1201	AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGCAGAGGGGGAGGGGGAAGGGGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103803	AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGCAGAGGGGGAGGGGGAAGGGGAGG	103852

AL590864.12	1251	GGGGAGGAGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103853	GGGGAGGAGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGG	103902

AL590864.12	1301	GGAAGGGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGCAGGCAGGCAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103903	GGAAGGGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGCAGGCAGGCAGG	103952

AL590864.12	1351	CAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCCGGCCAATGAGATTGCTTGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	103953	CAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCCGGCCAATGAGATTGCTTGAG	104002

AL590864.12	1401	TTTGTTCCCCAGGACCCACACATTGGAAGGAGGAAATCAACACCTAAATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104003	TTTGTTCCCCAGGACCCACACATTGGAAGGAGGAAATCAACACCTAAATA	104052

AL590864.12	1451	TTGTCCTCTGACTTCCTCATGTACACAACGGCATGCATCTACACATGTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104053	TTGTCCTCTGACTTCCTCATGTACACAACGGCATGCATCTACACATGTGC	104102

AL590864.12	1501	TCATACATGGGTGCACACGAACACAGCCATAAATAAAATATAAAATTAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104103	TCATACATGGGTGCACACGAACACAGCCATAAATAAAATATAAAATTAAT	104152

AL590864.12	1551	AGATTTTAAAAGACTCAAGCGTGGTAGTGCACACACCTGTAATCTCAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104153	AGATTTTAAAAGACTCAAGCGTGGTAGTGCACACACCTGTAATCTCAGCA	104202

AL590864.12	1601	CCCTGAAGGCTGAAACTGAAGAGCCACTATAAGTTTAAGATCATCTTGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104203	CCCTGAAGGCTGAAACTGAAGAGCCACTATAAGTTTAAGATCATCTTGGG	104252

AL590864.12	1651	ATATACACAGAAAGACCATGAGGAAACAAAGAATGGGAGATAAGGAAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104253	ATATACACAGAAAGACCATGAGGAAACAAAGAATGGGAGATAAGGAAGGG	104302

AL590864.12	1701	GATAGGAGGGGGAAGCAGGAGAGGTAGGAGGAAGAAATTCTCTAGGCTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104303	GATAGGAGGGGGAAGCAGGAGAGGTAGGAGGAAGAAATTCTCTAGGCTAA	104352

AL590864.12	1751	TCCAAGCATGTCCTGTATGCAGTGGTCCAGGACATATCCTATCTCTGGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104353	TCCAAGCATGTCCTGTATGCAGTGGTCCAGGACATATCCTATCTCTGGAA	104402

AL590864.12	1801	CAAGGTAGCAGCCCAACTTCACAGGGAAGCTTTGTAGCTGGTTTCCTACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104403	CAAGGTAGCAGCCCAACTTCACAGGGAAGCTTTGTAGCTGGTTTCCTACC	104452

AL590864.12	1851	AGACACCACTGTGTCCAGGAGGATGCTAAGTCAGAATCTTGCTGCCGAAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104453	AGACACCACTGTGTCCAGGAGGATGCTAAGTCAGAATCTTGCTGCCGAAC	104502

AL590864.12	1901	TTTGGGCTCCTTTGCCTCACATGCAGAAATGCCAGATCATGCAGGACGCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104503	TTTGGGCTCCTTTGCCTCACATGCAGAAATGCCAGATCATGCAGGACGCC	104552

AL590864.12	1951	ATTGTGTGTCTGCACTTGACACCTGCCCCCAACCCTTGGTGATTATATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683873.14	104553	ATTGTGTGTCTGCACTTGACACCTGCCCCCAACCCTTGGTGATTATATTC	104602

Overview

Query
AL590864.12 - 196857 bps
Hit
AL683873.14 - 104602 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link