<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672311.26	1	TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGCGTCTCGCTTTGTCACCCACACTGGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	173766	TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGCGTCTCGCTTTGTCACCCACACTGGAG	173815

AL672311.26	51	TGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	173816	TGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGGGTTCAAA	173865

AL672311.26	101	CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGATTACGGGCACCCGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	173866	CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTACCTGGGATTACGGGCACCCGCC	173915

AL672311.26	151	ACCACATCTGGCTAATTTTTCTTTTTTGATATGGAGTCTCGCTCTGTTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	173916	ACCACATCTGGCTAATTTTTCTTTTTTGATATGGAGTCTCGCTCTGTTAC	173965

AL672311.26	201	TCAGCCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	173966	TCAGCCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC	174015

AL672311.26	251	CCGGGTTCAAATGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174016	CCGGGTTCAAATGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAC	174065

AL672311.26	301	AGGCATATGCCACCATATCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174066	AGGCATATGCCACCATATCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG	174115

AL672311.26	351	GGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCCTAACTGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174116	GGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCAGACCCTAACTGAT	174165

AL672311.26	401	CCAGCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCTTGAGCCACCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174166	CCAGCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCTTGAGCCACCG	174215

AL672311.26	451	TGCCTGGCCCCAGTGTGTGAATTTTTACGTTTGTGTGTCCACGTGATTAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174216	TGCCTGGCCCCAGTGTGTGAATTTTTACGTTTGTGTGTCCACGTGATTAC	174265

AL672311.26	501	GTGAGTCTTTTTGTGACTGCGTTTGCACGAGTGTGACTGTATGTATGTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174266	GTGAGTCTTTTTGTGACTGCGTTTGCACGAGTGTGACTGTATGTATGTGT	174315

AL672311.26	551	CTGTGTGTGCTTGTGTGATTCTGAGTGTGTGTATGAGTGTGTATGACATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174316	CTGTGTGTGCTTGTGTGATTCTGAGTGTGTGTATGAGTGTGTATGACATA	174365

AL672311.26	601	TGTGAGTGTCTATGTGGGTGAATGGCCATCCACGTGTTTATATGAGAGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174366	TGTGAGTGTCTATGTGGGTGAATGGCCATCCACGTGTTTATATGAGAGTG	174415

AL672311.26	651	TTTTCATGATTCTGTTTATGCGTCTTTGTACGTATACGTGTTTGTGTGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174416	TTTTCATGATTCTGTTTATGCGTCTTTGTACGTATACGTGTTTGTGTGCT	174465

AL672311.26	701	TTGTGAGAACATCCATGTGCCTCTGCACCCACGTGTGCATGTGAGGGTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174466	TTGTGAGAACATCCATGTGCCTCTGCACCCACGTGTGCATGTGAGGGTTT	174515

AL672311.26	751	TTGTAATTGTGTTTGTGTGTGTGTGTCCCTGTGTTTGTGTGAGTGTGCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174516	TTGTAATTGTGTTTGTGTGTGTGTGTCCCTGTGTTTGTGTGAGTGTGCAT	174565

AL672311.26	801	GTCTTTGTGTGTCCATGTGCTTCTCTGAGTGTGTTTTGTGATTCTGTCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174566	GTCTTTGTGTGTCCATGTGCTTCTCTGAGTGTGTTTTGTGATTCTGTCTT	174615

AL672311.26	851	TGCGTTGATGTGCGTTTGTGTAAGCGTGTGGTTGCATTTGTGTCCGTGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174616	TGCGTTGATGTGCGTTTGTGTAAGCGTGTGGTTGCATTTGTGTCCGTGAT	174665

AL672311.26	901	TCTGGAGCAGGTGAGCTGATCACAAGCCTGAGTCAAGAATCCATGGAGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174666	TCTGGAGCAGGTGAGCTGATCACAAGCCTGAGTCAAGAATCCATGGAGAT	174715

AL672311.26	951	CATTTACAGCAGAAGCCGGGACCCTGTGCAAATCCTTCTGAAATATCCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174716	CATTTACAGCAGAAGCCGGGACCCTGTGCAAATCCTTCTGAAATATCCCC	174765

AL672311.26	1001	GATTGACTGAGCTCCTAGGGGTGGGGAAGAAAAATTCCCTGACATCTCGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174766	GATTGACTGAGCTCCTAGGGGTGGGGAAGAAAAATTCCCTGACATCTCGG	174815

AL672311.26	1051	CCTCAGGGAAAGAGACACCCCACTGGCAGGACGTCTCTGCTGTTTCTCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174816	CCTCAGGGAAAGAGACACCCCACTGGCAGGACGTCTCTGCTGTTTCTCAG	174865

AL672311.26	1101	AAGACAGCTGGGGTGTCACTCTCCCAAACGACGGTGATTTTCAGAACGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174866	AAGACAGCTGGGGTGTCACTCTCCCAAACGACGGTGATTTTCAGAACGGT	174915

AL672311.26	1151	TCACTTTGTGGAGAGACGTTTCTGCCCTGGAGATCCGTACATATTGAACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174916	TCACTTTGTGGAGAGACGTTTCTGCCCTGGAGATCCGTACATATTGAACC	174965

AL672311.26	1201	CAAATGAATATTTTTTAATTAAAAAAGTTTATATAAATATGCATTGTGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	174966	CAAATGAATATTTTTTAATTAAAAAAGTTTATATAAATATGCATTGTGTA	175015

AL672311.26	1251	TACTTTATATTAATATATTGATATAAATAAATGTATTTTATTAATATAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175016	TACTTTATATTAATATATTGATATAAATAAATGTATTTTATTAATATAAA	175065

AL672311.26	1301	CATATGATTTTTATAGTTTACATAAATAATAAAGTTACATATGGTGTATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175066	CATATGATTTTTATAGTTTACATAAATAATAAAGTTACATATGGTGTATA	175115

AL672311.26	1351	TGTAAAATATACTTTTATTTGTAATACATAATTGTATAGATTAAATTTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175116	TGTAAAATATACTTTTATTTGTAATACATAATTGTATAGATTAAATTTTA	175165

AL672311.26	1401	TATACTAAGCAAAGTTACGTGTAATATATACATGCCATATAACATCATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175166	TATACTAAGCAAAGTTACGTGTAATATATACATGCCATATAACATCATTT	175215

AL672311.26	1451	ATATAATATATAACTTTATGTAAATAAAATAAAATTGATCTTATATTAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175216	ATATAATATATAACTTTATGTAAATAAAATAAAATTGATCTTATATTAAT	175265

AL672311.26	1501	ACGTAATTATGTATATACACTATGTAAAAATAAAATTATATATTGTATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175266	ACGTAATTATGTATATACACTATGTAAAAATAAAATTATATATTGTATAT	175315

AL672311.26	1551	GCATAATTATATTTCTATAAATACACGCTTATGTGTGTATTTATACGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175316	GCATAATTATATTTCTATAAATACACGCTTATGTGTGTATTTATACGTGA	175365

AL672311.26	1601	ATGCCTGTGTTTGTGTGAGTCCATCAGTGAGTGCGTGAATGTGTGTGTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175366	ATGCCTGTGTTTGTGTGAGTCCATCAGTGAGTGCGTGAATGTGTGTGTGA	175415

AL672311.26	1651	GCATGTGTGTCTGTGTGAGTGTAAGAGTGTTGTACCTTTATACACACCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175416	GCATGTGTGTCTGTGTGAGTGTAAGAGTGTTGTACCTTTATACACACCCA	175465

AL672311.26	1701	TTTTGTTTTCTGGTTAATAACAAGGTCTATGTTTGATTTAGGATATGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175466	TTTTGTTTTCTGGTTAATAACAAGGTCTATGTTTGATTTAGGATATGAAG	175515

AL672311.26	1751	AATTCTTATAAGCAACCCCACACACACAATTTGTATTTATTTTAAAATAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175516	AATTCTTATAAGCAACCCCACACACACAATTTGTATTTATTTTAAAATAT	175565

AL672311.26	1801	TCTTAAAATATGGATTTTTTTTATTTTTGCACAAACAGACAAGACTGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175566	TCTTAAAATATGGATTTTTTTTATTTTTGCACAAACAGACAAGACTGTTT	175615

AL672311.26	1851	TTTCTTTCCAAAACTTTTATTTCAAATTCTGACACCGAGGGGGAGAAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175616	TTTCTTTCCAAAACTTTTATTTCAAATTCTGACACCGAGGGGGAGAAAAA	175665

AL672311.26	1901	GAAGAAAACATTGTGTAACCTTATATGCATTAGACACATAAGTAATTACT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175666	GAAGAAAACATTGTGTAACCTTATATGCATTAGACACATAAGTAATTACT	175715

AL672311.26	1951	AAATGCAATACAGATTTCGACAACATGCTTTTAGGAAACAGGAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL683871.15	175716	AAATGCAATACAGATTTCGACAACATGCTTTTAGGAAACAGGAGGAATTC	175765

Overview

Query
AL672311.26 - 115998 bps
Hit
AL683871.15 - 175765 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link