<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672151.8	1	GATCATTACTATGCATTCTTATATTGAATATTACAAACATAATGCAATAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45698	GATCATTACTATGCATTCTTATATTGAATATTACAAACATAATGCAATAA	45747

AL672151.8	51	AAAGTCAAAATTCACTGCATTGCATTGTGAACATGTTTGCATGCTTTAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45748	AAAGTCAAAATTCACTGCATTGCATTGTGAACATGTTTGCATGCTTTAAA	45797

AL672151.8	101	GTTTTTCGCAAAATGTAAGATAAACAATGTCGAGTTTGTGATATTTGCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45798	GTTTTTCGCAAAATGTAAGATAAACAATGTCGAGTTTGTGATATTTGCTT	45847

AL672151.8	151	AGAAATCGTGTCTTTTACAACTGTAATAAGATAAGCCTGTTGCAACAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45848	AGAAATCGTGTCTTTTACAACTGTAATAAGATAAGCCTGTTGCAACAAGT	45897

AL672151.8	201	TGACACTGTATTTCACAGTTAACCCCAGGGCTATGAATAATTTTGTGTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45898	TGACACTGTATTTCACAGTTAACCCCAGGGCTATGAATAATTTTGTGTAA	45947

AL672151.8	251	AAAAATGTAACTTGTTCAAACTACCTAATTAAAATAAGCTGAAAAAACAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45948	AAAAATGTAACTTGTTCAAACTACCTAATTAAAATAAGCTGAAAAAACAC	45997

AL672151.8	301	AATTCTTGATGTTTCATTGAGACAACTTAATTTTTTTATGTTCAATCCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	45998	AATTCTTGATGTTTCATTGAGACAACTTAATTTTTTTATGTTCAATCCAC	46047

AL672151.8	351	ATAGTTTTGTTGAAAGTGTTAAGTTAACTTGATTTGTGTTGAGACACCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46048	ATAGTTTTGTTGAAAGTGTTAAGTTAACTTGATTTGTGTTGAGACACCAT	46097

AL672151.8	401	GAATGAATTGTGTGGAACCCTGCATTTTTTACAGTGTGTAATAGTAAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46098	GAATGAATTGTGTGGAACCCTGCATTTTTTACAGTGTGTAATAGTAAAAT	46147

AL672151.8	451	TAAATTGTATATGGATAAAACACCCACCCGTCGCACTAATAGGTAGACTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46148	TAAATTGTATATGGATAAAACACCCACCCGTCGCACTAATAGGTAGACTG	46197

AL672151.8	501	CCCTCACGGTATCTCGTTGAGTCTTCAGGTTATGAGTGTCATTCAGTCGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46198	CCCTCACGGTATCTCGTTGAGTCTTCAGGTTATGAGTGTCATTCAGTCGC	46247

AL672151.8	551	TCGTCATAACGTCCAGCTTCACTGGGCTCCATGCTGAAACTGCGCACAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46248	TCGTCATAACGTCCAGCTTCACTGGGCTCCATGCTGAAACTGCGCACAGT	46297

AL672151.8	601	CCTCACACCTGCGACAGCTTCTCCTGCTGTCTCATTGGCTCGGGCCACAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46298	CCTCACACCTGCGACAGCTTCTCCTGCTGTCTCATTGGCTCGGGCCACAG	46347

AL672151.8	651	AGTCCTGTACTTCTTTGGATAATTTCTGCACAACAAAATGAGAGAAATAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46348	AGTCCTGTACTTCTTTGGATAATTTCTGCACAACAAAATGAGAGAAATAC	46397

AL672151.8	701	AATTAGCTTGTTGGCTCAAAATCATGGGAAACACGTTAATGATGTTCAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46398	AATTAGCTTGTTGGCTCAAAATCATGGGAAACACGTTAATGATGTTCAGC	46447

AL672151.8	751	ACAATGGTGCAGTAGGTTTCACATACTGTTACACCACTTTCATATAGAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46448	ACAATGGTGCAGTAGGTTTCACATACTGTTACACCACTTTCATATAGAGA	46497

AL672151.8	801	GATATAAATGGTAATTTACCACAACAACTTAAGCTGTTTTATAAAACAAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46498	GATATAAATGGTAATTTACCACAACAACTTAAGCTGTTTTATAAAACAAT	46547

AL672151.8	851	CCTTGATTCTGGTTGGTTAGTCTTGTTGAAAGTAGAGTAAATTACTCTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46548	CCTTGATTCTGGTTGGTTAGTCTTGTTGAAAGTAGAGTAAATTACTCTAC	46597

AL672151.8	901	AAACATACAATTTTGAGTGTTGATAGGCAACCATCCCACTATCAATACAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46598	AAACATACAATTTTGAGTGTTGATAGGCAACCATCCCACTATCAATACAA	46647

AL672151.8	951	TATACAGTCACAAATAAAGGTACAGAATCTGTAACTGGAGTGGTGCCTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46648	TATACAGTCACAAATAAAGGTACAGAATCTGTAACTGGAGTGGTGCCTTT	46697

AL672151.8	1001	TGTAGTGGATATTTTTTAGGGAACACTTTTGTACATCTGAGGTTCACTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46698	TGTAGTGGATATTTTTTAGGGAACACTTTTGTACATCTGAGGTTCACTTC	46747

AL672151.8	1051	TTTACCTTTAAGTTACTCTGACGTACACATTTGTACTTTTAGGTATTAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46748	TTTACCTTTAAGTTACTCTGACGTACACATTTGTACTTTTAGGTATTAAA	46797

AL672151.8	1101	ATTTACCTTTAAGGACCTGTTAGGAACAAAAATGTACCTTATGATAAAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46798	ATTTACCTTTAAGGACCTGTTAGGAACAAAAATGTACCTTATGATAAAGT	46847

AL672151.8	1151	ACCGCCCCAGTGACAGATTATGAACCTTTATATCTGAGAGTGTACTGACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46848	ACCGCCCCAGTGACAGATTATGAACCTTTATATCTGAGAGTGTACTGACC	46897

AL672151.8	1201	CAGCAGGCACAGGACATCAATATGACGTCAGATTGTAGAAATGTCGGACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46898	CAGCAGGCACAGGACATCAATATGACGTCAGATTGTAGAAATGTCGGACA	46947

AL672151.8	1251	GACATTGAATTTTGGTTATTTTTCAATGCAACCTAAAAATAATAAAATAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46948	GACATTGAATTTTGGTTATTTTTCAATGCAACCTAAAAATAATAAAATAT	46997

AL672151.8	1301	TGGCCTCTAATGATGCTACAACTTGACGTTGTGTGGATGTTATGTTATGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	46998	TGGCCTCTAATGATGCTACAACTTGACGTTGTGTGGATGTTATGTTATGA	47047

AL672151.8	1351	CGTTTATTAGACGCTGGATTTTGGTTGCCATACCTAACAAATAAATGTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47048	CGTTTATTAGACGCTGGATTTTGGTTGCCATACCTAACAAATAAATGTCA	47097

AL672151.8	1401	GTATACGTCAATATGACATTGGTTTAAGATCAGTTTAAGCTCGATGTTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47098	GTATACGTCAATATGACATTGGTTTAAGATCAGTTTAAGCTCGATGTTGG	47147

AL672151.8	1451	ATTTTGGTCACTTTCCAACACAACCTGAAATCAACAAAATATCAACGTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47148	ATTTTGGTCACTTTCCAACACAACCTGAAATCAACAAAATATCAACGTCT	47197

AL672151.8	1501	TTTCAAGTCATTATTGGATGCCAAAATAACATTGTCCAAGCTAGTGACCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47198	TTTCAAGTCATTATTGGATGCCAAAATAACATTGTCCAAGCTAGTGACCA	47247

AL672151.8	1551	AAATCGAACCTAATATTAACGTCTGCTGGGGAGCCATAGAAACTTCAACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47248	AAATCGAACCTAATATTAACGTCTGCTGGGGAGCCATAGAAACTTCAACT	47297

AL672151.8	1601	AAACAGACTAAAAGAGAGGTGAAGAACATGGGAAGAACTCTTCAGGTTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47298	AAACAGACTAAAAGAGAGGTGAAGAACATGGGAAGAACTCTTCAGGTTTT	47347

AL672151.8	1651	AGAGGGTTCTTTGTACAACAGTGGTACTATACAACCACCCCAAAGGACTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47348	AGAGGGTTCTTTGTACAACAGTGGTACTATACAACCACCCCAAAGGACTG	47397

AL672151.8	1701	TAAAAGAACCTTTTTTTAGTGTGTACTAGTGACAAGAAAGTTCTCTTTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47398	TAAAAGAACCTTTTTTTAGTGTGTACTAGTGACAAGAAAGTTCTCTTTGA	47447

AL672151.8	1751	AGGTACGGAATTAGATAAAGATCTTAAATTTGTTAACTAAATCAATTTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47448	AGGTACGGAATTAGATAAAGATCTTAAATTTGTTAACTAAATCAATTTGA	47497

AL672151.8	1801	AATACATTGAAAAAAAACACTTATTTTTTCAAATTGCTGTTTGTTCAAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47498	AATACATTGAAAAAAAACACTTATTTTTTCAAATTGCTGTTTGTTCAAAC	47547

AL672151.8	1851	CATGTATTTAAAATGAGCGAAAACAACACGATTCTTGAGTTTTTTTGGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47548	CATGTATTTAAAATGAGCGAAAACAACACGATTCTTGAGTTTTTTTGGGA	47597

AL672151.8	1901	GCAACTATAAATGTTTTATATTCAGTCCATTTAAATTTATAAGATAAGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47598	GCAACTATAAATGTTTTATATTCAGTCCATTTAAATTTATAAGATAAGCT	47647

AL672151.8	1951	TGTTGATAAGCAATGAATCAATTGTGTGGAACCCAACCTGTTTTACAGTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672185.7	47648	TGTTGATAAGCAATGAATCAATTGTGTGGAACCCAACCTGTTTTACAGTG	47697

Overview

Query
AL672151.8 - 102077 bps
Hit
AL672185.7 - 47697 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001930200012000145698476971
289.3917328817825181121134016311
3953275416612892170571166558261
494.6733641915012154301279432241
593.7832643214023144541378141981
687.111489290716216191221493378321
788.0223559216165167561503356251
888.3621053216165166961508356151
988.4119948916168166561513456251
1088.517343216165165961518156151
1190.9149672222535232561812988431
1289.6455890123327242271884697621
1388.882524585225852715-19770102281
1487.36238466242912475619770102281
1587.913165657858079144110491110691
1689.9263010017917880178111546125371
1793.751592108016980378112575127821
1882.561503277419274518126138264641
1982.951864398151281950128811292381
2084.441563852436424748-132626329981
2185.681864095225652664-137181375991
2285.651854162434224757137181375981
Short-link