<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL596203.6	1	GATCAGAATACAGTGCATTACGCAATGGCCGTTCTTTTGCTCGTTCAGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9415	GATCAGAATACAGTGCATTACGCAATGGCCGTTCTTTTGCTCGTTCAGTA	9464

AL596203.6	51	TTATGTTACTTACAAAATCTTTTAAAACGTGCCAGCGAAAGTATTGGCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9465	TTATGTTACTTACAAAATCTTTTAAAACGTGCCAGCGAAAGTATTGGCAA	9514

AL596203.6	101	ACATCCACAATAGTTACAGTACAGTTCTCCTCCTGCTAAATGACAGGCGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9515	ACATCCACAATAGTTACAGTACAGTTCTCCTCCTGCTAAATGACAGGCGA	9564

AL596203.6	151	GCAGAAAAGCAGGTTCTTCTGAGAGAGAGAAAGAAGTGTAAAAAGACCGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9565	GCAGAAAAGCAGGTTCTTCTGAGAGAGAGAAAGAAGTGTAAAAAGACCGC	9614

AL596203.6	201	ATGCACCTGGCTGATTTAACTGTAAGTCTGTGTTTGTTTTAAGAGAAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9615	ATGCACCTGGCTGATTTAACTGTAAGTCTGTGTTTGTTTTAAGAGAAAAG	9664

AL596203.6	251	GAAGACATGAGATGTGAACTAACATACAGTTGAAGTCAAAATTATTAGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9665	GAAGACATGAGATGTGAACTAACATACAGTTGAAGTCAAAATTATTAGCC	9714

AL596203.6	301	CACCTAAAATATTAGCCGCCCCGTATATTTTGCTCACAATTTCTGTTTAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9715	CACCTAAAATATTAGCCGCCCCGTATATTTTGCTCACAATTTCTGTTTAC	9764

AL596203.6	351	CGAAAATAAGATTTTTTTCAACACATTTCTAAACATAAGTTTTAATAATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9765	CGAAAATAAGATTTTTTTCAACACATTTCTAAACATAAGTTTTAATAATT	9814

AL596203.6	401	CATTTCTAATAACTGATTTATTTTATCTTTGCCATGATAACAGTGGATAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9815	CATTTCTAATAACTGATTTATTTTATCTTTGCCATGATAACAGTGGATAA	9864

AL596203.6	451	TATTTGACTAGATATTTTTAGGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9865	TATTTGACTAGATATTTTTAGGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATT	9914

AL596203.6	501	TAAAGGCTTAAATAGGTTAATTAGGCAAGATAGAATAATTTTGTAAGTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9915	TAAAGGCTTAAATAGGTTAATTAGGCAAGATAGAATAATTTTGTAAGTCA	9964

AL596203.6	551	TTGTATAACGATGGTTTGTCCTGTAGTTATAATCAAAATCAAAAATATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	9965	TTGTATAACGATGGTTTGTCCTGTAGTTATAATCAAAATCAAAAATATAT	10014

AL596203.6	601	ATTGGTTAAAGGGGGCTAATAATATTGACCTTAAAATAGTTAAAAAAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10015	ATTGGTTAAAGGGGGCTAATAATATTGACCTTAAAATAGTTAAAAAAAAT	10064

AL596203.6	651	AAATAAAATAAACTGCTTTTATTTTAGCCAAAAAAATAAAAAAGTTTCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10065	AAATAAAATAAACTGCTTTTATTTTAGCCAAAAAAATAAAAAAGTTTCTC	10114

AL596203.6	701	CAGATGAATATTATAGGAAAAACTGTGCCAAATTCCTTGCTCTATTAAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10115	CAGATGAATATTATAGGAAAAACTGTGCCAAATTCCTTGCTCTATTAAAC	10164

AL596203.6	751	ATCATGTGGGAACAGTAAGCTTCTTTATTGCTATAAAAGAAGCTCACCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10165	ATCATGTGGGAACAGTAAGCTTCTTTATTGCTATAAAAGAAGCTCACCAA	10214

AL596203.6	801	GGCTGCATTTATTTGATTAAAAACTATGATAACTGGAAAATATTATTACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10215	GGCTGCATTTATTTGATTAAAAACTATGATAACTGGAAAATATTATTACA	10264

AL596203.6	851	CAGTAATTTAAAATTTAATATTAAATTTAATTTAATAATAATAAAAAAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10265	CAGTAATTTAAAATTTAATATTAAATTTAATTTAATAATAATAAAAAAAC	10314

AL596203.6	901	ATTGTTTTATTAAATCTTGTTTAAAATAAAATTAATTTCTGTGATTCAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10315	ATTGTTTTATTAAATCTTGTTTAAAATAAAATTAATTTCTGTGATTCAAA	10364

AL596203.6	951	GCAGAATTTTTGGCCCCATTAATAATTTCAAAATCATTGTAATATAATGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10365	GCAGAATTTTTGGCCCCATTAATAATTTCAAAATCATTGTAATATAATGA	10414

AL596203.6	1001	GCTGCAGCTCAAAAACACTGTACAATTCAGAAGTAACATTAAAAGTTCTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10415	GCTGCAGCTCAAAAACACTGTACAATTCAGAAGTAACATTAAAAGTTCTA	10464

AL596203.6	1051	CGGCTGCCAAACAAAATACATAACATTACAGTAAAATGTCTTTGTTGAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10465	CGGCTGCCAAACAAAATACATAACATTACAGTAAAATGTCTTTGTTGAAA	10514

AL596203.6	1101	TAAAGTGCAAAAATAATAAATCTACAAATATTTCTAATATTTCCCAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10515	TAAAGTGCAAAAATAATAAATCTACAAATATTTCTAATATTTCCCAGAGA	10564

AL596203.6	1151	TGGGTTGCGGCTGGAAGGGCATCCGCTGTGTAAAAACGTGCTGGATAAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10565	TGGGTTGCGGCTGGAAGGGCATCCGCTGTGTAAAAACGTGCTGGATAAGT	10614

AL596203.6	1201	TGGCAGGATAAGATTGATACAGGGCCTATTTGAAATGAAAACGAATGAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10615	TGGCAGGATAAGATTGATACAGGGCCTATTTGAAATGAAAACGAATGAAT	10664

AL596203.6	1251	GAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATATTTCCAATAAAATGTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10665	GAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATATTTCCAATAAAATGTTT	10714

AL596203.6	1301	ACAGAAATACACTGTTATTTTACAGACTTTTCCTATATTATTACGGGCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10715	ACAGAAATACACTGTTATTTTACAGACTTTTCCTATATTATTACGGGCAA	10764

AL596203.6	1351	ATACATTCAATTTTCAATATAAGTTTTACAAAGCATAAAAAATACATAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10765	ATACATTCAATTTTCAATATAAGTTTTACAAAGCATAAAAAATACATAAA	10814

AL596203.6	1401	AATACATTTAAAAGTAAAACTAATAAGAGTTTACTTTAAAATGACAAGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10815	AATACATTTAAAAGTAAAACTAATAAGAGTTTACTTTAAAATGACAAGAA	10864

AL596203.6	1451	TTAAGAAAAATGTTAGCATTGTCATGAACCTTAATTTTGTGAGGTGCACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10865	TTAAGAAAAATGTTAGCATTGTCATGAACCTTAATTTTGTGAGGTGCACA	10914

AL596203.6	1501	AGTAATTACAATTTATTACTTTAATTTAAATGTTTTTCAAAAAAAAAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10915	AGTAATTACAATTTATTACTTTAATTTAAATGTTTTTCAAAAAAAAAAAA	10964

AL596203.6	1551	AAAAACAGGAAAAACACTAAAAGCTGGTCTAAAGTTCAGCAAAGAGCACG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	10965	AAAAACAGGAAAAACACTAAAAGCTGGTCTAAAGTTCAGCAAAGAGCACG	11014

AL596203.6	1601	TTAGTTATGTGCCTATACAGAAAAAGCCAATACATTGCTTAATACACAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11015	TTAGTTATGTGCCTATACAGAAAAAGCCAATACATTGCTTAATACACAAA	11064

AL596203.6	1651	GGATATACAGCAATACACAAATATCTTTATATATGAAAAAAAAGGATATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11065	GGATATACAGCAATACACAAATATCTTTATATATGAAAAAAAAGGATATG	11114

AL596203.6	1701	TTAGAAAAAATAATAATAATAAATAATAATTACTACATAAATATAAAAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11115	TTAGAAAAAATAATAATAATAAATAATAATTACTACATAAATATAAAAAC	11164

AL596203.6	1751	CCCTACCTCCATTCCTTTTGTTCCAGCTCATTTAAGACAATTTGCATTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11165	CCCTACCTCCATTCCTTTTGTTCCAGCTCATTTAAGACAATTTGCATTTG	11214

AL596203.6	1801	TGTAATGTTATTGTTGTCATTAGTATTATTTATTATATGCATATTTATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11215	TGTAATGTTATTGTTGTCATTAGTATTATTTATTATATGCATATTTATAT	11264

AL596203.6	1851	TTGGTTAAATTAATACAAGTTTACATTTGTCCACCTGTTGGGTTTTGGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11265	TTGGTTAAATTAATACAAGTTTACATTTGTCCACCTGTTGGGTTTTGGAG	11314

AL596203.6	1901	GTATATGCATCATTATATGGGGCAAAAGAATAGGATGTGCGTTTGGATAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11315	GTATATGCATCATTATATGGGGCAAAAGAATAGGATGTGCGTTTGGATAT	11364

AL596203.6	1951	AGTTTTTTGACCACACTTCATCATTATAGTTCATTTATTGGTTTGCTGGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672155.6	11365	AGTTTTTTGACCACACTTCATCATTATAGTTCATTTATTGGTTTGCTGGA	11414

Overview

Query
AL596203.6 - 104106 bps
Hit
AL672155.6 - 11414 bps
Total alignments
11
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100185220001200019415114141
292.1510015119858200081449346451
387.4919736959994603621449848651
488.2318532750969512951454648681
587.16133247279525-1462048681
689.8414723651600518351463348681
777.334514952878530261592260711
892.11547657865579401607561501
984.881022405160151840-1968899251
1085.361112515104751297-1969199361
1183.64691752062420798110074102381
Short-link