<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1175 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672129.4	92359	GATCCCTGTCTGAATTAATGCTTGCATGCAAAGAGAAGCTTCCCATACCA	92408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	1	GATCCCTGTCTGAATTAATGCTTGCATGCAAAGAGAAGCTTCCCATACCA	50

AL672129.4	92409	ATGTATTTTTTGTTATTTATCTGGGTTTTTTATATCTTCCCCTTACATAC	92458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	51	ATGTATTTTTTGTTATTTATCTGGGTTTTTTATATCTTCCCCTTACATAC	100

AL672129.4	92459	CCCTCTACATAACTTACATTTTTATTATTTAGCTTAATTCTTGTCTACTG	92508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	101	CCCTCTACATAACTTACATTTTTATTATTTAGCTTAATTCTTGTCTACTG	150

AL672129.4	92509	TGCAATATGCACATTTTGGCAAATAATGCTAATATTTAAAAACACCAAAA	92558
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	151	TGCAATATGCACATTTTGGCAAATAATGCTAATATTTAAAAACACCAAAA	200

AL672129.4	92559	GAAAAAATATCAACACGCAAACACGACCATAACCCAAACAAAACCTTGAA	92608
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	201	GAAAAAATATCAACACGCAAACACGACCATAACCCAAACAAAACCTTGAA	250

AL672129.4	92609	CCATTTGTTTACATCTCCGTTAGAACTACACCCCTCACTGCTGACTGGTA	92658
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	251	CCATTTGTTTACATCTCCGTTAGAACTACACCCCTCACTGCTGACTGGTA	300

AL672129.4	92659	GCAAGTGCATTTTGGGACTCAGTTGGACATGTTGATCAAAAGCATTAATT	92708
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	301	GCAAGTGCATTTTGGGACTCAGTTGGACATGTTGATCAAAAGCATTAATT	350

AL672129.4	92709	TCTCTATCTATAATGCTACTATCAATGATTTCTCTGCAAAGCGATGACAA	92758
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	351	TCTCTATCTATAATGCTACTATCAATGATTTCTCTGCAAAGCGATGACAA	400

AL672129.4	92759	AAACATATCGTTTATTTTCCAGAAAACACATCATTGCTTCCTAAAATCTC	92808
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	401	AAACATATCGTTTATTTTCCAGAAAACACATCATTGCTTCCTAAAATCTC	450

AL672129.4	92809	ATCGTTCAGTCATGCTCAGTATGAAAGTGGTTTCATAAACAACTAATTGC	92858
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	451	ATCGTTCAGTCATGCTCAGTATGAAAGTGGTTTCATAAACAACTAATTGC	500

AL672129.4	92859	AATCTAAAGTCGTGGACACTGAGGTTTGAGCATGCAAAATTCTGTCGTAT	92908
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	501	AATCTAAAGTCGTGGACACTGAGGTTTGAGCATGCAAAATTCTGTCGTAT	550

AL672129.4	92909	GGCACTGCGAAAAAGGGCAAGATTAAACAAGATTATTGGACATTAAAAAA	92958
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	551	GGCACTGCGAAAAAGGGCAAGATTAAACAAGATTATTGGACATTAAAAAA	600

AL672129.4	92959	GTGAGCAATTGCTCCATATTTTACATTTCTGTCCAAAAAGCTTGCGTTTC	93008
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	601	GTGAGCAATTGCTCCATATTTTACATTTCTGTCCAAAAAGCTTGCGTTTC	650

AL672129.4	93009	CAGTCTGCTGTGTTTGCATGCATATGAATAGAAGTCTATGGGGAGAAAAG	93058
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	651	CAGTCTGCTGTGTTTGCATGCATATGAATAGAAGTCTATGGGGAGAAAAG	700

AL672129.4	93059	TTCAGAGTGACTGCGACTTAACTTGGCTGTGTTTTATTGTAGTACTTGTA	93108
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	701	TTCAGAGTGACTGCGACTTAACTTGGCTGTGTTTTATTGTAGTACTTGTA	750

AL672129.4	93109	GTGTTTTATTGTGTCCTATTGACCTTTTCAATGTAAAAAACATCTAAAGC	93158
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	751	GTGTTTTATTGTGTCCTATTGACCTTTTCAATGTAAAAAACATCTAAAGC	800

AL672129.4	93159	AAACATGTTAAAGGTTTCTTAAAAATCGAAACACTCCATACTTTAGTCTT	93208
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	801	AAACATGTTAAAGGTTTCTTAAAAATCGAAACACTCCATACTTTAGTCTT	850

AL672129.4	93209	AATTATGATAACATTGAGCAAGCCTCAACAACTTAACCACTTGATTTCAA	93258
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	851	AATTATGATAACATTGAGCAAGCCTCAACAACTTAACCACTTGATTTCAA	900

AL672129.4	93259	CTTTGTTGGAACCATAGTTCTGCACTTTATCAGGTCGATAAGGCACATCG	93308
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	901	CTTTGTTGGAACCATAGTTCTGCACTTTATCAGGTCGATAAGGCACATCG	950

AL672129.4	93309	TGGCTTCACAGCGATACAAGTTCTGACCCATGACCACCAAAGACATAAAG	93358
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	951	TGGCTTCACAGCGATACAAGTTCTGACCCATGACCACCAAAGACATAAAG	1000

AL672129.4	93359	AAAAAGAAGAACAGACAAATATTTCACAAGGTTGGATTTAAGCAGGTGAT	93408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	1001	AAAAAGAAGAACAGACAAATATTTCACAAGGTTGGATTTAAGCAGGTGAT	1050

AL672129.4	93409	AAATGTTACAAGCAAAGCCAATGAACACTGGAGCCAATTCAGAACTGCAC	93458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	1051	AAATGTTACAAGCAAAGCCAATGAACACTGGAGCCAATTCAGAACTGCAC	1100

AL672129.4	93459	AGATGTAAATGAAAGTCAGATATTTGTTTATTTATTGCCACATCCGAAAC	93508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	1101	AGATGTAAATGAAAGTCAGATATTTGTTTATTTATTGCCACATCCGAAAC	1150

AL672129.4	93509	TGATAGCTATTTTAATGGCAAGATC	93533
			|||||||||||||||||||||||||
AL672097.5	1151	TGATAGCTATTTTAATGGCAAGATC	1175

Overview

Query
AL672129.4 - 93533 bps
Hit
AL672097.5 - 100381 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1175 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link