<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR381640.8	1	AGAGAGAGAAGGTGAGTTGGAGATGTTTCTCATTTAGAAAAATAAACTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115298	AGAGAGAGAAGGTGAGTTGGAGATGTTTCTCATTTAGAAAAATAAACTGA	115347

CR381640.8	51	GGTCTCTCGGCCAGCACGCATTTAATTTTACATAAACATGTTCCATCATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115348	GGTCTCTCGGCCAGCACGCATTTAATTTTACATAAACATGTTCCATCATA	115397

CR381640.8	101	AATCTAACTGATTTTCAACATGAACGTAAAATATAAAACCTGCTCTAGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115398	AATCTAACTGATTTTCAACATGAACGTAAAATATAAAACCTGCTCTAGGA	115447

CR381640.8	151	TTTATTTCTAAAAAGACGTTACATCAGAATCGCCTGAATCATCAGACTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115448	TTTATTTCTAAAAAGACGTTACATCAGAATCGCCTGAATCATCAGACTCA	115497

CR381640.8	201	TCTGGTTTGGAAAAATTGGATTCATCCAACAAACCTTCAGCCAACAACTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115498	TCTGGTTTGGAAAAATTGGATTCATCCAACAAACCTTCAGCCAACAACTG	115547

CR381640.8	251	TTGTAGAACGATGTTAATATCACATGCGGCAATGATATGTTTTCTAGGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115548	TTGTAGAACGATGTTAATATCACATGCGGCAATGATATGTTTTCTAGGAT	115597

CR381640.8	301	TCGACATTTTCAGCGATCGAGAATGATTATATTTCAAATGGAAATACCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115598	TCGACATTTTCAGCGATCGAGAATGATTATATTTCAAATGGAAATACCAC	115647

CR381640.8	351	TATTAAGACAGAATGGTATAAATAGGATGACGTCTTCCGTTTCCAAAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115648	TATTAAGACAGAATGGTATAAATAGGATGACGTCTTCCGTTTCCAAAGTT	115697

CR381640.8	401	GACATATTAGAATGATGAGAAAATAATCATAAAAATGAGATACTGAGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115698	GACATATTAGAATGATGAGAAAATAATCATAAAAATGAGATACTGAGGCT	115747

CR381640.8	451	GAGCACGGTGGTCATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGTGGACGGATCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115748	GAGCACGGTGGTCATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGTGGACGGATCAC	115797

CR381640.8	501	CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGACGGTGAAACCCCATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115798	CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGACGGTGAAACCCCATC	115847

CR381640.8	551	TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCCGACGTGGTGGCGGGCGCCTGTAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115848	TCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCCGACGTGGTGGCGGGCGCCTGTAAT	115897

CR381640.8	601	CCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGTGAATTGCTTGAACCCAGGAGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115898	CCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGTGAATTGCTTGAACCCAGGAGGC	115947

CR381640.8	651	GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACAACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115948	GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACAACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGA	115997

CR381640.8	701	CAGAGCGAGGATCCATCTCAAAAAAAACAAAAGATACGTGTGGCAGTGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	115998	CAGAGCGAGGATCCATCTCAAAAAAAACAAAAGATACGTGTGGCAGTGTT	116047

CR381640.8	751	ATCTCAGAGTAAATGCTGCTGCCACAAGTACAGCCCGTGAGTATTCTCGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116048	ATCTCAGAGTAAATGCTGCTGCCACAAGTACAGCCCGTGAGTATTCTCGG	116097

CR381640.8	801	GGCAAACAGGAAGAGGGTTGAAGCTAGAGAGACACTCGCTCTTCCCACCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116098	GGCAAACAGGAAGAGGGTTGAAGCTAGAGAGACACTCGCTCTTCCCACCA	116147

CR381640.8	851	CCTCTTAATGTCCTATTTGTGCTTCAAGGACACTCGGTCCCTTGTTGTTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116148	CCTCTTAATGTCCTATTTGTGCTTCAAGGACACTCGGTCCCTTGTTGTTA	116197

CR381640.8	901	TATCCATAAATCCCTTCTCCTCCCAGCCCAGCAGTGAGGGCCCCATTGCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116198	TATCCATAAATCCCTTCTCCTCCCAGCCCAGCAGTGAGGGCCCCATTGCC	116247

CR381640.8	951	CATTACCTATCTATAGGGAACCAGCCCTGCAGGCATGCAGAGACCCCTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116248	CATTACCTATCTATAGGGAACCAGCCCTGCAGGCATGCAGAGACCCCTGA	116297

CR381640.8	1001	GACAGTCTTCCTCATGTCCCCTCATCATAGCCCCAAAAGCTAACACCCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116298	GACAGTCTTCCTCATGTCCCCTCATCATAGCCCCAAAAGCTAACACCCAG	116347

CR381640.8	1051	GGATGGGCTGTAACCCGCTTGAGGTTAGAAGGTCACTGACGTTACAGGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116348	GGATGGGCTGTAACCCGCTTGAGGTTAGAAGGTCACTGACGTTACAGGAG	116397

CR381640.8	1101	TCCGCACTGACACCCAGGGGCCCTGACTCCTGGCACGCTGGATATTGTTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116398	TCCGCACTGACACCCAGGGGCCCTGACTCCTGGCACGCTGGATATTGTTG	116447

CR381640.8	1151	AGAGGCAGAGGCTGCTCTGGGACACACCTGTTCTTACCTGGTCCCCAGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116448	AGAGGCAGAGGCTGCTCTGGGACACACCTGTTCTTACCTGGTCCCCAGGA	116497

CR381640.8	1201	TCCGGGTCTTTTGAACAGGGCTGCTTTGCACGATACCCTCAGGTACCTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116498	TCCGGGTCTTTTGAACAGGGCTGCTTTGCACGATACCCTCAGGTACCTGC	116547

CR381640.8	1251	CTCCCAGGGCTCTGTCCTTCTCAGATGGCTCAGGGCTGTGGTTCCTGGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116548	CTCCCAGGGCTCTGTCCTTCTCAGATGGCTCAGGGCTGTGGTTCCTGGGA	116597

CR381640.8	1301	AAAGCTTCGGGATGAGGTTTCCTGCCATGTTTCCCCATGGGTCAGAATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116598	AAAGCTTCGGGATGAGGTTTCCTGCCATGTTTCCCCATGGGTCAGAATAA	116647

CR381640.8	1351	TGTCATATTGATTGTGGAAATCAGCAGCACTGCTTACTTTTTTTTTTTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116648	TGTCATATTGATTGTGGAAATCAGCAGCACTGCTTACTTTTTTTTTTTTT	116697

CR381640.8	1401	TTCAGGCGGAGTCTCGCTCTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116698	TTCAGGCGGAGTCTCGCTCTGTCACCGAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAAT	116747

CR381640.8	1451	CTCTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116748	CTCTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACT	116797

CR381640.8	1501	CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTATGGGCTCCCACCACCACGGCCAGATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116798	CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTATGGGCTCCCACCACCACGGCCAGATA	116847

CR381640.8	1551	ATTTTTGTATTTTTAGTAGAAATGGGGTTTTGCCAAGTTGGCCAGGCTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116848	ATTTTTGTATTTTTAGTAGAAATGGGGTTTTGCCAAGTTGGCCAGGCTGG	116897

CR381640.8	1601	TCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCCCAGCTAATTTTTGTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116898	TCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCCCAGCTAATTTTTGTA	116947

CR381640.8	1651	TTTTTAGTAGACACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116948	TTTTTAGTAGACACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACT	116997

CR381640.8	1701	CCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	116998	CCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACA	117047

CR381640.8	1751	GGCTTGAGCCACCGCACCTGTCCTAGGTATGTTCGTTTAACAATACCGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	117048	GGCTTGAGCCACCGCACCTGTCCTAGGTATGTTCGTTTAACAATACCGTA	117097

CR381640.8	1801	GGGTATACTTAAATATTTGTTAGGCTCAATTCCTGGTGGCTTAGTCATTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	117098	GGGTATACTTAAATATTTGTTAGGCTCAATTCCTGGTGGCTTAGTCATTC	117147

CR381640.8	1851	TGCCCTGGGGATTGTCCTTGCTTCACACTGGTTCCAGAAACTCCTCACGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	117148	TGCCCTGGGGATTGTCCTTGCTTCACACTGGTTCCAGAAACTCCTCACGG	117197

CR381640.8	1901	CCCCCACAATGAATTCCTGGTGGCTTAGTCATTCTGCCCTGGGGATTGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	117198	CCCCCACAATGAATTCCTGGTGGCTTAGTCATTCTGCCCTGGGGATTGTC	117247

CR381640.8	1951	CTTGCTTCACACTGGTTCCAGAAACTTCTCACCGTCCCCACAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672040.10	117248	CTTGCTTCACACTGGTTCCAGAAACTTCTCACCGTCCCCACAATGAATTC	117297

Overview

Query
CR381640.8 - 63682 bps
Hit
AL672040.10 - 117297 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link