<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL683824.8	1	TTACAGGTGTGGACAGAATGGCAATAACAATAACAAACTTGATGCTGTTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181334	TTACAGGTGTGGACAGAATGGCAATAACAATAACAAACTTGATGCTGTTG	181383

AL683824.8	51	AAGAGAGATGGTACACTTTGTAGGAGGGCAATAGAAAAAGATTCCTTGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181384	AAGAGAGATGGTACACTTTGTAGGAGGGCAATAGAAAAAGATTCCTTGAA	181433

AL683824.8	101	GGCAAGCCTTCCCTCATAAAAAGCTTCTGAATATAAAAAAGGCAAACTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181434	GGCAAGCCTTCCCTCATAAAAAGCTTCTGAATATAAAAAAGGCAAACTCA	181483

AL683824.8	151	TTTGACAGTCTTTCATTTAAAAAGAGAGATTCACCAACTGGAACAGGGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181484	TTTGACAGTCTTTCATTTAAAAAGAGAGATTCACCAACTGGAACAGGGGT	181533

AL683824.8	201	TATGCCAAAAGCTGTTTGTTGCCTATATGGGGAATATGTTCTACTAGCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181534	TATGCCAAAAGCTGTTTGTTGCCTATATGGGGAATATGTTCTACTAGCTG	181583

AL683824.8	251	GGCTGCCTTGTTTGGTCTCAGTATGTGAAGGAGCACATAGCCTTGCAGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181584	GGCTGCCTTGTTTGGTCTCAGTATGTGAAGGAGCACATAGCCTTGCAGAA	181633

AL683824.8	301	GCTTGAAGTGCCCAGGTAGGGGGATACCTGGAGGGTTCCCACCCACTCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181634	GCTTGAAGTGCCCAGGTAGGGGGATACCTGGAGGGTTCCCACCCACTCAG	181683

AL683824.8	351	AGAAGAAAAGGATGTGGGTGGGATGAGGGAAGGATTGTGGTAGGAGTGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181684	AGAAGAAAAGGATGTGGGTGGGATGAGGGAAGGATTGTGGTAGGAGTGAC	181733

AL683824.8	401	CAGGAGGGGGGCAGTGAGTGGGAAAAAAGTGAAAAATTAAAATAAAAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181734	CAGGAGGGGGGCAGTGAGTGGGAAAAAAGTGAAAAATTAAAATAAAAAAT	181783

AL683824.8	451	TTACATAACAAAAAAGAGAGGTTCACATCTCAAAAAAGGTCAAAGTTAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181784	TTACATAACAAAAAAGAGAGGTTCACATCTCAAAAAAGGTCAAAGTTAGA	181833

AL683824.8	501	AAGTGTTTTCATAGGTATGCAAGTTATCAGAAGTCACTGTAACCATGATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181834	AAGTGTTTTCATAGGTATGCAAGTTATCAGAAGTCACTGTAACCATGATC	181883

AL683824.8	551	CAATGAGGTCTGGCTACATATTTAAACAAATAATATTATCATATGATCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181884	CAATGAGGTCTGGCTACATATTTAAACAAATAATATTATCATATGATCAT	181933

AL683824.8	601	ACATACATATGTATTCATTTATTTATTTATTGGTTGTCTTAGTTAGGGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181934	ACATACATATGTATTCATTTATTTATTTATTGGTTGTCTTAGTTAGGGTT	181983

AL683824.8	651	TTACTGCTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAGGACAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	181984	TTACTGCTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTTATAAGGACAAG	182033

AL683824.8	701	ATTTAATTGGAGCTAGCTTATAGATTCAGAGGATCAGTCCATTATTATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182034	ATTTAATTGGAGCTAGCTTATAGATTCAGAGGATCAGTCCATTATTATCA	182083

AL683824.8	751	AGACAAGAGCATGGCAGCACCCAGGCAGGCATGGTACAGGAGGAGCTGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182084	AGACAAGAGCATGGCAGCACCCAGGCAGGCATGGTACAGGAGGAGCTGAG	182133

AL683824.8	801	AGTCCTACATCTTCATCTGAAGGGTGCTAAAAGATTGGCTTCCAGGCAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182134	AGTCCTACATCTTCATCTGAAGGGTGCTAAAAGATTGGCTTCCAGGCAGC	182183

AL683824.8	851	TAGAGAGTCCCTATGTGCTTGCTACAAGTGGCAGAGCCATAAAAATGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182184	TAGAGAGTCCCTATGTGCTTGCTACAAGTGGCAGAGCCATAAAAATGGAG	182233

AL683824.8	901	CCTGTCATGACTAAGCCTGTCATGACACTATAAGATCCAGACCCTGTGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182234	CCTGTCATGACTAAGCCTGTCATGACACTATAAGATCCAGACCCTGTGCA	182283

AL683824.8	951	TGATGATGCAAGACTTAAAAGTGTGCTGTTTTGGGTTGCAGTCTTGCTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182284	TGATGATGCAAGACTTAAAAGTGTGCTGTTTTGGGTTGCAGTCTTGCTTT	182333

AL683824.8	1001	CCATTGTTATCCTTGTACTAGTCCTTTTGGAATGGAAGATACTCCTCATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182334	CCATTGTTATCCTTGTACTAGTCCTTTTGGAATGGAAGATACTCCTCATG	182383

AL683824.8	1051	TACCACTGTGTACTAGAAGTATGTAACTGAAAAGAATACAAGAGTTCTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182384	TACCACTGTGTACTAGAAGTATGTAACTGAAAAGAATACAAGAGTTCTTA	182433

AL683824.8	1101	GATAAAAGTTTCCCGTATATTAACTTCGTATGCCCCAGTACAGAGGAATG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182434	GATAAAAGTTTCCCGTATATTAACTTCGTATGCCCCAGTACAGAGGAATG	182483

AL683824.8	1151	CCAGGGCCAAGAAGCAGGAGTGGGTGGGTAAGGGAGCAGGGTGGAGGGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182484	CCAGGGCCAAGAAGCAGGAGTGGGTGGGTAAGGGAGCAGGGTGGAGGGAG	182533

AL683824.8	1201	GGTATAGGGAACTTTCGGGATAGCATTTGAAATGTATATAAAGAAAATAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182534	GGTATAGGGAACTTTCGGGATAGCATTTGAAATGTATATAAAGAAAATAT	182583

AL683824.8	1251	CTAATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGAAAATTAATACA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182584	CTAATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGAAAATTAATACA	182633

AL683824.8	1301	CAGCACTGTTAATAAAAAAAAGTTTCCCTTGCTCTCAGAAAAAGTCATTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182634	CAGCACTGTTAATAAAAAAAAGTTTCCCTTGCTCTCAGAAAAAGTCATTG	182683

AL683824.8	1351	AACACTCACGACATTATTAAGATGTTAGGGACTGAAGGCAGTTTACATCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182684	AACACTCACGACATTATTAAGATGTTAGGGACTGAAGGCAGTTTACATCT	182733

AL683824.8	1401	TGAGCTGGCTATGATACTATATGAACCATGAGTAGAAAGTTTGCATGTAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182734	TGAGCTGGCTATGATACTATATGAACCATGAGTAGAAAGTTTGCATGTAA	182783

AL683824.8	1451	ATCCCCTCCCTCAGGGTCACATTTGAGGAACAGGTTCCCTAGATGGAGGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182784	ATCCCCTCCCTCAGGGTCACATTTGAGGAACAGGTTCCCTAGATGGAGGC	182833

AL683824.8	1501	ATTTGGTTTTTCCTGCCTGCATTTGGATGGTGGTGGTGCCTTTAGAAGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182834	ATTTGGTTTTTCCTGCCTGCATTTGGATGGTGGTGGTGCCTTTAGAAGGT	182883

AL683824.8	1551	GGCACTTACTAGCAGCATACTGTAAGGAGTGGGGATTGAGCCTTGGGCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182884	GGCACTTACTAGCAGCATACTGTAAGGAGTGGGGATTGAGCCTTGGGCTA	182933

AL683824.8	1601	CTTTCTTCTGTCCATTTTCTGATATCTCAGACTGCCATGTGAATCCAACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182934	CTTTCTTCTGTCCATTTTCTGATATCTCAGACTGCCATGTGAATCCAACT	182983

AL683824.8	1651	CCTATAAACCTAGCAAACCCATTTTTCCAGGCCTGCAGTACTGGGCAGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	182984	CCTATAAACCTAGCAAACCCATTTTTCCAGGCCTGCAGTACTGGGCAGAC	183033

AL683824.8	1701	ACTGAGACTAAAATAGGATTTTCTTCTCTCAATTAGCTTCTGTCAAGTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183034	ACTGAGACTAAAATAGGATTTTCTTCTCTCAATTAGCTTCTGTCAAGTCT	183083

AL683824.8	1751	TTTGCTACTGTAACACAAAAGTAATGAGTACATCTTATATGTCAGTATTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183084	TTTGCTACTGTAACACAAAAGTAATGAGTACATCTTATATGTCAGTATTT	183133

AL683824.8	1801	AAACCACAGAATAACACAATAGGCATGTAATTCATATAGAAACAAAATGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183134	AAACCACAGAATAACACAATAGGCATGTAATTCATATAGAAACAAAATGT	183183

AL683824.8	1851	GTCAATAAAATCTGGATGAAAGTATATATAAGATTTTTTTGTATCATTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183184	GTCAATAAAATCTGGATGAAAGTATATATAAGATTTTTTTGTATCATTGA	183233

AL683824.8	1901	GGGGAAGAGATTATAGCTTTTCAAATATTTTTCATCATGTTCTATATGTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183234	GGGGAAGAGATTATAGCTTTTCAAATATTTTTCATCATGTTCTATATGTT	183283

AL683824.8	1951	TAATTTTGCTATTATCATTAGGAGTTAAATATTTTAACAAAACAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671987.12	183284	TAATTTTGCTATTATCATTAGGAGTTAAATATTTTAACAAAACAGAATTC	183333

Overview

Query
AL683824.8 - 233589 bps
Hit
AL671987.12 - 183333 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link