<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606756.17	1	GAATTCACTACCTAGATCAGATCAGACTGGAAACAAATGGAGTGCCTGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41438	GAATTCACTACCTAGATCAGATCAGACTGGAAACAAATGGAGTGCCTGAA	41487

AL606756.17	51	CATGGGATTGAGTCTTCCTTGGATCGTGGAAATAGTTGGATTCTAGGGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41488	CATGGGATTGAGTCTTCCTTGGATCGTGGAAATAGTTGGATTCTAGGGAC	41537

AL606756.17	101	AGAACAGGACATCAAGATTCCAGTCATGAGTGTGGGTGCCCACAGCAAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41538	AGAACAGGACATCAAGATTCCAGTCATGAGTGTGGGTGCCCACAGCAAGG	41587

AL606756.17	151	TATTGTGGATCCACTACCAAAAACCTATTGGTATGAAAGCCATTGACATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41588	TATTGTGGATCCACTACCAAAAACCTATTGGTATGAAAGCCATTGACATA	41637

AL606756.17	201	TGAGAGATAGTTTGTCTTTATCAAAAGATTTATGATCACTGAGGATCAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41638	TGAGAGATAGTTTGTCTTTATCAAAAGATTTATGATCACTGAGGATCAAA	41687

AL606756.17	251	CTCAACTAAATGCAAATTAAGTGGCAGGAGCCATTGTCTAGAGTATGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41688	CTCAACTAAATGCAAATTAAGTGGCAGGAGCCATTGTCTAGAGTATGAGA	41737

AL606756.17	301	AAAGTTTCTTTTATTGAGAAGCAACAACATACTTTGTACCACCACCTCAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41738	AAAGTTTCTTTTATTGAGAAGCAACAACATACTTTGTACCACCACCTCAT	41787

AL606756.17	351	ACCGGAAATCTTGTACATAACAGAAGGTCTCAAATGTCTGCAGTGAGGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41788	ACCGGAAATCTTGTACATAACAGAAGGTCTCAAATGTCTGCAGTGAGGTG	41837

AL606756.17	401	TTGTGTAGAGAACACTGTGCTTAGTGGCAGAAAATGCTCCTGAAATTAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41838	TTGTGTAGAGAACACTGTGCTTAGTGGCAGAAAATGCTCCTGAAATTAGA	41887

AL606756.17	451	GCTAGTACTGTTGGCAACCAGGCAGATACTCCGAGGTTTGACACCTATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41888	GCTAGTACTGTTGGCAACCAGGCAGATACTCCGAGGTTTGACACCTATGC	41937

AL606756.17	501	TACAGCCTTGCTGAACTTACTGACTTTGTACTTACCAAGAGGCAAATCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41938	TACAGCCTTGCTGAACTTACTGACTTTGTACTTACCAAGAGGCAAATCTA	41987

AL606756.17	551	TTTCAGTTACAAAGTTGGCCACCCAAGTGGGACTTCTTCCTTGAAGGCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	41988	TTTCAGTTACAAAGTTGGCCACCCAAGTGGGACTTCTTCCTTGAAGGCTT	42037

AL606756.17	601	GTGGCTACTTTACCTGTCAACAAGAGAATCAGTGGGCAATGGCATTTTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42038	GTGGCTACTTTACCTGTCAACAAGAGAATCAGTGGGCAATGGCATTTTGT	42087

AL606756.17	651	CCTGAGTTAACTTTACTCTGTTGACAGAAACAAGCCATGAGTACATAGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42088	CCTGAGTTAACTTTACTCTGTTGACAGAAACAAGCCATGAGTACATAGAA	42137

AL606756.17	701	GTGTCTTCTTGGTGCAAGATTGCATTCCTATCAACTTGTATTGAATTTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42138	GTGTCTTCTTGGTGCAAGATTGCATTCCTATCAACTTGTATTGAATTTAT	42187

AL606756.17	751	TGGCCTCTCTGAACTTTTGGTTGAAAATTTTCTCTGGATTGTGAGTCATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42188	TGGCCTCTCTGAACTTTTGGTTGAAAATTTTCTCTGGATTGTGAGTCATG	42237

AL606756.17	801	TTGGATGACTCTATGGATAGGGTTCTGGGAACACAGAGAAGCATTTTTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42238	TTGGATGACTCTATGGATAGGGTTCTGGGAACACAGAGAAGCATTTTTGC	42287

AL606756.17	851	TGGAGATGTACAAAGGAGACAGCTATCAGTCTGGGAAGCTACTGCCAGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42288	TGGAGATGTACAAAGGAGACAGCTATCAGTCTGGGAAGCTACTGCCAGCA	42337

AL606756.17	901	ATCAGAGATCTGGGAGATTAAAAGAAATCTCAGAGCCAGGTGCCTTCAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42338	ATCAGAGATCTGGGAGATTAAAAGAAATCTCAGAGCCAGGTGCCTTCAAT	42387

AL606756.17	951	AAACGTTCTGGAAAATTGAAGAAAGCTTTGTCCAAAAGTAGAGGATGGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42388	AAACGTTCTGGAAAATTGAAGAAAGCTTTGTCCAAAAGTAGAGGATGGTT	42437

AL606756.17	1001	GGGGAATGAGTGAGGGAACATGTGGCCAATGAAACCTGGAAAACTGGGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42438	GGGGAATGAGTGAGGGAACATGTGGCCAATGAAACCTGGAAAACTGGGAA	42487

AL606756.17	1051	AAATCTGCATCCTGGCTTTGACAATTAAAGGGTTGGAAAATTGGCTGGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42488	AAATCTGCATCCTGGCTTTGACAATTAAAGGGTTGGAAAATTGGCTGGTG	42537

AL606756.17	1101	TCTGTCTCCATACTGTGGGCCAGCATCAAAATGAAAGTACCCCAGAGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42538	TCTGTCTCCATACTGTGGGCCAGCATCAAAATGAAAGTACCCCAGAGGGA	42587

AL606756.17	1151	AGTTTTGTTTAATATTTACAGAATAATTATAAAATTTTTATGGGTTAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42588	AGTTTTGTTTAATATTTACAGAATAATTATAAAATTTTTATGGGTTAAGG	42637

AL606756.17	1201	AAGACAGATTTTGGTTTCTTTTCATACAAATGTTCTTGTCTACGTGTCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42638	AAGACAGATTTTGGTTTCTTTTCATACAAATGTTCTTGTCTACGTGTCAG	42687

AL606756.17	1251	GTGGGAGCCATTTCTGTTCATCGAAAGAAGTGGGATTTTTTAGTTAAAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42688	GTGGGAGCCATTTCTGTTCATCGAAAGAAGTGGGATTTTTTAGTTAAAGT	42737

AL606756.17	1301	TGTACTCAATATCTGTATTTCTTTAAATGCTTCCAGGTTGAACAAGGAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42738	TGTACTCAATATCTGTATTTCTTTAAATGCTTCCAGGTTGAACAAGGAGT	42787

AL606756.17	1351	GGGCTTGTCTTTTCTACACTTTATTTTCTGTTGTGTTTAATTAATCCAGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42788	GGGCTTGTCTTTTCTACACTTTATTTTCTGTTGTGTTTAATTAATCCAGT	42837

AL606756.17	1401	TTTTGTTTAGTTTCTGTTATTTCACGCTAACACCGCTAATGAAGTTCAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42838	TTTTGTTTAGTTTCTGTTATTTCACGCTAACACCGCTAATGAAGTTCAAA	42887

AL606756.17	1451	CTCATCAGCGATATTGCTTTGGGAATTACTCCCCAGCTCTTTCCCCATTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42888	CTCATCAGCGATATTGCTTTGGGAATTACTCCCCAGCTCTTTCCCCATTT	42937

AL606756.17	1501	GCTGCAGGGGACACACCTTTCCTCATTCTTTCTACCTCCTGGTTATGCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42938	GCTGCAGGGGACACACCTTTCCTCATTCTTTCTACCTCCTGGTTATGCCA	42987

AL606756.17	1551	GTGAACTTCACACTCACCAAGAGGTGAACCAGTCATGTTACGTTACAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	42988	GTGAACTTCACACTCACCAAGAGGTGAACCAGTCATGTTACGTTACAATA	43037

AL606756.17	1601	GTATCAGTAATAATAATATTTATAAAACATTCATTGATACAGCAAGTGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43038	GTATCAGTAATAATAATATTTATAAAACATTCATTGATACAGCAAGTGTT	43087

AL606756.17	1651	CTAGGGGTTTAGCATGTATTAATTCATATGATAAAAGTCATTATCACCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43088	CTAGGGGTTTAGCATGTATTAATTCATATGATAAAAGTCATTATCACCAT	43137

AL606756.17	1701	TTCACATGTAAGAAAACCAAGACACACAATAGAAACTAAGTTGTCCAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43138	TTCACATGTAAGAAAACCAAGACACACAATAGAAACTAAGTTGTCCAAAG	43187

AL606756.17	1751	TCATGTAACAAATAAACCACATAGCTGGGGCTACAGATCCAGGTAATATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43188	TCATGTAACAAATAAACCACATAGCTGGGGCTACAGATCCAGGTAATATG	43237

AL606756.17	1801	ACTCCAGGGTCTGCATTTAAATTGTATGGTTTTACTTATTAAGATAGAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43238	ACTCCAGGGTCTGCATTTAAATTGTATGGTTTTACTTATTAAGATAGAGA	43287

AL606756.17	1851	GATGTTTGTGGGAGACCACTAGAAATAAAGAGTGCTTCTGGCTGGGAAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43288	GATGTTTGTGGGAGACCACTAGAAATAAAGAGTGCTTCTGGCTGGGAAGG	43337

AL606756.17	1901	TTACTGTCTAAAGAAGCAGATGTTTTGGTGATACTTTAATAACAACTGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43338	TTACTGTCTAAAGAAGCAGATGTTTTGGTGATACTTTAATAACAACTGAA	43387

AL606756.17	1951	TATTATTTTCTGTTCCTAGCATTATCCCTAAGTTGAGCTCAGGAGGCCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671965.6	43388	TATTATTTTCTGTTCCTAGCATTATCCCTAAGTTGAGCTCAGGAGGCCTT	43437

Overview

Query
AL606756.17 - 193976 bps
Hit
AL671965.6 - 43437 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link