<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845310.4	1	AGCTGCTAGTATGTGCTCTCTCCCGTTTCTTCTTGGAGGTACTCAGAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121445	AGCTGCTAGTATGTGCTCTCTCCCGTTTCTTCTTGGAGGTACTCAGAGCT	121494

AL845310.4	51	ATGAGTTTCCCTCTTAGAAATGCTTTCATTGTGTCCCAAAGGTTTGGGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121495	ATGAGTTTCCCTCTTAGAAATGCTTTCATTGTGTCCCAAAGGTTTGGGTA	121544

AL845310.4	101	CGTTGTGGCTTCATTTTCATTAAACTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121545	CGTTGTGGCTTCATTTTCATTAAACTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTTCT	121594

AL845310.4	151	TTATTCCTTCCTTGACCAAGGTATCATTGAGAAGAGTGTTGTTCAGTTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121595	TTATTCCTTCCTTGACCAAGGTATCATTGAGAAGAGTGTTGTTCAGTTTC	121644

AL845310.4	201	CACGTGAATGTTGGCTTTCCATTCTTAATGTTGTTATTGAAGATCAGTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121645	CACGTGAATGTTGGCTTTCCATTCTTAATGTTGTTATTGAAGATCAGTCT	121694

AL845310.4	251	TAGGCCATGGTGGTCTGATAGGATACATGGGACAATTTCAATATTTTTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121695	TAGGCCATGGTGGTCTGATAGGATACATGGGACAATTTCAATATTTTTGT	121744

AL845310.4	301	ATCTGTTGAGGCCTATTTTGTGACCAATTATATGGTCAATTTTGGAGAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121745	ATCTGTTGAGGCCTATTTTGTGACCAATTATATGGTCAATTTTGGAGAAG	121794

AL845310.4	351	GTTCCGTGAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATCCTTTTGTTTTAGGATTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121795	GTTCCGTGAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATCCTTTTGTTTTAGGATTAAA	121844

AL845310.4	401	TATTCTGTAGATATCTGTCAGGTCCATTTGTTTCATAACTTCTGTTAGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121845	TATTCTGTAGATATCTGTCAGGTCCATTTGTTTCATAACTTCTGTTAGTT	121894

AL845310.4	451	TCACTGTGTCCCTGTTTAGTTTCTGTTTCCACGATCTGTCCATTGATGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121895	TCACTGTGTCCCTGTTTAGTTTCTGTTTCCACGATCTGTCCATTGATGAA	121944

AL845310.4	501	AGTGGTGTGTTGAGGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121945	AGTGGTGTGTTGAGGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGC	121994

AL845310.4	551	TTTGAGCTTTATTAAAGTGTCTTTAATGAATGTGGCTGCCCTTGCATTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	121995	TTTGAGCTTTATTAAAGTGTCTTTAATGAATGTGGCTGCCCTTGCATTTG	122044

AL845310.4	601	GAGCGTAGATATTCAGAATTGAGAGTTCCTCTTGGAGGATTTTACCTTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122045	GAGCGTAGATATTCAGAATTGAGAGTTCCTCTTGGAGGATTTTACCTTTG	122094

AL845310.4	651	ATGAGTATGAAGTGTCCCTCCTTGTCTTTTTTGATAACTTTGGGTTGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122095	ATGAGTATGAAGTGTCCCTCCTTGTCTTTTTTGATAACTTTGGGTTGGAA	122144

AL845310.4	701	GTCGATTTTATCCGATATTAGAATGGCTACTCCAGCCTGTTTCTTCAGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122145	GTCGATTTTATCCGATATTAGAATGGCTACTCCAGCCTGTTTCTTCAGAC	122194

AL845310.4	751	CATTTGCTTGGAAAATTGTTTTCCAGCCTTTCACTCTGAGGTAGTGTCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122195	CATTTGCTTGGAAAATTGTTTTCCAGCCTTTCACTCTGAGGTAGTGTCTG	122244

AL845310.4	801	TCTTTTTCCCTGAGATGGGTTTCCTGTAAGCAGCAGAATGTTGGGTCCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122245	TCTTTTTCCCTGAGATGGGTTTCCTGTAAGCAGCAGAATGTTGGGTCCTG	122294

AL845310.4	851	TTTGTGTAGCCAGTCTGTTAGTCTATGTCTTTTTATTGGGGAATTGAGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122295	TTTGTGTAGCCAGTCTGTTAGTCTATGTCTTTTTATTGGGGAATTGAGTC	122344

AL845310.4	901	CATTGATATTAAGAGATATTAAGGAAAGGTAATTGTTGCTTCCTGTTATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122345	CATTGATATTAAGAGATATTAAGGAAAGGTAATTGTTGCTTCCTGTTATT	122394

AL845310.4	951	TTTGTTGTTAAAGTTGGCATTCTGTTCTTGTGGCTGTCTTCTTTTAGGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122395	TTTGTTGTTAAAGTTGGCATTCTGTTCTTGTGGCTGTCTTCTTTTAGGTT	122444

AL845310.4	1001	TGTTGAGGGATTATCTTCTTGTTTTTTCTAGGGCGTGGTTCCTGTCCTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122445	TGTTGAGGGATTATCTTCTTGTTTTTTCTAGGGCGTGGTTCCTGTCCTTG	122494

AL845310.4	1051	TATTGGTTTTTTTCTGTTATTATCCTTTGAAGGGCTGGATTCGTGGAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122495	TATTGGTTTTTTTCTGTTATTATCCTTTGAAGGGCTGGATTCGTGGAGAG	122544

AL845310.4	1101	ATAATGGGTGAATTTAGTTTTGTCGTGGAATACTTTGGTTTCTCCATCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122545	ATAATGGGTGAATTTAGTTTTGTCGTGGAATACTTTGGTTTCTCCATCTA	122594

AL845310.4	1151	TGGTAATTGAGAGTTTGGCTGGGTATAGTAGCCTGGGCTGGCATTTGTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122595	TGGTAATTGAGAGTTTGGCTGGGTATAGTAGCCTGGGCTGGCATTTGTGT	122644

AL845310.4	1201	TCTCTTAGTGTCTGTATAACATCTGTCCAGGCTCTTCTGGCTTTCATAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122645	TCTCTTAGTGTCTGTATAACATCTGTCCAGGCTCTTCTGGCTTTCATAGT	122694

AL845310.4	1251	CTCTGGTGAAAAATCTGGTGTAATTCTGATAGGCTTGCCTTTATATGTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122695	CTCTGGTGAAAAATCTGGTGTAATTCTGATAGGCTTGCCTTTATATGTTA	122744

AL845310.4	1301	CTTGACCTTTTTCCCTTACTGCTTTTAGTATTCTATCTTTATTTAGTGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122745	CTTGACCTTTTTCCCTTACTGCTTTTAGTATTCTATCTTTATTTAGTGCA	122794

AL845310.4	1351	TTTGGTGTTCTGATTATTATGTGTCGGGAGGAATTTCTTTTCTGGTCCAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122795	TTTGGTGTTCTGATTATTATGTGTCGGGAGGAATTTCTTTTCTGGTCCAG	122844

AL845310.4	1401	TCTATTTGGAGTTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTCATGGGCATCTCTTTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122845	TCTATTTGGAGTTCTGTAGGCTTCTTGTATGTTCATGGGCATCTCTTTCT	122894

AL845310.4	1451	TTAGATTTGGGAAGTTTTCTTCAATAATTTTGTTGAAGATGTTTGCTGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122895	TTAGATTTGGGAAGTTTTCTTCAATAATTTTGTTGAAGATGTTTGCTGGT	122944

AL845310.4	1501	CCTTTGAGTTGAAAATCTTCATTCTCATCCACTCCTATTATCCGTAGGTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122945	CCTTTGAGTTGAAAATCTTCATTCTCATCCACTCCTATTATCCGTAGGTT	122994

AL845310.4	1551	TGGTCTTCTCATTGTGTCCTGGATTTCCTGGATGTTTTGAGTTAGGATCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	122995	TGGTCTTCTCATTGTGTCCTGGATTTCCTGGATGTTTTGAGTTAGGATCT	123044

AL845310.4	1601	TTTTGCATTTTCCATTTTCTTTGATTGTTGTGCCGATGTTCTCTATGGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123045	TTTTGCATTTTCCATTTTCTTTGATTGTTGTGCCGATGTTCTCTATGGAG	123094

AL845310.4	1651	TCTTCTGCACCTGAGATTCTCTCTTCCATCTCTTGTATTCTGTTGCTGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123095	TCTTCTGCACCTGAGATTCTCTCTTCCATCTCTTGTATTCTGTTGCTGAT	123144

AL845310.4	1701	GCTGGCATCTATGGTTCCAGATTTCTTTCCTAGGGTTTCTATCTCCAGCG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123145	GCTGGCATCTATGGTTCCAGATTTCTTTCCTAGGGTTTCTATCTCCAGCG	123194

AL845310.4	1751	TCGCCTCACTTTGGGTTTTCTTTATTGTGTCTACTTCCCTTTTTAGGTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123195	TCGCCTCACTTTGGGTTTTCTTTATTGTGTCTACTTCCCTTTTTAGGTCT	123244

AL845310.4	1801	AGTATGGTTTTGTTCATTTCCATCACCTGTTTGGATGTGTTTTCCTGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123245	AGTATGGTTTTGTTCATTTCCATCACCTGTTTGGATGTGTTTTCCTGTTT	123294

AL845310.4	1851	TTCTATAAGGACTTCTACCTGTTTGGTTGTGTTTTCCTGTTTTTCTTTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123295	TTCTATAAGGACTTCTACCTGTTTGGTTGTGTTTTCCTGTTTTTCTTTAA	123344

AL845310.4	1901	GGACTTGTAACTCTTTAGCAGTGTTTTCCTGTTTTTCTTTAAGGACTTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123345	GGACTTGTAACTCTTTAGCAGTGTTTTCCTGTTTTTCTTTAAGGACTTGT	123394

AL845310.4	1951	AACTCTTTAGCAGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAAGTGAGTTATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671921.16	123395	AACTCTTTAGCAGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAAGTGAGTTATTGAATTC	123444

Overview

Query
AL845310.4 - 122356 bps
Hit
AL671921.16 - 123444 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link