<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672200.10	1	AGGCAGGAGAGGAGAGTGGCAGAGAAGGCAGACAGAGGGTTAGCTGGAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	130776	AGGCAGGAGAGGAGAGTGGCAGAGAAGGCAGACAGAGGGTTAGCTGGAGC	130825

AL672200.10	51	AACAGAGGGGACAGTGAACAGCTTCCACCAGAAAAAGAAACAGAAAAGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	130826	AACAGAGGGGACAGTGAACAGCTTCCACCAGAAAAAGAAACAGAAAAGCA	130875

AL672200.10	101	GCCCCAGCCCCCACCCTCTCGCAAGACGGGGGACAGGCATTGCGCATAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	130876	GCCCCAGCCCCCACCCTCTCGCAAGACGGGGGACAGGCATTGCGCATAAA	130925

AL672200.10	151	GCCCAGGGGGTCTGGTGTACCCCCAACAGAGCACCATGTTGTCTGGGCGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	130926	GCCCAGGGGGTCTGGTGTACCCCCAACAGAGCACCATGTTGTCTGGGCGC	130975

AL672200.10	201	ACAAGGGAGCTGGACTCCGCTTAGCCCAACTGCCAAGCAGAGTAGCCCGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	130976	ACAAGGGAGCTGGACTCCGCTTAGCCCAACTGCCAAGCAGAGTAGCCCGG	131025

AL672200.10	251	TGAAGCTCAGAGGCAGCAGTGGGTCAGTGGCTTGGGTTAGCAAGGACCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131026	TGAAGCTCAGAGGCAGCAGTGGGTCAGTGGCTTGGGTTAGCAAGGACCTC	131075

AL672200.10	301	AGGCAGGTTCCCCCCACCCCACCCCCGTCTCTCCCGCCCGACTCACTCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131076	AGGCAGGTTCCCCCCACCCCACCCCCGTCTCTCCCGCCCGACTCACTCAG	131125

AL672200.10	351	AGCCAGAGGAGTCCTCATCCACCGTGCCTGCCTTGATGCTCATGGCGACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131126	AGCCAGAGGAGTCCTCATCCACCGTGCCTGCCTTGATGCTCATGGCGACA	131175

AL672200.10	401	GGCATGACCCCATTCAGCTGTTCCTGCAGAGACTGGCGCGGAGGTGGGCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131176	GGCATGACCCCATTCAGCTGTTCCTGCAGAGACTGGCGCGGAGGTGGGCG	131225

AL672200.10	451	GGGAGGAGGTCCGTGCCGACTGCCCTCACTGATGGAGGAGCCCCGAGAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131226	GGGAGGAGGTCCGTGCCGACTGCCCTCACTGATGGAGGAGCCCCGAGAAG	131275

AL672200.10	501	ACCCTGTGCCCTGCTCCAGGGGCAGCCTTAGGAGGCTGCTCTTTTCGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131276	ACCCTGTGCCCTGCTCCAGGGGCAGCCTTAGGAGGCTGCTCTTTTCGCTG	131325

AL672200.10	551	ATGGTGGGCAGACACTTCTTCTTGAGGATGCCTAGGTACAAGGTGTGGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131326	ATGGTGGGCAGACACTTCTTCTTGAGGATGCCTAGGTACAAGGTGTGGGT	131375

AL672200.10	601	ATCATGAGATGGGAAGTCCTAATAGCTCCGGCAAGAGAATGGGAGAGTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131376	ATCATGAGATGGGAAGTCCTAATAGCTCCGGCAAGAGAATGGGAGAGTGG	131425

AL672200.10	651	AGCTGATGGGAGAGACTCCACTCACCTTTGTGAGGTTGGGTAGAAGGGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131426	AGCTGATGGGAGAGACTCCACTCACCTTTGTGAGGTTGGGTAGAAGGGCC	131475

AL672200.10	701	CGGAAGGGGTCCCAGAGACCCTTCCCGAGTTAGGGCATCTCCATTCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131476	CGGAAGGGGTCCCAGAGACCCTTCCCGAGTTAGGGCATCTCCATTCTCCC	131525

AL672200.10	751	GTGGCCGCTCTTCAAGGGGCCCACTACCACTATTCTCCTTTGTTGTGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131526	GTGGCCGCTCTTCAAGGGGCCCACTACCACTATTCTCCTTTGTTGTGGTC	131575

AL672200.10	801	CCAAAGTCTCCCAGCCAAGGGACCTTCCCAGAACCCGGACCCCCATCTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131576	CCAAAGTCTCCCAGCCAAGGGACCTTCCCAGAACCCGGACCCCCATCTGT	131625

AL672200.10	851	CAAAGAAAGGAAACCAATAGTCCCAGAGAGGGCAGACAGTTAGGATAGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131626	CAAAGAAAGGAAACCAATAGTCCCAGAGAGGGCAGACAGTTAGGATAGCC	131675

AL672200.10	901	ACCACCCCAGCTCTATTTTCCAAAAAGCCCTGGCCTCTTAGGCTTCTGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131676	ACCACCCCAGCTCTATTTTCCAAAAAGCCCTGGCCTCTTAGGCTTCTGTT	131725

AL672200.10	951	GCCCCCCAATGGCTGCAGCCCTGGTGCTGGCCCACCCTTGGGGGTACTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131726	GCCCCCCAATGGCTGCAGCCCTGGTGCTGGCCCACCCTTGGGGGTACTGT	131775

AL672200.10	1001	GAAGGGGCAGTCTCTCAGCTCCAGGACCCAGCAGGCTGTCCCAGCCCTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131776	GAAGGGGCAGTCTCTCAGCTCCAGGACCCAGCAGGCTGTCCCAGCCCTGC	131825

AL672200.10	1051	TCGCCAGGGAAGGCGGCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGCTGTCTGATGAGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131826	TCGCCAGGGAAGGCGGCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGCTGTCTGATGAGTG	131875

AL672200.10	1101	GGTGGAGGCATAGGAACCACTCTGGTCATCTTCCAGGGACAGGTCACTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131876	GGTGGAGGCATAGGAACCACTCTGGTCATCTTCCAGGGACAGGTCACTGT	131925

AL672200.10	1151	CAGAGTCCGTGTCGGGATCTGGGAGGTCAGGGAGGGATCACAACTGTCCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131926	CAGAGTCCGTGTCGGGATCTGGGAGGTCAGGGAGGGATCACAACTGTCCC	131975

AL672200.10	1201	ACCTGCCCCAGCCCACCCTCAGCAAAAGCCAGGCCCCTGCCCTGCTAGGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	131976	ACCTGCCCCAGCCCACCCTCAGCAAAAGCCAGGCCCCTGCCCTGCTAGGC	132025

AL672200.10	1251	ATCCAGGGCCTCTGTCCTCACCATGTTGTTGGGCTTGGCCTTCCAAGAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132026	ATCCAGGGCCTCTGTCCTCACCATGTTGTTGGGCTTGGCCTTCCAAGAAC	132075

AL672200.10	1301	AGGCCGCTTGGGTCCCCTAGGCCAGGGGGAACCTGGCCAGGGTTCAGCGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132076	AGGCCGCTTGGGTCCCCTAGGCCAGGGGGAACCTGGCCAGGGTTCAGCGT	132125

AL672200.10	1351	GGACTCCTCCCTAAAAAGACAACACTATGCTGTAGAGGGATTCCCAGGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132126	GGACTCCTCCCTAAAAAGACAACACTATGCTGTAGAGGGATTCCCAGGTC	132175

AL672200.10	1401	CTACTTTGTGTCCCTTACTGCTGTTAATCTAGGCTGCGACCTGTGCTGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132176	CTACTTTGTGTCCCTTACTGCTGTTAATCTAGGCTGCGACCTGTGCTGGC	132225

AL672200.10	1451	CCCCATCTGAGATGCTCAGCTCCTAGCAGCTGGCTGGTCTTGGTTCTAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132226	CCCCATCTGAGATGCTCAGCTCCTAGCAGCTGGCTGGTCTTGGTTCTAGC	132275

AL672200.10	1501	GTTCACAGTCTTTCCCCCATTCCCAATTCTCCCGTTTCCCGGACTCACCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132276	GTTCACAGTCTTTCCCCCATTCCCAATTCTCCCGTTTCCCGGACTCACCT	132325

AL672200.10	1551	CAGCAAGAAGGGGATGTAGCTGGGCTGACTCTTGCCGGAGCGGCTGGCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132326	CAGCAAGAAGGGGATGTAGCTGGGCTGACTCTTGCCGGAGCGGCTGGCAC	132375

AL672200.10	1601	TGTGCAACGAGCCAGCCGAATCTCCGTAAGGCTGGTACAGCCTCCCGTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132376	TGTGCAACGAGCCAGCCGAATCTCCGTAAGGCTGGTACAGCCTCCCGTCT	132425

AL672200.10	1651	GCGTAGGGGCTGGGGCAGTTATAGGACTAGGCCGGAGACAGACATGTCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132426	GCGTAGGGGCTGGGGCAGTTATAGGACTAGGCCGGAGACAGACATGTCAG	132475

AL672200.10	1701	TGAGTGAGTGAGCAGGAGGGAGTGGCCCCAGGCTAAAAAGTAAAGGGTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132476	TGAGTGAGTGAGCAGGAGGGAGTGGCCCCAGGCTAAAAAGTAAAGGGTCC	132525

AL672200.10	1751	CAGGAACTTACCCCAAACCCTACCTCCCACATGCCCAGGGATTAAAGTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132526	CAGGAACTTACCCCAAACCCTACCTCCCACATGCCCAGGGATTAAAGTGG	132575

AL672200.10	1801	AAAGGCCCCTTCTGTGTTGCCTTCATCATAGGGCCTAGCAGTGGGCACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132576	AAAGGCCCCTTCTGTGTTGCCTTCATCATAGGGCCTAGCAGTGGGCACAG	132625

AL672200.10	1851	CTACACCATAGCTGTGTAGCACTGAACACTCCAAATGCCCTGGACTTGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132626	CTACACCATAGCTGTGTAGCACTGAACACTCCAAATGCCCTGGACTTGTA	132675

AL672200.10	1901	GAAGGGCTTTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAATGGCATTTGGAATTGTCTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132676	GAAGGGCTTTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAATGGCATTTGGAATTGTCTC	132725

AL672200.10	1951	CTGAGAATATTCTAGGAGACAGGAAATTTATCAAAATTCATGAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671899.11	132726	CTGAGAATATTCTAGGAGACAGGAAATTTATCAAAATTCATGAGGAATTC	132775

Overview

Query
AL672200.10 - 89129 bps
Hit
AL671899.11 - 132775 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link