<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645933.8	1	GAATTCAGTTTCAGGCAGTTGTGGGATTGTAGTCCTTGTTCCTGGGCAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118198	GAATTCAGTTTCAGGCAGTTGTGGGATTGTAGTCCTTGTTCCTGGGCAGC	118247

AL645933.8	51	TGTCAGGTGGAGGTGGGGTGGAGCTGTTCTCAATTCCTGGAGCCCGTCAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118248	TGTCAGGTGGAGGTGGGGTGGAGCTGTTCTCAATTCCTGGAGCCCGTCAT	118297

AL645933.8	101	ATCCTTTGCCACATGGCCCCTTCATTTTCAAAGCTCACAGCGGAGGAAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118298	ATCCTTTGCCACATGGCCCCTTCATTTTCAAAGCTCACAGCGGAGGAAGC	118347

AL645933.8	151	CCCTCACGTTGAATTTCGCTCACACTGTGAATCTCTTTGCTGAAGAAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118348	CCCTCACGTTGAATTTCGCTCACACTGTGAATCTCTTTGCTGAAGAAGAA	118397

AL645933.8	201	ATAAGTTGTTTTAAGAGCTCACCTGATTAGGACAGTCCAAGGCAGGATAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118398	ATAAGTTGTTTTAAGAGCTCACCTGATTAGGACAGTCCAAGGCAGGATAA	118447

AL645933.8	251	TCATGGTCTTAAAGTCAACTGATTTGGGACCTTGCTTATATCTGCAGAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118448	TCATGGTCTTAAAGTCAACTGATTTGGGACCTTGCTTATATCTGCAGAAT	118497

AL645933.8	301	CCCTTCACAGCGGCACCTACAGTAGTGTTGATTGAGTAACTGGGGAAGGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118498	CCCTTCACAGCGGCACCTACAGTAGTGTTGATTGAGTAACTGGGGAAGGT	118547

AL645933.8	351	GAATCACCAGGGGTGGTTATGTGGGGGCCATCACTGAATCATCCTCGCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118548	GAATCACCAGGGGTGGTTATGTGGGGGCCATCACTGAATCATCCTCGCAT	118597

AL645933.8	401	AGCCAGGATCTTCCTTTTGTGTTTAATTGGGTCGTGGTAGGAAACTGAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118598	AGCCAGGATCTTCCTTTTGTGTTTAATTGGGTCGTGGTAGGAAACTGAAG	118647

AL645933.8	451	TTCAAATAAATAGGTTGTTGTGAATGTTAATAAAATACATCCTATTGATA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118648	TTCAAATAAATAGGTTGTTGTGAATGTTAATAAAATACATCCTATTGATA	118697

AL645933.8	501	CATGGAAATACTGAAATCTTAAAACCAAATAACACTGAATATCTTTTAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118698	CATGGAAATACTGAAATCTTAAAACCAAATAACACTGAATATCTTTTAGT	118747

AL645933.8	551	TAATTTAGAATAAATAAAAATTAAAGTGTAGTAATTCATTCTCTCTTTTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118748	TAATTTAGAATAAATAAAAATTAAAGTGTAGTAATTCATTCTCTCTTTTG	118797

AL645933.8	601	AAGCGCTATTGTCTATTGTTGTATAATAAATAACATGAAGTTTGACAACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118798	AAGCGCTATTGTCTATTGTTGTATAATAAATAACATGAAGTTTGACAACC	118847

AL645933.8	651	CAAAACAACAAATACTTATCATCTCCCACAGTTTCCAGTGGTCAGGAATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118848	CAAAACAACAAATACTTATCATCTCCCACAGTTTCCAGTGGTCAGGAATC	118897

AL645933.8	701	TGGGAGAGATTTCCTTGAGTGCTTCTGGCTCAGGGCCTCTCACAAGGTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118898	TGGGAGAGATTTCCTTGAGTGCTTCTGGCTCAGGGCCTCTCACAAGGTTT	118947

AL645933.8	751	ATTGGGGGACACACCTGTCAGAGAATATGGGGAGGGAGCCAGAGAACCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118948	ATTGGGGGACACACCTGTCAGAGAATATGGGGAGGGAGCCAGAGAACCCT	118997

AL645933.8	801	GGGAAAAGTGGCACATCCAGAGGCAAGGCCGACTCCAGTCCTGGACAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	118998	GGGAAAAGTGGCACATCCAGAGGCAAGGCCGACTCCAGTCCTGGACAAAA	119047

AL645933.8	851	GGAAAGAAGGGTTGTTGGACGCATCCTAGACCACAGGCAATCTGAGGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119048	GGAAAGAAGGGTTGTTGGACGCATCCTAGACCACAGGCAATCTGAGGAGA	119097

AL645933.8	901	GTTGAGCAAGGCCATGGAGGAGTCCTCCAGCCACAGATGGCCAACAGAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119098	GTTGAGCAAGGCCATGGAGGAGTCCTCCAGCCACAGATGGCCAACAGAGG	119147

AL645933.8	951	AGTCTCCTGTTGCCCAGGAATGGTCTGTCTTAGTGTCCCTGCTGTTACGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119148	AGTCTCCTGTTGCCCAGGAATGGTCTGTCTTAGTGTCCCTGCTGTTACGT	119197

AL645933.8	1001	GTCAGTGGCTGGGAACAGCCCATGGGAAGCAGGGCCTCTGCACCAATGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119198	GTCAGTGGCTGGGAACAGCCCATGGGAAGCAGGGCCTCTGCACCAATGCT	119247

AL645933.8	1051	GCTGAGAATGACAGAGCACGGGAGGGAGGCCTTGGGAAATTTCCTGGAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119248	GCTGAGAATGACAGAGCACGGGAGGGAGGCCTTGGGAAATTTCCTGGAAA	119297

AL645933.8	1101	TGCGGCTCCAATCTTCCTCCTGAGGGGTCTGGGCCTTTGGAAATCAAACG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119298	TGCGGCTCCAATCTTCCTCCTGAGGGGTCTGGGCCTTTGGAAATCAAACG	119347

AL645933.8	1151	CTGTCAGACTGGGTTGCTGGACGATTCTGTTCACATTTACAATGGGACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119348	CTGTCAGACTGGGTTGCTGGACGATTCTGTTCACATTTACAATGGGACAA	119397

AL645933.8	1201	GGGAAACAAGGAGGCCCCCAAGTGAATCTCTGGGTTCCACACAAACTCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119398	GGGAAACAAGGAGGCCCCCAAGTGAATCTCTGGGTTCCACACAAACTCCT	119447

AL645933.8	1251	CCTGCCCTTACTGTGTATCAGCAGCCCTGCCTCGTCCTGGGGATGAGGGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119448	CCTGCCCTTACTGTGTATCAGCAGCCCTGCCTCGTCCTGGGGATGAGGGT	119497

AL645933.8	1301	CCATCACTCCTGCCTGGAGAGGAGGGGAGTGCTCTTCTTCCCTGCTTGTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119498	CCATCACTCCTGCCTGGAGAGGAGGGGAGTGCTCTTCTTCCCTGCTTGTC	119547

AL645933.8	1351	TCTAGGCCCATACAGTCCTGTGGGCAACTGTAATGTGTAGCTCAATGGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119548	TCTAGGCCCATACAGTCCTGTGGGCAACTGTAATGTGTAGCTCAATGGGC	119597

AL645933.8	1401	TCTTGTTTGTCCCCTTGTCTGAGTGCCTCCCTGTGGAAAACCAGGACCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119598	TCTTGTTTGTCCCCTTGTCTGAGTGCCTCCCTGTGGAAAACCAGGACCTC	119647

AL645933.8	1451	CTATACTACAAAGCCCAGATTTGGGATATGAGAAGTCCAAGTTCCACAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119648	CTATACTACAAAGCCCAGATTTGGGATATGAGAAGTCCAAGTTCCACAGT	119697

AL645933.8	1501	GGGTGAATATAAGGGATGGGACATGCAGCCACACTCTCTTCCATCCCTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119698	GGGTGAATATAAGGGATGGGACATGCAGCCACACTCTCTTCCATCCCTTG	119747

AL645933.8	1551	GTTTCTGGACCCAAGTTTCTTCCTACTGAGAATACAGCACCGTAGTGATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119748	GTTTCTGGACCCAAGTTTCTTCCTACTGAGAATACAGCACCGTAGTGATG	119797

AL645933.8	1601	TCTCTGATTCAATAAATGCACCGTGCCCTGAAAGATGGCACCCATTCCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119798	TCTCTGATTCAATAAATGCACCGTGCCCTGAAAGATGGCACCCATTCCTC	119847

AL645933.8	1651	AGTGTTTCCTCCAAGCTGGTTCTGAGTTGTGCCTGTTGAAGGCCTGTCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119848	AGTGTTTCCTCCAAGCTGGTTCTGAGTTGTGCCTGTTGAAGGCCTGTCCA	119897

AL645933.8	1701	ATGTTCTGTGTGGCCGGCAGCCCCCGCAGGGTGCAGATGGTGATAGGATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119898	ATGTTCTGTGTGGCCGGCAGCCCCCGCAGGGTGCAGATGGTGATAGGATC	119947

AL645933.8	1751	AGTGGATCCCCTGGTCATGGTCCATGCTGCACCCACTTCCATTTCCCTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119948	AGTGGATCCCCTGGTCATGGTCCATGCTGCACCCACTTCCATTTCCCTGT	119997

AL645933.8	1801	GAGGTGGGTCCCCCAGGAAGAGGCTGTGCTGAGAGTAATTCCAAACCTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	119998	GAGGTGGGTCCCCCAGGAAGAGGCTGTGCTGAGAGTAATTCCAAACCTGT	120047

AL645933.8	1851	GGATCAGGAATGTCAGTGGTGCTGGCTGAGAGTCTGAGAATAGTGGGGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	120048	GGATCAGGAATGTCAGTGGTGCTGGCTGAGAGTCTGAGAATAGTGGGGGA	120097

AL645933.8	1901	AAAAGCCTACCCATGGAGGAAGTTTCTGTCCCAGTGAGGATGAATCTCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	120098	AAAAGCCTACCCATGGAGGAAGTTTCTGTCCCAGTGAGGATGAATCTCTG	120147

AL645933.8	1951	GCCCTTCCATGATGAGGCTTAATGTGGTCAATGTGTCATTTAGTGGCACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671883.3	120148	GCCCTTCCATGATGAGGCTTAATGTGGTCAATGTGTCATTTAGTGGCACT	120197

Overview

Query
AL645933.8 - 111328 bps
Hit
AL671883.3 - 120197 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link