<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL901607.1	1	ACATACTCCGTGGGTTGCGTCTACCCAGGGCCTGGATAGCTCAGTTGGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	174996	ACATACTCCGTGGGTTGCGTCTACCCAGGGCCTGGATAGCTCAGTTGGTA	175045

AL901607.1	51	GAACATCAGACTTTTAATCTGACGATGCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175046	GAACATCAGACTTTTAATCTGACGATGCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGG	175095

AL901607.1	101	CGAAATATTTGTCTGTTTTACTCTAGCTCCGGAGTCCCCAACCTCCAGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175096	CGAAATATTTGTCTGTTTTACTCTAGCTCCGGAGTCCCCAACCTCCAGTA	175145

AL901607.1	151	AACGTAACCGCGTATCAGGCAGCGCGGCAGGCGAGCCAGAGAAGTTTCAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175146	AACGTAACCGCGTATCAGGCAGCGCGGCAGGCGAGCCAGAGAAGTTTCAT	175195

AL901607.1	201	CTGTCCTTATACAGCAACTCCCCAACGCTCCTGCGACCGCCTGAGCTACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175196	CTGTCCTTATACAGCAACTCCCCAACGCTCCTGCGACCGCCTGAGCTACT	175245

AL901607.1	251	CTTCCTCCCAGATAAGCGGGGGCGTCAGATTCTCACAGAAGTCCAAACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175246	CTTCCTCCCAGATAAGCGGGGGCGTCAGATTCTCACAGAAGTCCAAACCC	175295

AL901607.1	301	TATTGTGAACTGCGTATGAAAGGGATCTAGATTGTGGGCTCCTTATGAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175296	TATTGTGAACTGCGTATGAAAGGGATCTAGATTGTGGGCTCCTTATGAGA	175345

AL901607.1	351	ATCTAATGCTTGATAATCCGTCACTGTTTTCCATCAGTGCCAGATGGGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175346	ATCTAATGCTTGATAATCCGTCACTGTTTTCCATCAGTGCCAGATGGGAC	175395

AL901607.1	401	TGTCTAGTTGCAGGAAAACAAACTCAAGGCTTCCAGTGATTCTACATTAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175396	TGTCTAGTTGCAGGAAAACAAACTCAAGGCTTCCAGTGATTCTACATTAT	175445

AL901607.1	451	GGTGAGTTGGATACTTATTTCATTATATATTACAATATAATAACAATATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175446	GGTGAGTTGGATACTTATTTCATTATATATTACAATATAATAACAATATT	175495

AL901607.1	501	AAAAAAGTGCACAATAAATCTAATGTGCTTGAATCATCCCAAAATCATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175496	AAAAAAGTGCACAATAAATCTAATGTGCTTGAATCATCCCAAAATCATCC	175545

AL901607.1	551	CCCCCAACCCCTGCTCCCTCATCCATGGAAAAAACTGTCTTTCATGAAAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175546	CCCCCAACCCCTGCTCCCTCATCCATGGAAAAAACTGTCTTTCATGAAAC	175595

AL901607.1	601	GGTCTCTGGTGCCAAAAAGGTGGGGAACTGCCGCCCAAGATAGTTTATAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175596	GGTCTCTGGTGCCAAAAAGGTGGGGAACTGCCGCCCAAGATAGTTTATAC	175645

AL901607.1	651	CAATTAAGCACAGGAAGAAGTTCAGATACTTGTTTGTACAGTGACTAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175646	CAATTAAGCACAGGAAGAAGTTCAGATACTTGTTTGTACAGTGACTAAAA	175695

AL901607.1	701	CTTTGCTACTTTATGCTTTACAAATGTGGAATGATTTACATCATGAAATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175696	CTTTGCTACTTTATGCTTTACAAATGTGGAATGATTTACATCATGAAATT	175745

AL901607.1	751	ACCAGCCCTAAGGGATTGCCTTAGTGAAGTTGTTTTCCAAACACCAGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175746	ACCAGCCCTAAGGGATTGCCTTAGTGAAGTTGTTTTCCAAACACCAGAAT	175795

AL901607.1	801	ACAGAAATCTAAACTATTTTAGAGACTGTTGACCTGGAGATTTGCATTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175796	ACAGAAATCTAAACTATTTTAGAGACTGTTGACCTGGAGATTTGCATTTT	175845

AL901607.1	851	TACGTATTTTTTAGAGAATCTCCTTCAACGGTTAACTGAAAACAAAATCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175846	TACGTATTTTTTAGAGAATCTCCTTCAACGGTTAACTGAAAACAAAATCA	175895

AL901607.1	901	ATCAAAATTTCTAAACTCTAAAAACAGAGAAAGAGATATTGAAAGCAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175896	ATCAAAATTTCTAAACTCTAAAAACAGAGAAAGAGATATTGAAAGCAAGA	175945

AL901607.1	951	AAAGAGACAAAACACCTTACCTACAGAGAAAACCAATTTGCATAACAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175946	AAAGAGACAAAACACCTTACCTACAGAGAAAACCAATTTGCATAACAGTG	175995

AL901607.1	1001	GGTATCTTATCAGAAATCACAGAAGTCAGAAAGAGTGGCACAACAGTTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	175996	GGTATCTTATCAGAAATCACAGAAGTCAGAAAGAGTGGCACAACAGTTTT	176045

AL901607.1	1051	CAAGGACCGAAAGAAAAGAATTGTTAATTCTGAATTCTATATCCACAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176046	CAAGGACCGAAAGAAAAGAATTGTTAATTCTGAATTCTATATCCACAGAA	176095

AL901607.1	1101	AATATCCTTTAGAACTGAAGAAGAAATCAAGACATTTTCAGAGCAAAGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176096	AATATCCTTTAGAACTGAAGAAGAAATCAAGACATTTTCAGAGCAAAGAA	176145

AL901607.1	1151	AACTAAGATAATTAGCTTCTAGCAGAATTATCCTTTAAAAAATAGTTAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176146	AACTAAGATAATTAGCTTCTAGCAGAATTATCCTTTAAAAAATAGTTAAA	176195

AL901607.1	1201	TTTCTCCAGATGGAAAGAAATGATAAAAGAAGAAATAATTGACACCAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176196	TTTCTCCAGATGGAAAGAAATGATAAAAGAAGAAATAATTGACACCAGGA	176245

AL901607.1	1251	AAGAAGAAAGAACATGGTAAGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176246	AAGAAGAAAGAACATGGTAAGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA	176295

AL901607.1	1301	GGTAAAAACAATACATTTTCCTTTTCCTCTTGAGCTTTCTAAATTATGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176296	GGTAAAAACAATACATTTTCCTTTTCCTCTTGAGCTTTCTAAATTATGTT	176345

AL901607.1	1351	TAACAGTTGAAGCAAAAAGTGTAACATGTCCGGGCACGGTGGCTCAGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176346	TAACAGTTGAAGCAAAAAGTGTAACATGTCCGGGCACGGTGGCTCAGGCA	176395

AL901607.1	1401	TGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGATGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176396	TGTAATCCTACCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCATGAGATGAGG	176445

AL901607.1	1451	AGATCAAGACCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176446	AGATCAAGACCAGCCTGACTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA	176495

AL901607.1	1501	TACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176496	TACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACT	176545

AL901607.1	1551	CGAGAGGCTGAGGAGGGAGAATCACTTGAACCAGGGAAACGGAGGTTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176546	CGAGAGGCTGAGGAGGGAGAATCACTTGAACCAGGGAAACGGAGGTTGCA	176595

AL901607.1	1601	GCGAGCCAAGATCACGCCACTACACTCAGGCCTGGGCAACAGAGTGAGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176596	GCGAGCCAAGATCACGCCACTACACTCAGGCCTGGGCAACAGAGTGAGAC	176645

AL901607.1	1651	AATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176646	AATGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAGTA	176695

AL901607.1	1701	TAACATCGTTCGATGTGGTTCGAAATGTATGTAGAAGAAATAATTTAAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176696	TAACATCGTTCGATGTGGTTCGAAATGTATGTAGAAGAAATAATTTAAGA	176745

AL901607.1	1751	CAATTATATTACAAGTAGGAGAGGCAAAGTGACAAAAAGGTAAAGATGAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176746	CAATTATATTACAAGTAGGAGAGGCAAAGTGACAAAAAGGTAAAGATGAC	176795

AL901607.1	1801	ACACATCACTTTAACTGATAAAATAATGATACCAGTACACAGTGATAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176796	ACACATCACTTTAACTGATAAAATAATGATACCAGTACACAGTGATAAAT	176845

AL901607.1	1851	TAAATAAATATGTAATACTCAGACAAATCACTAAAAGAGTTATATAAAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176846	TAAATAAATATGTAATACTCAGACAAATCACTAAAAGAGTTATATAAAGA	176895

AL901607.1	1901	GATCATTTAAAAACACTACAGATAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176896	GATCATTTAAAAACACTACAGATAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGT	176945

AL901607.1	1951	AATGCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGATCACCTGTGGTCAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671879.2	176946	AATGCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGATCACCTGTGGTCAGGAATTC	176995

Overview

Query
AL901607.1 - 58752 bps
Hit
AL671879.2 - 176995 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link