<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671854.14	1	GAATTCTACGCCCCAGACTCTCCTCTACCTGAGGAATGTCATGGAGCCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144016	GAATTCTACGCCCCAGACTCTCCTCTACCTGAGGAATGTCATGGAGCCTC	144065

AL671854.14	51	AATTACTTTATAGGATCAATTTCCCTTCTCCTGACAAAAGGTGTTTAGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144066	AATTACTTTATAGGATCAATTTCCCTTCTCCTGACAAAAGGTGTTTAGCC	144115

AL671854.14	101	AGCATCTGAGATTCCTGAAATGCTTCCCCACGCTAAAGAGGCATTCCAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144116	AGCATCTGAGATTCCTGAAATGCTTCCCCACGCTAAAGAGGCATTCCAGG	144165

AL671854.14	151	TCCCCTAAGCCCCCAGTGACCTTTGCCCATCCTGGATGTCCCTACTATCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144166	TCCCCTAAGCCCCCAGTGACCTTTGCCCATCCTGGATGTCCCTACTATCA	144215

AL671854.14	201	GTCCCCAAAAACTTCATAAGCCTTGAATCACCCTAAGTAAAGTTGATCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144216	GTCCCCAAAAACTTCATAAGCCTTGAATCACCCTAAGTAAAGTTGATCTG	144265

AL671854.14	251	CCTACCGTCGAGGGGTCCCGGTGTGGTCGTTTACCATCTGTATTCACAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144266	CCTACCGTCGAGGGGTCCCGGTGTGGTCGTTTACCATCTGTATTCACAGG	144315

AL671854.14	301	GCTTCCGGACCCTCTGTTCAGCTTTTCCACTCCCTCTCCCTTGTGGTCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144316	GCTTCCGGACCCTCTGTTCAGCTTTTCCACTCCCTCTCCCTTGTGGTCCC	144365

AL671854.14	351	AAATGGCCAATGATCCACAAGGGTAGGGAGTCCCACAAAGGTGGTTCGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144366	AAATGGCCAATGATCCACAAGGGTAGGGAGTCCCACAAAGGTGGTTCGCT	144415

AL671854.14	401	CCTGTGTGTTTTGAGACAGGGTCTTATTATGCAGCCACAGGCTGGCCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144416	CCTGTGTGTTTTGAGACAGGGTCTTATTATGCAGCCACAGGCTGGCCTCA	144465

AL671854.14	451	AACTTCAGAGCACCCTGCCTCTTCCCCCACTCCCGGTGTTGGGATTGTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144466	AACTTCAGAGCACCCTGCCTCTTCCCCCACTCCCGGTGTTGGGATTGTTG	144515

AL671854.14	501	GGACGGCAGGTATGCAGGGCCATCATTGTTTTAGATCAAGCAACAAAAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144516	GGACGGCAGGTATGCAGGGCCATCATTGTTTTAGATCAAGCAACAAAAGG	144565

AL671854.14	551	CTTGGGTTAGAACTTCCAAGACAACTCACCTGGTAAACCCTATAGCATCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144566	CTTGGGTTAGAACTTCCAAGACAACTCACCTGGTAAACCCTATAGCATCA	144615

AL671854.14	601	TTGAATATGGAGAGCTGTTCTTTTCTGCATAACAGAAAAGTTGGTACAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144616	TTGAATATGGAGAGCTGTTCTTTTCTGCATAACAGAAAAGTTGGTACAAC	144665

AL671854.14	651	TCCAAAGCCAAAATTATCTTGAGTTACTCTAGCCTTATTAGTACTCAGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144666	TCCAAAGCCAAAATTATCTTGAGTTACTCTAGCCTTATTAGTACTCAGCC	144715

AL671854.14	701	TGTTGTTGCTTACCTCTGTGTATGGTGTAATATTCCTATTATGGGAACTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144716	TGTTGTTGCTTACCTCTGTGTATGGTGTAATATTCCTATTATGGGAACTC	144765

AL671854.14	751	CAAACTGCTTAATGAAATAAACTTTAAGGACAAACCAATTCTAGTAACGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144766	CAAACTGCTTAATGAAATAAACTTTAAGGACAAACCAATTCTAGTAACGC	144815

AL671854.14	801	CTGTCTGTTATGGCTTGGATGAGAAACGTCTCCCAACGTGCGTAAGCACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144816	CTGTCTGTTATGGCTTGGATGAGAAACGTCTCCCAACGTGCGTAAGCACT	144865

AL671854.14	851	TGGTTCTGGTTTGCGAAGGTGAAGTATTGTAGAGGAAGCACATCACCAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144866	TGGTTCTGGTTTGCGAAGGTGAAGTATTGTAGAGGAAGCACATCACCAGG	144915

AL671854.14	901	GATGAGTTTTATGGCTTTGTTTTTTATTTGTTTGTTTTGTTTAGGTTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144916	GATGAGTTTTATGGCTTTGTTTTTTATTTGTTTGTTTTGTTTAGGTTTTT	144965

AL671854.14	951	AAGACTTTTATTTTTGTTTGTTTTGATTTTTTGAGATAGGGTTTCTCTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	144966	AAGACTTTTATTTTTGTTTGTTTTGATTTTTTGAGATAGGGTTTCTCTGT	145015

AL671854.14	1001	ATAGCCCTGACTATCCTGGAACTCACTCTAGAGACCAGGCTGTCCTCAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145016	ATAGCCCTGACTATCCTGGAACTCACTCTAGAGACCAGGCTGTCCTCAAG	145065

AL671854.14	1051	TTCATAAGAGATGCATGTGCCTCTGCCTCCAGAGTGATGGAATTAAAGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145066	TTCATAAGAGATGCATGTGCCTCTGCCTCCAGAGTGATGGAATTAAAGTC	145115

AL671854.14	1101	ATGTACCACCACTGCCCAACAGCTTTGAGGTTTTATAACCCAGCCCTACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145116	ATGTACCACCACTGCCCAACAGCTTTGAGGTTTTATAACCCAGCCCTACC	145165

AL671854.14	1151	TCCTGTGTTGTAGTTCCCCCCACCCCCATTGTCTCCCACCACCCTAATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145166	TCCTGTGTTGTAGTTCCCCCCACCCCCATTGTCTCCCACCACCCTAATTC	145215

AL671854.14	1201	CAGACTGCCTTTCAGGGCATATTGGTTCTACCCACTCAAGAATTGTAAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145216	CAGACTGCCTTTCAGGGCATATTGGTTCTACCCACTCAAGAATTGTAAGT	145265

AL671854.14	1251	AAAAAATAAAAGCTTTCTTCCTAAAGCTACTCCGATCGGGGTGTTTTATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145266	AAAAAATAAAAGCTTTCTTCCTAAAGCTACTCCGATCGGGGTGTTTTATC	145315

AL671854.14	1301	ACAGCAATAAAAAAGTGAAGCATCCTCTTGGCCCACTGATGCTCTCCCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145316	ACAGCAATAAAAAAGTGAAGCATCCTCTTGGCCCACTGATGCTCTCCCCA	145365

AL671854.14	1351	TCCCCTCCGCTAACCTACACAGGTTAACCTCACCTTAAACCCCAACATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145366	TCCCCTCCGCTAACCTACACAGGTTAACCTCACCTTAAACCCCAACATGT	145415

AL671854.14	1401	GGGAAGAGAGGCAAACAGAACTCTGTGGGTTCCAGACCAGCCAGGGCCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145416	GGGAAGAGAGGCAAACAGAACTCTGTGGGTTCCAGACCAGCCAGGGCCAC	145465

AL671854.14	1451	ACGGTGAGGATGCTCCTCAGAAACAAAAGCAAAGTGATCACGTTGTCATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145466	ACGGTGAGGATGCTCCTCAGAAACAAAAGCAAAGTGATCACGTTGTCATT	145515

AL671854.14	1501	AACACTTCTATTTACCTCATCCCTCCTTCTTAACAAATTCAATCCAAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145516	AACACTTCTATTTACCTCATCCCTCCTTCTTAACAAATTCAATCCAAAAA	145565

AL671854.14	1551	TAATATCAAAGCTTGTCATAGAATCCCTGATCTACACTTGTGGTTCTTCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145566	TAATATCAAAGCTTGTCATAGAATCCCTGATCTACACTTGTGGTTCTTCC	145615

AL671854.14	1601	TGGAATTACTTTTTGAGTCTTCCACCTGTGAGCCCTGCTCTATTCTGCTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145616	TGGAATTACTTTTTGAGTCTTCCACCTGTGAGCCCTGCTCTATTCTGCTT	145665

AL671854.14	1651	GCTGATTCGATTTACCCAGGTTGCCATTCAGCATTTATATGGACAATATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145666	GCTGATTCGATTTACCCAGGTTGCCATTCAGCATTTATATGGACAATATT	145715

AL671854.14	1701	TCCCCACTTCATAAATCCTGGTACCAACCTCTGCCTCAAAGACCACGGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145716	TCCCCACTTCATAAATCCTGGTACCAACCTCTGCCTCAAAGACCACGGAA	145765

AL671854.14	1751	AAGAGGGGAGGTGTGGTGGCTAGATTGAAAATGGTCCCGGTAGGCTCATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145766	AAGAGGGGAGGTGTGGTGGCTAGATTGAAAATGGTCCCGGTAGGCTCATG	145815

AL671854.14	1801	TATTTGAATACTTGTCTCCTGCACTCCGTGGCAGTATCTGGGAAGGTTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145816	TATTTGAATACTTGTCTCCTGCACTCCGTGGCAGTATCTGGGAAGGTTAC	145865

AL671854.14	1851	AGTCTGGGTAGGAGGTGGAGCCTTGCTGGAAGGAATCAGTCAGTCATAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145866	AGTCTGGGTAGGAGGTGGAGCCTTGCTGGAAGGAATCAGTCAGTCATAGG	145915

AL671854.14	1901	AGCAGGTTTTGTGTTTAGAGCCTTGCCTGACTTAACAGCTACAAAAGAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145916	AGCAGGTTTTGTGTTTAGAGCCTTGCCTGACTTAACAGCTACAAAAGAAG	145965

AL671854.14	1951	CACCCCCCCCCCACGACCCTACTACACCTCAATAGTCAACTTGAGGAAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671877.15	145966	CACCCCCCCCCCACGACCCTACTACACCTCAATAGTCAACTTGAGGAAGC	146015

Overview

Query
AL671854.14 - 207265 bps
Hit
AL671877.15 - 146015 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link