<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845450.3	1	CACCCAGTGGGAGAATGGGGGAAGGCCTGGTTTTATCCACAGATGTGTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142170	CACCCAGTGGGAGAATGGGGGAAGGCCTGGTTTTATCCACAGATGTGTGC	142219

AL845450.3	51	ATGGGTGAAGGACCGTGGCTGCAGATCTTGGTCTTGGCATGAGGTGTGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142220	ATGGGTGAAGGACCGTGGCTGCAGATCTTGGTCTTGGCATGAGGTGTGGG	142269

AL845450.3	101	AGGAGCGTAGGGCTTTAAGCCAGGAGACTGGGATCGTCCTTAACGTGATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142270	AGGAGCGTAGGGCTTTAAGCCAGGAGACTGGGATCGTCCTTAACGTGATA	142319

AL845450.3	151	CTTTCTAGCTTTGTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACATTTGGAAAGTCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142320	CTTTCTAGCTTTGTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACATTTGGAAAGTCAG	142369

AL845450.3	201	TTTACATTTCTTTCTCTGTAAAATGAAGGTAATAATGTTTGCCTAGAGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142370	TTTACATTTCTTTCTCTGTAAAATGAAGGTAATAATGTTTGCCTAGAGGG	142419

AL845450.3	251	TTATTAAAATTGAATGTAGTAATATAAAAATACTAAACCCTAGATAAATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142420	TTATTAAAATTGAATGTAGTAATATAAAAATACTAAACCCTAGATAAATG	142469

AL845450.3	301	TGGTTGAAACTGATTATCTGACTAATCGTTTTCTAATGTGTATCAACATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142470	TGGTTGAAACTGATTATCTGACTAATCGTTTTCTAATGTGTATCAACATA	142519

AL845450.3	351	AATCATTTGCATTATGGTTTCTTGCCTTCTCCCCGCTACAGTAAAAATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142520	AATCATTTGCATTATGGTTTCTTGCCTTCTCCCCGCTACAGTAAAAATAA	142569

AL845450.3	401	ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAGTCCAGTGTTACCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142570	ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAGTCCAGTGTTACCC	142619

AL845450.3	451	GAACCCCAAAGGGGACTGTTGTGCCAGGTGGTGGGGGATTTGGGACCGTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142620	GAACCCCAAAGGGGACTGTTGTGCCAGGTGGTGGGGGATTTGGGACCGTA	142669

AL845450.3	501	GGAGGGGCCACCATGGGCAGATGTGGTGAGGGAGGAAAGGAGAGCAGAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142670	GGAGGGGCCACCATGGGCAGATGTGGTGAGGGAGGAAAGGAGAGCAGAAG	142719

AL845450.3	551	AGGGGACCCGATGAGCAATCCTTACACCCTACCTGCAGTGTCGAAACAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142720	AGGGGACCCGATGAGCAATCCTTACACCCTACCTGCAGTGTCGAAACAGC	142769

AL845450.3	601	GTCCCGCCCACACACTTCCGGCAGAATCTCCCGAAGTCCACACCTCTCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142770	GTCCCGCCCACACACTTCCGGCAGAATCTCCCGAAGTCCACACCTCTCAC	142819

AL845450.3	651	TCCAGCCTGGACTTTGATGCTGTGGGCACGCCTCAGAGCCAGAAGTTTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142820	TCCAGCCTGGACTTTGATGCTGTGGGCACGCCTCAGAGCCAGAAGTTTAT	142869

AL845450.3	701	GGCTCCCACCTGCTCAATCTGACAGGAAGCTTCTGCTCCCCAGTTCTCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142870	GGCTCCCACCTGCTCAATCTGACAGGAAGCTTCTGCTCCCCAGTTCTCCC	142919

AL845450.3	751	CAGCCACTGTGGTCTACAGATTCCAGGAAACCCATCCCCCTGTGACCTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142920	CAGCCACTGTGGTCTACAGATTCCAGGAAACCCATCCCCCTGTGACCTCA	142969

AL845450.3	801	TGGTGTGCTCTGTTCTCCACCCTAGGGACCAGAAGGAGCCAGGAGTAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	142970	TGGTGTGCTCTGTTCTCCACCCTAGGGACCAGAAGGAGCCAGGAGTAAAG	143019

AL845450.3	851	AACTGGCTTACTTGGCCGCCACTGGGAAATTCTGGGTAATTCGAGACGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143020	AACTGGCTTACTTGGCCGCCACTGGGAAATTCTGGGTAATTCGAGACGCC	143069

AL845450.3	901	CTGGAATTTGGACCCACTCCGCTGATAGGTGGTGGCCAGGGTTCTAGGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143070	CTGGAATTTGGACCCACTCCGCTGATAGGTGGTGGCCAGGGTTCTAGGGA	143119

AL845450.3	951	ACACAAGAGGCGGAGCCAGGTGGCTTCCCTGTGCTGGCATTCTTGCCTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143120	ACACAAGAGGCGGAGCCAGGTGGCTTCCCTGTGCTGGCATTCTTGCCTCT	143169

AL845450.3	1001	CTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCAGCCTTGCAGCCGTTTCCCTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143170	CTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCAGCCTTGCAGCCGTTTCCCTCTG	143219

AL845450.3	1051	CGATTCATGTAAGTGTGACTCGATTTCAGGGAAAGGGAACTCGCGTGGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143220	CGATTCATGTAAGTGTGACTCGATTTCAGGGAAAGGGAACTCGCGTGGGC	143269

AL845450.3	1101	TGAGGAGACCGGAGTGGACGGGCTGGGGAAGGCACCGTGATGCCCGCAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143270	TGAGGAGACCGGAGTGGACGGGCTGGGGAAGGCACCGTGATGCCCGCAAC	143319

AL845450.3	1151	CCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTACCCTCTGTGCGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143320	CCCGTCCCTGAAGGTGGTCCATGAGCTGCCTGCCTGTACCCTCTGTGCGG	143369

AL845450.3	1201	GGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACACCTTCTGCCGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143370	GGCCGCTGGAGGATGCGGTGACCATTCCCTGTGGACACACCTTCTGCCGG	143419

AL845450.3	1251	CTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCCTCGGGCAAGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143420	CTCTGCCTCCCCGCGCTCTCCCAGATGGGGGCCCAATCCTCGGGCAAGAT	143469

AL845450.3	1301	CCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGAGACTCCCATGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143470	CCTGCTCTGCCCGCTCTGCCAAGAGGAGGAGCAGGCAGAGACTCCCATGG	143519

AL845450.3	1351	CCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCGAGGAGCACGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143520	CCCCTGTGCCCCTGGGCCCGCTGGGAGAAACTTACTGCGAGGAGCACGGC	143569

AL845450.3	1401	GAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTCCTCTGTGTGTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143570	GAGAAGATCTACTTCTTCTGCGAGAACGATGCCGAGTTCCTCTGTGTGTT	143619

AL845450.3	1451	CTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGGGTTCCTGGACG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143620	CTGCAGGGAGGGTCCCACGCACCAGGCGCACACCGTGGGGTTCCTGGACG	143669

AL845450.3	1501	AGGCCATTCAGCCCTACCGGGTAAGAAGTGTAGCTTTACCTAGGGCCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143670	AGGCCATTCAGCCCTACCGGGTAAGAAGTGTAGCTTTACCTAGGGCCTGT	143719

AL845450.3	1551	TTGGGGCAGGATGATGTCCTGTTATGAGGGGAGGAAATCGGGCGGGGATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143720	TTGGGGCAGGATGATGTCCTGTTATGAGGGGAGGAAATCGGGCGGGGATC	143769

AL845450.3	1601	TGGATGAAAGGCTTCCACATCAGGGAACCCTAAGGTTACAGGGACTTTCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143770	TGGATGAAAGGCTTCCACATCAGGGAACCCTAAGGTTACAGGGACTTTCG	143819

AL845450.3	1651	AGGCATTCCCAGACTGAAGGCAGATAGGGCTCCACTTGGATGTGTGGTAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143820	AGGCATTCCCAGACTGAAGGCAGATAGGGCTCCACTTGGATGTGTGGTAG	143869

AL845450.3	1701	TTCCTGGTCTGGGGGGAACTTCAGCTCCAGCTCTCAGAGGACCCCACAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143870	TTCCTGGTCTGGGGGGAACTTCAGCTCCAGCTCTCAGAGGACCCCACAGA	143919

AL845450.3	1751	GGTGGAGTGCAAAGAACTGTAGCCTTGGCTTCACTCACTATGGAAAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143920	GGTGGAGTGCAAAGAACTGTAGCCTTGGCTTCACTCACTATGGAAAGAAA	143969

AL845450.3	1801	GCTCCAATGCCGAGTGGGATCTTCTGCAGATTATGGGCAGGGTAAACTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	143970	GCTCCAATGCCGAGTGGGATCTTCTGCAGATTATGGGCAGGGTAAACTTG	144019

AL845450.3	1851	TTCTCCCAGGATCCAGACTGGAAATGGGGTTTATAGGGCCCTGACTGCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	144020	TTCTCCCAGGATCCAGACTGGAAATGGGGTTTATAGGGCCCTGACTGCCA	144069

AL845450.3	1901	GGGCGCAGAGGGGAGGGAGGAGCTGGGAAGGGGAACCTGCTAGCACTGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	144070	GGGCGCAGAGGGGAGGGAGGAGCTGGGAAGGGGAACCTGCTAGCACTGCT	144119

AL845450.3	1951	CTTCTTCTTGAGAAAGGGAGGGTGGCAGTAGTCCAGAATTGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671859.3	144120	CTTCTTCTTGAGAAAGGGAGGGTGGCAGTAGTCCAGAATTGTGAGAATTC	144169

Overview

Query
AL845450.3 - 28904 bps
Hit
AL671859.3 - 144169 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link