<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731716.10	1	CATCCTCAAAGCTCTTTTGCTTCTTAAAATTTGATGCTTGTCACAGGAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205355	CATCCTCAAAGCTCTTTTGCTTCTTAAAATTTGATGCTTGTCACAGGAGG	205404

AL731716.10	51	AACATGCTTTGGAGACTAGGGTCTGGTAGCACTTCAGTCTTTGGACATGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205405	AACATGCTTTGGAGACTAGGGTCTGGTAGCACTTCAGTCTTTGGACATGT	205454

AL731716.10	101	AGGTGCTATACTAGAGTCATGAGGCTCAGGGTAGAGCCAGGACTGTGGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205455	AGGTGCTATACTAGAGTCATGAGGCTCAGGGTAGAGCCAGGACTGTGGCT	205504

AL731716.10	151	TGAGTGATGGCAGCCAGCATCTGTGAGTCCTGAGTGACAGCCTGGTTGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205505	TGAGTGATGGCAGCCAGCATCTGTGAGTCCTGAGTGACAGCCTGGTTGGC	205554

AL731716.10	201	ATAGGAAATAGTGATGTAGGTGGGTGGGGGCTGTCTTTGTACCTTTCCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205555	ATAGGAAATAGTGATGTAGGTGGGTGGGGGCTGTCTTTGTACCTTTCCAC	205604

AL731716.10	251	TTCATTTTGCTCATTTGGGGCATTAGAGTGTTTGAATAGACATCCCTTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205605	TTCATTTTGCTCATTTGGGGCATTAGAGTGTTTGAATAGACATCCCTTTG	205654

AL731716.10	301	GATGCTTTTAGCTGTCAAAAGTGTGTGTTATTGCCTCTGCCTTGCATTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205655	GATGCTTTTAGCTGTCAAAAGTGTGTGTTATTGCCTCTGCCTTGCATTCT	205704

AL731716.10	351	CTATACTTTACAAATTATCTACAAGAATATATTACTGTCAAAACTTGAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205705	CTATACTTTACAAATTATCTACAAGAATATATTACTGTCAAAACTTGAGG	205754

AL731716.10	401	TGCCAGGCTAAGGTTCCAATGACTCATAACAAGCAAAAGATCGAGCTAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205755	TGCCAGGCTAAGGTTCCAATGACTCATAACAAGCAAAAGATCGAGCTAAA	205804

AL731716.10	451	AGAAAAGCATTCAGCCCAAAGAAGCACCTACAGGCAGGCCCATCTGGCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205805	AGAAAAGCATTCAGCCCAAAGAAGCACCTACAGGCAGGCCCATCTGGCAC	205854

AL731716.10	501	CCAAATGACACTTATTAGTGACACACTTGACAGTGCCAGGGGCTTGGAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205855	CCAAATGACACTTATTAGTGACACACTTGACAGTGCCAGGGGCTTGGAAG	205904

AL731716.10	551	AATCATGGTCAGCAAGAAGACTCTAAACAGGACTGGACCAGGCTGAGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205905	AATCATGGTCAGCAAGAAGACTCTAAACAGGACTGGACCAGGCTGAGGTT	205954

AL731716.10	601	ATGTAAGGCTGCAAATGGCCTGTGTTTATCAGTGTTATCAATTAGGAAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	205955	ATGTAAGGCTGCAAATGGCCTGTGTTTATCAGTGTTATCAATTAGGAAGC	206004

AL731716.10	651	CAATGCATACTTGCTTGAGTATATTTGGCAATAGGCATATTTGACACTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206005	CAATGCATACTTGCTTGAGTATATTTGGCAATAGGCATATTTGACACTAG	206054

AL731716.10	701	GTGAAGATTTTTGCACCAATGATTTCATTTGACTTCACAATTTCCCCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206055	GTGAAGATTTTTGCACCAATGATTTCATTTGACTTCACAATTTCCCCAGG	206104

AL731716.10	751	ATCGGCTTAAATATCTCAAAATCATATGTTAGAAATGGGCTCAGATAAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206105	ATCGGCTTAAATATCTCAAAATCATATGTTAGAAATGGGCTCAGATAAGC	206154

AL731716.10	801	TAAGTAACTTACCCAGATCACTCAAGTATGAAATGTTGAAGTCATTCTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206155	TAAGTAACTTACCCAGATCACTCAAGTATGAAATGTTGAAGTCATTCTTC	206204

AL731716.10	851	TAGTGCCCAGTCACAAGATTCTAAAACCTGTGTTCTTTTTTTTTTTTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206205	TAGTGCCCAGTCACAAGATTCTAAAACCTGTGTTCTTTTTTTTTTTTTTT	206254

AL731716.10	901	TTTTTTTTGTTGATATAACATTCTACTTCTATGTTAGGCAAAGAGATAAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206255	TTTTTTTTGTTGATATAACATTCTACTTCTATGTTAGGCAAAGAGATAAG	206304

AL731716.10	951	GGTCTAAGAGGGCTACTGACAAGACCCGGAATTTGGAGATACTGTTTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206305	GGTCTAAGAGGGCTACTGACAAGACCCGGAATTTGGAGATACTGTTTCCA	206354

AL731716.10	1001	GATTCCTAATAGCATAAAGAGATGGTAGATAGTGCAGAATTCTATTACAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206355	GATTCCTAATAGCATAAAGAGATGGTAGATAGTGCAGAATTCTATTACAA	206404

AL731716.10	1051	ATTTCCCATCTTCAAGCAAGTGTTTTGATGAGGGATTACAAGTTGTTCTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206405	ATTTCCCATCTTCAAGCAAGTGTTTTGATGAGGGATTACAAGTTGTTCTT	206454

AL731716.10	1101	ATCCATGTCTTGAGGAATCCAGATTTCTAGCTGTAAGTCAAAGAATGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206455	ATCCATGTCTTGAGGAATCCAGATTTCTAGCTGTAAGTCAAAGAATGGGA	206504

AL731716.10	1151	TCTGAGTCACTCCTTGAGTCACTGCCAGGGCCATGGTGCCTGGCAGGCAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206505	TCTGAGTCACTCCTTGAGTCACTGCCAGGGCCATGGTGCCTGGCAGGCAG	206554

AL731716.10	1201	GAACAGTGCGTGCAGGGGCCCCTGGAGCTTGTCTGGTCATGTGAGCTGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206555	GAACAGTGCGTGCAGGGGCCCCTGGAGCTTGTCTGGTCATGTGAGCTGCC	206604

AL731716.10	1251	AGGCACGCTGTCTTTGAGACAGGGCCCTGGACTTCAGCCACTGCCATGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206605	AGGCACGCTGTCTTTGAGACAGGGCCCTGGACTTCAGCCACTGCCATGGA	206654

AL731716.10	1301	GCCCTTACTTGAGATGTTGTTAATCGTTATGGTGAGAGTACAAACACACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206655	GCCCTTACTTGAGATGTTGTTAATCGTTATGGTGAGAGTACAAACACACC	206704

AL731716.10	1351	TTTTTCCTCATTTCACAAGCTTCTAAGTGGGCATCTAGGAGTGGGGTGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206705	TTTTTCCTCATTTCACAAGCTTCTAAGTGGGCATCTAGGAGTGGGGTGCC	206754

AL731716.10	1401	TGTGGCACAACATAGGTCATGTGTGCAAGCCCTAGGATGAGGTGAAGGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206755	TGTGGCACAACATAGGTCATGTGTGCAAGCCCTAGGATGAGGTGAAGGCT	206804

AL731716.10	1451	GAGATGCAAGTGATGGGCAGCTCTATGTTAGAGTGGATGATGGGCTCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206805	GAGATGCAAGTGATGGGCAGCTCTATGTTAGAGTGGATGATGGGCTCCCA	206854

AL731716.10	1501	ATTCTAAGATAGGGGTTTTCCCATGCAGACAAAACTGGTCATGTCACACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206855	ATTCTAAGATAGGGGTTTTCCCATGCAGACAAAACTGGTCATGTCACACA	206904

AL731716.10	1551	GCATACATGCAAAAGATAGACACTGGAGCATCCAACCAAGCTTCCATTAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206905	GCATACATGCAAAAGATAGACACTGGAGCATCCAACCAAGCTTCCATTAC	206954

AL731716.10	1601	CACTTATTTCAGTAGAATGCTATTTCTTCTTATGCCAAATGTAAGGAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	206955	CACTTATTTCAGTAGAATGCTATTTCTTCTTATGCCAAATGTAAGGAAAA	207004

AL731716.10	1651	TTGTGGTGCACTTTTTATTCCTTGGGTCCAGAATCTTTGGAACTCTCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207005	TTGTGGTGCACTTTTTATTCCTTGGGTCCAGAATCTTTGGAACTCTCTCT	207054

AL731716.10	1701	TGCATTCATCATCTGGAATAACATACACTGTAATATGAAGATACTCTTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207055	TGCATTCATCATCTGGAATAACATACACTGTAATATGAAGATACTCTTAA	207104

AL731716.10	1751	ATTAGACAGCTTCCTTTCTATGAATGGGACCATCATACCAGTTTAGAGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207105	ATTAGACAGCTTCCTTTCTATGAATGGGACCATCATACCAGTTTAGAGCA	207154

AL731716.10	1801	TCAATACTTAGGTTTTGAAACTTCTCAGTAATCATTGTCTGCTCTTACAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207155	TCAATACTTAGGTTTTGAAACTTCTCAGTAATCATTGTCTGCTCTTACAA	207204

AL731716.10	1851	ATGGTGCTTTCACCTCTTGGATCAGCCATGCTGGTTGCTGCCAGGGTACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207205	ATGGTGCTTTCACCTCTTGGATCAGCCATGCTGGTTGCTGCCAGGGTACT	207254

AL731716.10	1901	CTCTCGAAAGCCCAGTTTTCACCATGCATCCCATTTTGAAGATTATCCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207255	CTCTCGAAAGCCCAGTTTTCACCATGCATCCCATTTTGAAGATTATCCAT	207304

AL731716.10	1951	TAAGATAGTCGAGGAGTCAGTGACCTTTGGATCACTTTTGACTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671857.16	207305	TAAGATAGTCGAGGAGTCAGTGACCTTTGGATCACTTTTGACTTGAATTC	207354

Overview

Query
AL731716.10 - 49105 bps
Hit
AL671857.16 - 207354 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link