<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662782.3	1	GAATTCGGGGCAAAAAGCAAGTGATCTGGATGTGCATACTAGGAGTGACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43647	GAATTCGGGGCAAAAAGCAAGTGATCTGGATGTGCATACTAGGAGTGACT	43696

AL662782.3	51	GCACCCCTACTGGCCAGGCCAAAGGCCTGGATCCCAGGCTGTCCCAGGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43697	GCACCCCTACTGGCCAGGCCAAAGGCCTGGATCCCAGGCTGTCCCAGGAG	43746

AL662782.3	101	ATCCCAGTGACTGTGGATGATGCGTTCTTGTGGTCACACTTGGCTTACTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43747	ATCCCAGTGACTGTGGATGATGCGTTCTTGTGGTCACACTTGGCTTACTT	43796

AL662782.3	151	TCCCCACGGAGCCGAGCATCAGTGGTGCTCTGAAGCACAGTGCAGGCCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43797	TCCCCACGGAGCCGAGCATCAGTGGTGCTCTGAAGCACAGTGCAGGCCAC	43846

AL662782.3	201	AAAAACTACCAGGGCTCTGAACGCTAGAAATCCCCACAGGGCTCAAAGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43847	AAAAACTACCAGGGCTCTGAACGCTAGAAATCCCCACAGGGCTCAAAGAG	43896

AL662782.3	251	GGGCAGGAGGTAGCAGCCAGCTGGGAGGTGGATGAGACAAGGCGTTAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43897	GGGCAGGAGGTAGCAGCCAGCTGGGAGGTGGATGAGACAAGGCGTTAAAT	43946

AL662782.3	301	TGCCCTGGTCTTGTGGCTGACCCACAGGGGAAAATTGAGGGTTCTTCATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43947	TGCCCTGGTCTTGTGGCTGACCCACAGGGGAAAATTGAGGGTTCTTCATA	43996

AL662782.3	351	TTTGTGCCAGAATATCTGTCTAATGTTGAATCATGAACCAAGCTCTCTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	43997	TTTGTGCCAGAATATCTGTCTAATGTTGAATCATGAACCAAGCTCTCTTG	44046

AL662782.3	401	TCTAAAATATTCCTAAGTGTCACTTGGTGCTTTGCACCAAATATAGGAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44047	TCTAAAATATTCCTAAGTGTCACTTGGTGCTTTGCACCAAATATAGGAAG	44096

AL662782.3	451	GAATCCTTTATCATCTTGTGGAATGGTTCAAACCTTGACTACACATCAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44097	GAATCCTTTATCATCTTGTGGAATGGTTCAAACCTTGACTACACATCAGA	44146

AL662782.3	501	TTTGTAGTCTTCAAACTGGTGAGTCTTCAAAACATACCTAGACCAACTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44147	TTTGTAGTCTTCAAACTGGTGAGTCTTCAAAACATACCTAGACCAACTGA	44196

AL662782.3	551	CTTAGGATCTCCAGAGGTGGCCCAGGCTCTGGTATTAAAAAACAAACTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44197	CTTAGGATCTCCAGAGGTGGCCCAGGCTCTGGTATTAAAAAACAAACTTC	44246

AL662782.3	601	CCAGGAGATTCTAAAGTCTATCCAGGACTGTGAATCACTAGAACCCCTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44247	CCAGGAGATTCTAAAGTCTATCCAGGACTGTGAATCACTAGAACCCCTTA	44296

AL662782.3	651	TTTACAGAGGAGGACAGTGAGTGCCAGAGCCTCGGACTCATTTGCCCAGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44297	TTTACAGAGGAGGACAGTGAGTGCCAGAGCCTCGGACTCATTTGCCCAGC	44346

AL662782.3	701	AGCAGAGCTGGCTGGCAGCAAGGCCAGCACTAGCACGAGGTGGGGTGAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44347	AGCAGAGCTGGCTGGCAGCAAGGCCAGCACTAGCACGAGGTGGGGTGAGG	44396

AL662782.3	751	TGCACCTCCCAGCTCTGGGCTCCTTCCATTCCACCATACACTGCACTTTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44397	TGCACCTCCCAGCTCTGGGCTCCTTCCATTCCACCATACACTGCACTTTG	44446

AL662782.3	801	GTGCCTGGAAAATGAACTCTTCCCTGCCCATATGGAGTGCTGTGGAGGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44447	GTGCCTGGAAAATGAACTCTTCCCTGCCCATATGGAGTGCTGTGGAGGGT	44496

AL662782.3	851	TAGCCTCACAGGCAGAGGAAATCATCCGCCGGAGAAAGGGTAGCGGTGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44497	TAGCCTCACAGGCAGAGGAAATCATCCGCCGGAGAAAGGGTAGCGGTGAA	44546

AL662782.3	901	TTTGAGGAGCTGACAATTGGCCACAGGTGGAGTGCAGTGAGGCGAGCAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44547	TTTGAGGAGCTGACAATTGGCCACAGGTGGAGTGCAGTGAGGCGAGCAGA	44596

AL662782.3	951	GGAAGGGTGGAGAAACAGGAGGGAACAGATTATGCAAGACTGTGACCCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44597	GGAAGGGTGGAGAAACAGGAGGGAACAGATTATGCAAGACTGTGACCCAG	44646

AL662782.3	1001	GTTAAGAATTTTGGACTTTATCCTAACAGCCCTGGGAAGCCATTGAGGGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44647	GTTAAGAATTTTGGACTTTATCCTAACAGCCCTGGGAAGCCATTGAGGGT	44696

AL662782.3	1051	TTAAGCAGCAGGATGTTGAAAGTTATTCAACAGCTAGCAGATGTTTATTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44697	TTAAGCAGCAGGATGTTGAAAGTTATTCAACAGCTAGCAGATGTTTATTA	44746

AL662782.3	1101	GGTGCCGACTATGTGTCAGGCACCGAGGTTACAGCAGAGAACAAAAGTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44747	GGTGCCGACTATGTGTCAGGCACCGAGGTTACAGCAGAGAACAAAAGTGG	44796

AL662782.3	1151	CAAACTCCCTGTCCTACCAGAACTTACATCCAGTGACCTGAGGAATCCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44797	CAAACTCCCTGTCCTACCAGAACTTACATCCAGTGACCTGAGGAATCCTT	44846

AL662782.3	1201	TAGAAGCTGAAATCAGATCCAACTGTGGGATCATCAAACCCTCAAGGGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44847	TAGAAGCTGAAATCAGATCCAACTGTGGGATCATCAAACCCTCAAGGGTT	44896

AL662782.3	1251	TCCTGATTTACATAAACCTCCTCTCCCCTTTGCTGCCCCAGTGCTGCAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44897	TCCTGATTTACATAAACCTCCTCTCCCCTTTGCTGCCCCAGTGCTGCAGC	44946

AL662782.3	1301	CACTCTGGCCTTTTGATCCTCAAACACACTCGGTCACGTGTTAAACTGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44947	CACTCTGGCCTTTTGATCCTCAAACACACTCGGTCACGTGTTAAACTGCC	44996

AL662782.3	1351	AATCTGCCCGGGTGACCAACCAGGTTAAACCCCTCAATGGCTTTCTGGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	44997	AATCTGCCCGGGTGACCAACCAGGTTAAACCCCTCAATGGCTTTCTGGTG	45046

AL662782.3	1401	CTCCAGGAATAAAGTCAAAACTCCTGTCCTTCCTTTCTTCTGTGAGGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45047	CTCCAGGAATAAAGTCAAAACTCCTGTCCTTCCTTTCTTCTGTGAGGAGG	45096

AL662782.3	1451	CTGTCCCAGGAGATCCTAGCTGGATTCCCAGATAATCATGGCCCAGCCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45097	CTGTCCCAGGAGATCCTAGCTGGATTCCCAGATAATCATGGCCCAGCCTG	45146

AL662782.3	1501	TGTCTCCAGGCTCATTTCCTGCCACTCCCCACCTCAAACTCACAGCCAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45147	TGTCTCCAGGCTCATTTCCTGCCACTCCCCACCTCAAACTCACAGCCAAA	45196

AL662782.3	1551	CCAAACCGCTCTCCATGCCTCAAAGTGCTATGCTCTTTCCTGGCTAAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45197	CCAAACCGCTCTCCATGCCTCAAAGTGCTATGCTCTTTCCTGGCTAAGCC	45246

AL662782.3	1601	CTTCGACAATGTAATTCCTTCTGCCTAGAACACCATCCCTTTCCCACTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45247	CTTCGACAATGTAATTCCTTCTGCCTAGAACACCATCCCTTTCCCACTTA	45296

AL662782.3	1651	GCAAATGCCTTTTCTAGCTTGAAGTCTCAGCTGAAAGCCACCTCCTCTGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45297	GCAAATGCCTTTTCTAGCTTGAAGTCTCAGCTGAAAGCCACCTCCTCTGG	45346

AL662782.3	1701	CAATTCTTTCCTGACCTGTCAGATTGGGTCCACATGTAGTCTAGTTATAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45347	CAATTCTTTCCTGACCTGTCAGATTGGGTCCACATGTAGTCTAGTTATAC	45396

AL662782.3	1751	AGCCCCAAAACACCCCATGCTGCACCCTGTACTTCTCTGCAGTTTTAAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45397	AGCCCCAAAACACCCCATGCTGCACCCTGTACTTCTCTGCAGTTTTAAGT	45446

AL662782.3	1801	CCTGACTTATTAGTGTAATTACTCGCTTAACACCAGCTTTTTCCATGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45447	CCTGACTTATTAGTGTAATTACTCGCTTAACACCAGCTTTTTCCATGAAA	45496

AL662782.3	1851	CAAGGAGAGAGATTGTGTCTGTCTTATCACCAGAATCTACATATTACTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45497	CAAGGAGAGAGATTGTGTCTGTCTTATCACCAGAATCTACATATTACTTG	45546

AL662782.3	1901	GCACAGAGTAGACAATAAAAACTGACTGAGAAAACAAAGCACAAGCACAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45547	GCACAGAGTAGACAATAAAAACTGACTGAGAAAACAAAGCACAAGCACAG	45596

AL662782.3	1951	AGTATCTGACACAAAGAAGATGCTTCCTACACATCTGCTGAAGGAATGCG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671855.4	45597	AGTATCTGACACAAAGAAGATGCTTCCTACACATCTGCTGAAGGAATGCG	45646

Overview

Query
AL662782.3 - 62456 bps
Hit
AL671855.4 - 45646 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link