<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645922.12	1	GAATTCTTGAACTCAAGGGATGCTGTTTGGCAGGAGGGTGGAGGCAGCGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111583	GAATTCTTGAACTCAAGGGATGCTGTTTGGCAGGAGGGTGGAGGCAGCGT	111632

AL645922.12	51	AGACAGTGTTTAGGTGGTACCTTGACTTTTTGCCTTTTTCTTTTAAATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111633	AGACAGTGTTTAGGTGGTACCTTGACTTTTTGCCTTTTTCTTTTAAATTC	111682

AL645922.12	101	TCTGATTTGTATGCCCGCACCCAGTTCCCTCTGTTGAATCTAAGAGTCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111683	TCTGATTTGTATGCCCGCACCCAGTTCCCTCTGTTGAATCTAAGAGTCTG	111732

AL645922.12	151	TTCTAAACTGCTCTCTTTGTATTTAGGCCTTGTAGATTTGAGGAAGAACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111733	TTCTAAACTGCTCTCTTTGTATTTAGGCCTTGTAGATTTGAGGAAGAACA	111782

AL645922.12	201	CCTGATTTTGTGTCAGACGCACCTAGGCTTAAAGCCACATTCCTAGGAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111783	CCTGATTTTGTGTCAGACGCACCTAGGCTTAAAGCCACATTCCTAGGAGT	111832

AL645922.12	251	TTCTGAGCCTACTCTGGCTCAGAAGGCTGCCAGATTCGCAAATCATTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111833	TTCTGAGCCTACTCTGGCTCAGAAGGCTGCCAGATTCGCAAATCATTAAA	111882

AL645922.12	301	AAAATAAAATAAAAGCCCTATTCCTGTACCAAATGAGGCCCACTGGGCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111883	AAAATAAAATAAAAGCCCTATTCCTGTACCAAATGAGGCCCACTGGGCAA	111932

AL645922.12	351	GTTACTTAATTCTCTGAATCACAGTGTCCTTATCTTTGTCTCCCCCGCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111933	GTTACTTAATTCTCTGAATCACAGTGTCCTTATCTTTGTCTCCCCCGCCC	111982

AL645922.12	401	ATCCTTAGCTCATCTGAAAGCATTTTTATCTTGAAGGCCCTGATCTCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	111983	ATCCTTAGCTCATCTGAAAGCATTTTTATCTTGAAGGCCCTGATCTCTCA	112032

AL645922.12	451	CAGGGCTAATGTGAGGTTTAAATGAGCCTGGCATGCAGTAGTTGCTGAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112033	CAGGGCTAATGTGAGGTTTAAATGAGCCTGGCATGCAGTAGTTGCTGAGT	112082

AL645922.12	501	AAACAATAGCTCTGTTCTCCTTTTCCTAATCTGGGAAACGGACTATGAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112083	AAACAATAGCTCTGTTCTCCTTTTCCTAATCTGGGAAACGGACTATGAAA	112132

AL645922.12	551	TTTTCAAAAGAATTTTATTTTATTTTAATTAATTAATTAATTTATTTAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112133	TTTTCAAAAGAATTTTATTTTATTTTAATTAATTAATTAATTTATTTAGC	112182

AL645922.12	601	TGGAGTTTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACGATCTTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112183	TGGAGTTTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACGATCTTGG	112232

AL645922.12	651	CTCACTGCAACCTCCGCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112233	CTCACTGCAACCTCCGCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAACC	112282

AL645922.12	701	TCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTAGCTAATTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112283	TCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTAGCTAATTTT	112332

AL645922.12	751	CGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112333	CGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG	112382

AL645922.12	801	AACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCTTGCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112383	AACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCTTGCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGG	112432

AL645922.12	851	ATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGACCCAAAAGAACTTTAAAAATTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112433	ATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGACCCAAAAGAACTTTAAAAATTCT	112482

AL645922.12	901	GTTTTTCTATCTCATCTCTTCTTTTCCGCATTGCCAAACTTCTCAGAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112483	GTTTTTCTATCTCATCTCTTCTTTTCCGCATTGCCAAACTTCTCAGAAGA	112532

AL645922.12	951	ATAGTTCACATTCCAGTGAGAGCAGAAATACAAAAAGCTGTCAAGTTAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112533	ATAGTTCACATTCCAGTGAGAGCAGAAATACAAAAAGCTGTCAAGTTAAG	112582

AL645922.12	1001	AATTAGAGTTTGTAAAATTTTGTTTCTTGTCCCTTTCTTGCTACTTTTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112583	AATTAGAGTTTGTAAAATTTTGTTTCTTGTCCCTTTCTTGCTACTTTTCC	112632

AL645922.12	1051	TTTCTAGGAATGTAGATGGGACAGGGGGCCTAACTCAGCCCATGGCTCAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112633	TTTCTAGGAATGTAGATGGGACAGGGGGCCTAACTCAGCCCATGGCTCAA	112682

AL645922.12	1101	GACAGGTAGTCCTTGGTGGCAGGTGGAGTTGACAGCCAATGAATCCTTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112683	GACAGGTAGTCCTTGGTGGCAGGTGGAGTTGACAGCCAATGAATCCTTCA	112732

AL645922.12	1151	AGTGTCCAGCCCACCCAGTTACAACTCTGCGTAAAAACAAGCAGAGGTGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112733	AGTGTCCAGCCCACCCAGTTACAACTCTGCGTAAAAACAAGCAGAGGTGC	112782

AL645922.12	1201	ACAAACTCTTTTCCATGTAGTCTGGTGGAGAGATGATGTGGAGCCATTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112783	ACAAACTCTTTTCCATGTAGTCTGGTGGAGAGATGATGTGGAGCCATTTC	112832

AL645922.12	1251	CCATGCATCCCATCCAGGGGGTTTACAATCATCTAGATCCTTGTCCCTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112833	CCATGCATCCCATCCAGGGGGTTTACAATCATCTAGATCCTTGTCCCTTC	112882

AL645922.12	1301	TTCCCCAACTTCTGCCAGTATAAAACCAGGGGCTTTCCTGTCCTTAGCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112883	TTCCCCAACTTCTGCCAGTATAAAACCAGGGGCTTTCCTGTCCTTAGCTT	112932

AL645922.12	1351	GCAGTACCAAATGCCTTGGTGTGGTGTCAAGAACAGATAAATTTAGGAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112933	GCAGTACCAAATGCCTTGGTGTGGTGTCAAGAACAGATAAATTTAGGAGA	112982

AL645922.12	1401	TACTTTTAGGATTTTTGGGTCAGGCTCAATGGTTCATTCCTGTAATCCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	112983	TACTTTTAGGATTTTTGGGTCAGGCTCAATGGTTCATTCCTGTAATCCCA	113032

AL645922.12	1451	GCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGGATCCCTTGAGCCCAGCAGTTTGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113033	GCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGGATCCCTTGAGCCCAGCAGTTTGAG	113082

AL645922.12	1501	ACCAGTCTGGGCAACATAGCAAGACCCCATCTCTACAAATAATAAGAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113083	ACCAGTCTGGGCAACATAGCAAGACCCCATCTCTACAAATAATAAGAAAA	113132

AL645922.12	1551	TTAGCAGGGCATGATGGTGTGTATGTGCTTGGGATCCCAGTTACATGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113133	TTAGCAGGGCATGATGGTGTGTATGTGCTTGGGATCCCAGTTACATGAGA	113182

AL645922.12	1601	GGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTAAGCCCAGGCAGTTGAGGCTGCAGTGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113183	GGCTGAGGTGGGAGGACTGCTTAAGCCCAGGCAGTTGAGGCTGCAGTGAA	113232

AL645922.12	1651	CCATGATAGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGACCCTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113233	CCATGATAGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAATGAGACCCTGT	113282

AL645922.12	1701	CTTTTAAAAAAAAAATTAGGATTCTTAGTGAGCTTTAGAAATAAAATCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113283	CTTTTAAAAAAAAAATTAGGATTCTTAGTGAGCTTTAGAAATAAAATCTG	113332

AL645922.12	1751	GGCTGGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113333	GGCTGGGCACTGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGA	113382

AL645922.12	1801	GGTGGGAGGATCACTTAAGGCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113383	GGTGGGAGGATCACTTAAGGCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAA	113432

AL645922.12	1851	AGCGAGACACCTGTCTCAAAAATAATAAAATAATAAATAAAAGTAAATAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113433	AGCGAGACACCTGTCTCAAAAATAATAAAATAATAAATAAAAGTAAATAC	113482

AL645922.12	1901	ATTTTTTAAAGGAAATAAAATTTGACTAGGGATGCAAGGAATAACTAGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113483	ATTTTTTAAAGGAAATAAAATTTGACTAGGGATGCAAGGAATAACTAGGA	113532

AL645922.12	1951	GACAAAAGGTCCAGGTTCCAGTCCATCTTGAAGTCATCAAGGCTCCCCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671762.10	113533	GACAAAAGGTCCAGGTTCCAGTCCATCTTGAAGTCATCAAGGCTCCCCAG	113582

Overview

Query
AL645922.12 - 180560 bps
Hit
AL671762.10 - 113582 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link