<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662857.3	1	GAATTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACATGATGAACTCCTGTTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	6989	GAATTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACATGATGAACTCCTGTTTC	7038

AL662857.3	51	TACTAAAAATGCAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATACCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7039	TACTAAAAATGCAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATACCT	7088

AL662857.3	101	ATAGTGTCAGCTACTCTGAAGACTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7089	ATAGTGTCAGCTACTCTGAAGACTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTGG	7138

AL662857.3	151	GAGGTGGAGGTCACAGTGAGCCAAGATTGTGCCAGTGCACTCCAGCTGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7139	GAGGTGGAGGTCACAGTGAGCCAAGATTGTGCCAGTGCACTCCAGCTGGG	7188

AL662857.3	201	GCAACAAAGCAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAAATTTTTAGAAGTGTTAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7189	GCAACAAAGCAAGACCCTGTCTCAAGAAAAAAAATTTTTAGAAGTGTTAG	7238

AL662857.3	251	TATATAACAAATACATATTTCGAATTGCTTTTAAAAGGAATAGAATTGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7239	TATATAACAAATACATATTTCGAATTGCTTTTAAAAGGAATAGAATTGTT	7288

AL662857.3	301	TGGACTTGAATTATAATAGAAAAGTAATTTTAGACAACTTATAAAAGCAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7289	TGGACTTGAATTATAATAGAAAAGTAATTTTAGACAACTTATAAAAGCAT	7338

AL662857.3	351	AAATCTCACAAACATCATTGAAGAGATATACATATGTGTGTGTGTATATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7339	AAATCTCACAAACATCATTGAAGAGATATACATATGTGTGTGTGTATATA	7388

AL662857.3	401	TATATATATATGCCTCCTCTTTTGATTTTCCTTATATCTTTTCAATTTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7389	TATATATATATGCCTCCTCTTTTGATTTTCCTTATATCTTTTCAATTTTA	7438

AL662857.3	451	ATGTTGAATCCTAAATTATCCTCAGGGTTGTAAAGTTGCTTTTATTTTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7439	ATGTTGAATCCTAAATTATCCTCAGGGTTGTAAAGTTGCTTTTATTTTCC	7488

AL662857.3	501	CTATTCCCCTTTAAATCCTAAGGTATACAATAGTGGTACTTCCTGTCATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7489	CTATTCCCCTTTAAATCCTAAGGTATACAATAGTGGTACTTCCTGTCATA	7538

AL662857.3	551	TCTTCATTTGCATTAGCAGTCAGACCCCTGAAATAAATCAGACAGATATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7539	TCTTCATTTGCATTAGCAGTCAGACCCCTGAAATAAATCAGACAGATATT	7588

AL662857.3	601	GGGATGACAGTAGCAAATTACCACAGATTGAAATAAGTAGTAGCCCCAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7589	GGGATGACAGTAGCAAATTACCACAGATTGAAATAAGTAGTAGCCCCAAT	7638

AL662857.3	651	TGAATCTGCTGGAAGAGATATGTTATCCTTGATAGAGTATATTAGCATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7639	TGAATCTGCTGGAAGAGATATGTTATCCTTGATAGAGTATATTAGCATGT	7688

AL662857.3	701	TACTGAGTACCCCGTATGCATACATTGATCTGGTAAATGTTTTCTTTTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7689	TACTGAGTACCCCGTATGCATACATTGATCTGGTAAATGTTTTCTTTTTC	7738

AL662857.3	751	ATCCTTATCAGGAAACATGATCAGGGAGTTTGCACTCACTTGGAGCTGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7739	ATCCTTATCAGGAAACATGATCAGGGAGTTTGCACTCACTTGGAGCTGAC	7788

AL662857.3	801	AATACTATACCATGTCCCAGAGCTATGCTAGGTTTTTCATCTTCCATCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7789	AATACTATACCATGTCCCAGAGCTATGCTAGGTTTTTCATCTTCCATCAT	7838

AL662857.3	851	AAAATACTGAAGAGAACGGGACTAGCTGTATATTCTGTAGGCCGTCACAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7839	AAAATACTGAAGAGAACGGGACTAGCTGTATATTCTGTAGGCCGTCACAC	7888

AL662857.3	901	TGGCCAACTATATCTAACACATCATGCGTATCAGACAATATGAACAAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7889	TGGCCAACTATATCTAACACATCATGCGTATCAGACAATATGAACAAGAA	7938

AL662857.3	951	GTGGTCAATACATTAAAAGCCTTGATAAGACACATGTGATCCAGAGAGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7939	GTGGTCAATACATTAAAAGCCTTGATAAGACACATGTGATCCAGAGAGTG	7988

AL662857.3	1001	AGTGTTGCACTCCATAAAGATTCAGGGACCTAAAGCATAAAAGTTTTAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	7989	AGTGTTGCACTCCATAAAGATTCAGGGACCTAAAGCATAAAAGTTTTAAG	8038

AL662857.3	1051	TGTTTATTGGTCTGGGGCACTATGAGACATTCTATCTAAAGTAAAGGATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8039	TGTTTATTGGTCTGGGGCACTATGAGACATTCTATCTAAAGTAAAGGATA	8088

AL662857.3	1101	CATTTTTGCATTATGCATTTCCTATCATAAAAAAGAAGCAAAGTGCCTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8089	CATTTTTGCATTATGCATTTCCTATCATAAAAAAGAAGCAAAGTGCCTGG	8138

AL662857.3	1151	CAGACCTCTCTGTACTTTGTAGTAAGCATATTTGACACTATCGAGTACTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8139	CAGACCTCTCTGTACTTTGTAGTAAGCATATTTGACACTATCGAGTACTG	8188

AL662857.3	1201	TTCTAATTCATCCACTAGGTGCTGTATTTGAATGGCCTTCAGGGTAAGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8189	TTCTAATTCATCCACTAGGTGCTGTATTTGAATGGCCTTCAGGGTAAGAA	8238

AL662857.3	1251	TGGGCTCTATAGCAAGTCTAAATTTCACCATAAATGAGGTGGAATTTATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8239	TGGGCTCTATAGCAAGTCTAAATTTCACCATAAATGAGGTGGAATTTATG	8288

AL662857.3	1301	GCAAGTTTATGGGAAGATCATAACAAAATTCTTAGGGTTTTGATAAAACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8289	GCAAGTTTATGGGAAGATCATAACAAAATTCTTAGGGTTTTGATAAAACT	8338

AL662857.3	1351	CTGCTATCTACAGCACAGGATTGTATACATTTCAAAAATAAAGCCCTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8339	CTGCTATCTACAGCACAGGATTGTATACATTTCAAAAATAAAGCCCTGGT	8388

AL662857.3	1401	GTTTTACTGAATTCTGGGTAGAGAAATAACATCTGACCATGGAACAACAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8389	GTTTTACTGAATTCTGGGTAGAGAAATAACATCTGACCATGGAACAACAA	8438

AL662857.3	1451	ATAACCATGCAGGCAAAACTACCCATATGAGCTGGGGACTGTCTGAACCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8439	ATAACCATGCAGGCAAAACTACCCATATGAGCTGGGGACTGTCTGAACCA	8488

AL662857.3	1501	TCAAGTTATTAGGTTGAGTGGATACAGAGCAATCACTGTAACACGGCATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8489	TCAAGTTATTAGGTTGAGTGGATACAGAGCAATCACTGTAACACGGCATT	8538

AL662857.3	1551	AGTACATCCAGGATTGACCACAGCATGACTAGAGGGCAGAGGCAAACAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8539	AGTACATCCAGGATTGACCACAGCATGACTAGAGGGCAGAGGCAAACAGT	8588

AL662857.3	1601	ATGAGCAAGTAGCCCAGGACTTCATGCTATTCACCACTTTTGCATCAATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8589	ATGAGCAAGTAGCCCAGGACTTCATGCTATTCACCACTTTTGCATCAATA	8638

AL662857.3	1651	TCTCTTCTTCAGACCACACTTACGCCTCCAAGAGAGAACACTTCCAACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8639	TCTCTTCTTCAGACCACACTTACGCCTCCAAGAGAGAACACTTCCAACTC	8688

AL662857.3	1701	TAATGGAGGAGAAAAATGTCAAGCTTGGTTCATTAATGGGTCAGCTTGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8689	TAATGGAGGAGAAAAATGTCAAGCTTGGTTCATTAATGGGTCAGCTTGGT	8738

AL662857.3	1751	ATGTGAGTCCAAGTCAAAAAGGATGAAGATAAATTATAGCCTCGCTTACG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8739	ATGTGAGTCCAAGTCAAAAAGGATGAAGATAAATTATAGCCTCGCTTACG	8788

AL662857.3	1801	GTGATCTTGAAAAATAGTAGTGAGGAAAACGCCTCCCAATGGACAGAGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8789	GTGATCTTGAAAAATAGTAGTGAGGAAAACGCCTCCCAATGGACAGAGTT	8838

AL662857.3	1851	TCAGATGGTACCCAGTCATTCACTTTGTGTGGAAAGAGAAGTAGTTTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8839	TCAGATGGTACCCAGTCATTCACTTTGTGTGGAAAGAGAAGTAGTTTGAA	8888

AL662857.3	1901	GTTAGAATATGTATAACTCATAGGTAGTGATAAATGGCTTAGGAGGCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8889	GTTAGAATATGTATAACTCATAGGTAGTGATAAATGGCTTAGGAGGCTTT	8938

AL662857.3	1951	TCAGGTGGCTGGAAAGAAAAAGATAGAAACACTTGGAAAAAAGAAGTCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671755.4	8939	TCAGGTGGCTGGAAAGAAAAAGATAGAAACACTTGGAAAAAAGAAGTCTG	8988

Overview

Query
AL662857.3 - 136687 bps
Hit
AL671755.4 - 8988 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link