<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662845.5	1	GAATTCATAAGGGTAGGGCCATGATTCAATAGGATTAATTCAATAGGAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	164804	GAATTCATAAGGGTAGGGCCATGATTCAATAGGATTAATTCAATAGGAAG	164853

AL662845.5	51	AGAAACCAGGGTATGCTCTCTTGCTCTTTCTCCCTCCCAGCCTTCCTCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	164854	AGAAACCAGGGTATGCTCTCTTGCTCTTTCTCCCTCCCAGCCTTCCTCTC	164903

AL662845.5	101	TCTTTCTCTCTCACTCTGCCCCCAGAAGATGGCAACTCTCTCTATAAGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	164904	TCTTTCTCTCTCACTCTGCCCCCAGAAGATGGCAACTCTCTCTATAAGCC	164953

AL662845.5	151	AGGAAGAGCCCTTACCAGAAGCTGACCATGCTGGCGCCTTGATCTCAGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	164954	AGGAAGAGCCCTTACCAGAAGCTGACCATGCTGGCGCCTTGATCTCAGAC	165003

AL662845.5	201	TTCCAACCTCCAGAACTGTGAGAGAATATATTTCTGTTGTTTAAGCCACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165004	TTCCAACCTCCAGAACTGTGAGAGAATATATTTCTGTTGTTTAAGCCACC	165053

AL662845.5	251	TAGTTTTATTTTGTTATGGCACCCCAAGCTAATACATATATCAATAATTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165054	TAGTTTTATTTTGTTATGGCACCCCAAGCTAATACATATATCAATAATTA	165103

AL662845.5	301	CATTATTCCTAATACAAAGAAATGATAAATTCTTGAGGTGGTAGATGCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165104	CATTATTCCTAATACAAAGAAATGATAAATTCTTGAGGTGGTAGATGCCC	165153

AL662845.5	351	CAATTACTCTGATTTGGTCATTGCACATTGTATGCCTGTAACTAACATCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165154	CAATTACTCTGATTTGGTCATTGCACATTGTATGCCTGTAACTAACATCA	165203

AL662845.5	401	CATGTACCTCACTAATATATACAACGGTTGTGTACCCATAATAATTAAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165204	CATGTACCTCACTAATATATACAACGGTTGTGTACCCATAATAATTAAAC	165253

AL662845.5	451	ATAAAAATTAAGAAAAAAAATTACACTAAATGCAAATGATCTAAATACCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165254	ATAAAAATTAAGAAAAAAAATTACACTAAATGCAAATGATCTAAATACCT	165303

AL662845.5	501	CAATTAAGAAACCCAGTTCAGGCCAGGCATGGTGGCTTACACCTGTAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165304	CAATTAAGAAACCCAGTTCAGGCCAGGCATGGTGGCTTACACCTGTAAAC	165353

AL662845.5	551	CCAGCACTCTACAAAAAAAAACAAACAAACAAAAAACAAAAACAAAAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165354	CCAGCACTCTACAAAAAAAAACAAACAAACAAAAAACAAAAACAAAAACA	165403

AL662845.5	601	AAAAAAAACCCAGTTCAAATATAACAATATAGGCCAGGCTCAGTGGCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165404	AAAAAAAACCCAGTTCAAATATAACAATATAGGCCAGGCTCAGTGGCTCT	165453

AL662845.5	651	CAGCACTTTGGGAGGCTAAGCCAGGTGGATAATTTGAGGTAGGTCAGGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165454	CAGCACTTTGGGAGGCTAAGCCAGGTGGATAATTTGAGGTAGGTCAGGAG	165503

AL662845.5	701	TTCGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165504	TTCGAGACCAGCCTGGCCTACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATAC	165553

AL662845.5	751	AAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165554	AAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTGGTCCCAGCTACTCAGG	165603

AL662845.5	801	AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGACCCTGGAAGACAGAGGTTGCCGTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165604	AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGACCCTGGAAGACAGAGGTTGCCGTGA	165653

AL662845.5	851	GCAGAGATTGTGCCGCTGCACTCCAGCCTAGGTGACAAGATGAGACTTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165654	GCAGAGATTGTGCCGCTGCACTCCAGCCTAGGTGACAAGATGAGACTTTG	165703

AL662845.5	901	TCTCAAAAAAAACACAAAACAAACAAAAACAACAATAAAACCACACAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165704	TCTCAAAAAAAACACAAAACAAACAAAAACAACAATAAAACCACACAAAT	165753

AL662845.5	951	ATAACAACATAGGCAGGTTAAAAGTAAAAGGATGGAAAAAGACACAACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165754	ATAACAACATAGGCAGGTTAAAAGTAAAAGGATGGAAAAAGACACAACAT	165803

AL662845.5	1001	GTTTTCCTTAATTAGAGGAATACAGGAGTGAGTGTACTACTCTCAGATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165804	GTTTTCCTTAATTAGAGGAATACAGGAGTGAGTGTACTACTCTCAGATAA	165853

AL662845.5	1051	GGTAAACTTCAGAGCCAAAACAAAAAAAATTACCAGAGAAAGATAAGGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165854	GGTAAACTTCAGAGCCAAAACAAAAAAAATTACCAGAGAAAGATAAGGAC	165903

AL662845.5	1101	GTTTTATAATAATAGAAGGGTCAGTCTATCAAGAAGACATTGCAGTCAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165904	GTTTTATAATAATAGAAGGGTCAGTCTATCAAGAAGACATTGCAGTCAGA	165953

AL662845.5	1151	AATGTTTATGCCCAAAACACCAGAGCTGTAAAATATGTGAAGCAAAAACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	165954	AATGTTTATGCCCAAAACACCAGAGCTGTAAAATATGTGAAGCAAAAACT	166003

AL662845.5	1201	GACGGAACTGAAAGAAAAAATAGAAAATCCACAATTATAATTGGAGACAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166004	GACGGAACTGAAAGAAAAAATAGAAAATCCACAATTATAATTGGAGACAT	166053

AL662845.5	1251	CAACACAACTCTCACAACTATTAATAAAACTAGAAAGAAGGCAGGGAGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166054	CAACACAACTCTCACAACTATTAATAAAACTAGAAAGAAGGCAGGGAGTG	166103

AL662845.5	1301	GTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGGGGGTGGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166104	GTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGGGGGTGGAT	166153

AL662845.5	1351	CACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166154	CACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGA	166203

AL662845.5	1401	CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166204	CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTA	166253

AL662845.5	1451	GTCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166254	GTCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGGA	166303

AL662845.5	1501	CGGAGCTTTCAGTGAGCTGAGATCCTGCCACTGCACTCCAGCAGCCTGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166304	CGGAGCTTTCAGTGAGCTGAGATCCTGCCACTGCACTCCAGCAGCCTGGG	166353

AL662845.5	1551	GGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166354	GGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAA	166403

AL662845.5	1601	CTAGAAAGAAAATCAGCAAAGATGTAGAAGAGCTCAATAACACCATCAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166404	CTAGAAAGAAAATCAGCAAAGATGTAGAAGAGCTCAATAACACCATCAAC	166453

AL662845.5	1651	CAACAGGATCAAATCCACATTTACAGGACACTCCACCCATCAATAGCAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166454	CAACAGGATCAAATCCACATTTACAGGACACTCCACCCATCAATAGCAGA	166503

AL662845.5	1701	ATACACATTGGCTCTTTTTTGTTGTTTTTCTTTTCCGGTTTTACTAGGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166504	ATACACATTGGCTCTTTTTTGTTGTTTTTCTTTTCCGGTTTTACTAGGTG	166553

AL662845.5	1751	CAAGGGGTACATATGCAGGTTTGTTACATGGGTAAATTGCGTGTCACAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166554	CAAGGGGTACATATGCAGGTTTGTTACATGGGTAAATTGCGTGTCACAAG	166603

AL662845.5	1801	GGTTTGGTGTACAGATAATTTTAAAAGAATTTAAATTATACAAACTTTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166604	GGTTTGGTGTACAGATAATTTTAAAAGAATTTAAATTATACAAACTTTTC	166653

AL662845.5	1851	TCTGACTACAATGGAATCAAATTAGAAATCAATAACGGAAAGACAGCAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166654	TCTGACTACAATGGAATCAAATTAGAAATCAATAACGGAAAGACAGCAGA	166703

AL662845.5	1901	GGAAAAATCATCAGCATAATACCCGATAGGTGCTTTTTCAATCATCACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166704	GGAAAAATCATCAGCATAATACCCGATAGGTGCTTTTTCAATCATCACTG	166753

AL662845.5	1951	TCCTCCCACCCTCCACCCTCAAATAGGCCCCAGTGTCTATTTTTCCCATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671681.4	166754	TCCTCCCACCCTCCACCCTCAAATAGGCCCCAGTGTCTATTTTTCCCATC	166803

Overview

Query
AL662845.5 - 97128 bps
Hit
AL671681.4 - 166803 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link