<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645935.7	1	ACTTTATGTGGTCACTGCTCAGCTGGGTCATCTTTGCTCCTTCATTCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103634	ACTTTATGTGGTCACTGCTCAGCTGGGTCATCTTTGCTCCTTCATTCTCC	103683

AL645935.7	51	TTGGCCCTTCAGTAGAACCTTGTCCCACCACCACCTGTGATCACAGGGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103684	TTGGCCCTTCAGTAGAACCTTGTCCCACCACCACCTGTGATCACAGGGAC	103733

AL645935.7	101	TTGGATGTCACCTACGGTGGTCCCTGCATACAAATCTCATTGTGGTATCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103734	TTGGATGTCACCTACGGTGGTCCCTGCATACAAATCTCATTGTGGTATCA	103783

AL645935.7	151	AGAGACTAATTTTCAGACCTGTCCAGCTCTTGCCCTCCTCCCAGGGCTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103784	AGAGACTAATTTTCAGACCTGTCCAGCTCTTGCCCTCCTCCCAGGGCTCT	103833

AL645935.7	201	TTCCTGGATTGTAGTTTTCATCTTGTCTCCAATCTTTTTAAAGGAAGCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103834	TTCCTGGATTGTAGTTTTCATCTTGTCTCCAATCTTTTTAAAGGAAGCAG	103883

AL645935.7	251	ATTCTGAAATTTGCAGAGAGGAGGGGTCCCATAGTTTCTCATCATAGTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103884	ATTCTGAAATTTGCAGAGAGGAGGGGTCCCATAGTTTCTCATCATAGTGA	103933

AL645935.7	301	ACTTTCTGTTGGAGCTCCTCTTCTGCTCTCCTACTCTTCTTCCTGCCCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103934	ACTTTCTGTTGGAGCTCCTCTTCTGCTCTCCTACTCTTCTTCCTGCCCTG	103983

AL645935.7	351	AGTTGTAGTAATCCTAGTGCTGGCTCCAATCCAAACTCATGGATTTACAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	103984	AGTTGTAGTAATCCTAGTGCTGGCTCCAATCCAAACTCATGGATTTACAA	104033

AL645935.7	401	AGCAGAGTCTAATTTAGATTCATACGTGGTTGGAAAATTGTACCCATAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104034	AGCAGAGTCTAATTTAGATTCATACGTGGTTGGAAAATTGTACCCATAAG	104083

AL645935.7	451	CCTAGGGTTATCTTTCCTGAAGAGAAAAATATGGTTGTGTGCTGCAGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104084	CCTAGGGTTATCTTTCCTGAAGAGAAAAATATGGTTGTGTGCTGCAGTGT	104133

AL645935.7	501	GCAGGAGGGTTGGTGTGGGAGGAGGTAGGGAGGGAGGGAGGACACACAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104134	GCAGGAGGGTTGGTGTGGGAGGAGGTAGGGAGGGAGGGAGGACACACAAG	104183

AL645935.7	551	CACTCCTGGTGAGAAAAGCACTGGCGGCATCGATGTCCACATGAGATGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104184	CACTCCTGGTGAGAAAAGCACTGGCGGCATCGATGTCCACATGAGATGAT	104233

AL645935.7	601	GTTGTTCTTTAGCTGCCACAAAACAGCATTTGCCCTGAGGCTACCTTAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104234	GTTGTTCTTTAGCTGCCACAAAACAGCATTTGCCCTGAGGCTACCTTAAC	104283

AL645935.7	651	AAAGATATTGGCTTTAGAATAGAGAAGTGCTCTACAGTGATCATTCATTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104284	AAAGATATTGGCTTTAGAATAGAGAAGTGCTCTACAGTGATCATTCATTC	104333

AL645935.7	701	AACTGACATTTGTTGTCTGCTAGGGATATGACTGCTTTTGCGTTTAGAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104334	AACTGACATTTGTTGTCTGCTAGGGATATGACTGCTTTTGCGTTTAGAAA	104383

AL645935.7	751	GCATCATTAAGGTGAAAACAGAAAAATTTCTGGTGTTGTGGTACATATGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104384	GCATCATTAAGGTGAAAACAGAAAAATTTCTGGTGTTGTGGTACATATGT	104433

AL645935.7	801	TCTAGATGCTAGCTTGTCTAACCCGTAGCTCGCAGGCTGAATGTGGCCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104434	TCTAGATGCTAGCTTGTCTAACCCGTAGCTCGCAGGCTGAATGTGGCCCA	104483

AL645935.7	851	GGACAGTTTTGAATGTGAGGAGTTTTTGCTTTTCTGTGGCGGACCTGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104484	GGACAGTTTTGAATGTGAGGAGTTTTTGCTTTTCTGTGGCGGACCTGAGA	104533

AL645935.7	901	CCTGGAGTGAGTGCACCCACCTCCCTCAGGATCAGGAGTGAATGCTTTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104534	CCTGGAGTGAGTGCACCCACCTCCCTCAGGATCAGGAGTGAATGCTTTAG	104583

AL645935.7	951	GAACCCTCCTTTGCAGTGACCTGCAAAAGATAGAGGGCACGGTTACTGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104584	GAACCCTCCTTTGCAGTGACCTGCAAAAGATAGAGGGCACGGTTACTGTG	104633

AL645935.7	1001	AGAACCCAGAGTAGCAGCCAAAGGGGCTCAACCTTCATGGAGTTTTGGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104634	AGAACCCAGAGTAGCAGCCAAAGGGGCTCAACCTTCATGGAGTTTTGGGA	104683

AL645935.7	1051	AAGGTTAGTAAAAGGTGGTGTCCCAGCGTCAGAACAGATGGGCAGCCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104684	AAGGTTAGTAAAAGGTGGTGTCCCAGCGTCAGAACAGATGGGCAGCCAGC	104733

AL645935.7	1101	GAGGGCACTGCTTCATATCTATGATGGGAATGCAAGAATTGAGGAGCAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104734	GAGGGCACTGCTTCATATCTATGATGGGAATGCAAGAATTGAGGAGCAGG	104783

AL645935.7	1151	AGACTGAGGGTGTTTGATCAAATACAAAGTCATGATCCCAGTCTCAATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104784	AGACTGAGGGTGTTTGATCAAATACAAAGTCATGATCCCAGTCTCAATTC	104833

AL645935.7	1201	CTAGACTTCAGCCAAGCTTCAGATTCAGAATCTACAGTGGGGCTTAAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104834	CTAGACTTCAGCCAAGCTTCAGATTCAGAATCTACAGTGGGGCTTAAGGA	104883

AL645935.7	1251	GGCCAGGAAATAAACCTGGACACATTATGGCCCACTGTGGGACCACTGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104884	GGCCAGGAAATAAACCTGGACACATTATGGCCCACTGTGGGACCACTGGG	104933

AL645935.7	1301	TTCATAAACCCAGTCCTGGTTATCTCCCCATTCTCCACATGCATAATTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104934	TTCATAAACCCAGTCCTGGTTATCTCCCCATTCTCCACATGCATAATTGG	104983

AL645935.7	1351	CCTTGATGCACTGGCAAAGGGAGTCACCCCCACACTACATCCCTAGTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	104984	CCTTGATGCACTGGCAAAGGGAGTCACCCCCACACTACATCCCTAGTCTG	105033

AL645935.7	1401	GAGAGTAAGGGCTATCATTGTGCTGAAGCCCAAAGGGAATCATCTAAAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105034	GAGAGTAAGGGCTATCATTGTGCTGAAGCCCAAAGGGAATCATCTAAAAC	105083

AL645935.7	1451	TTCCCTCATCCCAGCCAAGCCAGAAGCAATATTGTGCCCCAGGTGGGACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105084	TTCCCTCATCCCAGCCAAGCCAGAAGCAATATTGTGCCCCAGGTGGGACT	105133

AL645935.7	1501	TCAGGAGGGTACTGCAGGTATTGTAGGGGTGGCACTGCCATTAGAGAGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105134	TCAGGAGGGTACTGCAGGTATTGTAGGGGTGGCACTGCCATTAGAGAGCT	105183

AL645935.7	1551	GAAGGATGGGGGGTGGTGTTGGGATTGCCTATTATCTCCATATAATTCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105184	GAAGGATGGGGGGTGGTGTTGGGATTGCCTATTATCTCCATATAATTCAG	105233

AL645935.7	1601	CAGTCTGTCCCTGAAGAAGCCTGATAAAGAATGAATGGAATTACTCCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105234	CAGTCTGTCCCTGAAGAAGCCTGATAAAGAATGAATGGAATTACTCCAGA	105283

AL645935.7	1651	CTTGACCAAGTAGGAGTCCTGATTGCAGCTGCCATGCTGGCTGGATATCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105284	CTTGACCAAGTAGGAGTCCTGATTGCAGCTGCCATGCTGGCTGGATATCA	105333

AL645935.7	1701	CTGCTTGGGGAGATTAATAAGGCCTCAGGCACATGGCAAACAGCCATGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105334	CTGCTTGGGGAGATTAATAAGGCCTCAGGCACATGGCAAACAGCCATGCA	105383

AL645935.7	1751	TTTGGTGAGTGCATTCTTTCCCATTCCATTTAGAAAATGGATATGGAATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105384	TTTGGTGAGTGCATTCTTTCCCATTCCATTTAGAAAATGGATATGGAATG	105433

AL645935.7	1801	ATTCACATTCACATGGGATTTATAATACATTTATTGATAGCTTGCCTCAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105434	ATTCACATTCACATGGGATTTATAATACATTTATTGATAGCTTGCCTCAG	105483

AL645935.7	1851	GGCTACTTTAACTCCTCAACCTTCTATAAATATCACCTTAAGAGATCTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105484	GGCTACTTTAACTCCTCAACCTTCTATAAATATCACCTTAAGAGATCTGG	105533

AL645935.7	1901	ACAAATCAGACATCTCACAGAATACTAAATCTCTTCGTTTCATTGGCAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105534	ACAAATCAGACATCTCACAGAATACTAAATCTCTTCGTTTCATTGGCAAT	105583

AL645935.7	1951	ATCACATAGATTGGGATGGATGAGTAAGAGGAGGAAAGTACGCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671561.7	105584	ATCACATAGATTGGGATGGATGAGTAAGAGGAGGAAAGTACGCTGAATTC	105633

Overview

Query
AL645935.7 - 129611 bps
Hit
AL671561.7 - 105633 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link