<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732549.16	1	TTACCCCTCTGCAACCCTAAACCCAATTAAACACTTTCTTTTCTAAATTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	155988	TTACCCCTCTGCAACCCTAAACCCAATTAAACACTTTCTTTTCTAAATTG	156037

AL732549.16	51	CCTTGATCATGAGGTTTCATCACAGCAACGGAAAAGTAACTCAGACAAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156038	CCTTGATCATGAGGTTTCATCACAGCAACGGAAAAGTAACTCAGACAAGG	156087

AL732549.16	101	GGTAAGTTGCTTATTACGCAAAAATAGAGTTGAGTAGGCCACCATTTATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156088	GGTAAGTTGCTTATTACGCAAAAATAGAGTTGAGTAGGCCACCATTTATG	156137

AL732549.16	151	GGTCAGTGAAGGATTATGGATAGACTAATTACGTGAACTTCATGAGTGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156138	GGTCAGTGAAGGATTATGGATAGACTAATTACGTGAACTTCATGAGTGAG	156187

AL732549.16	201	GCAAGGAGCAATGGTAAGCAAGTGAAAAAGCAGACAATTTCTGGACTTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156188	GCAAGGAGCAATGGTAAGCAAGTGAAAAAGCAGACAATTTCTGGACTTGC	156237

AL732549.16	251	TTTAGACGTTGTAATCCTTACACACACACACACACACACACACACACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156238	TTTAGACGTTGTAATCCTTACACACACACACACACACACACACACACACA	156287

AL732549.16	301	CACTCACTCACTCACACACTGTCACCCCTCAACTGACTATAGCTTAGCTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156288	CACTCACTCACTCACACACTGTCACCCCTCAACTGACTATAGCTTAGCTC	156337

AL732549.16	351	TCTGCCACATTCAGTTAGGAAGGAGGCTAGGTAACATCTTCAATGGGACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156338	TCTGCCACATTCAGTTAGGAAGGAGGCTAGGTAACATCTTCAATGGGACC	156387

AL732549.16	401	ACCTTGGGCCTGGATGACCTCAGCATGGTTCATGGCTAACTCAGGAACAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156388	ACCTTGGGCCTGGATGACCTCAGCATGGTTCATGGCTAACTCAGGAACAA	156437

AL732549.16	451	ATGAATCGTGGCTGCTGTTAAAAATGAGCAGCCTTTGCCCCAAGTGGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156438	ATGAATCGTGGCTGCTGTTAAAAATGAGCAGCCTTTGCCCCAAGTGGGGA	156487

AL732549.16	501	TGGTGGAAGCAAAAGCTTCACAGGGGTTTTGAAGAAACAAAAGGCTCTAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156488	TGGTGGAAGCAAAAGCTTCACAGGGGTTTTGAAGAAACAAAAGGCTCTAG	156537

AL732549.16	551	GTTGAACACAGCAGACACCCCACAGCTAATGTATGGAGGTTGGTAAGATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156538	GTTGAACACAGCAGACACCCCACAGCTAATGTATGGAGGTTGGTAAGATG	156587

AL732549.16	601	GGTTACAGACTTGCGTTTGGACTTCCACCCTAAAAGAACCTTCTTGGAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156588	GGTTACAGACTTGCGTTTGGACTTCCACCCTAAAAGAACCTTCTTGGAGA	156637

AL732549.16	651	CACCAAATTCCCCTAGAGGGGGATCATTTCCTCCCCCACATTGGATACAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156638	CACCAAATTCCCCTAGAGGGGGATCATTTCCTCCCCCACATTGGATACAA	156687

AL732549.16	701	TTTCAAAACTATCACAGTATGTCATCTGACCTAGTCCAGGTCGGAGCAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156688	TTTCAAAACTATCACAGTATGTCATCTGACCTAGTCCAGGTCGGAGCAGG	156737

AL732549.16	751	AGACTTTTCTTAATTTAGGTTTCCAAAAGGAGACACTAAAACACTTGAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156738	AGACTTTTCTTAATTTAGGTTTCCAAAAGGAGACACTAAAACACTTGAGA	156787

AL732549.16	801	GTGTTATATTTGGCAGATAATGGGTTAATTTTCTCCTTGCTATGACTAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156788	GTGTTATATTTGGCAGATAATGGGTTAATTTTCTCCTTGCTATGACTAAA	156837

AL732549.16	851	GCAACTTGGAGAAGGAGGGCATTGTGTTCATGGTTTCAAGACTGACCAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156838	GCAACTTGGAGAAGGAGGGCATTGTGTTCATGGTTTCAAGACTGACCAGC	156887

AL732549.16	901	AAGCAATGAGCCCAGGAATCGGTGTGAAAGCAGAACTGAAGGGAGACCAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156888	AAGCAATGAGCCCAGGAATCGGTGTGAAAGCAGAACTGAAGGGAGACCAT	156937

AL732549.16	951	GTAGACGAATGAGCACAGGACTGATCTATGCTCAGTGTACTTGAACCCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156938	GTAGACGAATGAGCACAGGACTGATCTATGCTCAGTGTACTTGAACCCCA	156987

AL732549.16	1001	TGACTGTCCTGGAATATTTGTCAGGCAGATCTCTGTGCCTGTGTATTTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	156988	TGACTGTCCTGGAATATTTGTCAGGCAGATCTCTGTGCCTGTGTATTTAT	157037

AL732549.16	1051	ACATCACCTCCTGTCCCTCACTGAGGTTCTTTCTTGAGGACTTGAATAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157038	ACATCACCTCCTGTCCCTCACTGAGGTTCTTTCTTGAGGACTTGAATAAG	157087

AL732549.16	1101	GAGTATGCCAACCTGCTCTGCCGTGAACCAATCACATTCCAGGGCCTGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157088	GAGTATGCCAACCTGCTCTGCCGTGAACCAATCACATTCCAGGGCCTGAG	157137

AL732549.16	1151	AGCTCTCAGGCAGGGAGACAGGGTGATCTCTGAGACAGGGCCTGCCTGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157138	AGCTCTCAGGCAGGGAGACAGGGTGATCTCTGAGACAGGGCCTGCCTGCA	157187

AL732549.16	1201	GTGACCTCTGAGGTGTTGTGATAGGCACACAGCAGGGCTGAGTGGTTGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157188	GTGACCTCTGAGGTGTTGTGATAGGCACACAGCAGGGCTGAGTGGTTGGT	157237

AL732549.16	1251	GCTCAGTTCTAGGACATCAGCAGTCACAGAGGTACATGAAGATGGAGATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157238	GCTCAGTTCTAGGACATCAGCAGTCACAGAGGTACATGAAGATGGAGATC	157287

AL732549.16	1301	TTTGGTGTCTTGTCCTACTCCAACAGCCTGCCCTACTGCCAGGTCCTCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157288	TTTGGTGTCTTGTCCTACTCCAACAGCCTGCCCTACTGCCAGGTCCTCCT	157337

AL732549.16	1351	CATTCTGCCCCTCCAACCTTCTAGAAAGGTCTTCTTCCCAACTTATTTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157338	CATTCTGCCCCTCCAACCTTCTAGAAAGGTCTTCTTCCCAACTTATTTCC	157387

AL732549.16	1401	AGATCTAGCCCTTCACACTGCCTGGCACTTCTGAAAATTTGCATTATACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157388	AGATCTAGCCCTTCACACTGCCTGGCACTTCTGAAAATTTGCATTATACA	157437

AL732549.16	1451	TACAATAATTACAATATATTTCCAGGAGAATTTTCCAAAGTTGGCTTCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157438	TACAATAATTACAATATATTTCCAGGAGAATTTTCCAAAGTTGGCTTCTG	157487

AL732549.16	1501	TTGTTTGCATCTAGATTACATGGTACCTGGCACACCTGGGTACACACACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157488	TTGTTTGCATCTAGATTACATGGTACCTGGCACACCTGGGTACACACACC	157537

AL732549.16	1551	TGGTACCTGGCACACCTGGAGACCATTGCCCCTGACCCGCATCTTTAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157538	TGGTACCTGGCACACCTGGAGACCATTGCCCCTGACCCGCATCTTTAAGA	157587

AL732549.16	1601	AGAAGAGTCATCTCTCCTCACTTCAATTTCCTTACCCACAAAATGAGAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157588	AGAAGAGTCATCTCTCCTCACTTCAATTTCCTTACCCACAAAATGAGAAG	157637

AL732549.16	1651	ATTGGAGATTATTTTCAAGTTTCCACTTTATGGTATGATTCAATTATTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157638	ATTGGAGATTATTTTCAAGTTTCCACTTTATGGTATGATTCAATTATTCT	157687

AL732549.16	1701	GTTTGGGCCAAACTGTAAGTCAGACAACGGAAACCCATCAAAGCTCATGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157688	GTTTGGGCCAAACTGTAAGTCAGACAACGGAAACCCATCAAAGCTCATGC	157737

AL732549.16	1751	CTCTAATCTAAGTTACAAACTCCATTCTCTACTAACTTTATAGTCTCCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157738	CTCTAATCTAAGTTACAAACTCCATTCTCTACTAACTTTATAGTCTCCTT	157787

AL732549.16	1801	TAAATGCTAATAAGAGATTGACAAGAATGGGAATGACGGAACAAAGAAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157788	TAAATGCTAATAAGAGATTGACAAGAATGGGAATGACGGAACAAAGAAGG	157837

AL732549.16	1851	GCCTAGATTTTCCCCGACCTCTACATGGAAGCGATCCTGTGTGCATGTGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157838	GCCTAGATTTTCCCCGACCTCTACATGGAAGCGATCCTGTGTGCATGTGC	157887

AL732549.16	1901	ACACACGCTCACCAAACACACAAACACACACACACACACACACACACACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157888	ACACACGCTCACCAAACACACAAACACACACACACACACACACACACACA	157937

AL732549.16	1951	CACACACATTCAGTGGGGAGGAAGCATTCTCCCTTTATCCAAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671560.7	157938	CACACACATTCAGTGGGGAGGAAGCATTCTCCCTTTATCCAAAGGAATTC	157987

Overview

Query
AL732549.16 - 7276 bps
Hit
AL671560.7 - 157987 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link