<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662796.6	1	GAATTCAATGAACACATAGACTTACTGATTGTGTGAGGATGCGATCTGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85295	GAATTCAATGAACACATAGACTTACTGATTGTGTGAGGATGCGATCTGAC	85344

AL662796.6	51	TGAAAAACAAGCAAAGATACTTTTTGTTACCCCTTTCTTGTTTCTTTTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85345	TGAAAAACAAGCAAAGATACTTTTTGTTACCCCTTTCTTGTTTCTTTTCC	85394

AL662796.6	101	TACTCATTTTTTTTTCTATTGGTAAATTTACTAGTGATATACTTGCTTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85395	TACTCATTTTTTTTTCTATTGGTAAATTTACTAGTGATATACTTGCTTGA	85444

AL662796.6	151	ACATTTTTTTTTTTAATCAAAGGCACTAGAAATTTCCAGAAAACTAATTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85445	ACATTTTTTTTTTTAATCAAAGGCACTAGAAATTTCCAGAAAACTAATTA	85494

AL662796.6	201	TCAGCTGGTTGAATTCTGGATAATGGAAAAACAAAAGGCTGAGAAAATAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85495	TCAGCTGGTTGAATTCTGGATAATGGAAAAACAAAAGGCTGAGAAAATAG	85544

AL662796.6	251	AACTTCAAGTTCCATGTTGCAACTCAAGTTCCAATAGACATCAGTGGACT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85545	AACTTCAAGTTCCATGTTGCAACTCAAGTTCCAATAGACATCAGTGGACT	85594

AL662796.6	301	TTGATAAGTGCACCACAGAGAAACAAATAAATAACTGACTAATTGCCTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85595	TTGATAAGTGCACCACAGAGAAACAAATAAATAACTGACTAATTGCCTGT	85644

AL662796.6	351	ATAGATGACTTATCTAGAAAGCAGAAATGGATCTATATCATTTTTCTGTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85645	ATAGATGACTTATCTAGAAAGCAGAAATGGATCTATATCATTTTTCTGTC	85694

AL662796.6	401	ATTTTTTTTCCTTCTGCATGGAAAGTTCCTAACATTCTTTAGAGTCATGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85695	ATTTTTTTTCCTTCTGCATGGAAAGTTCCTAACATTCTTTAGAGTCATGT	85744

AL662796.6	451	AAAAACTTTTTTCTCAGGTCTTTATTTTTTATGCGAGTCAGTGAATGTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85745	AAAAACTTTTTTCTCAGGTCTTTATTTTTTATGCGAGTCAGTGAATGTTC	85794

AL662796.6	501	TAGAAACTTATTAATAATTTATTTATGCCTTTCTGCCCATGGATGCCATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85795	TAGAAACTTATTAATAATTTATTTATGCCTTTCTGCCCATGGATGCCATG	85844

AL662796.6	551	GAAGAAGCATCATTAAAGTCTCTCTTCTCCTGGCCGTCTTATCTAAGTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85845	GAAGAAGCATCATTAAAGTCTCTCTTCTCCTGGCCGTCTTATCTAAGTCA	85894

AL662796.6	601	GAGTCTCCTAAAGAGCCAGAACAACTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85895	GAGTCTCCTAAAGAGCCAGAACAACTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTT	85944

AL662796.6	651	GAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAGTGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85945	GAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAGTGAG	85994

AL662796.6	701	GGACACTCCCGGACAGTGTGGTCATGAGAGATCCAAACCCAAGCACTCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	85995	GGACACTCCCGGACAGTGTGGTCATGAGAGATCCAAACCCAAGCACTCCA	86044

AL662796.6	751	GGGGCTTTGGATTTTTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86045	GGGGCTTTGGATTTTTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCC	86094

AL662796.6	801	GTGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGCTGTGGAACCAAAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86095	GTGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGCTGTGGAACCAAAGAG	86144

AL662796.6	851	AGCTGTCTCAAGAGAAGATTCTCAAATACCAGGTGCCCACTTAACTGTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86145	AGCTGTCTCAAGAGAAGATTCTCAAATACCAGGTGCCCACTTAACTGTGA	86194

AL662796.6	901	AAAAGATATATGCTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAAATCACCTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86195	AAAAGATATATGCTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAAATCACCTAA	86244

AL662796.6	951	GAAATTATTTTGAGTAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAAACATGACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86245	GAAATTATTTTGAGTAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAAACATGACT	86294

AL662796.6	1001	GACCGAGGCAGTTGCAAGAAAAGGGGATTTGCCTTTGTAACCTTTGATGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86295	GACCGAGGCAGTTGCAAGAAAAGGGGATTTGCCTTTGTAACCTTTGATGA	86344

AL662796.6	1051	CCATGACTCCGTGGATAAGACTGTCATTCAGAAATACCACAGTGTGAATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86345	CCATGACTCCGTGGATAAGACTGTCATTCAGAAATACCACAGTGTGAATG	86394

AL662796.6	1101	GCCACAACTGTGAAGTTAGGAAAGTCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86395	GCCACAACTGTGAAGTTAGGAAAGTCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTG	86444

AL662796.6	1151	CTCCATCCAGCCGAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTAGGTGGTGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86445	CTCCATCCAGCCGAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTAGGTGGTGGT	86494

AL662796.6	1201	CATGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTTGATCATGGAGGAAACTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86495	CATGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTTGATCATGGAGGAAACTT	86544

AL662796.6	1251	CAGTGGTTGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCTGTGGTGGTGGTGGATATGGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86545	CAGTGGTTGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCTGTGGTGGTGGTGGATATGGTG	86594

AL662796.6	1301	GCAGTGAGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGGAGCAATTTTGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86595	GCAGTGAGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGGAGCAATTTTGGA	86644

AL662796.6	1351	GGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATCAGTCTTCAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86645	GGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATCAGTCTTCAAA	86694

AL662796.6	1401	TTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAACTTTGGAGGCAGAAGCTGTGGCCTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86695	TTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAACTTTGGAGGCAGAAGCTGTGGCCTCT	86744

AL662796.6	1451	ATGGTGGTGGAGGCCAATACTTTGCCAAACCATGAAACCAAAGTGGCTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86745	ATGGTGGTGGAGGCCAATACTTTGCCAAACCATGAAACCAAAGTGGCTAT	86794

AL662796.6	1501	TGTGGTTCCAGTAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTTTAATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86795	TGTGGTTCCAGTAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTTTAATT	86844

AL662796.6	1551	AGGAAACAAAGCTTAGCAGGAGAGGAGAGCCAGAGAAGTGACAGGGAAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86845	AGGAAACAAAGCTTAGCAGGAGAGGAGAGCCAGAGAAGTGACAGGGAAGC	86894

AL662796.6	1601	TACAGGTTATAACAGATTTGTGAACTCAGCCAAGCACAGTGGTGGCAGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86895	TACAGGTTATAACAGATTTGTGAACTCAGCCAAGCACAGTGGTGGCAGGG	86944

AL662796.6	1651	CCTAGCTGGTACAAAGAAGACATGTTTTAGACAAATACTCATGTGTATGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86945	CCTAGCTGGTACAAAGAAGACATGTTTTAGACAAATACTCATGTGTATGG	86994

AL662796.6	1701	GCAAAAAACTCGAGGACTGTATTTGTGACTAATTGTATAACAGGTTATTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	86995	GCAAAAAACTCGAGGACTGTATTTGTGACTAATTGTATAACAGGTTATTT	87044

AL662796.6	1751	TAGTTTCTGTTCTGTGGAAAGTGTAAAGCATTCCGACAAAGGGTTTTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	87045	TAGTTTCTGTTCTGTGGAAAGTGTAAAGCATTCCGACAAAGGGTTTTAAT	87094

AL662796.6	1801	GTAGATTTTTTTTTGCACCCATGCTGTTTATTGCTAAATGTAATAGTCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	87095	GTAGATTTTTTTTTGCACCCATGCTGTTTATTGCTAAATGTAATAGTCTG	87144

AL662796.6	1851	ATCGTGACACTGAAAAAAATATATATTTGTGTTCTGAGTAATGGAAAAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	87145	ATCGTGACACTGAAAAAAATATATATTTGTGTTCTGAGTAATGGAAAAAT	87194

AL662796.6	1901	AAGGGACCAAGGAAATTGGAACATTATCATATCACAATGTGGATGCATAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	87195	AAGGGACCAAGGAAATTGGAACATTATCATATCACAATGTGGATGCATAC	87244

AL662796.6	1951	ATTTTGGCTTAAGATATGTTAGACACTGCTGGAGATAATTGAGTTTCACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671511.4	87245	ATTTTGGCTTAAGATATGTTAGACACTGCTGGAGATAATTGAGTTTCACT	87294

Overview

Query
AL662796.6 - 130102 bps
Hit
AL671511.4 - 87294 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link