<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662834.8	1	GAATTCTCATTACTTGCTAACAAGTTAATGTCTTCCCCTCTCAAAACCAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88733	GAATTCTCATTACTTGCTAACAAGTTAATGTCTTCCCCTCTCAAAACCAC	88782

AL662834.8	51	CCCTCAACCAAAGAGTGCACGTGGGATTGGGGGTGGGAGTCAAGGAGGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88783	CCCTCAACCAAAGAGTGCACGTGGGATTGGGGGTGGGAGTCAAGGAGGGA	88832

AL662834.8	101	AGGGATTGGGGAGTTAAGGCTGGACCGGGGGAAAGGTGAGAGTTGGCTTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88833	AGGGATTGGGGAGTTAAGGCTGGACCGGGGGAAAGGTGAGAGTTGGCTTC	88882

AL662834.8	151	CAGGAATTTGGGTGGCTGAGGAGAGAAGTGTTCTTACCTTCACGAACAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88883	CAGGAATTTGGGTGGCTGAGGAGAGAAGTGTTCTTACCTTCACGAACAAT	88932

AL662834.8	201	TCGACCTGCGGTTGTTCTTCAGCCATGGTTGCGTCGGGGACCAGGAAGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88933	TCGACCTGCGGTTGTTCTTCAGCCATGGTTGCGTCGGGGACCAGGAAGTG	88982

AL662834.8	251	GCCGTCCCTGGGGGAACTGGGAGGGGCTGGGACCGGGGAAGGCGGGTCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	88983	GCCGTCCCTGGGGGAACTGGGAGGGGCTGGGACCGGGGAAGGCGGGTCTC	89032

AL662834.8	301	ACACTCAGGGACTCTCTCCCCTAGACCCAGGGCTGTCCCTTCAGCACAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89033	ACACTCAGGGACTCTCTCCCCTAGACCCAGGGCTGTCCCTTCAGCACAAC	89082

AL662834.8	351	ACAAGCTCAATCAGACCTACTTGCACCCAAACTAGGCCTCCCCACCAGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89083	ACAAGCTCAATCAGACCTACTTGCACCCAAACTAGGCCTCCCCACCAGCC	89132

AL662834.8	401	CAACGCACCCCACACCCAGCTCCTCCAGCTCGGTCCTCTCCCTGGCTGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89133	CAACGCACCCCACACCCAGCTCCTCCAGCTCGGTCCTCTCCCTGGCTGGA	89182

AL662834.8	451	TCAGAGAGCCGCTGACTCACCGACCGGCCCCGCCCTGAACCTGGGGAGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89183	TCAGAGAGCCGCTGACTCACCGACCGGCCCCGCCCTGAACCTGGGGAGGG	89232

AL662834.8	501	GACTGGAGGGGGGCGGGACTCGACGATGTAGGGAGTGAGTCCGGAAGGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89233	GACTGGAGGGGGGCGGGACTCGACGATGTAGGGAGTGAGTCCGGAAGGGG	89282

AL662834.8	551	AATCCTCGGATCTCCCACAGGATGGGGATGGGGGTGTTAAGGAGGAGTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89283	AATCCTCGGATCTCCCACAGGATGGGGATGGGGGTGTTAAGGAGGAGTCC	89332

AL662834.8	601	TGAAAACCTCCTTGTTTCTCCGACCTCTCCTGAACACAGGACTCTTTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89333	TGAAAACCTCCTTGTTTCTCCGACCTCTCCTGAACACAGGACTCTTTTCT	89382

AL662834.8	651	GCCTCAGTTTCCCTGCTTCATTAATCTGAGTACAACCCGACTGACCCTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89383	GCCTCAGTTTCCCTGCTTCATTAATCTGAGTACAACCCGACTGACCCTCA	89432

AL662834.8	701	TATAAAAAACTTGACACTAACAGCTTGGGCACACCCGTGAAGATTCAGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89433	TATAAAAAACTTGACACTAACAGCTTGGGCACACCCGTGAAGATTCAGGG	89482

AL662834.8	751	ATGGGGACTTCAAATGGAAAGGTGGTCGTTTAATCATTCTGCATTTCTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89483	ATGGGGACTTCAAATGGAAAGGTGGTCGTTTAATCATTCTGCATTTCTTC	89532

AL662834.8	801	CAGACTCCAATCCAAATTCTGGGTTGCTGGGACTGTGGTCTGAGAGAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89533	CAGACTCCAATCCAAATTCTGGGTTGCTGGGACTGTGGTCTGAGAGAAGA	89582

AL662834.8	851	ACTCGGAAGTGGAAGGCTGGGACTGCAGATAGGAACCGTTAGCCATGCAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89583	ACTCGGAAGTGGAAGGCTGGGACTGCAGATAGGAACCGTTAGCCATGCAG	89632

AL662834.8	901	CCTGGGATTAGGGAAGGGGTGACGCCAGCACTCCCTGAGCTGCCCAGACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89633	CCTGGGATTAGGGAAGGGGTGACGCCAGCACTCCCTGAGCTGCCCAGACT	89682

AL662834.8	951	GGTGTCTCAGTAGGTCCTGTGCCCCCCGCAGTCTACTGTCTCCGGGCCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89683	GGTGTCTCAGTAGGTCCTGTGCCCCCCGCAGTCTACTGTCTCCGGGCCCA	89732

AL662834.8	1001	GCTCAGCACTAGGACTTGCAGTCCTTGTGGCCTACACTTGGGATTGGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89733	GCTCAGCACTAGGACTTGCAGTCCTTGTGGCCTACACTTGGGATTGGGCA	89782

AL662834.8	1051	TAGGAAATAGAGTTAGGGGCCGGGTGAGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89783	TAGGAAATAGAGTTAGGGGCCGGGTGAGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA	89832

AL662834.8	1101	ACACTTTAGGAGGCCAAGGGGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGGAGTCAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89833	ACACTTTAGGAGGCCAAGGGGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGGAGTCAAG	89882

AL662834.8	1151	ACCAGACTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89883	ACCAGACTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAA	89932

AL662834.8	1201	TTTGCCAGGCGGGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89933	TTTGCCAGGCGGGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCT	89982

AL662834.8	1251	GAGGCAGGAGAATCAATTGAACCCGGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	89983	GAGGCAGGAGAATCAATTGAACCCGGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCTGA	90032

AL662834.8	1301	GATGGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90033	GATGGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCGAAACTCCATCTC	90082

AL662834.8	1351	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAAGAAAAAGAAAGTAGAGTTAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90083	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAAGAAAAAGAAAGTAGAGTTAG	90132

AL662834.8	1401	GGATGGGAAGGGAGATGACGAAGTCTTTTGCGAAGGAAACATAAAGCCGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90133	GGATGGGAAGGGAGATGACGAAGTCTTTTGCGAAGGAAACATAAAGCCGA	90182

AL662834.8	1451	GGCAAGGGGCTTTGTTGCAGGGAGGGGTCTGTTCCTGTAGCTTGGTCAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90183	GGCAAGGGGCTTTGTTGCAGGGAGGGGTCTGTTCCTGTAGCTTGGTCAGC	90232

AL662834.8	1501	TTTGTGCTTCCACTTATGTTTCCTATTGGGGCCCCTTCCTGTGCCCTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90233	TTTGTGCTTCCACTTATGTTTCCTATTGGGGCCCCTTCCTGTGCCCTTTG	90282

AL662834.8	1551	TCCTCGTCTCACTGACAGGTTGCCTTGGAGATGGGGCAGAGGGGTGGGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90283	TCCTCGTCTCACTGACAGGTTGCCTTGGAGATGGGGCAGAGGGGTGGGAT	90332

AL662834.8	1601	TATCATGGCCCGATCCTGAAGTATGTGTATAGGGGGTGGGGTAGGGGTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90333	TATCATGGCCCGATCCTGAAGTATGTGTATAGGGGGTGGGGTAGGGGTGT	90382

AL662834.8	1651	TGTTAGCTGGTCCTGTCATGGGGATAAAGAAAGATCAGACAGAATAGTGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90383	TGTTAGCTGGTCCTGTCATGGGGATAAAGAAAGATCAGACAGAATAGTGG	90432

AL662834.8	1701	GAGTAGAGTCCTTGGGGACACCTAAATAAATAAGCAGGGAGGACATAGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90433	GAGTAGAGTCCTTGGGGACACCTAAATAAATAAGCAGGGAGGACATAGGA	90482

AL662834.8	1751	GGAGCAGCTCTCTCTCCAGTAACCTTGATTTCTATTAAACCTTTATGACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90483	GGAGCAGCTCTCTCTCCAGTAACCTTGATTTCTATTAAACCTTTATGACC	90532

AL662834.8	1801	TGCTGAAAAAATAAACCCAGAATTCCAGCCTCCATATCCTGAATTTCTCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90533	TGCTGAAAAAATAAACCCAGAATTCCAGCCTCCATATCCTGAATTTCTCT	90582

AL662834.8	1851	CCTGTCCAACCATCCCTTCTCTATCCTCCTCATCACCCTCTGTCCAACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90583	CCTGTCCAACCATCCCTTCTCTATCCTCCTCATCACCCTCTGTCCAACAA	90632

AL662834.8	1901	AAGACCTACAGTTCCAGAAAACCATGGTGGAGTGCAAGAACACAGAACTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90633	AAGACCTACAGTTCCAGAAAACCATGGTGGAGTGCAAGAACACAGAACTA	90682

AL662834.8	1951	AAACAGAGCTTGAAACTTAAAGAAAGGGAGAGACTTGGGGGAGGAGTGGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670886.6	90683	AAACAGAGCTTGAAACTTAAAGAAAGGGAGAGACTTGGGGGAGGAGTGGG	90732

Overview

Query
AL662834.8 - 179894 bps
Hit
AL670886.6 - 90732 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link