<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662842.3	1	GAATTCACAGATAAGGAAACAGTAATTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTATTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158624	GAATTCACAGATAAGGAAACAGTAATTTTTTTTCTCTTTTTTTTTTATTT	158673

AL662842.3	51	TTGGGATGGAGTCTAGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158674	TTGGGATGGAGTCTAGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATC	158723

AL662842.3	101	TGGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158724	TGGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTC	158773

AL662842.3	151	AGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCTACCATGCCCAGCTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158774	AGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCTACCATGCCCAGCTAA	158823

AL662842.3	201	TTTTTTTATTTTTAGTAAAGACGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158824	TTTTTTTATTTTTAGTAAAGACGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTC	158873

AL662842.3	251	TTGATTTCCTGGCCTCATGATCTGCCCATTTCAGCATCCCAAAGTGCTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158874	TTGATTTCCTGGCCTCATGATCTGCCCATTTCAGCATCCCAAAGTGCTGG	158923

AL662842.3	301	GATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTGGCCAAGGAAACAGTAATTTTAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158924	GATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCTGGCCAAGGAAACAGTAATTTTAAG	158973

AL662842.3	351	AAAAAAGAATTTTTTTTTAAATTAAGATTCATCTCTTTCCGGCTGGGCAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	158974	AAAAAAGAATTTTTTTTTAAATTAAGATTCATCTCTTTCCGGCTGGGCAT	159023

AL662842.3	401	GTTGGCTCTCATCTGTAATCCTAGCATGTTGGGAGGCAGGAGGATCGCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159024	GTTGGCTCTCATCTGTAATCCTAGCATGTTGGGAGGCAGGAGGATCGCTT	159073

AL662842.3	451	GAGCCCAGGAGTATAAGACCAGCCTGGGCAATATAGCAAAATGCAGTCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159074	GAGCCCAGGAGTATAAGACCAGCCTGGGCAATATAGCAAAATGCAGTCTC	159123

AL662842.3	501	TACCAAAATTACAATAATTAGCTGGGTGTGGTTTCCTGCCTGTAGTCCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159124	TACCAAAATTACAATAATTAGCTGGGTGTGGTTTCCTGCCTGTAGTCCCA	159173

AL662842.3	551	GCTACTCTGGAGGCTGAGGAGGGAGGATCACTTGAGCTTTGGCGGCAGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159174	GCTACTCTGGAGGCTGAGGAGGGAGGATCACTTGAGCTTTGGCGGCAGAG	159223

AL662842.3	601	GTTGCAGTGAGCCTCTATCATACCACTACACTACAGCCTGGGTGACAGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159224	GTTGCAGTGAGCCTCTATCATACCACTACACTACAGCCTGGGTGACAGAG	159273

AL662842.3	651	CCAGGCCCTGTCTCAAAAAAAGAAGAAATTATCTCTTGTGATGAACCTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159274	CCAGGCCCTGTCTCAAAAAAAGAAGAAATTATCTCTTGTGATGAACCTCA	159323

AL662842.3	701	TAGTGCTCTAGGTCTGTGCAAGCTTTAAGGATTTCGGGAAATAATGACAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159324	TAGTGCTCTAGGTCTGTGCAAGCTTTAAGGATTTCGGGAAATAATGACAA	159373

AL662842.3	751	CATAGCTGGGGAAAAATAGAGAGAAACTGGAGGAAGAGGTAAGTGGACAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159374	CATAGCTGGGGAAAAATAGAGAGAAACTGGAGGAAGAGGTAAGTGGACAT	159423

AL662842.3	801	GGCTAATTAAGAAAAGCTGACGGCATGATGGGTGAACCTATGAAATTTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159424	GGCTAATTAAGAAAAGCTGACGGCATGATGGGTGAACCTATGAAATTTAG	159473

AL662842.3	851	GACAAGACCCGAGTAGGACAATGAGTTCCCAGGACTTGCTCATTGACTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159474	GACAAGACCCGAGTAGGACAATGAGTTCCCAGGACTTGCTCATTGACTTT	159523

AL662842.3	901	CAGCCCTATGAGATGTGAACAATGTCCACATTGTCTCGGTAACTCCACTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159524	CAGCCCTATGAGATGTGAACAATGTCCACATTGTCTCGGTAACTCCACTC	159573

AL662842.3	951	AGAGTATATAGTTTGAACCTTAGCAAATTTCTGATATTTCACTATTTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159574	AGAGTATATAGTTTGAACCTTAGCAAATTTCTGATATTTCACTATTTTTG	159623

AL662842.3	1001	ACTTACAAAAATATAATTTCATATAATTTATCCTACATTCATTGAATCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159624	ACTTACAAAAATATAATTTCATATAATTTATCCTACATTCATTGAATCTC	159673

AL662842.3	1051	TTCTTGTGGAGTCTAGTTAGAGCATATAGGAGATGTAGGAGAAGCTAGTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159674	TTCTTGTGGAGTCTAGTTAGAGCATATAGGAGATGTAGGAGAAGCTAGTA	159723

AL662842.3	1101	TAGAAAGGTTAAAAGAGATTCATAATAAACACTAACCTGGGCCAGGTTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159724	TAGAAAGGTTAAAAGAGATTCATAATAAACACTAACCTGGGCCAGGTTTT	159773

AL662842.3	1151	CAGAGGATGCCTTAAGTTCTTTAGGCACCAAAGAACACCCCATAGATGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159774	CAGAGGATGCCTTAAGTTCTTTAGGCACCAAAGAACACCCCATAGATGTT	159823

AL662842.3	1201	CTTTGTCTGTAGGGTGATACCAAGTACTAAAGATCTTGGCTTCAGCTCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159824	CTTTGTCTGTAGGGTGATACCAAGTACTAAAGATCTTGGCTTCAGCTCCA	159873

AL662842.3	1251	CGGATTTTTCCCCATAAGAAAGAAAGAGCACTAAGTATAACTTTTGTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159874	CGGATTTTTCCCCATAAGAAAGAAAGAGCACTAAGTATAACTTTTGTCAG	159923

AL662842.3	1301	AGAACCTACATAAGCTACAGGGATACAGGCTTTATAAAGACTGGACTTCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159924	AGAACCTACATAAGCTACAGGGATACAGGCTTTATAAAGACTGGACTTCA	159973

AL662842.3	1351	GAAAGAAACGAAAGTAGATAATGGGGAGGCCACTGGGTACATCTTCACTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	159974	GAAAGAAACGAAAGTAGATAATGGGGAGGCCACTGGGTACATCTTCACTT	160023

AL662842.3	1401	ATGAGGAAGAGGGGCCAACACCACAGGTCCTGTGGAGGACATAACACAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160024	ATGAGGAAGAGGGGCCAACACCACAGGTCCTGTGGAGGACATAACACAGG	160073

AL662842.3	1451	ATCATCTAGGAGAGACCCTTTGAATTCCCTTGACTCTCACAAAATTTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160074	ATCATCTAGGAGAGACCCTTTGAATTCCCTTGACTCTCACAAAATTTTCA	160123

AL662842.3	1501	GAAAAAAACCTCCTTTTGTCTGACTTAAGTCAACATAATAAAGGGAAGTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160124	GAAAAAAACCTCCTTTTGTCTGACTTAAGTCAACATAATAAAGGGAAGTG	160173

AL662842.3	1551	CTGTATGGGGAATTTATTTTAGCATCCTTATTTCTAAATCCTCTAAAGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160174	CTGTATGGGGAATTTATTTTAGCATCCTTATTTCTAAATCCTCTAAAGAC	160223

AL662842.3	1601	CCTGAGGACATGTGATGCAAAGTTTTATTGGTAGAGATTTGAGAAGAAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160224	CCTGAGGACATGTGATGCAAAGTTTTATTGGTAGAGATTTGAGAAGAAAT	160273

AL662842.3	1651	GACCTGTATGGAGGCCCTTAAACAAGTCTCATGGAGAGGGCAAGTAGCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160274	GACCTGTATGGAGGCCCTTAAACAAGTCTCATGGAGAGGGCAAGTAGCCA	160323

AL662842.3	1701	AGCTCCTTTTGTGGAGGAAGTAATTTGGGATCCATGTGATAAAGATGGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160324	AGCTCCTTTTGTGGAGGAAGTAATTTGGGATCCATGTGATAAAGATGGGC	160373

AL662842.3	1751	AATCCCTGTGGAAAACGTTACAAATTCTTAAGGGACATGGACTGGGCACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160374	AATCCCTGTGGAAAACGTTACAAATTCTTAAGGGACATGGACTGGGCACA	160423

AL662842.3	1801	GTGACAAATTTAGGTCCCTACTTTACCCCCCTTATGGTAGCTCAGCAACC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160424	GTGACAAATTTAGGTCCCTACTTTACCCCCCTTATGGTAGCTCAGCAACC	160473

AL662842.3	1851	GCAGTGTGCACTTAGGTCGGGTGTCCCCAGCCAAAGCCAGTGGGGAGCTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160474	GCAGTGTGCACTTAGGTCGGGTGTCCCCAGCCAAAGCCAGTGGGGAGCTC	160523

AL662842.3	1901	AGCACCATCAGTGTCACTGTCAGCGCTGCCATGCAGGAGCCTCCAGGGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160524	AGCACCATCAGTGTCACTGTCAGCGCTGCCATGCAGGAGCCTCCAGGGAG	160573

AL662842.3	1951	CCTCAAACACACCATGCTGGAGAACAGGACAGGACCAGGTGCCAGGGTAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670296.7	160574	CCTCAAACACACCATGCTGGAGAACAGGACAGGACCAGGTGCCAGGGTAG	160623

Overview

Query
AL662842.3 - 130819 bps
Hit
AL670296.7 - 160623 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link