<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662859.5	1	GAATTCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61506	GAATTCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACA	61555

AL662859.5	51	AACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTACAATCCCTTCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61556	AACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTACAATCCCTTCG	61605

AL662859.5	101	CTAGACATAAAGGTTCTCCAAGTCCCCACCAGAGTAGCTAAATACAGAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61606	CTAGACATAAAGGTTCTCCAAGTCCCCACCAGAGTAGCTAAATACAGAGT	61655

AL662859.5	151	GTCCATTGGTGCATTCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCCGATTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61656	GTCCATTGGTGCATTCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCCGATTGG	61705

AL662859.5	201	TGTGTTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61706	TGTGTTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTAT	61755

AL662859.5	251	AATCCCTTAGCTAGACGTAAACGTTCTCCAAGTCCCTACCAGACTCAGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61756	AATCCCTTAGCTAGACGTAAACGTTCTCCAAGTCCCTACCAGACTCAGGA	61805

AL662859.5	301	GCCCAGCTGGCTTCACCCAGTGGATTTTCCACCGGTGCCGCAGGTGGAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61806	GCCCAGCTGGCTTCACCCAGTGGATTTTCCACCGGTGCCGCAGGTGGAGC	61855

AL662859.5	351	TGCCTGCCAGTCCCGTGCTTTGCGCCCGCACTTCTCAGCCGTTGGGTGGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61856	TGCCTGCCAGTCCCGTGCTTTGCGCCCGCACTTCTCAGCCGTTGGGTGGC	61905

AL662859.5	401	CGATGGGATTGGGCGCCGTGGAGCAGGGGGCGGCGCTCGTCGGGGAGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61906	CGATGGGATTGGGCGCCGTGGAGCAGGGGGCGGCGCTCGTCGGGGAGGCT	61955

AL662859.5	451	CGGGCCGCGCAGGAGCCCATGGCGGGGAGGGGCGTCTCAGGCATGGCGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	61956	CGGGCCGCGCAGGAGCCCATGGCGGGGAGGGGCGTCTCAGGCATGGCGGG	62005

AL662859.5	501	CTGTAGGTCCCGAGCCTTACCCCGCGGGGAGACAGCTAAGGCCCGGCGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62006	CTGTAGGTCCCGAGCCTTACCCCGCGGGGAGACAGCTAAGGCCCGGCGAG	62055

AL662859.5	551	AAGTCGAGAACAGCAGCTGCTGGCACAGGTGCTAAGCCTCTTACTGCTCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62056	AAGTCGAGAACAGCAGCTGCTGGCACAGGTGCTAAGCCTCTTACTGCTCG	62105

AL662859.5	601	GGGCTTGCGGATTAGGGGGCCGCTCCGAGTGCGGAGCCCGCCGAGCCCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62106	GGGCTTGCGGATTAGGGGGCCGCTCCGAGTGCGGAGCCCGCCGAGCCCAC	62155

AL662859.5	651	GCCCACCCGGAACTCGCGCTGGGCCCGCAAGCGCCGCGCGCAGCCTCGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62156	GCCCACCCGGAACTCGCGCTGGGCCCGCAAGCGCCGCGCGCAGCCTCGGT	62205

AL662859.5	701	TCCCGCCTGCGCTTCTCCCTCCACACATCCCTGCAAGCTGAGGGAGCCGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62206	TCCCGCCTGCGCTTCTCCCTCCACACATCCCTGCAAGCTGAGGGAGCCGG	62255

AL662859.5	751	CTCCGGCCTTGGCCAGCCCAGCAAGGGGCTCCCACAGTGCAGCGGCGGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62256	CTCCGGCCTTGGCCAGCCCAGCAAGGGGCTCCCACAGTGCAGCGGCGGGC	62305

AL662859.5	801	TGAAGTTCTCCTCAAGCGCGGCCAGAGTGGGCGCCAAGGCCGAGGAGGCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62306	TGAAGTTCTCCTCAAGCGCGGCCAGAGTGGGCGCCAAGGCCGAGGAGGCG	62355

AL662859.5	851	CCTAGAGCAAGCGAAGGCTGTGAGGGCTGCCAGCAAGCTGTCACCTCTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62356	CCTAGAGCAAGCGAAGGCTGTGAGGGCTGCCAGCAAGCTGTCACCTCTCA	62405

AL662859.5	901	GTATGGCGGCTGGCTGTTTTAGCACCATGTCGTTTATTGTCATGCATTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62406	GTATGGCGGCTGGCTGTTTTAGCACCATGTCGTTTATTGTCATGCATTTG	62455

AL662859.5	951	TAGGATTATGAAATGCTTCCTGAATTTTGCTTTTACAGTAACTTGTATTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62456	TAGGATTATGAAATGCTTCCTGAATTTTGCTTTTACAGTAACTTGTATTC	62505

AL662859.5	1001	ATTCATGCATTTTTCAACCTGCTCACTCCAGTTCAAGGTCTTTGGTGGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62506	ATTCATGCATTTTTCAACCTGCTCACTCCAGTTCAAGGTCTTTGGTGGCT	62555

AL662859.5	1051	GAAGCCTAATTCAACTCCTCATAGTGTCAGGAGGGAACCCACCGTGGACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62556	GAAGCCTAATTCAACTCCTCATAGTGTCAGGAGGGAACCCACCGTGGACA	62605

AL662859.5	1101	GGTGGCCATTCCATCACAGGGCGGGCTCATACACACACACACACACTCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62606	GGTGGCCATTCCATCACAGGGCGGGCTCATACACACACACACACACTCAC	62655

AL662859.5	1151	ACATATGCTCGCGTGCTCTTTCACTCAGACTGATGACGCTAGACTCAGAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62656	ACATATGCTCGCGTGCTCTTTCACTCAGACTGATGACGCTAGACTCAGAC	62705

AL662859.5	1201	TAGATATGCTAATGAACCTAATGTGCACATTTTTGGGATGTGGGAGGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62706	TAGATATGCTAATGAACCTAATGTGCACATTTTTGGGATGTGGGAGGAAA	62755

AL662859.5	1251	CTCAGACAGTGGCTTCCAGGAGAAATAGACTTTTTTCTCATCAACATTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62756	CTCAGACAGTGGCTTCCAGGAGAAATAGACTTTTTTCTCATCAACATTAT	62805

AL662859.5	1301	AACAAAATGATGTTGAATGAAACAACGTTATTCAAGGGTCTGCTGTACGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62806	AACAAAATGATGTTGAATGAAACAACGTTATTCAAGGGTCTGCTGTACGC	62855

AL662859.5	1351	AGATTTTCCTATTTCTTTAGGTCTTCATTTTTGAAGGCTCTTGTGTCAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62856	AGATTTTCCTATTTCTTTAGGTCTTCATTTTTGAAGGCTCTTGTGTCAAT	62905

AL662859.5	1401	AAAATTTGTTTGATTTGTATGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62906	AAAATTTGTTTGATTTGTATGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG	62955

AL662859.5	1451	TTGTTGAGACAGAATTTCACTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGTAATGGCG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	62956	TTGTTGAGACAGAATTTCACTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGTAATGGCG	63005

AL662859.5	1501	CGATCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63006	CGATCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCT	63055

AL662859.5	1551	GCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACTATGCCCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63056	GCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACTATGCCCA	63105

AL662859.5	1601	GCTAATTTCGTATTTTTAGTGGAAATGGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63106	GCTAATTTCGTATTTTTAGTGGAAATGGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGG	63155

AL662859.5	1651	CTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCTTCAGCCCCCCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63156	CTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCTTCAGCCCCCCAA	63205

AL662859.5	1701	AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCCCACCCGGCCTGCTTTTCCCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63206	AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCCCACCCGGCCTGCTTTTCCCTT	63255

AL662859.5	1751	GTTAATCTATCTTTTATTATGAAGTGTCAGCCATGAACCTGGCACTGGGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63256	GTTAATCTATCTTTTATTATGAAGTGTCAGCCATGAACCTGGCACTGGGT	63305

AL662859.5	1801	GGGAAAAGATGTTTTTCTGCCCTAGACCTTCCTATAAGTGCTTTTGGGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63306	GGGAAAAGATGTTTTTCTGCCCTAGACCTTCCTATAAGTGCTTTTGGGAC	63355

AL662859.5	1851	AACACTGCAGGAGTCCCCAAAGGTGAAAATTTACCTGCGGGAGTTAATAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63356	AACACTGCAGGAGTCCCCAAAGGTGAAAATTTACCTGCGGGAGTTAATAA	63405

AL662859.5	1901	AAACAGGAATCCCCAGGCCTTACCCCAGAGACTGAGATGCTGAGTGCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63406	AAACAGGAATCCCCAGGCCTTACCCCAGAGACTGAGATGCTGAGTGCTTT	63455

AL662859.5	1951	CAGAGTCTCCAGAAAAGGGCCCAGGAATTATTATGGGGTGACAGATGTCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669978.3	63456	CAGAGTCTCCAGAAAAGGGCCCAGGAATTATTATGGGGTGACAGATGTCA	63505

Overview

Query
AL662859.5 - 61233 bps
Hit
AL669978.3 - 63505 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link