<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672281.18	1	GGTGTGTCTTTCTCTAGGCTTCTGACACACACCCTTTTCTTTGTTGCTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161675	GGTGTGTCTTTCTCTAGGCTTCTGACACACACCCTTTTCTTTGTTGCTTT	161724

AL672281.18	51	ACCTTGGCAACACAGAATGCCTCCTCTGAACTCCCTGGGCACACTGTCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161725	ACCTTGGCAACACAGAATGCCTCCTCTGAACTCCCTGGGCACACTGTCAA	161774

AL672281.18	101	ATATCCTCACTTCTCAGTCACAAAGTGTTCAGCAGAGATCTTACCACCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161775	ATATCCTCACTTCTCAGTCACAAAGTGTTCAGCAGAGATCTTACCACCTG	161824

AL672281.18	151	CCAGGCCCCTCAATCTCTGGAGATTTTACTAGAACACTGCCTTAAACTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161825	CCAGGCCCCTCAATCTCTGGAGATTTTACTAGAACACTGCCTTAAACTTC	161874

AL672281.18	201	TGTTATTTGTATGTACAGCTCATGGAATCTTCTAGGACTTTTTTCAAGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161875	TGTTATTTGTATGTACAGCTCATGGAATCTTCTAGGACTTTTTTCAAGGC	161924

AL672281.18	251	TACTCAGAGCATCTCTCTGCACATGCTATGCATAAAGCACCTTCTATATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161925	TACTCAGAGCATCTCTCTGCACATGCTATGCATAAAGCACCTTCTATATC	161974

AL672281.18	301	AAAGATATTAGCATACTGGCTGAATTGGACTAAATTTAATATTTTGCATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	161975	AAAGATATTAGCATACTGGCTGAATTGGACTAAATTTAATATTTTGCATA	162024

AL672281.18	351	AAAATGCTCATTTCGGGCGTAGTATTTCAGCACTGATTACTGCTACATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162025	AAAATGCTCATTTCGGGCGTAGTATTTCAGCACTGATTACTGCTACATTC	162074

AL672281.18	401	TGCCTGGTCTCATCAAGAAATCAGCTAAGGACGCAAGGAGGGTTATGTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162075	TGCCTGGTCTCATCAAGAAATCAGCTAAGGACGCAAGGAGGGTTATGTCT	162124

AL672281.18	451	GAAAATGCTCATCAGTTAAGATGCATCCTCAAGTACTCAGTGGTAAGTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162125	GAAAATGCTCATCAGTTAAGATGCATCCTCAAGTACTCAGTGGTAAGTGG	162174

AL672281.18	501	TATCTGGAGGCTGCTGAGGTACGACCTGCCTGCAGTTCCAGCATGTGAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162175	TATCTGGAGGCTGCTGAGGTACGACCTGCCTGCAGTTCCAGCATGTGAGA	162224

AL672281.18	551	GGCAGAGGCCAGAGGGTGCTGAGTTCAAGGCCAGCTGGGCTACAAAGGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162225	GGCAGAGGCCAGAGGGTGCTGAGTTCAAGGCCAGCTGGGCTACAAAGGGA	162274

AL672281.18	601	AAGAGCTCCTGTCTCGCAGAAGAAAAGACATGGCCTCTCGAGTATGCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162275	AAGAGCTCCTGTCTCGCAGAAGAAAAGACATGGCCTCTCGAGTATGCTTT	162324

AL672281.18	651	ATGCTCTTGCAGATTAAAAAGTGTATGTGAGCGCGCACATGCGTGCATGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162325	ATGCTCTTGCAGATTAAAAAGTGTATGTGAGCGCGCACATGCGTGCATGT	162374

AL672281.18	701	GAGCGAGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGTTGAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162375	GAGCGAGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGTTGAAAT	162424

AL672281.18	751	CAGATAAGTAAGATACTTGCAGTTAAAGCTGGTGATTATTTCTTCTGCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162425	CAGATAAGTAAGATACTTGCAGTTAAAGCTGGTGATTATTTCTTCTGCAA	162474

AL672281.18	801	ATGTTTGTAAATTTGTTTTGAGAAGCTGAAAACAAACACCCACCCATGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162475	ATGTTTGTAAATTTGTTTTGAGAAGCTGAAAACAAACACCCACCCATGCT	162524

AL672281.18	851	ATCTATCAGCTCTCTCGGAACACGGAGCCGTGTCAAGCTGAGCGCCAAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162525	ATCTATCAGCTCTCTCGGAACACGGAGCCGTGTCAAGCTGAGCGCCAAGA	162574

AL672281.18	901	GCATGTGAGAATTCGGGCCTGCTTTCTAATCTGGGTACCAGGTCCACACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162575	GCATGTGAGAATTCGGGCCTGCTTTCTAATCTGGGTACCAGGTCCACACC	162624

AL672281.18	951	TGCTCTGACACTCTCTCTCCAAAGCTATAGACTCGCAGGTGACCCTCCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162625	TGCTCTGACACTCTCTCTCCAAAGCTATAGACTCGCAGGTGACCCTCCTC	162674

AL672281.18	1001	CGAAGAGAGACTCCACTACAAACTGGGATCACTAAATGCCTTTCTCCAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162675	CGAAGAGAGACTCCACTACAAACTGGGATCACTAAATGCCTTTCTCCAAG	162724

AL672281.18	1051	TTTTCCAAACAGTGAAAACCTTGAGAATGACTGGCTACGTTACAGACCAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162725	TTTTCCAAACAGTGAAAACCTTGAGAATGACTGGCTACGTTACAGACCAC	162774

AL672281.18	1101	AGTATTTCCTGCCTACTGTTTCCAGGGTGCCTGCTTTTCCTAGTGTGTCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162775	AGTATTTCCTGCCTACTGTTTCCAGGGTGCCTGCTTTTCCTAGTGTGTCG	162824

AL672281.18	1151	GCGAGGTATGCAGACACCCTTCACTTACTCTGACAAGTCTATAAAGAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162825	GCGAGGTATGCAGACACCCTTCACTTACTCTGACAAGTCTATAAAGAAGG	162874

AL672281.18	1201	TATATAGCTTATCCCATTCTGCAGTAACAAGAGTGACAATCAGCATTTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162875	TATATAGCTTATCCCATTCTGCAGTAACAAGAGTGACAATCAGCATTTTC	162924

AL672281.18	1251	GGAGGGCTTTCTAGATGCCAGGCAGCAGGCCATAATACTTTCTTGGAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162925	GGAGGGCTTTCTAGATGCCAGGCAGCAGGCCATAATACTTTCTTGGAATT	162974

AL672281.18	1301	TGGCTTAACTCTCCCATGTTATAGGATTAGTATTATCTTTGTGTATGTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	162975	TGGCTTAACTCTCCCATGTTATAGGATTAGTATTATCTTTGTGTATGTTT	163024

AL672281.18	1351	CAAATGACAAACAAAAATGAAGCTCAGGAAGCTAAGTTAGAGAATTTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163025	CAAATGACAAACAAAAATGAAGCTCAGGAAGCTAAGTTAGAGAATTTCTG	163074

AL672281.18	1401	CATAGAGTGTGAGCAGAATTGCATGGGAGAGCTTTCTATCTAGGTCATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163075	CATAGAGTGTGAGCAGAATTGCATGGGAGAGCTTTCTATCTAGGTCATCT	163124

AL672281.18	1451	GGCTCCCAACCCAGACTACCTGGACAGGCTCATCCCACCCCTGGGGTACC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163125	GGCTCCCAACCCAGACTACCTGGACAGGCTCATCCCACCCCTGGGGTACC	163174

AL672281.18	1501	AAGCTTTCTTGGCCTGCTCCCTCCCAGAAGTTCAGAGTGATGCTATCAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163175	AAGCTTTCTTGGCCTGCTCCCTCCCAGAAGTTCAGAGTGATGCTATCAGA	163224

AL672281.18	1551	GAAGCTCTGACCCTGCTCCCCAGGCACACATGCTGCATTCCAGGAGGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163225	GAAGCTCTGACCCTGCTCCCCAGGCACACATGCTGCATTCCAGGAGGGCA	163274

AL672281.18	1601	TGTTTTAACCCCCTCTCTCCAACTGTAACCTTGTATAGATAATGTGGGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163275	TGTTTTAACCCCCTCTCTCCAACTGTAACCTTGTATAGATAATGTGGGAA	163324

AL672281.18	1651	GGGCAGGGTTAGAAAGACCAGGAGGAGCACTCCACTTTCCAGGCACTTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163325	GGGCAGGGTTAGAAAGACCAGGAGGAGCACTCCACTTTCCAGGCACTTGC	163374

AL672281.18	1701	CACGGTCAGATACTCCAAGAGTTAGCACACTCATCTGTATAATAAAGACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163375	CACGGTCAGATACTCCAAGAGTTAGCACACTCATCTGTATAATAAAGACT	163424

AL672281.18	1751	CTCATATTTAAACAGAGATGGCTACAAATTAAGTCCTGTGATGGGGGTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163425	CTCATATTTAAACAGAGATGGCTACAAATTAAGTCCTGTGATGGGGGTGG	163474

AL672281.18	1801	GGTGGGAGGGATAGCTCTGCAGAGTCCAAGAGGAACAATTATCATGACAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163475	GGTGGGAGGGATAGCTCTGCAGAGTCCAAGAGGAACAATTATCATGACAG	163524

AL672281.18	1851	AAGTCAGCATTAGCCATCTCAGAGCAATACGCAGTTCAGATGGCCTGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163525	AAGTCAGCATTAGCCATCTCAGAGCAATACGCAGTTCAGATGGCCTGCCT	163574

AL672281.18	1901	CAGCTCCCTTCATCCTCATTCACTCCTCTCAGAGAGGGCCAGGAATATCC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163575	CAGCTCCCTTCATCCTCATTCACTCCTCTCAGAGAGGGCCAGGAATATCC	163624

AL672281.18	1951	AGAGCACAGGAGGAAGGGCTGGCTCTAACCCTTGCACCTCTTGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669937.11	163625	AGAGCACAGGAGGAAGGGCTGGCTCTAACCCTTGCACCTCTTGGGAATTC	163674

Overview

Query
AL672281.18 - 73520 bps
Hit
AL669937.11 - 163674 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link