<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645760.15	1	GAATTCTACTATGCTCTCATCTGAAAGCTCTGTGAGAAGAGAGTGCATAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	59814	GAATTCTACTATGCTCTCATCTGAAAGCTCTGTGAGAAGAGAGTGCATAC	59863

AL645760.15	51	TTTCCTACATCGCAAGGTCTTGGTCCAAGTGTCGGTCAGCAGGTGAAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	59864	TTTCCTACATCGCAAGGTCTTGGTCCAAGTGTCGGTCAGCAGGTGAAGTT	59913

AL645760.15	101	AGAAACGAGTATTTTGATGCCATACAGATTATTTGTTCATGAGTAATCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	59914	AGAAACGAGTATTTTGATGCCATACAGATTATTTGTTCATGAGTAATCTG	59963

AL645760.15	151	GAATTATGACATTAAACAACAAGACGGAGATAGGTGCCGAAAGCCTATCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	59964	GAATTATGACATTAAACAACAAGACGGAGATAGGTGCCGAAAGCCTATCC	60013

AL645760.15	201	TCCCATTCTGCCTCTTTCATGACAATCATATCCTAAAACCTGAAGAGACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60014	TCCCATTCTGCCTCTTTCATGACAATCATATCCTAAAACCTGAAGAGACC	60063

AL645760.15	251	CCGAAAAATATATCTACTTTCAAGAGAGCAAAATATACAGCTTTAGGTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60064	CCGAAAAATATATCTACTTTCAAGAGAGCAAAATATACAGCTTTAGGTGA	60113

AL645760.15	301	CACATACATACAAGTGTACATACATACATATTTCTGCTTTAAAGTGAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60114	CACATACATACAAGTGTACATACATACATATTTCTGCTTTAAAGTGAATT	60163

AL645760.15	351	ATGCAAATAAAAAAGAGAAAAGGTGCAGGTTATAGGTTAGAGGATCTTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60164	ATGCAAATAAAAAAGAGAAAAGGTGCAGGTTATAGGTTAGAGGATCTTAA	60213

AL645760.15	401	ACAAATTAAATTCTGGATTGGGGTCAGCAGCTATGATGTAAGAGGCAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60214	ACAAATTAAATTCTGGATTGGGGTCAGCAGCTATGATGTAAGAGGCAAAT	60263

AL645760.15	451	CCAGGCCTCCATCTGTTTTTTTTTTTTTTAATGTGCATTGCATCACAGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60264	CCAGGCCTCCATCTGTTTTTTTTTTTTTTAATGTGCATTGCATCACAGTT	60313

AL645760.15	501	CCACTCATGTATTTGCATATTATTTATAGCTGTAACAGCAGAAATGAGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60314	CCACTCATGTATTTGCATATTATTTATAGCTGTAACAGCAGAAATGAGTA	60363

AL645760.15	551	ATAAGAGAGCTACATGACTGGCAGACCTTAAAACACTCTCTGGCTGTTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60364	ATAAGAGAGCTACATGACTGGCAGACCTTAAAACACTCTCTGGCTGTTTA	60413

AL645760.15	601	CAGAAAAGCTTGCTGGCTATTTATAGAGCAAACAGAATACTTGTATTGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60414	CAGAAAAGCTTGCTGGCTATTTATAGAGCAAACAGAATACTTGTATTGGG	60463

AL645760.15	651	GTATGGAGCTAAAGAACAGAGGCATGCTTTCCAGTGTCCCTGAACTACGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60464	GTATGGAGCTAAAGAACAGAGGCATGCTTTCCAGTGTCCCTGAACTACGA	60513

AL645760.15	701	GTGACTTGAAACAGCTCCTGGTCAGATGCTGATGACTTAAATGCTCTGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60514	GTGACTTGAAACAGCTCCTGGTCAGATGCTGATGACTTAAATGCTCTGCA	60563

AL645760.15	751	GACAGGCTGTGCGGACTACAGCAACTCTATCATCTACCTATCAGTGAGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60564	GACAGGCTGTGCGGACTACAGCAACTCTATCATCTACCTATCAGTGAGCA	60613

AL645760.15	801	GACCATACTCCAGATCTGTGTATAACTGTACATATACACAGCTAAGCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60614	GACCATACTCCAGATCTGTGTATAACTGTACATATACACAGCTAAGCAAA	60663

AL645760.15	851	AACAGACGAGGCAGGAGCCAGCCAATCCCAGGATAAAGAGCCCAGAGAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60664	AACAGACGAGGCAGGAGCCAGCCAATCCCAGGATAAAGAGCCCAGAGAAA	60713

AL645760.15	901	AGAAGGAACCTAAAGTTACATCTATTATGCTCTAGTAACTGGGTTAGAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60714	AGAAGGAACCTAAAGTTACATCTATTATGCTCTAGTAACTGGGTTAGAGA	60763

AL645760.15	951	AATTTTAGTATGTTTTCTCTATATGCGAGAAATACAGATGCCACCGTTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60764	AATTTTAGTATGTTTTCTCTATATGCGAGAAATACAGATGCCACCGTTAT	60813

AL645760.15	1001	TAGGAAGTATACTCGAGAAAAAACAATTTACAACTGCACAGTGTACCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60814	TAGGAAGTATACTCGAGAAAAAACAATTTACAACTGCACAGTGTACCCAT	60863

AL645760.15	1051	GAATTAAGGGACAATTTTTCTTTTAGATATAAAGTAACACAGACTTCTAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60864	GAATTAAGGGACAATTTTTCTTTTAGATATAAAGTAACACAGACTTCTAC	60913

AL645760.15	1101	AAAGTATTGATCTTAATCATGTAATTAAAGTAATAACAAAATACAAATGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60914	AAAGTATTGATCTTAATCATGTAATTAAAGTAATAACAAAATACAAATGA	60963

AL645760.15	1151	TTTTATTTCTGAAGTAAATATTTTAGTCAAAGATGCAACAGAAATCAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	60964	TTTTATTTCTGAAGTAAATATTTTAGTCAAAGATGCAACAGAAATCAAAT	61013

AL645760.15	1201	ATTTCTTTGACATTTTTCAAGAGTCTTTAGTTATTAACTACAATTTTTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61014	ATTTCTTTGACATTTTTCAAGAGTCTTTAGTTATTAACTACAATTTTTGT	61063

AL645760.15	1251	TGTTAGTATTATATAGTAACAGTGTTTAAAATATATTATAAACCTTTTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61064	TGTTAGTATTATATAGTAACAGTGTTTAAAATATATTATAAACCTTTTAT	61113

AL645760.15	1301	CTCCCTTTTTAATTTAAATGAAATATAAAATTAAGAATTTTGAAACATGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61114	CTCCCTTTTTAATTTAAATGAAATATAAAATTAAGAATTTTGAAACATGA	61163

AL645760.15	1351	TTCATTTTGGGGAATATTTAAAATGCTATGGAACACTCTCATACAGAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61164	TTCATTTTGGGGAATATTTAAAATGCTATGGAACACTCTCATACAGAAGA	61213

AL645760.15	1401	TGCCACTGGAATCATGTGACATGCTGTAAGGCCGGGGTGGTGCCAGGCGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61214	TGCCACTGGAATCATGTGACATGCTGTAAGGCCGGGGTGGTGCCAGGCGG	61263

AL645760.15	1451	AGCGTGACGCGTATGACATGCTCTGTACCTGTTTGTTCCCTCATTCTCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61264	AGCGTGACGCGTATGACATGCTCTGTACCTGTTTGTTCCCTCATTCTCTC	61313

AL645760.15	1501	ACGAATGCACTCGCTCAGAGAACTCCAGCCTGAAGGGAGACTCATTGTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61314	ACGAATGCACTCGCTCAGAGAACTCCAGCCTGAAGGGAGACTCATTGTCA	61363

AL645760.15	1551	GTCTTTACCGACAAATTCAGAGTGCTGACAAACACTTTGGTAATGAAGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61364	GTCTTTACCGACAAATTCAGAGTGCTGACAAACACTTTGGTAATGAAGAG	61413

AL645760.15	1601	CAAAAAGGAGGAGAAGCTGAGGATCGTGACCTCAGACTGCTTGTTTAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61414	CAAAAAGGAGGAGAAGCTGAGGATCGTGACCTCAGACTGCTTGTTTAAAA	61463

AL645760.15	1651	CCTGCCAAGGGAAGCCGTGGCGCCCGAGATGACATCATAGGGAATCAGGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61464	CCTGCCAAGGGAAGCCGTGGCGCCCGAGATGACATCATAGGGAATCAGGT	61513

AL645760.15	1701	AGTCAATATTCTGCAAAAAGAATGCGTTCCTCTAACACCCAGGCTTTCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61514	AGTCAATATTCTGCAAAAAGAATGCGTTCCTCTAACACCCAGGCTTTCCT	61563

AL645760.15	1751	GCGCACATACCCCAGCTGGACGACACCGACAGGCTGGTGTTAGAGGCGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61564	GCGCACATACCCCAGCTGGACGACACCGACAGGCTGGTGTTAGAGGCGCA	61613

AL645760.15	1801	CAAAATGTGCAGCCCACCTGAAGAAAGACCTTCACCTCGGAACTTGCTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61614	CAAAATGTGCAGCCCACCTGAAGAAAGACCTTCACCTCGGAACTTGCTGT	61663

AL645760.15	1851	TCTGCAGTGAGACTTCTTGGTGAAGGGCTCATTCTTAGTTTTACGAGCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61664	TCTGCAGTGAGACTTCTTGGTGAAGGGCTCATTCTTAGTTTTACGAGCTT	61713

AL645760.15	1901	CATATTGGTTCATTAGTTTCTAAAACTCAGGTTTGAACCAAAAGGTGTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61714	CATATTGGTTCATTAGTTTCTAAAACTCAGGTTTGAACCAAAAGGTGTGA	61763

AL645760.15	1951	TTCTAAAATGAGCAATAAATCTGGAATTAGAAGGTGTTCAATAGTCCCTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669933.6	61764	TTCTAAAATGAGCAATAAATCTGGAATTAGAAGGTGTTCAATAGTCCCTA	61813

Overview

Query
AL645760.15 - 135825 bps
Hit
AL669933.6 - 61813 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link